BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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Biblioteca(s):  Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Data corrente:  18/06/2013
Data da última atualização:  17/07/2018
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  PASSOS, M. A. N.; CRUZ, V. O. de; EMEDIATO, F. L.; TEIXEIRA, C. C. de; AZEVEDO, V. C. R.; BRASILEIRO, A. C. M.; AMORIM, E. P.; FERREIRA, C. F.; MARTINS, N. F.; TOGAWA, R. C.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; SILVA JUNIOR, O. B. da; MILLER, R. T N. G.
Afiliação:  MARCO A N PASSOS, UNB; VIVIANE OLIVEIRA DE CRUZ, UNB; FLAVIA L EMEDIATO, UNB; CRISTIANE CAMARGO DE TEIXEIRA, UCB; VANIA CRISTINA RENNO AZEVEDO, CENARGEN; ANA CRISTINA MIRANDA BRASILEIRO, CENARGEN; EDSON PERITO AMORIM, CNPMF; CLAUDIA FORTES FERREIRA, CNPMF; NATALIA FLORENCIO MARTINS, CENARGEN; ROBERTO COITI TOGAWA, CENARGEN; GEORGIOS J PAPPAS JÚNIOR, UNB; ORZENIL BONFIM DA SILVA JUNIOR, CENARGEN; ROBERT N. G. MILLER, UNB.
Título:  Analysis of the leaf transcriptome of Musa acuminata during interaction with Mycosphaerella musicola: gene assembly, annotation and marker development.
Ano de publicação:  2013
Fonte/Imprenta:  BMC Genomics, v.14, n.78, 2013.
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Background: Although banana (Musa sp.) is an important edible crop, contributing towards poverty alleviation and food security, limited transcriptome datasets are available for use in accelerated molecular-based breeding in this genus. 454 GS-FLX Titanium technology was employed to determine the sequence of gene transcripts in genotypes of Musa acuminata ssp. burmannicoides Calcutta 4 and M. acuminata subgroup Cavendish cv. Grande Naine, contrasting in resistance to the fungal pathogen Mycosphaerella musicola, causal organism of Sigatoka leaf spot disease. To enrich for transcripts under biotic stress responses, full length-enriched cDNA libraries were prepared from whole plant leaf materials, both uninfected and artificially challenged with pathogen conidiospores. Results: The study generated 846,762 high quality sequence reads, with an average length of 334 bp and totaling 283 Mbp. De novo assembly generated 36,384 and 35,269 unigene sequences for M. acuminata Calcutta 4 and Cavendish Grande Naine, respectively. A total of 64.4% of the unigenes were annotated through Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) similarity analyses against public databases. Assembled sequences were functionally mapped to Gene Ontology (GO) terms, with unigene functions covering a diverse range of molecular functions, biological processes and cellular components. Genes from a number of defense-related pathways were observed in transcripts from each cDNA library. Over 99% of contig unigenes mapp... Mostrar Tudo
Thesagro:  Banana; Fungo; Musa Acuminata; Mycosphaerella Musicola.
Thesaurus Nal:  Microsatellite repeats; Transcriptome.
Categoria do assunto:  --
URL:  http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/156239/1/1471-2164-14-78.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CENARGEN34700 - 1UPCSP - DDSP 20459SP 20459
CNPMF29450 - 2UPCSP - PPSP/130832013.13083

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Registros recuperados : 14
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1.Imagem marcado/desmarcadoEMEDIATO, F. L.; PASSOS, M. A. N.; TEIXEIRA, C. de C.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; MILLER, R. N. G. Análise de expressão de genes análogos de resistência em musa acuminata durante as interações compatíveis e incompatíveis com Mycosphaerella musicola. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 45., 2012, Manaus. Fito 2012. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 37, 2012. Suplemento. Resumo 708. 1 CD-ROM.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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2.Imagem marcado/desmarcadoPASSOS, M. A. N.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; SILVA JUNIOR, O. B. da; EMEDIATO, F. L.; TEIXEIRA, C. C.; MILLER, R. N. G. Identificação e caracterização de components genéticos de resistência a Mycosphaerella musicola em Musa acuminata. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 45., 2012, Manaus. Fito 2012. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 37, 2012. Suplemento. Resumo 470. 1 CD-ROM.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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3.Imagem marcado/desmarcadoMILLER, R. N. G.; PASSOS, M. A. N.; EMEDIATO, F. L.; TEIXEIRA, C. C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; PAPPAS JUNIOR, G. J. Gene expression analysis in Musa acuminata-Mycosphaerella interactions. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 45., 2012, Manaus. Fito 2012. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 37, 2012. Suplemento. 1 CD-ROM.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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4.Imagem marcado/desmarcadoEMEDIATO, F. L.; PASSOS, M. A. N.; NUNES, F. A. C.; TEIXEIRA, C. C.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; MILLER, R. N. G. Caracterização de genes análogos de resistência em cultivares de Musa acuminata contrastantes em resistência à estresses bióticos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Resumos... Salvador: SBG, 2008. p. 22.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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5.Imagem marcado/desmarcadoEMEDIATO, F. L.; PASSOS, M. A. N.; TEIXEIRA, C. C.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; MARTINS, N. F.; MILLER, R. N. G. Caracterização de genes análogos de resistência (RGAs) em cultivares de Musa acuminata contrastantes em resistência a estresses bióticos. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 34, p. X261, out. 2009. Suplemento. Edição dos Resumos do XLII do Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Rio de Janeiro, RJ, out. 2009.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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6.Imagem marcado/desmarcadoPASSOS, M. A. N.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; EMEDIATO, F. L.; MARTINS, N. F.; TOGAWA, R. C.; CIAMPI, A. Y.; MILLER, R. N. G. A caracterização de genes e desenvolvimento de marcadores moleculares na interação entre Musa acuminata e Mycosphaerella fijensis. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 34, p. X260, out. 2009. Suplemento. Edição dos Resumos do XLII do Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Rio de Janeiro, RJ, out. 2009.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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7.Imagem marcado/desmarcadoANJOS, R. A.; BATISTA, D. S.; PASSOS, M. A. N.; LERIA, H. M. B.; BERTIOLI, D. J.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; SANTOS, C. M. R.; SILVA, F. R. da; MARTINS, N. F.; SOUZA JÚNIOR, M. T.; MILLER, R. N. G. Analysis of resistance gene analog in Musa acuminata cv Calcutta 4. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 50., 2004, Costão do Santinho, Florianópolis. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2004. não paginado.
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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8.Imagem marcado/desmarcadoANJOS, R. A.; BATISTA, D. S.; PASSOS, M. A. N.; LERIA, H. M. B.; BERTIOLI, D. J.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; SANTOS, C. M. R.; SILVA, F. R.; MARTINS, N. F.; SOUZA JÚNIOR, M. T.; MILLER, R. N. G. Analysis of resistance gene analogs in Musa acuminata cv Calcutta 4. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 50., 2004, Costão do Santinho, Florianópolis. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2004. p. 1200.
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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9.Imagem marcado/desmarcadoMILLER, R. N. G.; PASSOS, M. A. N.; MENEZES, N. N. P.; SOUZA JUNIOR, M. T.; COSTA, M. M. do C.; AZEVEDO, V. C. R.; AMORIM, E. P.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; CIAMPI, A. Y. Characterization of novel microsatellite markers in Musa acuminata subsp. burmannicoides, var. Calcutta 4. BMC Research Notes, v.3, n.148, 2010. Disponível em:.Acesso em: 16 ago. 2010.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 2
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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10.Imagem marcado/desmarcadoPASSOS, M. A. N.; MENEZES, N. N. P.; EMEDIATO, F. L.; VILARINHOS, A. D.; SOUZA JÚNIOR, M. T.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; MILLER, R. N. G.; CIAMPI, A. Y. Caracterização de marcadores microsatélites derivados de sequências de BAC e EST em Musa acuminata. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Resumos... Salvador: SBG, 2008. P. 275.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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11.Imagem marcado/desmarcadoPASSOS, M. A. N.; CRUZ, V. O. de; EMEDIATO, F. L.; TEIXEIRA, C. C. de; AZEVEDO, V. C. R.; BRASILEIRO, A. C. M.; AMORIM, E. P.; FERREIRA, C. F.; MARTINS, N. F.; TOGAWA, R. C.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; SILVA JUNIOR, O. B. da; MILLER, R. T N. G. Analysis of the leaf transcriptome of Musa acuminata during interaction with Mycosphaerella musicola: gene assembly, annotation and marker development. BMC Genomics, v.14, n.78, 2013.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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12.Imagem marcado/desmarcadoMILLER, R. N. G.; PASSOS, M. A. N.; IMEDIATO, F. L.; CRUZ, V. O.; TEIXEIRA, C. de C.; FIGUEIREDO, L. F. de A.; MARTINS, N. F.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; PAPPAS JUNIOR, G. J. Keynote: understanding plant immunity: transcriptome profiling in Musa-pathogen interactions using next generation sequencing. In: PROMUSA SYMPOSIUM, 2011, Salvador. Bananas and plantains: toward sustainable global production and improved uses: abstracts. [Montepellier.]: [Bioversity International, 2011. p. 116-117.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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13.Imagem marcado/desmarcadoPASSOS, M. A. N.; CRUZ, V. de O.; EMEDIATO, F. L.; TEIXEIRA, C. de C.; SOUZA JR. M. L T.; MATSUMOTO, T.; AZEVEDO, V. C. R.; FERREIRA, C. F.; AMORIM, E. P.; FIGUEIREDO, L. F. de A.; MARTINS, N. F.; CAVALCANTE, M. de J. B.; BAURENS, F.-C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; PAPPAS JUNIOR, G. J.; PIGNOLET, L.; ABADIE, C.; CIAMPI, A. Y.; PIFFANELLI, P.; MILLER, R. N. G. Development of expressed sequence tag and EST-SSR marker resources for Musa acuminata. AOB Plants, 2012. (Open Access).
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 4
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura.
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14.Imagem marcado/desmarcadoPASSOS, M. A. N.; CRUZ, V. de O.; EMEDIATO, F. L.; TEIXEIRA, C. de C.; SOUZA JUNIOR, M. T.; MATSUMOTO, T.; AZEVEDO, V. C. R.; FERREIRA, C. F.; AMORIM, E. P.; FIGUEIREDO, L. F. de A.; MARTINS, N. F.; CAVALCANTE, M. de J. B.; BAURENS, F. C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; PAPPAS JUNIOR, G. J.; PIGNOLET, L.; ABADIE, C.; CIAMPI, A. Y.; PIFFANELLI, P.; MILLER, R. N. G. Development of expressed sequence tag and expressed sequence tag-simple sequence repeat marker resources for Musa acuminata. AoB Plants, 2012.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 4
Biblioteca(s): Embrapa Acre; Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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