BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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Biblioteca(s):  Embrapa Mandioca e Fruticultura.
Data corrente:  16/07/2013
Data da última atualização:  16/07/2013
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  RODRIGUEZ, M. A. D.; HERAI, R.; WAALWIJK, C.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; FERREIRA, G. B.; SOUZA, M.; KEMA, G. H. J.
Afiliação:  MIGUEL ANGEL DITA RODRIGUEZ, CNPMF; R. HERAI, UNICAMP; C. WAALWIJK, Plant Research International B. V.; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; GILVAN BARBOSA FERREIRA, CNPA; M. SOUZA; G.H.J. KEMA, Plant Research International B. V.
Título:  Comparative transcriptome analyses and genome assembly of fusarium oxysporum f. sp. cubense.
Ano de publicação:  2013
Fonte/Imprenta:  Acta Horticulturae, n. 986, p. 165-168, 2013.
Páginas:  4p.
ISSN:  0567-7572
Idioma:  Inglês
Notas:  Trabalho apresentado no ISHS - ProMusa Symposium on Bananas and Plantains: Towards Sustainable Global Production and Improved Uses.
Conteúdo:  Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc), the causal agent of Fusarium wilt of banana, is a highly destructive and genetically diverse pathogen. Despite its economic importance, genomic information about Foc is limited and no transcriptomic analyses have been reported so far. By using 454 sequencing technology, we generated >2.5 million expressed sequenced tags (ESTs) from four Foc isolates representing different vegetative compatibility groups (VCGs) and races that infect banana: race 1 (R1, VCG unknown but different from the others here described), race 2 (R2, VCG 0124), subtropical race 4 (SR4, VCG 0120) and tropical race 4 (TR4, VCG 01213). The ESTs were obtained from libraries prepared from mRNA extracted from three physiological states (mycelium, conidia and germinated conidia), which were pooled in a 2:2:1 ratio. Most genes are represented in all libraries, but in silico comparative analyses identified a set of unique ESTs for each isolate (689 for R1, 974 for R2, 296 for SR4 and 555 for TR4), which are excellent candidates for diagnostics development, future plant-pathogen interaction studies and functional analyses. In subsequent analyses, a 40× sequencing-coverage (Illumina single reads) of TR4 genomic DNA was assembled in a de novo based methodology, resulting in a 45.5 Mb genome. Preliminary analyses show a high colinearity of EST and genomic data that significantly contributes to the quality of the assembly.
Thesagro:  Banana; Fusariose; Fusarium.
Thesaurus Nal:  Bananas; Fusarium oxysporum f. sp. cubense; Fusarium wilt; Genome.
Categoria do assunto:  --
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Registro original:  Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
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1.Imagem marcado/desmarcadoDITA, M. A.; WAALWIJK, C.; PAIVA, L.; KEMA, G.; SOUZA JUNIOR, M. Kit diagnóstico para a maior ameaça bananicultura mundial. In: SIMPÓSIO SOBRE INOVAÇÃO E CRIATIVIDADE CIENTÍFICA NA EMBRAPA, 2., 2010, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2010. Disponível em: Acesso em: 21 fev. 2011.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura.
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2.Imagem marcado/desmarcadoDITA, M. A.; WAALWIJK, C.; PAIVA, L.; KEMA, G.; SOUZA JUNIOR, M. T. Kit diagnóstico para a raça 4 tropical de Fusarium oxysporum f. sp. cubense, agente causal do mal-do-Panamá da bananeira. In: SIMPÓSIO SOBRE INOVAÇÃO E CRIATIVIDADE CIENTÍFICA NA EMBRAPA, 2., 2010, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2010. Disponível em: Acesso em: 21 fev. 2011.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura.
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3.Imagem marcado/desmarcadoDITA, M. A.; WAALWIJK, C.; PAIVA, L. V.; SOUZA JUNIOR, M. T.; KEMA, G. H. J. A greenhouse bio-assay for the Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Tropical Race 4) X banana (Cavendish subgroup) interaction. In: ISHS/PROMUSA BANANA SYMPOSIUM, 2009, Guangzhou, China. Global perspectives on asian challenges: programme and abstracts. Guangzhou: ISHS: Promusa, 2009. p. 45.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura.
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4.Imagem marcado/desmarcadoDITA, M.; HERAI, R.; YAMAGISHI, M.; FERREIRA, G.; SOUZA, M.; GIACHETTO, P.; WAALWIJK, C.; KEMA, G. Comparative transcriptome analyses of Fusarium oysporum f. sp. cubense. Phytopathology, v. 101, n. 6, Supplement, p. S43, 2011. Trabalho apresentado no: APS-IPPC 2011 Joint Meeting in Honolulu, Hawaii, August 6-10, 2011.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária.
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5.Imagem marcado/desmarcadoDITA, M. A.; KOBAYASHI, A. K.; WAALWIJK, C.; SOUZA JUNIOR, M. T.; KEMA, G. H. J. Genetic transformation of Fusarium oxysporum f. sp. cubense. Tropical Plant Pathology, v. 34, p. S177, ago. 2009. Suplemento. Ref. 606. Edição dos Resumos do 42° Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Rio de Janeiro, ago. 2009.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte.
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6.Imagem marcado/desmarcadoDITA, M. A.; WAALWIJK, C.; BUDDENHAGEN, I. M.; SOUZA JUNIOR, M. T.; KEMA, G. H. J. A molecular diagnostic for tropical race 4 of the banana fusarium wilt pathogen Plant Pathology, Dordrecht, v. 59, p. 348–357, 2010. Disponível em: Acesso em: 26 out. 2010.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura.
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7.Imagem marcado/desmarcadoDITA, M. A.; WAALWIJK, C.; BUDDENHAGEN, I. W.; SOUZA JUNIOR, M. T.; KEMA, G. H. J. A molecular diagnostic for tropical race 4 of the banana fusarium wilt pathogen. Plant Pathology, 2010. Doi: 10.1111/j.1365-3059.0221.x.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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8.Imagem marcado/desmarcadoRODRIGUEZ, M. A. D.; WAALWIJK, C.; PAIVA, L. V.; SOUZA JR. M. T.; G. H. J. KEMA. A Greenhouse Bioassay for the Fusarium oxysporum f. sp. cubense x ?Grand Naine? (Musa, AAA, Cavendish Subgroup) Interaction. Acta Horticulturae, 897, 2011.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 2
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura.
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9.Imagem marcado/desmarcadoRODRIGUEZ, M. A. D.; WAALWIJK, C.; PAIVA, L. V.; SOUZA JUNIOR, M. T.; KEMA, G. H. J. A greenhouse bioassay for the Fusarium oxysporum f. sp. cubense x ?Grand Naine? (Musa, AAA, Cavendish Subgroup) interaction. Acta Horticulturae, v. 897, p. 377-380, may 2011.
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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10.Imagem marcado/desmarcadoWAALWIJK, C.; RODRIGUEZ, M. A. D.; BUDDENHAGEN, I.; PAIVA, L. V.; SOUZA JR. M. T.; KEMA, G. H. J. A Detection Method for Tropical Race 4 of the Banana Pathogen Fusarium oxysporum f. sp. Cubense. Acta Horticulturae, v.897, 2011.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 2
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura.
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11.Imagem marcado/desmarcadoWAALWIJK, C.; RODRIGUEZ, M. A. D.; BUDDENHAGEN, I.; PAIVA, L. V.; SOUZA JUNIOR, M. T.; KEMA, G. H. J. A detection method for tropical race 4 of the banana pathogen Fusarium oxysporum f. sp. cubense. Acta Horticulturae, v. 897, p. 339-344, may 2011.
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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12.Imagem marcado/desmarcadoWAALWIJK, C.; DITA, M. A.; BUDDENHAGEN, I.; PAIVA, L. V. K.; SOUZA JUNIOR, M. T.; KEMA, G. H. J. Development of a detection method for tropical race 4 of Fusarium oxysporum f. sp. cubense. In: ISHS/PROMUSA BANANA SYMPOSIUM, 2009, Guangzhou, China. Global perspectives on asian challenges: programme and abstracts. Guangzhou: ISHS: Promusa, 2009. p.38.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura.
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13.Imagem marcado/desmarcadoDITA, M. A.; HERAI, R.; WAALWIJK, C.; YAMAGISHI, M.; GIACHETTO, P.; FERREIRA, G.; SOUZA, M.; KEMA, G. H. J. Comparative transcriptome analysis and genome assembly of Fusarium oxysporum f. sp. cubense. In: INTERNATIONAL PROMUSA SYMPOSIUM, 2011, Salvador. Bananas and plantains: toward sustainable global production and improved uses: abstracts. [S.l.]: ISHS, 2011. p. 58.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária.
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14.Imagem marcado/desmarcadoHERAI, R.; DITA, M.; WAALWIJK, C.; FERREIRA, G.; SOUZA, M.; KEMA, G.; FALCAO, P.; GIACHETTO, P.; YAMAGISHI, M. Building a transcriptome molecular marker platform for diagnosis of fungal plant pathogens. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 8., 2012, Campinas. Abstract book... Ribeirão Preto: AB3C, 2012. Não paginado. X-MEETING 2012.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária.
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15.Imagem marcado/desmarcadoRODRIGUEZ, M. A. D.; KOBAYASHI, A. K.; WAALWIJK, C.; SOUZA JUNIOR, M. T.; KEMA, G. H. J. Genetic transformation of Fusarium oxysporum f. sp. cubense. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 34, ago. 2009. Suplemento. Edição dos Resumos do XLII Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Rio de Janeiro, ago. 2009. Suplemento. Resumo 606.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura.
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16.Imagem marcado/desmarcadoRODRIGUEZ, M. A. D.; WAALWIJK, C.; MUTUA, P.; DALY, A.; CHANG, P. F. L.; CORCOLON, B. M.; KEMA, G. H. J. Detecting fusarium oxysporum f. Sp. cubense tropical race 4 in soil and symptomless banana tissues. In:PROMUSA SYMPOSIUM, 2011, Salvador. Bananas and plantains: toward sustainable global production and improved uses: abstracts. [Montepellier.]: [Bioversity International, 2011. p. 36.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura.
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17.Imagem marcado/desmarcadoRODRIGUEZ, M. A. D.; WAALWIJK, C.; MUTUA, P.; DALY, A.; CHANG, P. F. L.; CORCOLON, B. M.; PAIVA, L.; SOUZA, M.; KEMA, G. H. J. Detecting Fusarium oxysporum f. sp. cubense tropical race 4 in soil and symptomless banana tissues. Acta Horticulturae, n. 986, p. 127-130, April, 2013. Trabalho apresentado no ISHS - ProMusa Symposium on Bananas and Plantains: Towards Sustainable Global Production and Improved Uses. Eds.: I. Van den Bergh et al.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 2
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura.
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18.Imagem marcado/desmarcadoRODRIGUEZ, M. A. D.; WAALWIJK, C.; DIAZ, C.; D'HONT, A.; YAHIAOUE, N.; BAKRLY, F.; SOUZA JR. M.; KEMA, G. H. J. Characterization of Musa germplasm for resistance to tropical race 4 of fusarium oxysporum f. sp. cubense. In: PROMUSA SYMPOSIUM, 2011, Salvador. Bananas and plantains: toward sustainable global production and improved uses: abstracts. [Montepellier.]: [Bioversity International, 2011. p.37.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura.
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19.Imagem marcado/desmarcadoRODRIGUEZ, M. A. D.; WAALWIJK, C.; DIAZ, C.; D´HON, A.; YAHIAOUI, N.; CARREEL, F.; BAKRY, F.; SOUZA JUNIOR, M. T.; KEMA, G. H. J. Characterization of Musa germplasm for resistance to tropical race 4 of Fusarium oxysporum f. sp. cubense. In: ISHS / PROMUSA SYMPOSIUM, 2011, Salvador, BH. Bananas and plantains: toward sustainable global production and improved uses: program and abstracts. Leuven: ISHS, 2011. p. 49
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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20.Imagem marcado/desmarcadoDITA, M.; HERAI, R.; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, G. F. da; SOUZA JUNIOR, M. T.; GIACHETTO, P. F.; WAALWIJK, C.; KEMA, G. Comparative transcriptome analyses of Fusarium oysporum f. sp. cubense. Phytopathology, v. 101, n. 6, Supplement, p. S43, 2011. Trabalhos apresentados no: APS-IPPC 2011 Joint Meeting in Honolulu, Hawaii, August 6–10, 2011.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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