BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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Biblioteca(s):  Embrapa Informática Agropecuária.
Data corrente:  10/11/2011
Data da última atualização:  10/11/2011
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  VENERONI-GOUVEIA, G.; MEIRELLES, S. L.; GROSSI, D. A.; SANTIAGO, A. C.; SONSTEGARD, T. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; MATUKUMALLI, L. K.; COUTINHO, L. L.; ALENCAR, M. M. de; OLIVEIRA, H. N.; REGITANO, L. C. A.
Afiliação:  G. VENERONI-GOUVEIA, UFSCar; S. L. MEIRELLES, UFLA; D. A. GROSSI, USP; A. C. SANTIAGO, UFSCar; T. S. SONSTEGARD, USDA; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; L. K. MATUKUMALLI, ESALQ; L. L. COUTINHO; MAURICIO MELLO DE ALENCAR, CPPSE; H. N. OLIVEIRA, USP; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE.
Título:  Whole-genome analysis for backfat thickness in a tropically adapted, composite cattle breed from Brazil.
Ano de publicação:  2011
Fonte/Imprenta:  Animal Genetics, p. 1-7, 2011.
DOI:  10.1111/j.1365-2052.2011.02286.x
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Backfat thickness affects the preservation of the beef carcass after slaughter and confers organoleptic characteristics assessed by the consumer. One of the breeding goals for Canchim, a tropically adapted breed, is to comprehensively increase fat thickness. Our goals were to identify genomic regions associated with backfat in Canchim populations and validate the association of single nucleotide polymorphisms (SNPs) overlapping previously identi?ed QTL regions known to affect fat deposition. Fifteen animals with lower and 15 animals with higher residues for backfat, according to a linear model using the SAS GLM procedure, were selected from a population of 1171 animals and genotyped using the BovineSNP50 BeadChip. Initial analysis revealed more than 100 SNPs that discriminated the tails of phenotypic distribution. One extended region of association included the centromeric region of chromosome (Chr) 14. Because this region overlapped with QTL from previous reports, we developed SNP assays to interrogate two linkage disequilibrium blocks, one in the centromeric region and another in the middle region of Chr 14 to con?rm the association. The analysis validated the presence of speci?c haplotypes affecting fat thickness.
Palavras-Chave:  Gado tropical; Genomics analysis.
Thesagro:  Genoma.
Thesaurus Nal:  Cattle breeds; Genome.
Categoria do assunto:  L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Informática Agropecuária (CNPTIA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPTIA16189 - 1UPCAP - DD

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1.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, M. V. G. B.; VANRADEN, P. M.; VAN TASSEL, C. P.; SOSTENGARD, T. S.; MATUKUMALLI, L. K.; KIM, E.; WIGGANS, G. R. Análise de associação por todo o genoma para identificar locos relacionados ao lucro líquido, à vida produtiva e ao escore de células somáticas na raça Jersey. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 46., 2009, Maringá. Anais... Maringá: SBZ, 2009.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
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2.Imagem marcado/desmarcadoLIU, G. E.; LI, R. W.; SONSTEGARD, T. S.; MATUKUMALLI, L. K.; SILVA, M. V. G. B.; VAN TASSELL, C. P. Characterization of a novel microdeletion polymorphism on BTA5 in cattle. Animal Genetics v. 39 p. 655-658
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
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3.Imagem marcado/desmarcadoVENERONI-GOUVEIA, G.; MEIRELLES, S. L.; GROSSI, D. A.; SANTIAGO, A. C.; SONSTEGARD, T. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; MATUKUMALLI, L. K.; COUTINHO, L. L.; ALENCAR, M. M. de; OLIVEIRA, H. N.; REGITANO, L. C. A. Whole-genome analysis for backfat thickness in a tropically adapted, composite cattle breed from Brazil. Animal Genetics, p. 1-7, 2011.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária.
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4.Imagem marcado/desmarcadoVENERONI-GOUVEIA, G.; MEIRELLES, S. L.; GROSSI, D. A.; SANTIAGO, A. C.; SONSTEGARD, T. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; MATUKUMALLI, L. K.; COUTINHO, L. L.; ALENCAR, M. M. de; OLIVEIRA, H. N.; REGITANO, L. C. de A. Whole-genome analysis for backfat thickness in a tropically adapted, composite cattle breed from Brazil. Animal Genetics, v.43, p. 518-524. 6p.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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5.Imagem marcado/desmarcadoVENERONI-GOUVEIA; MEIRELLES, S. L.; GROSSI, D. A.; SANTIAGO, A. C.; SONSTEGARD, T. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; MATUKUMALLI, L. K.; COUTINHO, L. L.; ALENCAR, M. M. de; OLIVEIRA, H. N.; REGITANO, L. C. de A. Whole-genome analysis for backfat thickness in a tropically adapted, composite cattle breed from Brazil Animal Genetics, v. 43, n. 3, novembro, 2011.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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6.Imagem marcado/desmarcadoLIU G. E.; HOU, Y. L.; ZHU, B.; CARDONE, M. F.; JIANG, L.; CELLAMARE, A.; MITRA, A.; ALEXANDER, L. J.; COUTINHO. L. L.; DELL'AQUILA, M. E.; GASBARRE, L. C.; LACALANDRA, G.; LI, R. W.; MATUKUMALLI, L. K.; NONNEMAN, D.; REGITANO, L. C. de A.; SMITH, T. P; SONG, J. Z.; SONSTEGARD, T. S.; Van TASSELL, C. P.; VENTURA, M.; EICHLER, E. E.; McDANELD, T. G.; KEELE, J. W. Analysis of copy number variations among diverse cattle breeds. Genome Research, v. 20, n. 5, p. 693-703, 2010
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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7.Imagem marcado/desmarcadoSNELLING, W. M.; CHIU, R.; SCHEIN, J. E.; HOBBS, M.; ABBEY, C. A.; ADELSON, D. L.; AERTS, J.; BENNETT, G. L.; BOSDET, I. E.; BOUSSAHA, M.; BRAUNING, R.; CAETANO, A. R.; COSTA, M. M.; CRAWFORD, A. M.; DALRYMPLE, B. P.; EGGEN, A.; WIND, A. E. van der; FLORIOT, S.; GAUTIER, M.; GILL, C. A.; GREEN, R. D.; HOST, R.; JANN, O.; JONES, S. J. M.; DAPPES, S. M.; KEELE, J. W.; JONG, P. J. de; LARKIN, D. M.; LEWIN, J. A.; MCEWAN, J. C.; MCKAY, S.; MARRA, M. A.; MATHEWSON, C. A.; MATUKUMALLI, L. K.; MOORE, S. S.; MURDOCH, B.; NICHOLAS, F. W.; OSOEGAWA, K.; ROY, A.; SALIH, H.; SCHIBLE, L.; SCHNAGEL, R. D.; SILVERI, L.; SKOW, L. C.; SMITH, T. P. L.; SONSTEGARD, T. S.; TAYLOR, J.; TELLAM, R.; TASSELL, C. P. van; WILLIAMS, J. L.; WOMACK, J. E.; WYE, N. H.; YANG, G.; ZHAO, S. A physical map of the bovine genome. Genome Biology, 8, p. R165, 2007.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Internacional - A
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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