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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Rondônia. |
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Data corrente: |
21/12/2009 |
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Data da última atualização: |
02/08/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PETERNELLI, L. A.; FERREIRA, F. M.; ROCHA, R. B.; BARROS, W. S.; BARBOSA, W. H. P. |
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Afiliação: |
LUIZ ALEXANDRE PETERNELLI, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; FÁBIO MEDEIROS FERREIRA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS; RODRIGO BARROS ROCHA, CPAF-RO; WILLIAN SILVA BARROS, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PELOTAS; MÁRCIO HENRIQUE PEREIRA BARBOSA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA. |
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Título: |
Análise dos coeficientes de endogamia e de parentesco para qualquer nível de ploidia usando o pacote estatístico R. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
Bragantia, Campinas, v. 68, n. 4, p. 849-855, 2009. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
São poucos os softwares disponíveis para a análise de parentesco e, até a presente data, nenhum pode realizar a análise de parentesco para organismos poliplóides, com número par (2k) de cromossomos. Implementou-se junto ao programa R uma rotina capaz de executar a análise de parentesco para qualquer nível 2k de ploidia, número de indivíduos (ou populações) e número de gerações envolvidas na árvore genealógica. A função principal, calc.rxy() calcula o coeficiente de endogamia (F X) de cada indivíduo; coeficientes de parentesco (rXY) entre dois indivíduos quaisquer; e coeficiente de parentesco médio, variância, mínimo e máximo, para cada indivíduo. Ela pode mostrar a matriz completa de parentesco ou uma submatriz pré-definida de indivíduos selecionados. Adicionalmente, foram incluidas funções que servem para identificar erros de redundância dos dados originais (checar.nomes()) e para identificar os pares de indivíduos com rXY superior a certo limite especificado pelo pesquisador (corte.rxy()). Essas funções podem ser usadas na análise de pedigrees com um número elevado de indivíduos e poderão ser utilizadas pela comunidade científica livremente, sem restrições à plataforma operacional utilizada. Destaca-se a vantagem em se poder trabalhar com qualquer nível 2k de ploidia, mesmo quando existe a possibilidade de certo indivíduo ser oriundo de autofecundação, aspecto comum em várias espécies vegetais. |
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Thesagro: |
Endogamia. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/bitstream/doc/710761/1/ANALISE-DOS-COEFICIENTES.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Rondônia (CPAF-RO) |
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