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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
26/12/2008 |
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Data da última atualização: |
20/10/2014 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
CARVALHO, F. M.; BARIONI JUNIOR, W.; NAKATA, L. C.; REGITANO, L. C. de A. |
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Afiliação: |
F. M. Carvalho, Pós-graduando UFSCar; WALDOMIRO BARIONI JUNIOR, CPPSE; L. C. Nakata, UFSCar; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
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Título: |
Avaliação de testes estatísticos em dados de Q-PCR. |
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Ano de publicação: |
2008 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Resumos... Salvador: SBG, 2008 |
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Páginas: |
p. 410 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
A Q-PCR (Quantitative Polymerase Chain Reaction) é uma técnica que permite quantificar de forma precisa, especifica e indireta a quantidade de RNA mensageiro presente em uma determinada amostra. A Q-PCR apresenta vantagens metodológicas para a quantificação do RNA mensageiro quando comparada às técnicas de Northern Blot e Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction, facilitando estudos de expressão gênica diferenciada. No entanto, experimentos de Q-PCR freqüentemente apresentam limitações amostrais (6= N =12) e são analisados por testes estatísticos tradicionais (paramétricos) sem a devida verificação da condição de normalidade da variável resposta e de homogeneidade das variâncias dos grupos experimentais, exigidas nesses testes. O presente trabalho avaliou quatro testes estatísticos de comparação de médias e/ou medianas, entre os grupos controle(C) e tratado (T), com objetivo de propor o teste mais adequado para estudar expressão gênica com dados de Q-PCR. O experimento foi realizado na Embrapa Pecuária Sudeste ? São Carlos, Brasil, utilizando 10 bezerros Nelore (Bos indicus), divididos aleatoriamente em dois grupos de cinco animais: grupo tratado (T) infestado artificialmente com carrapatos Rhipicephalus (Boophilus) microplus e grupo controle (C) livre de infestação. Os dados foram submetidos a quatro diferentes testes estatísticos, sendo o primeiro paramétrico (ANOVA com teste t) e os demais não-paramétricos (teste de mediana, boot strap, e Rest.). Quando o gene referência (gene de expressão constitutiva) apresentou pequena variação entre os tratamentos (0,6 = P = 1) os testes estatísticos, com exceção do teste de mediana, apresentaram valores de probabilidade confiáveis e semelhantes. Porém, quando o gene referência apresentou variação entre os tratamentos (P = 0,6) todos os testes apresentaram resultados distintos, e o teste Rest©, não-paramétrico, de comparações das médias e com ajustes para eficiência de amplificação do primer e valores de probabilidade do gene referência, foi o mais adequado para analisar dados de Q-PCR. MenosA Q-PCR (Quantitative Polymerase Chain Reaction) é uma técnica que permite quantificar de forma precisa, especifica e indireta a quantidade de RNA mensageiro presente em uma determinada amostra. A Q-PCR apresenta vantagens metodológicas para a quantificação do RNA mensageiro quando comparada às técnicas de Northern Blot e Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction, facilitando estudos de expressão gênica diferenciada. No entanto, experimentos de Q-PCR freqüentemente apresentam limitações amostrais (6= N =12) e são analisados por testes estatísticos tradicionais (paramétricos) sem a devida verificação da condição de normalidade da variável resposta e de homogeneidade das variâncias dos grupos experimentais, exigidas nesses testes. O presente trabalho avaliou quatro testes estatísticos de comparação de médias e/ou medianas, entre os grupos controle(C) e tratado (T), com objetivo de propor o teste mais adequado para estudar expressão gênica com dados de Q-PCR. O experimento foi realizado na Embrapa Pecuária Sudeste ? São Carlos, Brasil, utilizando 10 bezerros Nelore (Bos indicus), divididos aleatoriamente em dois grupos de cinco animais: grupo tratado (T) infestado artificialmente com carrapatos Rhipicephalus (Boophilus) microplus e grupo controle (C) livre de infestação. Os dados foram submetidos a quatro diferentes testes estatísticos, sendo o primeiro paramétrico (ANOVA com teste t) e os demais não-paramétricos (teste de mediana, boot strap, e Rest.). Quando o gene refe... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Bovinos; Estatística não paramétrica; Q-PCR. |
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Thesagro: |
Boophilus Microplus; Bos Indicus. |
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Thesaurus Nal: |
Rhipicephalus. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/110193/1/PROCILCdeA2006.00198.PDF
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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| Registros recuperados : 3 | |
| 3. |  | DEON, M. D.; CASTRO, J. M. da C. e; AIDAR, S. de T.; CHAVES, A. R. de M.; SOUZA, F. de F.; SILVA, D. J. Índice de clorofila e diagnose nutricional de aceroleiras afetadas por nematoides. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 30.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 14.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 12.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 9.; SIMPÓSIO SOBRE SELÊNIO NO BRASIL, 1., 2012, Maceió. A responsabilidade socioambiental da pesquisa agrícola: anais. Viçosa, MG: SBCS, 2012. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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