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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Meio Ambiente. |
Data corrente: |
04/06/1998 |
Data da última atualização: |
04/11/2019 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
Autoria: |
MELO, I. S. de. |
Afiliação: |
ITAMAR SOARES DE MELO, CNPMA. |
Título: |
Estratégias ecológicas para melhorar a eficácia do controle biológico de fitopatógenos. |
Ano de publicação: |
1998 |
Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO DE CONTROLE BIOLÓGICO, 6., 1998, Rio de Janeiro. Anais: conferências e mesas-redondas. Rio de Janeiro: FIOCRUZ/EMBRAPA, 1998. p.362-365. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Os organismos vivos são de difícil manipulação. Diferentemente dos pesticidas químicos, os agentes de controle biológico (ACBs) são extremamente susceptíveis as mudanças de ambiente. O conhecimento dos fatores epidemiológicos e ecológicos requeridos pelos ACBs desempenham papel chave na determinação do sucesso do controle biológico. E possível, todavia, oferecer todas as vantagens aos ACBs para garantir o sucesso. Isso significa dizer que e necessário ter suficiente conhecimento sobre os ACBs para favorecer seu crescimento, metabolismo e sobrevivência. Para cada introdução, fatores abióticos do solo, como textura, pH, temperatura, conteudo de umidade de disponibilidade de substrato necessitam ser monitorados, já que eles determinam a sobrevivência e atividade dos organismos introduzidos. Alem dos efeitos diretos dos fatores ambientais sobre a atividade dos ACBs, o ambiente pode também afetar a taxa de exsudação por raízes de plantas e composição dos exsudados, que por sua vez influencia as interações planta-microrganismo e microrganismo-microrganisno. Já os fatores bióticos que influenciam a sobrevivência de microrganismo no solo são: predação, competição e o tipo de cultura, alem dos próprios fatores fisiológicos intrínsecos dos organismos. Um fator importante, responsável por falhas ou inconsistências no controle biológico refere-se ao rápido declínio do tamanho da população de células ativas a níveis não suficientes para controlar o patógeno. Desde que os patógenos estão a mercê de certos estádios de desenvolvimento das plantas ou de condições climáticas diversas, o controle biológico e, pois, dependente das condições temporais. Em um programa de biocontrole, a atividade do ACB deve ser, então, sincronizada com a máxima atividade (no tempo e espaço) do patógeno. Por exemplo, ACBs usados contra espécies de Pythium deveriam ter máxima atividade no estádio de maior susceptibilidade da planta o estádio juvenil. Um dos atributos mais importantes de um ACB e ele ser ativo no ambiente conducente ao desenvolvimento do patógeno. Aqui, devem-se incluir todos os caracteres que contribuem para o pleno estabelecimento do ACB como: competitividade saprofítica e adaptabilidade. MenosOs organismos vivos são de difícil manipulação. Diferentemente dos pesticidas químicos, os agentes de controle biológico (ACBs) são extremamente susceptíveis as mudanças de ambiente. O conhecimento dos fatores epidemiológicos e ecológicos requeridos pelos ACBs desempenham papel chave na determinação do sucesso do controle biológico. E possível, todavia, oferecer todas as vantagens aos ACBs para garantir o sucesso. Isso significa dizer que e necessário ter suficiente conhecimento sobre os ACBs para favorecer seu crescimento, metabolismo e sobrevivência. Para cada introdução, fatores abióticos do solo, como textura, pH, temperatura, conteudo de umidade de disponibilidade de substrato necessitam ser monitorados, já que eles determinam a sobrevivência e atividade dos organismos introduzidos. Alem dos efeitos diretos dos fatores ambientais sobre a atividade dos ACBs, o ambiente pode também afetar a taxa de exsudação por raízes de plantas e composição dos exsudados, que por sua vez influencia as interações planta-microrganismo e microrganismo-microrganisno. Já os fatores bióticos que influenciam a sobrevivência de microrganismo no solo são: predação, competição e o tipo de cultura, alem dos próprios fatores fisiológicos intrínsecos dos organismos. Um fator importante, responsável por falhas ou inconsistências no controle biológico refere-se ao rápido declínio do tamanho da população de células ativas a níveis não suficientes para controlar o patógeno. Desde que os patógenos estão ... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Rizobacteria. |
Thesagro: |
Bactéria; Carbono; Controle Biológico; Ferro; Formulação; Hospedeiro; Nitrogênio; Rhizobium; Trichoderma. |
Thesaurus Nal: |
Azospirillum; mancozeb; Pseudomonas. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/204232/1/1998PL-Melo-Estrategias-3483.pdf
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Marc: |
LEADER 03110nam a2200265 a 4500 001 1012922 005 2019-11-04 008 1998 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aMELO, I. S. de 245 $aEstratégias ecológicas para melhorar a eficácia do controle biológico de fitopatógenos.$h[electronic resource] 260 $aIn: SIMPÓSIO DE CONTROLE BIOLÓGICO, 6., 1998, Rio de Janeiro. Anais: conferências e mesas-redondas. Rio de Janeiro: FIOCRUZ/EMBRAPA, 1998. p.362-365.$c1998 520 $aOs organismos vivos são de difícil manipulação. Diferentemente dos pesticidas químicos, os agentes de controle biológico (ACBs) são extremamente susceptíveis as mudanças de ambiente. O conhecimento dos fatores epidemiológicos e ecológicos requeridos pelos ACBs desempenham papel chave na determinação do sucesso do controle biológico. E possível, todavia, oferecer todas as vantagens aos ACBs para garantir o sucesso. Isso significa dizer que e necessário ter suficiente conhecimento sobre os ACBs para favorecer seu crescimento, metabolismo e sobrevivência. Para cada introdução, fatores abióticos do solo, como textura, pH, temperatura, conteudo de umidade de disponibilidade de substrato necessitam ser monitorados, já que eles determinam a sobrevivência e atividade dos organismos introduzidos. Alem dos efeitos diretos dos fatores ambientais sobre a atividade dos ACBs, o ambiente pode também afetar a taxa de exsudação por raízes de plantas e composição dos exsudados, que por sua vez influencia as interações planta-microrganismo e microrganismo-microrganisno. Já os fatores bióticos que influenciam a sobrevivência de microrganismo no solo são: predação, competição e o tipo de cultura, alem dos próprios fatores fisiológicos intrínsecos dos organismos. Um fator importante, responsável por falhas ou inconsistências no controle biológico refere-se ao rápido declínio do tamanho da população de células ativas a níveis não suficientes para controlar o patógeno. Desde que os patógenos estão a mercê de certos estádios de desenvolvimento das plantas ou de condições climáticas diversas, o controle biológico e, pois, dependente das condições temporais. Em um programa de biocontrole, a atividade do ACB deve ser, então, sincronizada com a máxima atividade (no tempo e espaço) do patógeno. Por exemplo, ACBs usados contra espécies de Pythium deveriam ter máxima atividade no estádio de maior susceptibilidade da planta o estádio juvenil. Um dos atributos mais importantes de um ACB e ele ser ativo no ambiente conducente ao desenvolvimento do patógeno. Aqui, devem-se incluir todos os caracteres que contribuem para o pleno estabelecimento do ACB como: competitividade saprofítica e adaptabilidade. 650 $aAzospirillum 650 $amancozeb 650 $aPseudomonas 650 $aBactéria 650 $aCarbono 650 $aControle Biológico 650 $aFerro 650 $aFormulação 650 $aHospedeiro 650 $aNitrogênio 650 $aRhizobium 650 $aTrichoderma 653 $aRizobacteria
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Registro original: |
Embrapa Meio Ambiente (CNPMA) |
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URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
Data corrente: |
03/08/2021 |
Data da última atualização: |
03/08/2021 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
A - 1 |
Autoria: |
FERNANDES, A. C.; SILVA, V. H. da; GOES, C. P.; MOREIRA, G. C. M.; GODOY, T. F.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C.; REZENDE, F. M. de; COUTINHO, L. L. |
Afiliação: |
ANNA CAROLINA FERNANDES, ESALQ; VINICIUS HENRIQUE DA SILVA, ESALQ; CAROLINA PURCELL GOES, ESALQ; GABRIEL COSTA MONTEIRO MOREIRA, University of Liège; THAIS FERNANDA GODOY, ESALQ; ADRIANA MERCIA GUARATINI IBELLI, CNPSA; JANE DE OLIVEIRA PEIXOTO, CNPSA; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA; FERNANDA MARCONDES REZENDE, University of Florida; LUIZ LEHMANN COUTINHO, ESALQ. |
Título: |
Genome-wide detection of CNVs and their association with performance traits in broilers. |
Ano de publicação: |
2021 |
Fonte/Imprenta: |
BMC Genomics, v. 22, n. 354, 2021. |
DOI: |
https://doi.org/10.1186/s12864-021-07676-1 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Abstract Background: Copy number variations (CNVs) are a major type of structural genomic variants that underlie genetic architecture and phenotypic variation of complex traits, not only in humans, but also in livestock animals. We identified CNVs along the chicken genome and analyzed their association with performance traits. Genome-wide CNVs were inferred from Affymetrix® high density SNP-chip data for a broiler population. CNVs were concatenated into segments and association analyses were performed with linear mixed models considering a genomic relationship matrix, for birth weight, body weight at 21, 35, 41 and 42 days, feed intake from 35 to 41 days, feed conversion ratio from 35 to 41 days and, body weight gain from 35 to 41 days of age. Results: We identified 23,214 autosomal CNVs, merged into 5042 distinct CNV regions (CNVRs), covering 12.84% of the chicken autosomal genome. One significant CNV segment was associated with BWG on GGA3 (q-value = 0.00443); one significant CNV segment was associated with BW35 (q-value = 0.00571), BW41 (q-value = 0.00180) and BW42 (q-value = 0.00130) on GGA3, and one significant CNV segment was associated with BW on GGA5 (q-value = 0.00432). All significant CNV segments were verified by qPCR, and a validation rate of 92.59% was observed. These CNV segments are located nearby genes, such as KCNJ11, MyoD1 and SOX6, known to underlie growth and development. Moreover, gene-set analyses revealed terms linked with muscle physiology, cellular processes regulation and potassium channels. Conclusions: Overall, this CNV-based GWAS study unravels potential candidate genes that may regulate performance traits in chickens. Our findings provide a foundation for future functional studies on the role of specific genes in regulating performance in chickens. Keywords: GWAS, Performance, CNVs, QTLs, qPCR MenosAbstract Background: Copy number variations (CNVs) are a major type of structural genomic variants that underlie genetic architecture and phenotypic variation of complex traits, not only in humans, but also in livestock animals. We identified CNVs along the chicken genome and analyzed their association with performance traits. Genome-wide CNVs were inferred from Affymetrix® high density SNP-chip data for a broiler population. CNVs were concatenated into segments and association analyses were performed with linear mixed models considering a genomic relationship matrix, for birth weight, body weight at 21, 35, 41 and 42 days, feed intake from 35 to 41 days, feed conversion ratio from 35 to 41 days and, body weight gain from 35 to 41 days of age. Results: We identified 23,214 autosomal CNVs, merged into 5042 distinct CNV regions (CNVRs), covering 12.84% of the chicken autosomal genome. One significant CNV segment was associated with BWG on GGA3 (q-value = 0.00443); one significant CNV segment was associated with BW35 (q-value = 0.00571), BW41 (q-value = 0.00180) and BW42 (q-value = 0.00130) on GGA3, and one significant CNV segment was associated with BW on GGA5 (q-value = 0.00432). All significant CNV segments were verified by qPCR, and a validation rate of 92.59% was observed. These CNV segments are located nearby genes, such as KCNJ11, MyoD1 and SOX6, known to underlie growth and development. Moreover, gene-set analyses revealed terms linked with muscle physiology, cellular p... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
CNVs; Copy number variations; Desempenho zootécnico; GWAS; QPCR; QTLs. |
Thesagro: |
Gallus Domesticus; Genética Animal; Performance. |
Thesaurus NAL: |
Animal genetics; Animal performance; Gallus gallus; Genome-wide association study; Quantitative polymerase chain reaction; Quantitative trait loci. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/224781/1/final9547.pdf
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Marc: |
LEADER 03101naa a2200433 a 4500 001 2133197 005 2021-08-03 008 2021 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1186/s12864-021-07676-1$2DOI 100 1 $aFERNANDES, A. C. 245 $aGenome-wide detection of CNVs and their association with performance traits in broilers.$h[electronic resource] 260 $c2021 520 $aAbstract Background: Copy number variations (CNVs) are a major type of structural genomic variants that underlie genetic architecture and phenotypic variation of complex traits, not only in humans, but also in livestock animals. We identified CNVs along the chicken genome and analyzed their association with performance traits. Genome-wide CNVs were inferred from Affymetrix® high density SNP-chip data for a broiler population. CNVs were concatenated into segments and association analyses were performed with linear mixed models considering a genomic relationship matrix, for birth weight, body weight at 21, 35, 41 and 42 days, feed intake from 35 to 41 days, feed conversion ratio from 35 to 41 days and, body weight gain from 35 to 41 days of age. Results: We identified 23,214 autosomal CNVs, merged into 5042 distinct CNV regions (CNVRs), covering 12.84% of the chicken autosomal genome. One significant CNV segment was associated with BWG on GGA3 (q-value = 0.00443); one significant CNV segment was associated with BW35 (q-value = 0.00571), BW41 (q-value = 0.00180) and BW42 (q-value = 0.00130) on GGA3, and one significant CNV segment was associated with BW on GGA5 (q-value = 0.00432). All significant CNV segments were verified by qPCR, and a validation rate of 92.59% was observed. These CNV segments are located nearby genes, such as KCNJ11, MyoD1 and SOX6, known to underlie growth and development. Moreover, gene-set analyses revealed terms linked with muscle physiology, cellular processes regulation and potassium channels. Conclusions: Overall, this CNV-based GWAS study unravels potential candidate genes that may regulate performance traits in chickens. Our findings provide a foundation for future functional studies on the role of specific genes in regulating performance in chickens. Keywords: GWAS, Performance, CNVs, QTLs, qPCR 650 $aAnimal genetics 650 $aAnimal performance 650 $aGallus gallus 650 $aGenome-wide association study 650 $aQuantitative polymerase chain reaction 650 $aQuantitative trait loci 650 $aGallus Domesticus 650 $aGenética Animal 650 $aPerformance 653 $aCNVs 653 $aCopy number variations 653 $aDesempenho zootécnico 653 $aGWAS 653 $aQPCR 653 $aQTLs 700 1 $aSILVA, V. H. da 700 1 $aGOES, C. P. 700 1 $aMOREIRA, G. C. M. 700 1 $aGODOY, T. F. 700 1 $aIBELLI, A. M. G. 700 1 $aPEIXOTO, J. de O. 700 1 $aCANTAO, M. E. 700 1 $aLEDUR, M. C. 700 1 $aREZENDE, F. M. de 700 1 $aCOUTINHO, L. L. 773 $tBMC Genomics$gv. 22, n. 354, 2021.
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Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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