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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
Data corrente: |
21/08/2023 |
Data da última atualização: |
21/08/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
OTTO, P. I.; GUIMARÃES, S. E. F.; CALUS, M. P. L.; VANDENPLAS, J.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; SILVA, M. V. G. B. |
Afiliação: |
PAMELA I. OTTO, Universidade Federal de Viçosa; SIMONE E. F. GUIMARÃES, Universidade Federal de Viçosa; MARIO P. L. CALUS, Wageningen University & Research; JEREMIE VANDENPLAS, Wageningen University & Research; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; JOAO CLAUDIO DO CARMO PANETTO, CNPGL; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL. |
Título: |
Single-step genome-wide association studies (GWAS) and post-GWAS analyses to identify genomic regions and candidate genes for milk yield in Brazilian Girolando cattle. |
Ano de publicação: |
2020 |
Fonte/Imprenta: |
Journal of Dairy Science, v. 103, n. 11, p. 10347-10360, 2020. |
DOI: |
https://doi.org/10.3168/jds.2019-17890 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Milk production is economically important to the Brazilian agribusiness, and the majority of the country's milk production derives from Girolando (Gir × Holstein) cows. This study aimed to identify quantitative trait loci (QTL) and candidate genes associated with 305-d milk yield (305MY) in Girolando cattle. In addition, we investigated the SNP-specific variances for Holstein and Gir breeds of origin within the sequence of candidate genes. A single-step genomic BLUP procedure was used to identify QTL associated with 305MY, and the most likely candidate genes were identified through follow-up analyses. Genomic breeding values specific for Holstein and Gir were estimated in the Girolando animals using a model that uses breed-specific partial relationship matrices, which were converted to breed of origin SNP effects. Differences between breed of origin were evaluated by comparing estimated SNP variances between breeds. From 10 genome regions explaining most additive genetic variance for 305MY in Girolando cattle, 7 candidate genes were identified on chromosomes 1, 4, 6, and 26. Within the sequence of these 7 candidate genes, Gir breed of origin SNP alleles showed the highest genetic variance. These results indicated QTL regions that could be further explored in genomic selection panels and which may also help in understanding the gene mechanisms involved in milk production in the Girolando breed. |
Thesagro: |
Gado Gir; Gado Leiteiro; Gene; Produção Leiteira. |
Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
Marc: |
LEADER 02266naa a2200253 a 4500 001 2156012 005 2023-08-21 008 2020 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.3168/jds.2019-17890$2DOI 100 1 $aOTTO, P. I. 245 $aSingle-step genome-wide association studies (GWAS) and post-GWAS analyses to identify genomic regions and candidate genes for milk yield in Brazilian Girolando cattle.$h[electronic resource] 260 $c2020 520 $aMilk production is economically important to the Brazilian agribusiness, and the majority of the country's milk production derives from Girolando (Gir × Holstein) cows. This study aimed to identify quantitative trait loci (QTL) and candidate genes associated with 305-d milk yield (305MY) in Girolando cattle. In addition, we investigated the SNP-specific variances for Holstein and Gir breeds of origin within the sequence of candidate genes. A single-step genomic BLUP procedure was used to identify QTL associated with 305MY, and the most likely candidate genes were identified through follow-up analyses. Genomic breeding values specific for Holstein and Gir were estimated in the Girolando animals using a model that uses breed-specific partial relationship matrices, which were converted to breed of origin SNP effects. Differences between breed of origin were evaluated by comparing estimated SNP variances between breeds. From 10 genome regions explaining most additive genetic variance for 305MY in Girolando cattle, 7 candidate genes were identified on chromosomes 1, 4, 6, and 26. Within the sequence of these 7 candidate genes, Gir breed of origin SNP alleles showed the highest genetic variance. These results indicated QTL regions that could be further explored in genomic selection panels and which may also help in understanding the gene mechanisms involved in milk production in the Girolando breed. 650 $aGado Gir 650 $aGado Leiteiro 650 $aGene 650 $aProdução Leiteira 700 1 $aGUIMARÃES, S. E. F. 700 1 $aCALUS, M. P. L. 700 1 $aVANDENPLAS, J. 700 1 $aMACHADO, M. A. 700 1 $aPANETTO, J. C. do C. 700 1 $aSILVA, M. V. G. B. 773 $tJournal of Dairy Science$gv. 103, n. 11, p. 10347-10360, 2020.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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Registros recuperados : 48 | |
1. | | ALENCAR, E. R. de; FARONI, L. R. D'A.; FERREIRA, L. G.; COSTA, A. R. da; PIMENTEL, M. A. G. Qualidade de milho armazenado e infestado por Sitophilus zeamais E Tribolium castaneum. Engenharia na Agricultura, Viçosa, MG, v. 19, n. 1, p. 9-18, jan./fev. 2011.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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2. | | CARVALHO, G. D.; MADARI, B. E.; CARVALHO, M. T. de M.; SILVA, M. A. S. da; SANTOS, A. B. dos; COSTA, A. R. da; CORRÊA, R. S.; OLIVEIRA, J. de M.; LEAL, W. G. de O.; SOUZA, D. M. de; MATSUSHIGE, I.; SANTOS, R. C. G. dos. Impacto do manejo da adubação nitrogenada sobre a emissão de gás de efeito estufa óxido nitroso e a produtividade de arroz irrigado no Cerrado. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2018. 23 p. il. (Embrapa Arroz e Feijão. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 52).Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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3. | | CARVALHO, G. D.; MADARI, B. E.; SANTOS, A. B. dos; SILVA, M. A. S. da; COSTA, A. R. da; CORRÊA, R. dos S.; LEAL, W. G. de O.; SOUZA, D. M. de; SANTOS, R. C. G. dos; MATSUSHIGE, I. Perda de nitrogênio em arroz (Oryza sativa L.) irrigado em várzea tropical. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 8., 2014, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2014. p. 111. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 306).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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4. | | CARVALHO, G. D.; MADARI, B. E.; SANTOS, A. B. dos; SILVA, M. A. S. da; COSTA, A. R. da; CORRÊA, R. S. Fluxos de óxido nitroso em arroz irrigado em várzea tropical. In: CONFERENCIA INTERNACIONAL DO ARROZ PARA AMÉRICA LATINA E CARIBE, 12., 2015, Porto Alegre. Horizonte para a competitividade: anais. Porto Alegre: IRGA, 2015.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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5. | | CARVALHO, G. D.; MADARI, B. E.; SANTOS, A. B. dos; SILVA, M. A. S. da; COSTA, A. R. da; CORRÊA, R. S.; LEAL, W. G. de O. Emissão de óxido nitroso em sistema de produção de arroz irrigado em várzea tropical. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 9., 2015, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2015. p. 107. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 309).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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6. | | CARVALHO, M. T. de M.; MADARI, B. E.; ALVES, B. J. R.; LEAL, W. G. de O.; LANNA, A. C.; MOREIRA, J. A. A.; MACHADO, P. L. O. de A.; COSTA, A. R. da; SILVA, J. H. da; SOUZA, D. M. de. Emissão de N2O e volatilização de NH3 em sistema de produção de feijoeiro comum irrigado em Latossolo no Cerrado. In: SIMPÓSIO BRASIL-ALEMANHA, 4., 2009, Curitiba. Desenvolvimento sustentável. [Curitiba]:CCIBA: UFPR, 2009. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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7. | | CARVALHO, M. T. de M.; MADARI, B. E.; ALVES, B. J. R.; LEAL, W. G. O.; LANNA, A. C.; MOREIRA, J. A. A.; MACHADO, P. L. O. de A.; COSTA, A. R. da; SILVA, J. H. da; SOUZA, D. M. de. Emissão de N2O e volatilização de NH3 em sistema de produção de feijoeiro comum irrigado em Latossolo no Cerrado. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2008. 23 p. (Embrapa Arroz e Feijão. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 32).Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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8. | | CARVALHO, M. T. de M.; MADARI, B. E.; ALVES, B. J. R.; MOREIRA, J. A. A.; LEAL, W. G. de O.; COSTA, A. R. da; CUNHA, M. B. da; SILVA, J. H. da; SOUZA, D. M. de; MACHADO, P. L. O. de A. Emissão de óxido nitroso na produção de feijoeiro comum irrigado cultivado em plantio direto em latossolo de cerrado. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 9., 2008, Campinas. Ciência e tecnologia na cadeia produtiva do feijão. Campinas: Instituto Agronômico, 2008. (IAC. Documentos, 85).Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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9. | | CARVALHO, M. T. de M.; MADARI, B. E.; LEAL, W. G. de O.; COSTA, A. R. da; MACHADO, P. L. O. de A.; SILVEIRA, P. M. da; MOREIRA, J. A. A.; HEINEMANN, A. B. Nitrogen fluxes from irrigated common-bean as affected by mulching and mineral fertilization. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 48, n. 5, p. 478-486, maio 2013.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Unidades Centrais. |
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11. | | CARVALHO, M. T. de M.; MADARI, B. E.; SILVEIRA, P. M. da; OLIVEIRA, J. P. de; LEAL, W. G. de O.; LIMA, J. E. S.; SILVA, J. H. da; WISINTAINER, C.; COSTA, A. R. da. Perda de nitrogênio por volatilização de amônia na produção de feijoeiro comum irrigado cultivado em plantio direto em latossolo de cerrado. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 9., 2008, Campinas. Ciência e tecnologia na cadeia produtiva do feijão. Campinas: Instituto Agronômico, 2008. (IAC. Documentos, 85).Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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13. | | CORRÊA, R. S.; MADARI, B. E.; CARVALHO, G. D.; COSTA, A. R. da; PEREIRA, A. C. de C.; MEDEIROS, J. C. Fluxos de óxido nitroso e suas relações com atributos físicos e químicos do solo. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 51, n. 9, p. 1148-1155, set. 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Unidades Centrais. |
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14. | | CORRÊA, R. S.; MADARI, B. E.; MEDEIROS, J. C.; CARVALHO, G. D.; COSTA, A. R. da; PEREIRA, A. C. de C. Comportamento dos fluxos de N2O do solo sob pastagem de Urochloa ruziziensis. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 9., 2015, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2015. p. 27 (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 309).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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15. | | CORRÊA, R. S.; MADARI, B. E.; MEDEIROS, J. C.; CARVALHO, G. D.; COSTA, A. R. da; PEREIRA, A. C. de C. Fluxes of N2O in pasture of Urochloa spp. under integrated crop-livestock management. In: WORLD CONGRESS ON INTEGRATED CROP-LIVESTOCK-FOREST SYSTEMS; INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON INTEGRATED CROP-LIVESTOCK SYSTEMS, 3., 2015, Brasília, DF. Towards sustainable intensification: proceedings. Brasília, DF: Embrapa, 2015.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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16. | | CORRÊA, R. S.; MEDEIROS, J. C.; MADARI, B. E.; CARVALHO, G. D.; COSTA, A. R. da. Distribuição dos fluxos de n2o ao longo do dia em latossolo vermelho no cerrado. In: ENCONTRO BRASILEIRO DE SUBSTÂNCIAS HÚMICAS, 10., 2013, Santo Antônio de Goiás. Matéria orgânica e qualidade ambiental: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2013. p. 153-156.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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18. | | COSTA, A. R. da; CARVALHO, M. T. de M.; MADARI, B. E.; LANNA, A. C.; OLIVEIRA, J. P. de; SILVA, J. H. da; SANTOS, J. L. S.; FERNANDES, E. P. Biomassa microbiana do solo cultivado com feijoeiro comum irrigado em plantio direto. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 9., 2008, Campinas. Ciência e tecnologia na cadeia produtiva do feijão. Campinas: Instituto Agronômico, 2008. (IAC. Documentos, 85).Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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20. | | COSTA, A. R. da; CUNHA, M. B. da; MARTINS, D. R.; SANTOS, J. H. G. dos; MADARI, B. E.; MACHADO, P. L. O. de A.; ALVES, B. J. R.; JANTALIA, C. P. Emissão de óxido nitroso derivada da cultura do feijoeiro comum irrigado sob plantio direto em um latossolo dos cerrados de Santo Antônio de Goiás-GO. In: CONGRESSO DE PESQUISA, ENSINO E EXTENSÃO, 4., 2007, Goiânia. Ciência, educação e compromisso social: anais... Goiânia: Universidade Federal de Goiás, 2007.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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