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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
Data corrente: |
28/11/2022 |
Data da última atualização: |
06/12/2022 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
PINHEIRO, T. D. M.; REGO, E. C. S.; ALVES, G. S. C.; FONSECA, F. C. de A.; COTTA, M. G.; ANTONINO, J. D.; GOMES, T. G.; AMORIM, E. P.; FERREIRA, C. F.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; TOGAWA, R. C.; MILLER, R. N. G. |
Afiliação: |
TATIANA DAVID MIRANDA PINHEIRO, Universidade de Brasília; ERICA CRISTINA SILVA REGO, Universidade de Brasília; GABRIEL SERGIO COSTA ALVES, Universidade de Brasília; FERNANDO CAMPOS DE ASSIS FONSECA, Instituto Federal de Goiás; MICHELLE GUITTON COTTA, Universidade de Brasília; JOSE DIJAIR ANTONINO, Universidade Federal Rural de Pernambuco; TAÍSA GODOY GOMES, Universidade de Brasília; EDSON PERITO AMORIM, CNPMF; CLAUDIA FORTES FERREIRA, CNPMF; MARCOS MOTA DO CARMO COSTA, Cenargen; PRISCILA GRYNBERG, Cenargen; ROBERTO COITI TOGAWA, Cenargen; ROBERT NEIL GERARD MILLER, Universidade de Brasília. |
Título: |
Transcriptome profiling of the resistance response of Musa acuminata subsp. burmannicoides, var. Calcutta 4 to Pseudocercospora musae. |
Ano de publicação: |
2022 |
Fonte/Imprenta: |
International Journal of Molecular Sciences, v. 23, 2022. 13589. |
DOI: |
https://doi.org/10.3390/ijms232113589 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Banana (Musa spp.), which is one of the world's most popular and most traded fruits, is highly susceptible to pests and diseases. Pseudocercospora musae, responsible for Sigatoka leaf spot disease, is a principal fungal pathogen of Musa spp., resulting in serious economic damage to cultivars in the Cavendish subgroup. The aim of this study was to characterize genetic components of the early immune response to P. musae in Musa acuminata subsp. burmannicoides, var. Calcutta 4, a resistant wild diploid. Leaf RNA samples were extracted from Calcutta 4 three days after inoculation with fungal conidiospores, with paired-end sequencing conducted in inoculated and non-inoculated controls using lllumina HiSeq 4000 technology. Following mapping to the reference M. acuminata ssp. malaccensis var. Pahang genome, differentially expressed genes (DEGs) were identified and expression representation analyzed on the basis of gene ontology enrichment, Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes orthology and MapMan pathway analysis. Sequence data mapped to 29,757 gene transcript models in the reference Musa genome. A total of 1073 DEGs were identified in pathogen-inoculated cDNA libraries, in comparison to non-inoculated controls, with 32% overexpressed. GO enrichment analysis revealed common assignment to terms that included chitin binding, chitinase activity, pattern binding, oxidoreductase activity and transcription factor (TF) activity. Allocation to KEGG pathways revealed DEGs associated with environmental information processing, signaling, biosynthesis of secondary metabolites, and metabolism of terpenoids and polyketides. With 144 up-regulated DEGs potentially involved in biotic stress response pathways, including genes involved in cell wall reinforcement, PTI responses, TF regulation, phytohormone signaling and secondary metabolism, data demonstrated diverse early-stage defense responses to P. musae. With increased understanding of the defense responses occurring during the incompatible interaction in resistant Calcutta 4, these data are appropriate for the development of effective disease management approaches based on genetic improvement through introgression of candidate genes in superior cultivars. MenosBanana (Musa spp.), which is one of the world's most popular and most traded fruits, is highly susceptible to pests and diseases. Pseudocercospora musae, responsible for Sigatoka leaf spot disease, is a principal fungal pathogen of Musa spp., resulting in serious economic damage to cultivars in the Cavendish subgroup. The aim of this study was to characterize genetic components of the early immune response to P. musae in Musa acuminata subsp. burmannicoides, var. Calcutta 4, a resistant wild diploid. Leaf RNA samples were extracted from Calcutta 4 three days after inoculation with fungal conidiospores, with paired-end sequencing conducted in inoculated and non-inoculated controls using lllumina HiSeq 4000 technology. Following mapping to the reference M. acuminata ssp. malaccensis var. Pahang genome, differentially expressed genes (DEGs) were identified and expression representation analyzed on the basis of gene ontology enrichment, Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes orthology and MapMan pathway analysis. Sequence data mapped to 29,757 gene transcript models in the reference Musa genome. A total of 1073 DEGs were identified in pathogen-inoculated cDNA libraries, in comparison to non-inoculated controls, with 32% overexpressed. GO enrichment analysis revealed common assignment to terms that included chitin binding, chitinase activity, pattern binding, oxidoreductase activity and transcription factor (TF) activity. Allocation to KEGG pathways revealed DEGs associated with... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Pseudocercospora musae; Sigatoka leaf spot. |
Thesagro: |
Musa Acuminata. |
Thesaurus Nal: |
Biotic stress; Disease resistance; Transcriptome. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1149287/1/ijms-23-13589.pdf
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Marc: |
LEADER 03314naa a2200349 a 4500 001 2149287 005 2022-12-06 008 2022 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.3390/ijms232113589$2DOI 100 1 $aPINHEIRO, T. D. M. 245 $aTranscriptome profiling of the resistance response of Musa acuminata subsp. burmannicoides, var. Calcutta 4 to Pseudocercospora musae.$h[electronic resource] 260 $c2022 520 $aBanana (Musa spp.), which is one of the world's most popular and most traded fruits, is highly susceptible to pests and diseases. Pseudocercospora musae, responsible for Sigatoka leaf spot disease, is a principal fungal pathogen of Musa spp., resulting in serious economic damage to cultivars in the Cavendish subgroup. The aim of this study was to characterize genetic components of the early immune response to P. musae in Musa acuminata subsp. burmannicoides, var. Calcutta 4, a resistant wild diploid. Leaf RNA samples were extracted from Calcutta 4 three days after inoculation with fungal conidiospores, with paired-end sequencing conducted in inoculated and non-inoculated controls using lllumina HiSeq 4000 technology. Following mapping to the reference M. acuminata ssp. malaccensis var. Pahang genome, differentially expressed genes (DEGs) were identified and expression representation analyzed on the basis of gene ontology enrichment, Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes orthology and MapMan pathway analysis. Sequence data mapped to 29,757 gene transcript models in the reference Musa genome. A total of 1073 DEGs were identified in pathogen-inoculated cDNA libraries, in comparison to non-inoculated controls, with 32% overexpressed. GO enrichment analysis revealed common assignment to terms that included chitin binding, chitinase activity, pattern binding, oxidoreductase activity and transcription factor (TF) activity. Allocation to KEGG pathways revealed DEGs associated with environmental information processing, signaling, biosynthesis of secondary metabolites, and metabolism of terpenoids and polyketides. With 144 up-regulated DEGs potentially involved in biotic stress response pathways, including genes involved in cell wall reinforcement, PTI responses, TF regulation, phytohormone signaling and secondary metabolism, data demonstrated diverse early-stage defense responses to P. musae. With increased understanding of the defense responses occurring during the incompatible interaction in resistant Calcutta 4, these data are appropriate for the development of effective disease management approaches based on genetic improvement through introgression of candidate genes in superior cultivars. 650 $aBiotic stress 650 $aDisease resistance 650 $aTranscriptome 650 $aMusa Acuminata 653 $aPseudocercospora musae 653 $aSigatoka leaf spot 700 1 $aREGO, E. C. S. 700 1 $aALVES, G. S. C. 700 1 $aFONSECA, F. C. de A. 700 1 $aCOTTA, M. G. 700 1 $aANTONINO, J. D. 700 1 $aGOMES, T. G. 700 1 $aAMORIM, E. P. 700 1 $aFERREIRA, C. F. 700 1 $aCOSTA, M. M. do C. 700 1 $aGRYNBERG, P. 700 1 $aTOGAWA, R. C. 700 1 $aMILLER, R. N. G. 773 $tInternational Journal of Molecular Sciences$gv. 23, 2022. 13589.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Registros recuperados : 378 | |
62. | | MIRANDA, G. V.; SOUZA, L. V. de; GUIMARAES, L. J. M.; NAMORATO, H.; OLIVEIRA, L. R.; SOARES, M. O. Multivariate analyses of genotype x environment interaction of popcorn. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasilia, v. 44, n. 1, p. 45-50, 2009.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Unidades Centrais. |
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63. | | MARRIEL, I. E.; GUIMARAES, L. J. M.; SOARES, M. O.; GUIMARAES, P. E.; OLIVEIRA, A. C. de; MIRANDA, G. V. Performance de linhagens endogâmicas de milho melhoradas e não melhoradas para eficiência no uso de nitrogênio influenciada pela adubação nitrogenda. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 27.; SIMPOSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 3.; WORKSHOP SOBRE MANEJO E ETIOLOGIA DA MANCHA BRANCA DO MILHO, 2008, Londrina. Agroenergia, produção de alimentos e mudanças climáticas: desafios para milho e sorgo: trabalhos e palestras. [Londrina]: IAPAR; [Sete Lagoas]: Embrapa Milho e Sorgo, 2008. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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64. | | SILVA, M. R.; BASTOS, E. A.; CARDOSO, M. J.; MELO, F. de B.; GUIMARAES, L. J. M. Performance produtiva de híbridos elites de milho submetidos ao deficit hídrico. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA MEIO-NORTE, 5., 2019,Teresina, PI. Anais... Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2022. p. 80. (Embrapa Meio-Norte. Documentos, 285).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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65. | | SILVA, M. R.; BASTOS, E. A.; CARDOSO, M. J.; MELO, F. de B.; GUIMARAES, L. J. M. Performance produtiva de híbridos elites de milho submetidos ao deficit hídrico. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA MEIO-NORTE, 5., 2019,Teresina, PI. Anais... Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2022. 96 p. (Embrapa Meio-Norte. Documentos, 285). p. 80.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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66. | | MIRANDA, G. V.; COIMBRA, R. R.; GODOY, C. L.; SOUZA, L. V.; GUIMARÃES, L. J. M.; MELO, A. V. de. Potencial de melhoramento e divergência genética de cultivares de milho-pipoca. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 38, n. 6, p. 681-688, jun. 2003 Título em inglês: Potential to breeding and genetic divergence in popcorn cultivars.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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67. | | GUIMARÃES, M. C.; QUEIROZ, V. A. V.; GUIMARAES, L. J. M.; NEVES, J. F.; MIGUEL, R. A.; PEREIRA, G. M. Teor de fumonisinas em genótipos de milho avaliados em ambientes com alta e baixa disponibilidade de fósforo no solo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 27., 2013, Natal. Anais... [Natal]: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2013.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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68. | | GONCALVES, J. R. P.; FONTES, J. R. A.; MORAIS, R. R. de; ROCHA, M. de M.; GUIMARAES, L. J. M. Sustainable production of grains in Amazonian floodplain. In: WORLD CONGRESS OF SOIL SCIENCE, 19., 2010, Brisbane, Australia. Soil solutions for a changing world: proceedings. Brisbane: International Union of Soil Science: Australian Society of Soil Science, 2010. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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69. | | GONCALVES, J. R. P.; FONTES, J. R. A.; MORAIS, R. R. de; ROCHA, M. de M.; GUIMARAES, L. J. M. Sustainable production of grains in Amazonian floodplain. In: WORLD CONGRESS OF SOIL SCIENCE, 19., 2010, Brisbane, Australia. Soil solutions for a changing world: proceedings. Brisbane: International Union of Soil Science: Australian Society of Soil Science, 2010. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Meio-Norte. |
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71. | | GUIMARAES. L. J. M.; MARRIEL, I. E.; PARENTONI, S. N.; GUIMARAES, C. T.; PACHECO, C. A. P.; GAMA, E. E. G.; MIRANDA, G. V. Capacidade de combinacão de linhagens derivadas da população CMS 28 contrastantes na eficiência de uso de nitrogênio e comportamento produtivo dos híbridos. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 26.; SIMPÓSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 2.; SIMPÓSIO SOBRE COLLETOTRICHUM GRAMINICOLA, 1., 2006, Belo Horizonte. Inovação para sistemas integrados de produção: trabalhos apresentados. [Sete Lagoas]: ABMS, 2006. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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72. | | MARRIEL, I. E.; GUIMARAES, L. J. M.; GUIMARAES, P. E. de O.; PACHECO, C. A. P.; MAGALHAES, P. C.; OLIVEIRA, A. C. Bactérias diazotróficas selecionadas contribuem com economia de fertilizantes nitrogenados em milho In: SIMPÓSIO SOBRE INOVAÇÃO E CRIATIVIDADE CIENTÍFICA NA EMBRAPA, 1., 2008, Brasília, DF. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2008.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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73. | | PACHECO, C. A. O.; CARVALHO, H. W. L. de; GUIMARÃES, L. J. M.; GUIMARÃES, P. E. de O.; MEIRELLES, W. F.; SILVA, A. R. da; PARENTONI, S. N. Adaptabilidade e estabilidade de produção e estratificação de ambientes com base na classificação de variedades de milho em trinta e um locais. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 27.; SIMPÓSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 3.; WORKSHOP SOBRE MANEJO E ETIOLOGIA DA MANCHA BRANCA DO MILHO, 2008, Londrina. Agroenergia, produção de alimentos e mudanças climáticas: desafios para milho e sorgo: trabalhos e palestras. [Londrina]: IAPAR; [Sete Lagoas]: Embrapa Milho e Sorgo, 2008. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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74. | | PACHECO, C. A. P.; CARVALHO, H. W. L. de; GUIMARAES, L. J. M.; GUIMARAES, P. E. de O.; MEIRELLES, W. F.; SILVA, A. R. da; PARENTONI, S. N. Adaptabilidade e estabilidade de produção e estratificação de ambientes com base na classificação de variedades de milho em trinta e um locais. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 27.; SIMPOSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 3.; WORKSHOP SOBRE MANEJO E ETIOLOGIA DA MANCHA BRANCA DO MILHO, 2008, Londrina. Agroenergia, produção de alimentos e mudanças climáticas: desafios para milho e sorgo: trabalhos e palestras. [Londrina]: IAPAR; [Sete Lagoas]: Embrapa Milho e Sorgo, 2008. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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75. | | PACHECO, C. A. P.; CARVALHO, H. W. L. de; GUIMARÃES, L. J. M.; GUIMARÃES, P. E. de O.; MEIRELLES, W. F.; SILVA, A. R. da; PARENTONI, S. N. Adaptabilidade e estabilidade de produção e estratificação de ambientes com base na classificação de variedades de milho em trinta e um locais. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 27.; SIMPÓSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 3.; WORKSHOP SOBRE MANEJO E ETIOLOGIA DA MANCHA BRANCA DO MILHO, 2008, Londrina. Agroenergia, produção de alimentos e mudanças climáticas: desafios para milho e sorgo: trabalhos e palestras. [Londrina]: IAPAR; [Sete Lagoas]: Embrapa Milho e Sorgo, 2008. p. 503.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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76. | | GUIMARAES, L. J. M.; TRINDADE, R. dos S.; GODINHO, V. de P. C.; SOUZA, F. R. S. de; CARDOSO, M. J.; CECCON, G.; OLIVEIRA, I. J. de. Adaptabilidade e estabilidade de variedades de milho em 18 ambientes do Brasil Central. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 30.; SIMPÓSIO SOBRE LEPDÓPTEROS COMUNS A MILHO, SOJA E ALGODÃO, 1., 2014, Salvador. Eficiência nas cadeias produtivas e o abastecimento global: resumos expandidos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2014. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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77. | | GUIMARAES, L. J. M.; TRINDADE, R. dos S.; GODINHO, V. de P. C.; SOUZA, F. R. S. de; CARDOSO, M. J.; CECCON, G.; OLIVEIRA, I. J. de. Adaptabilidade e estabilidade de variedades de milho em 18 ambientes do Brasil Central. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 30.; SIMPÓSIO SOBRE LEPDÓPTEROS COMUNS A MILHO, SOJA E ALGODÃO, 1., 2014, Salvador. Eficiência nas cadeias produtivas e o abastecimento global: resumos expandidos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2014. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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78. | | GUIMARAES, L. J. M.; TRINDADE, R. dos S.; GODINHO, V. de P. C.; SOUZA, F. R. S. de; CARDOSO, M. J.; CECCON, G.; OLIVEIRA, I. J. de. Adaptabilidade e estabilidade de variedades de milho em 18 ambientes do Brasil Central. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 30.; SIMPÓSIO SOBRE LEPDÓPTEROS COMUNS A MILHO, SOJA E ALGODÃO, 1., 2014, Salvador. Eficiência nas cadeias produtivas e o abastecimento global: resumos expandidos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2014. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Milho e Sorgo. |
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79. | | MATOS, F. M. de; MEIRELLES, W. F.; NEGRI, B. F.; MENDES, F. F.; GUIMARAES, L. J. M.; PARENTONI, S. N.; VIDIGAL FILHO, P. S.; SOUSA, S. M. de. Análise da diversidade do sistema radicular de linhagens e híbridos de milho cultivados em solução nutritiva em diferentes níveis de fósforo. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 29., 2012, Águas de Lindóia. Diversidade e inovações na era dos transgênicos: resumos expandidos. Campinas: Instituto Agronômico; Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2012. p. 3096-3101. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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80. | | PAULA, A. L. S. P.; SOUZA, I. R. P. de; TRINDADE, R. dos S.; ALVES, M. de C.; GUIMARAES, P. E. de O.; GUIMARAES, L. J. M. Alterações morfológicas em estômatos de haploides de milho. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 32., 2018, Lavras. Soluções integradas para os sistemas de produção de milho e sorgo no Brasil: resumos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2018. p. 231.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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