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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
02/07/2021 |
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Data da última atualização: |
02/07/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PAZ VENTERO, M.; CUADRAT, R. R. C.; VIDAL, I.; ANDRADE, B. G. N.; MOLINA-PARDINES, C.; HARI-MORENO, J. M.; COUTINHO, F. H.; MERINO, E.; REGITANO, L. C. de A.; SILVEIRA, C. B.; AFLI, H.; LÓPEZ-PÉREZ, M.; RODRÍGUEZ, J. C. |
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Afiliação: |
MARIA PAZ VENTERO, ISABIAL; RAFAEL R. C. CUADRAT, German Institute of Human Nutrition Potsdam-Rehbrücke; INMACULADA VIDAL, ISABIAL; BRUNO G. N. ANDRADE, Munster Technological University; CARMEN MOLINA-PARDINES, ISABIAL; JOSE M. HARO-MORENO, Universidad Miguel Hernández; FELIPE H. COUTINHO, Universidad Miguel Hernández; ESPERANZA MERINO, ISABIAL; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; CYNTHIA B. SILVEIRA, University of Miami; HAITHEM AFLI, Munster Technological University; MARIO LÓPEZ-PÉREZ, ISABIAL; JUAN CARLOS RODRÍGUEZ, ISABIAL. |
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Título: |
Nasopharyngeal microbial communities of patients infected with SARS-CoV-2 that developed COVID-19. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Frontiers in Microbiology, v.12, 637430, mar. 2021 |
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Páginas: |
10 p. |
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DOI: |
10.3389/fmicb.2021.637430 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Background: SARS-CoV-2 is an RNA virus causing COVID-19. The clinical characteristics and epidemiology of COVID-19 have been extensively investigated, however, only one study so far focused on the patient?s nasopharynx microbiota. In this study we investigated the nasopharynx microbial community of patients that developed different severity levels of COVID-19. We performed 16S ribosomal DNA sequencing from nasopharyngeal swab samples obtained from SARS-CoV-2 positive (56) and negative (18) patients in the province of Alicante (Spain) in their first visit to the hospital. Positive SARS-CoV-2 patients were observed and later categorized in mild (symptomatic without hospitalization), moderate (hospitalization), and severe (admission to ICU). We compared the microbiota diversity and OTU composition among severity groups and built bacterial co-abundance networks for each group. Results: Statistical analysis indicated differences in the nasopharyngeal microbiome of COVID19 patients. 62 OTUs were found exclusively in SARS-CoV-2 positive patients, mostly classified as members of the phylum Bacteroidota (18) and Firmicutes (25). OTUs classified as Prevotella were found to be significantly more abundant in patients that developed more severe COVID-19. Furthermore, co-abundance analysis indicated a loss of network complexity among samples from patients that later developed more severe symptoms. Conclusion: Our study shows that the nasopharyngeal microbiome of COVID-19 patients showed differences in the composition of specific OTUs and complexity of co-abundance networks. Taxa with differential abundances among groups could serve as biomarkers for COVID-19 severity. Nevertheless, further studies with larger sample sizes should be conducted to validate these results. MenosBackground: SARS-CoV-2 is an RNA virus causing COVID-19. The clinical characteristics and epidemiology of COVID-19 have been extensively investigated, however, only one study so far focused on the patient?s nasopharynx microbiota. In this study we investigated the nasopharynx microbial community of patients that developed different severity levels of COVID-19. We performed 16S ribosomal DNA sequencing from nasopharyngeal swab samples obtained from SARS-CoV-2 positive (56) and negative (18) patients in the province of Alicante (Spain) in their first visit to the hospital. Positive SARS-CoV-2 patients were observed and later categorized in mild (symptomatic without hospitalization), moderate (hospitalization), and severe (admission to ICU). We compared the microbiota diversity and OTU composition among severity groups and built bacterial co-abundance networks for each group. Results: Statistical analysis indicated differences in the nasopharyngeal microbiome of COVID19 patients. 62 OTUs were found exclusively in SARS-CoV-2 positive patients, mostly classified as members of the phylum Bacteroidota (18) and Firmicutes (25). OTUs classified as Prevotella were found to be significantly more abundant in patients that developed more severe COVID-19. Furthermore, co-abundance analysis indicated a loss of network complexity among samples from patients that later developed more severe symptoms. Conclusion: Our study shows that the nasopharyngeal microbiome of COVID-19 patients showed d... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Coronavirus; COVID 19; NGS next generation sequencing; SARS CoV 2. |
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Thesaurus Nal: |
Microbiome; Prevotella. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/224271/1/NasopharyngealMicrobialCommunities.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
12/12/2011 |
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Data da última atualização: |
22/12/2011 |
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Autoria: |
DANTAS, J. D.; NICHELE, L. A.; BERGAMO, S. C. |
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Afiliação: |
JAIRO DOLVIM DANTAS, CNPF; LETICIA ANDREIA NICHELE, CNPF; SOLANGE CRISTINA BERGAMO, CNPF. |
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Título: |
Modelo de automação do processo de compra para laboratórios. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
In: EVENTO DE INICIATIVAS E MELHORIAS DAS ATIVIDADES DE APOIO TÉCNICO E ADMINISTRATIVO DA EMBRAPA FLORESTAS, 6., 2011, Colombo. Anais. Colombo: Embrapa Florestas, 2011. |
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Série: |
(Embrapa Florestas. Documentos, 226). |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Resumo. |
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Conteúdo: |
Os laboratórios desempenham um papel de extrema relevância nos centros de pesquisa, com toda a gama de serviços que prestam ao processo de PD&I. Entretanto, a qualidade desses serviços depende, em grande parte, da aquisição de reagentes e materiais utilizados nos experimentos e nas análises laboratoriais. Especificações incompletas e consolidação manual de informações contribuem para a morosidade do processo de compra. Para minimizar esse problema, construiu-se um modelo experimental embasado no aplicativo Excel, que padroniza e automatiza as etapas desse processo. A estruturação do modelo foi feita da seguinte forma: i) planilha, por solicitante, com especificação completa de reagentes e materiais para laboratórios (baseada em histórico de compras), com campos para seleção dos itens desejados e inserção de quantitativos por projeto; ii) planilha de controle orçamentário com indicação de valores financeiros solicitados por projeto, campos para inserção de valores disponíveis no Sistema de Acompanhamento Orçamentário (SAO) e saldo por projeto; iii) planilha de consolidação automática das demandas, com identificação dos demandantes e projetos correlacionados; iv) planilha para coleta de preço, separada por lote; v) planilha de acompanhamento do pedido, com indicação do número de propostas recebidas dos fornecedores; vi) planilha com as especificações que serão usadas no Edital de compra. A simulação do modelo com um número pequeno de variáveis de entrada (materiais, solicitantes, etc.) mostrou que ele automatiza uma série de cálculos, classifica e disponibiliza as informações do pedido de compra numa formatação que facilita a coleta de preço e as especificações dos itens no Edital de licitação, acelerando a realização de compras destinadas aos laboratórios. A próxima etapa compreenderá os testes de validação desse modelo numa situação real de compra para laboratórios. MenosOs laboratórios desempenham um papel de extrema relevância nos centros de pesquisa, com toda a gama de serviços que prestam ao processo de PD&I. Entretanto, a qualidade desses serviços depende, em grande parte, da aquisição de reagentes e materiais utilizados nos experimentos e nas análises laboratoriais. Especificações incompletas e consolidação manual de informações contribuem para a morosidade do processo de compra. Para minimizar esse problema, construiu-se um modelo experimental embasado no aplicativo Excel, que padroniza e automatiza as etapas desse processo. A estruturação do modelo foi feita da seguinte forma: i) planilha, por solicitante, com especificação completa de reagentes e materiais para laboratórios (baseada em histórico de compras), com campos para seleção dos itens desejados e inserção de quantitativos por projeto; ii) planilha de controle orçamentário com indicação de valores financeiros solicitados por projeto, campos para inserção de valores disponíveis no Sistema de Acompanhamento Orçamentário (SAO) e saldo por projeto; iii) planilha de consolidação automática das demandas, com identificação dos demandantes e projetos correlacionados; iv) planilha para coleta de preço, separada por lote; v) planilha de acompanhamento do pedido, com indicação do número de propostas recebidas dos fornecedores; vi) planilha com as especificações que serão usadas no Edital de compra. A simulação do modelo com um número pequeno de variáveis de entrada (materiais, solicitant... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Controle; Otimização; Pedido de compra. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/50895/1/201-Modelo-de-automacao-Jairo.pdf
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Marc: |
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520 $aOs laboratórios desempenham um papel de extrema relevância nos centros de pesquisa, com toda a gama de serviços que prestam ao processo de PD&I. Entretanto, a qualidade desses serviços depende, em grande parte, da aquisição de reagentes e materiais utilizados nos experimentos e nas análises laboratoriais. Especificações incompletas e consolidação manual de informações contribuem para a morosidade do processo de compra. Para minimizar esse problema, construiu-se um modelo experimental embasado no aplicativo Excel, que padroniza e automatiza as etapas desse processo. A estruturação do modelo foi feita da seguinte forma: i) planilha, por solicitante, com especificação completa de reagentes e materiais para laboratórios (baseada em histórico de compras), com campos para seleção dos itens desejados e inserção de quantitativos por projeto; ii) planilha de controle orçamentário com indicação de valores financeiros solicitados por projeto, campos para inserção de valores disponíveis no Sistema de Acompanhamento Orçamentário (SAO) e saldo por projeto; iii) planilha de consolidação automática das demandas, com identificação dos demandantes e projetos correlacionados; iv) planilha para coleta de preço, separada por lote; v) planilha de acompanhamento do pedido, com indicação do número de propostas recebidas dos fornecedores; vi) planilha com as especificações que serão usadas no Edital de compra. A simulação do modelo com um número pequeno de variáveis de entrada (materiais, solicitantes, etc.) mostrou que ele automatiza uma série de cálculos, classifica e disponibiliza as informações do pedido de compra numa formatação que facilita a coleta de preço e as especificações dos itens no Edital de licitação, acelerando a realização de compras destinadas aos laboratórios. A próxima etapa compreenderá os testes de validação desse modelo numa situação real de compra para laboratórios.
653 $aControle
653 $aOtimização
653 $aPedido de compra
700 1 $aNICHELE, L. A.
700 1 $aBERGAMO, S. C.
773 $tIn: EVENTO DE INICIATIVAS E MELHORIAS DAS ATIVIDADES DE APOIO TÉCNICO E ADMINISTRATIVO DA EMBRAPA FLORESTAS, 6., 2011, Colombo. Anais. Colombo: Embrapa Florestas, 2011.
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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