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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Semiárido; Embrapa Uva e Vinho. |
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Data corrente: |
29/11/2019 |
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Data da última atualização: |
10/12/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
VILLELA, J. G. A.; RITSCHEL, P. S.; BARBOSA, M. A. G.; BACCIN, J. M. S.; ROSSATO, M.; MAIA, J. D. G.; FERREIRA, M. A. S. V. |
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Afiliação: |
João Gilberto A. Villela; PATRICIA SILVA RITSCHEL, CNPUV; MARIA ANGELICA GUIMARAES BARBOSA, CPATSA; Kétini M. S. Baccin; Mauricio Rossato; JOAO DIMAS GARCIA MAIA, CNPUV; Marisa A. S. V. Ferreira. |
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Título: |
Detection of Xanthomonas citri pv. viticola on grapevine by real-time PCR and BIO-PCR using primers designed from pathogenicity and xanthomonadin gene sequences. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
European Journal of Plant Pathology, v. 155, n. 2, p. 445-459, 2019. |
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DOI: |
10.1007/s10658-019-01779-y |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Grapevine bacterial canker caused by Xanthomonas citri pv. viticola (X. campestris pv. viticola) (Xcv), was detected in Brazil in 1998 and is currently regarded as a quarantine disease with limited distribution in the country. To improve sensitivity and speed in the detection of Xcv in asymptomatic grapevines, two pairs of primers were designed, targeting sequences of a pathogenicity gene (hrpB) and the xanthomonadin coding cluster. Both pairs were tested in conventional PCR (cPCR) and real-time PCR (qPCR) formats. Primers targeting the hrpB gene showed cross reactions with other Xanthomonas spp. but were effective for use in both cPCR and qPCR, whereas primers for the xanthomonadin gene were highly specific for Xcv but showed low efficiency in qPCR. Enrichment of plant extracts in semi-selective medium before qPCR allowed a significant increase in sensitivity when compared to total DNA extraction, making it possible to detect as low as 101 CFU ml-1. Under natural infection conditions, symptomatic and asymptomatic grapevines were tested by qPCR with hrpB primers and cPCR with xanthomonadin primers. In both cases, plant extracts were enriched for 36-72h. Xcv was detected in all symptomatic samples by qPCR and the result was confirmed by cPCR. For the asymptomatic samples, Xcv was detected in 93.4% with qPCR and in 89.5% with cPCR. These two methods offer advantages in terms of sensitivity and specificity, and they could be useful in quarantine programs, certification of grapevine propagating material and detection of inoculum sources in alternative hosts, contributing to the prevention of pathogen spread to disease-free areas. MenosGrapevine bacterial canker caused by Xanthomonas citri pv. viticola (X. campestris pv. viticola) (Xcv), was detected in Brazil in 1998 and is currently regarded as a quarantine disease with limited distribution in the country. To improve sensitivity and speed in the detection of Xcv in asymptomatic grapevines, two pairs of primers were designed, targeting sequences of a pathogenicity gene (hrpB) and the xanthomonadin coding cluster. Both pairs were tested in conventional PCR (cPCR) and real-time PCR (qPCR) formats. Primers targeting the hrpB gene showed cross reactions with other Xanthomonas spp. but were effective for use in both cPCR and qPCR, whereas primers for the xanthomonadin gene were highly specific for Xcv but showed low efficiency in qPCR. Enrichment of plant extracts in semi-selective medium before qPCR allowed a significant increase in sensitivity when compared to total DNA extraction, making it possible to detect as low as 101 CFU ml-1. Under natural infection conditions, symptomatic and asymptomatic grapevines were tested by qPCR with hrpB primers and cPCR with xanthomonadin primers. In both cases, plant extracts were enriched for 36-72h. Xcv was detected in all symptomatic samples by qPCR and the result was confirmed by cPCR. For the asymptomatic samples, Xcv was detected in 93.4% with qPCR and in 89.5% with cPCR. These two methods offer advantages in terms of sensitivity and specificity, and they could be useful in quarantine programs, certification of grape... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
QPCR de diagnóstico baseado em PCR; Videira. |
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Thesagro: |
Cancro Bacteriano; Doença; Doença Fúngica; Uva; Xanthomonas Citri. |
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Thesaurus Nal: |
Bacterial canker; Grapes. |
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Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/206475/1/Detection-of-Xanthomonas-citri-pv-viticola-2019.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Uva e Vinho (CNPUV) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agroindústria Tropical. Para informações adicionais entre em contato com cnpat.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agroindústria Tropical. |
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Data corrente: |
27/03/2009 |
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Data da última atualização: |
19/10/2015 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
SOUZA, M. C. de. |
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Afiliação: |
Marcela Coelho de Souza, Mestranda UFC; Raimundo Wilane de Figueiredo, Orientador, UFC Ricardo Elesbão Alves, Co-orientador, CNPAT. |
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Título: |
Qualidade e atividade antioxidante de frutos de diferentes progênies de açaizeiro (Euterpe oleracea Mart). |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
2007. |
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Páginas: |
124 f. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Dissertação (Mestrado em Tecnologia de Alimentos) - Universidade Federal do Ceará, Fortaleza. |
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Conteúdo: |
Este trabalho teve por objetivos avaliar a qualidade de frutos de açaizeiro (Euterpe oleraceae Mart), oriundos de diferentes progênies, através de caracterização física, físico-química e química, selecionando dentre os materiais genéticos aqueles que apresentaram qualidade superior e avaliar a atividade antioxidante total de extratos fenólicos obtidos destas progênies. Os frutos utilizados no experimento foram obtidos de oito progênies de açaizeiros provenientes do Banco Ativo de Germoplasma, instalado no Campo Experimental do Curu/Paraipaba pertencente à Embrapa Agroindústria Tropical, situada no município de Paraipaba, CE, nas quais são: P032-5, P034-3, P048-8, P049-6, P072-1, P064-8, P131-3 e P308-2. Os frutos foram avaliados conforme as seguintes análises: peso total, diâmetro, comprimento, rendimento de polpa + casca, cor da polpa, sólidos solúveis, açúcares solúveis totais, pH, acidez total titulável, amido, pectina total e solúvel, minerais (ferro, manganês, cobre, zinco, cálcio, magnésio, sódio, potássio e fósforo), ácido ascórbico, carotenóides, clorofila, flavonóides amarelos, antocianinas, polifenóis extraíveis totais, taninos condensados e atividade antioxidante expressos em diferentes formas e em três concentrações. Os frutos de açaizeiro demonstraram excelente qualidade, no que diz respeito a maioria dos atributos de qualidade avaliados, apresentando elevada variação entre as progênies. Mediante avaliações de peso, diâmetro e comprimento podem ser caracterizados como frutos de tamanho grande,
com obtenção de alto rendimento da parte comestível. Dentre as progênies, destaca-se a P032-5 com excelente rendimento de 32,60 %. O fruto não é ácido, contém baixo teor de açúcares solúveis totais e elevado teor de amido, pectinas total e solúvel. Em relação aos minerais é uma boa fonte, com exceção do cobre, encontrando para alguns minerais níveis acima da recomendação diária. A média geral para ácido ascórbico foi de 58,72 mgll 00 g. Os açaís analisados contêm em sua composição enorme presença de substâncias biologicamente ativas, tais como: antocianinas, flavonóides amarelos, compostos fenólicos, clorofila, carotenóides e constituem uma fonte potencial de antioxidantes naturais para a dieta humana. De modo geral os extratos fenólicos de açaí apresentaram excelente poder de inibição da oxidação, exibindo atividade antioxidante diferenciada entre as progênies de açaizeiro, variável em função da concentração, demonstrando tendência a saturação. As progênies P032-5, P048-8, P049-6 e
P308-2 apresentaram, em todas as concentrações, maiores atividade antioxidante. MenosEste trabalho teve por objetivos avaliar a qualidade de frutos de açaizeiro (Euterpe oleraceae Mart), oriundos de diferentes progênies, através de caracterização física, físico-química e química, selecionando dentre os materiais genéticos aqueles que apresentaram qualidade superior e avaliar a atividade antioxidante total de extratos fenólicos obtidos destas progênies. Os frutos utilizados no experimento foram obtidos de oito progênies de açaizeiros provenientes do Banco Ativo de Germoplasma, instalado no Campo Experimental do Curu/Paraipaba pertencente à Embrapa Agroindústria Tropical, situada no município de Paraipaba, CE, nas quais são: P032-5, P034-3, P048-8, P049-6, P072-1, P064-8, P131-3 e P308-2. Os frutos foram avaliados conforme as seguintes análises: peso total, diâmetro, comprimento, rendimento de polpa + casca, cor da polpa, sólidos solúveis, açúcares solúveis totais, pH, acidez total titulável, amido, pectina total e solúvel, minerais (ferro, manganês, cobre, zinco, cálcio, magnésio, sódio, potássio e fósforo), ácido ascórbico, carotenóides, clorofila, flavonóides amarelos, antocianinas, polifenóis extraíveis totais, taninos condensados e atividade antioxidante expressos em diferentes formas e em três concentrações. Os frutos de açaizeiro demonstraram excelente qualidade, no que diz respeito a maioria dos atributos de qualidade avaliados, apresentando elevada variação entre as progênies. Mediante avaliações de peso, diâmetro e comprimento podem ser caracterizado... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Atividade antioxidante; Caracterização; Progênies. |
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Thesagro: |
Açaí; Qualidade. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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260 $a2007.$c2007
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500 $aDissertação (Mestrado em Tecnologia de Alimentos) - Universidade Federal do Ceará, Fortaleza.
520 $aEste trabalho teve por objetivos avaliar a qualidade de frutos de açaizeiro (Euterpe oleraceae Mart), oriundos de diferentes progênies, através de caracterização física, físico-química e química, selecionando dentre os materiais genéticos aqueles que apresentaram qualidade superior e avaliar a atividade antioxidante total de extratos fenólicos obtidos destas progênies. Os frutos utilizados no experimento foram obtidos de oito progênies de açaizeiros provenientes do Banco Ativo de Germoplasma, instalado no Campo Experimental do Curu/Paraipaba pertencente à Embrapa Agroindústria Tropical, situada no município de Paraipaba, CE, nas quais são: P032-5, P034-3, P048-8, P049-6, P072-1, P064-8, P131-3 e P308-2. Os frutos foram avaliados conforme as seguintes análises: peso total, diâmetro, comprimento, rendimento de polpa + casca, cor da polpa, sólidos solúveis, açúcares solúveis totais, pH, acidez total titulável, amido, pectina total e solúvel, minerais (ferro, manganês, cobre, zinco, cálcio, magnésio, sódio, potássio e fósforo), ácido ascórbico, carotenóides, clorofila, flavonóides amarelos, antocianinas, polifenóis extraíveis totais, taninos condensados e atividade antioxidante expressos em diferentes formas e em três concentrações. Os frutos de açaizeiro demonstraram excelente qualidade, no que diz respeito a maioria dos atributos de qualidade avaliados, apresentando elevada variação entre as progênies. Mediante avaliações de peso, diâmetro e comprimento podem ser caracterizados como frutos de tamanho grande, com obtenção de alto rendimento da parte comestível. Dentre as progênies, destaca-se a P032-5 com excelente rendimento de 32,60 %. O fruto não é ácido, contém baixo teor de açúcares solúveis totais e elevado teor de amido, pectinas total e solúvel. Em relação aos minerais é uma boa fonte, com exceção do cobre, encontrando para alguns minerais níveis acima da recomendação diária. A média geral para ácido ascórbico foi de 58,72 mgll 00 g. Os açaís analisados contêm em sua composição enorme presença de substâncias biologicamente ativas, tais como: antocianinas, flavonóides amarelos, compostos fenólicos, clorofila, carotenóides e constituem uma fonte potencial de antioxidantes naturais para a dieta humana. De modo geral os extratos fenólicos de açaí apresentaram excelente poder de inibição da oxidação, exibindo atividade antioxidante diferenciada entre as progênies de açaizeiro, variável em função da concentração, demonstrando tendência a saturação. As progênies P032-5, P048-8, P049-6 e P308-2 apresentaram, em todas as concentrações, maiores atividade antioxidante.
650 $aAçaí
650 $aQualidade
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653 $aCaracterização
653 $aProgênies
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Registro original: |
Embrapa Agroindústria Tropical (CNPAT) |
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