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Biblioteca(s):  Embrapa Florestas.
Data corrente:  03/12/2019
Data da última atualização:  03/12/2019
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  ANDRADE, L. R. B. de; SOUSA, M. B. e; OLIVEIRA, E. J. de; RESENDE, M. D. V. de; AZEVEDO, C. F.
Afiliação:  Luciano Rogério Braatz de Andrade, UFV; Massaine Bandeira e Sousa, Universidade Federal do Recôncavo da Bahia; EDER JORGE DE OLIVEIRA, CNPMF; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; Camila Ferreira Azevedo, UFV.
Título:  Cassava yield traits predicted by genomic selection methods.
Ano de publicação:  2019
Fonte/Imprenta:  PLoS One, v. 14, n. 11, e0224920, Nov. 2019. 22 p.
DOI:  10.1371/journal.pone.0224920
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Genomic selection (GS) has been used to optimize genetic gains when phenotypic selection is considered costly and difficult to measure. The objective of this work was to evaluate the efficiency and consistency of GS prediction for cassava yield traits (Manihot esculenta Crantz) using different methods, taking into account the effect of population structure. BLUPs and deregressed BLUPs were obtained for 888 cassava accessions and evaluated for fresh root yield, dry root yield and dry matter content in roots in 21 trials conducted from 2011 to 2016. The deregressed BLUPs obtained for the accessions from a 48K single nucleotide polymorphism dataset were used for genomic predictions based on the BayesB, BLASSO, RR-BLUP, G-BLUP and RKHS methods. The accessions? BLUPs were used in the validation step using four cross-validation strategies, taking into account population structure and different GS methods. Similar estimates of predictive ability and bias were identified for the different genomic selection methods in the first cross-validation strategy. Lower predictive ability was observed for fresh root yield (0.4569 ?RR-BLUP to 0.4756?RKHS) and dry root yield (0.4689 ?G-BLUP to 0.4818?RKHS) in comparison with dry matter content (0.5655 ? BLASSO to 0.5670 ?RKHS). However, the RKHS method exhibited higher efficiency and consistency in most of the validation scenarios in terms of prediction ability for fresh root yield and dry root yield. The correlations of the genomic estimated br... Mostrar Tudo
Palavras-Chave:  Genomic predictions; Heredity.
Thesagro:  Mandioca; Melhoramento Genético Vegetal.
Thesaurus Nal:  Cassava; Plant breeding.
Categoria do assunto:  G Melhoramento Genético
URL:  http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/205981/1/2019-M.Deon-PO-Cassava.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Florestas (CNPF)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPF57152 - 1UPCAP - DD

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1.Imagem marcado/desmarcadoANDRADE, L. R. B. de; SOUSA, M. B. e; OLIVEIRA, E. J. de; RESENDE, M. D. V. de; AZEVEDO, C. F. Cassava yield traits predicted by genomic selection methods. PLoS One, v. 14, n. 11, e0224920, Nov. 2019. 22 p.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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