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Biblioteca(s):  Embrapa Pecuária Sul.
Data corrente:  18/06/2019
Data da última atualização:  18/06/2019
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  FERREIRA, L. M.; SÁFADI, T.; FERREIRA, J. L.
Afiliação:  Leila Maria Ferreira, UFLA; Thelma Sáfadi, UFLA; JULIANO LINO FERREIRA, CPPSUL.
Título:  Wavelet-domain elastic net for clustering on genomes strains.
Ano de publicação:  2018
Fonte/Imprenta:  Genetics and Molecular Biology, v. 41, n. 4, p. 884-892, Oct./Dec. 2018.
Idioma:  Português
Conteúdo:  We propose to evaluate genome similarity by combining discrete non-decimated wavelet transform (NDWT) and elastic net. The wavelets represent a signal with levels of detail, that is, hidden components are detected by means of the decomposition of this signal, where each level provides a different characteristic. The main feature of the elastic net is the grouping of correlated variables where the number of predictors is greater than the number of observations. The combination of these two methodologies applied in the clustering analysis of the Mycobacterium tuberculosis genome strains proved very effective, being able to identify clusters at each level of decomposition.
Thesagro:  Análise Estatística; Bactéria Patogênica; Genética; Genoma; Linhagem; Micobactéria.
Categoria do assunto:  --
URL:  http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/198686/1/GMB-2018-0035-1.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Pecuária Sul (CPPSUL)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status
CPPSUL14544 - 1UPCSP - DD

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Tipo: Artigo em Periódico Indexado
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul.
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