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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
19/02/2018 |
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Data da última atualização: |
18/07/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ROMEROA, A. R. da S.; SIQUEIRA, F.; SANTIAGO, G. G.; REGITANO, L. C. de A.; SOUZA JÚNIOR, M. D. de; TORRES JúNIOR, R. A. de A.; NASCIMENTO, A. V. do; GRISOLIA, A. B. |
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Afiliação: |
Andrea Renata da Silva Romeroa, Federal University of Dourados - UFGD; FABIANE SIQUEIRA, CNPGC; Gustavo Garcia Santiago, Federal University of Mato Grosso do Sul - UFMS; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; Maury Dorta de Souza Júnior, Brazilian Association of Canchim Cattle Breeders - ABCCAN; Roberto Augusto de Almeida Torres Júnior; André Vieira do Nascimento, São Paulo State University - UNESP; Alexeia Barufatti Grisolia, Federal University of Dourados - UFGD. |
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Título: |
Prospecting genes associated with navel length, coat and scrotal circumference traits in Canchim cattle. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Livestock Science, v. 210, p. 33-38, April 2018 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The aim of this work was to identify genomic regions and genes in association with the navel length, coat and scrotal circumference traits of Canchim breed of cattle, using genome-wide association studies (GWAS). Imputed data from single nucleotide polymorphism type markers were used, with accuracy greater than 95%. The analyses of genome-wide association were conducted by the Bayes B method, implemented in the GenSel program. Non-overlapping windows that explained at least 0.19% of the additive genetic variance were considered as significant, this value corresponds five times the expected for 1 Mb size windows. GWAS indicated 31 regions in association with navel length, one coat region, and four SC-related regions. In these regions, 4 quantitative loci (QTLs) related to navel length and 5 with SC were identified, as for the coat, the QTLs detected did not present previously described relation with this trait. Among the candidate genes in the associated regions, 7 genes were cited in previous studies, with biological functions related to navel length, one for coat and three for SC. The candidate genes TMEM176A and TMEM176AB, which are orthologous in humans, are in association with navel's trait and compose the Androgen Induced 1 cluster. The identification of genes and QTLs, with a function related to the studied traits, previously described in the literature, reinforces the evidence that the found regions are associated with navel length, coat and SC. This information may contribute to the understanding of the genetic architecture involved with of these traits, to guiding genetic validation studies, gene introgression and contribute to include information concerning molecular markers in genetic evaluation of animal improvement programs. MenosThe aim of this work was to identify genomic regions and genes in association with the navel length, coat and scrotal circumference traits of Canchim breed of cattle, using genome-wide association studies (GWAS). Imputed data from single nucleotide polymorphism type markers were used, with accuracy greater than 95%. The analyses of genome-wide association were conducted by the Bayes B method, implemented in the GenSel program. Non-overlapping windows that explained at least 0.19% of the additive genetic variance were considered as significant, this value corresponds five times the expected for 1 Mb size windows. GWAS indicated 31 regions in association with navel length, one coat region, and four SC-related regions. In these regions, 4 quantitative loci (QTLs) related to navel length and 5 with SC were identified, as for the coat, the QTLs detected did not present previously described relation with this trait. Among the candidate genes in the associated regions, 7 genes were cited in previous studies, with biological functions related to navel length, one for coat and three for SC. The candidate genes TMEM176A and TMEM176AB, which are orthologous in humans, are in association with navel's trait and compose the Androgen Induced 1 cluster. The identification of genes and QTLs, with a function related to the studied traits, previously described in the literature, reinforces the evidence that the found regions are associated with navel length, coat and SC. This information may c... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
GWAS; Inference Bayesian; Polymorphisms. |
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Thesaurus Nal: |
Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
--
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 19 | |
| 2. |  | GHETTI, A. M.; SOUZA, E. D. de; CAMPOS JÚNIOR, P. H. A.; FREITAS, C. de; CAMARGO, L. S. de A.; VIANA, J. H. M.; VERNEQUE, R. da S. Avaliação de cultivo overnight como estratégia para a coleta e transferência a fresco de embriões F1 Holandês/Gir em rebanhos diferentes. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 46., 2009, Maringá. Inovação científica e tecnológica em zootecnia: anais dos resumos. Maringa: SBZ: UEM, 2009.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 3. | | SOUZA, E. D. DE; CAMPOS JUNIOR, P. H. de A.; BATISTA, R. I. P. T.; MACHADO, M. A.; FREITAS, C. de; LUZ, M. R.; VIANA, J. H. M. Associação do ganho de peso e idade à puberdade em novilhas F2. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 46., 2009, Maringa. Anais... Maringá: SBZ, 2009.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 4. | | CAMPOS JUNIOR, P. H. A.; SILVA, C. A.; GRAZIA, JOAO G. V.; MAFFILI, V. V.; SANTOS, R. R.; CARVALHO, B. C.; VIANA, J. H. M. Assessment of ovarian follicular growth by Ultrasound biomicroscopy. In: WORKSHOP ON MALE REPRODUCTIVE BIOLOGY, 2., 2009, São Paulo. Abstracts... São Paulo. FESBE, 2009. p. 22.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 5. | | GHETTI, A. M.; SOUZA, E. D. de; CAMPOS JÚNIOR, P. H. A.; FREITAS, C. de; CAMARGO, L. S. de A.; VIANA, J. H. M.; VERNEQUE, R. da S. Avaliação do potencial de produção de embriões F1 in vivo utilizando-se doadoras das raças Gir ou Holandesa. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 46., 2009, Maringá. Inovação científica e tecnológica em zootecnia: anais dos resumos. Maringa: SBZ: UEM, 2009.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 6. | | ALVES, T. J. M.; DIAS, M. T.; CAMARGO, L. S. de A.; ASSUNÇÃO, C. M.; VIANA, J. H. M.; CAMPOS JUNIOR, P. H. A. Blastocyst production from bovine ovarian cortex fragments xenografted under the back skin of mice In: ANNUAL CONFERENCE OF THE INTERNATIONAL EMBRYO TRANSFER SOCIETY, 2016, Louisville. Reproduction, fertility and development: proceedings. Louisville: [s.n.], 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 8. | | CAMPOS JUNIOR, P. H. A.; ASSUNÇÃO, C. M.; CARVALHO, B. C. de; BATISTA, R. I. T. P.; GARCIA, R. M. G.; VIANA, J. H. M. Follicular populations, recruitment and atresia in the ovaries of different strains of mice. Reproductive Biology, v. 12, n. 1. p. 41-55, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 9. | | PEREIRA, M. M.; SERAPIAO, R. V.; CAMPOS JUNIOR, P. H.; MACHADO, M. A.; VIANA, J. H. M.; CAMARGO, L. S. de A. Progressão da meiose, viabilidade das células do cumulus e abundância do transcrito GDF-9 em oócitos bovinos submetidos a diferentes ambientes de maturação in vitro. In: SEMANA DE BIOLOGIA.MOSTRA DE PRODUÇÃO CIENTÍFICA, 32., 2009, Juiz de Fora. Anais... Juiz de Fora: Universidade Federal de Juiz de Fora, 2009.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 10. | | PEREIRA, L. A. A. C.; NASCIMENTO, B. R.; JORGE, E. C.; SEGATELLI, T. M.; COUTINHO, L. L.; VIANA, J. H. M.; CAMPOS-JUNIOR, P. H. A. Vitrification leads to transcriptomic modifications of mice ovaries that do not affect folliculogenesis progression. Reproductive Biology, v. 20, n. 2, p. 264-272, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 11. | | CAMARGO, L. S. A.; COSTA, F. Q.; MUNK, M.; WOHLRES-VIANA, S.; SERAPIÃO, R. V.; CARVALHO, B. C.; CAMPOS JÚNIOR, P. H.; VIEIRA, A. C.; NOGUEIRA, L. A. G.; VIANA, J. H. M. Contrasting effects of heat shock during in vitro maturation on development of in vitro-fertilized and parthenogenetic bovine embryos. Reproduction in Domestic Animals, v. 54, n. 10, p. 1357-1365, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 12. | | MORAES, M. N. de C. M.; LIMA, K. D. A.; ALMEIDA, S. A. C. de; BATISTA, R. I. T. P.; CAMPOS JÚNIOR, P. H. de; MIRANDA, F. M. de; VIANA, J. H. M. Efeito da restrição alimentar e espaçamento sobre o desenvolvimento somático de camundongos (resultados preliminares). In: SEMANA DE BIOLOGIA, 30., 2007, Juiz de Fora. O mundo se tornou pequeno para você mas você não é grande para o mundo: anais. Juiz de Fora: DACBIO/UFJF, 2007. p. 169-174.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 13. | | BATISTA, R. I. T. P.; GAMA, M. A. S. da; BARBOSA, N. R.; CAMPOS JÚNIOR, P. H. de A.; CARVALHO, B. C.; CAMARGO, L. S. de A.; VIANA, J. H. M. Efeito da adição do isômero de CLA trans-10, cis-12 no cultivo de embriões bovinos em diferentes volumes de meio. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 46., 2009, Maringá. Inovação científica e tecnológica em zootecnia: anais dos resumos. Maringa: SBZ: UEM, 2009.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 14. | | BATISTA, R. I. T. P.; BARBOSA, N. R.; CAMARGO, L. S. de A.; GAMA, M. A. S. da; CARVALHO, B. C.; CAMPOS JUNIOR, P. H. A.; PEREIRA, M. M.; MIRANDA, F. M.; VIANA, J. H. M. Expression of genes involved in the control of apoptosis and cellular stress in bovine embryos cultures with CLA(trans-10,cis-12). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55., 2009, Aguas de Lindoia. Anais... Águas de Lindóia: Sociedade Brasileira de Genética, 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 15. | | CAMPOS JÚNIOR, P. H. de A.; MIRANDA, F. M. de; BATISTA, R. I. T. P.; ASSUNÇÃO, C. M.; PAIM, C. A. S.; SOUZA, F. A. M.; VIANA, J. H. M. Quantificação e morfometria folicular de camundongos (Mus musculus) provenientes de cruzamento outbred. In: SEMANA DE BIOLOGIA, 31.; MOSTRA DE PRODUÇÃO CIENTÍFICA, 14., 2008, Juiz de Fora. Anais... Juiz de Fora: UFJF, 2008. 1 CD.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 16. | | CAMPOS JÚNIOR, P. H. A.; CARVALHO, B. C.; SERAPIÃO, R. V.; PEREIRA, M. M.; COSTA, F. Q.; POLISSENI, J.; WOHLRES-VIANA, S.; SÁ, W. F.; VIANA, J. H. M.; CAMARGO, L. S. Produção e criotolerância de embriões bovinos produzidos sob diferentes sistemas de cultivo. In: 31ª SEMANA DE BIOLOGIA. MOSTRA DE PRODUÇÃO CIENTÍFICA. 14. 2008, Anais. Juiz de Fora. UFJF, 2008. 4 p. 1 CD.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 17. | | CAMPOS-JUNIOR, P. H. A.; ALVES, T. J. M.; DIAS, M. T.; ASSUNÇAO, C. M.; MUNK, M.; MATTOS, M. S.; KRAEMER, L. R.; ALMEIDA, B. G.; RUSSO, R. C.; BARCELOS, L.; CAMARGO, L. S. de A.; VIANA, J. H. M. Ovarian Grafts 10 days after Xenotransplantation: folliculogenesis and recovery of viable oocytes. Plos One, v. 11, n. 6, e0158109, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 18. | | ASSUNÇÃO, C. M.; CAMPOS JUNIOR, P. H. A.; MIRANDA, F. M.; PEREIRA, M. M.; SERAPIÃO, R. V.; CARVALHO, B. C.; VIANA, J. H. M.; CAMARGO, L. S. de A. Sire influence on speed development of in vitro fertilized bovine embryos. In: WORKSHOP ON MALE REPRODUCTIVE BIOLOGY, 2., 2009, São Paulo. Abstracts... São Paulo: FESBE, 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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