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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite; Embrapa Semiárido. |
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Data corrente: |
21/11/2017 |
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Data da última atualização: |
27/01/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B.; BARBOSA, R. S.; SANTOS, G. G. dos; LEITE, R. de M. H.; PEIXOTO, M. G. C. D. |
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Afiliação: |
JOAO CLAUDIO DO CARMO PANETTO, CNPGL; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; ROSANGELA SILVEIRA BARBOSA, CPATSA; GLAUCYANA GOUVEA DOS SANTOS, CNPGL; RICARDO de M. H. LEITE, EMEPA; MARIA GABRIELA CAMPOLINA D PEIXOTO, CNPGL. |
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Título: |
Parentage assignment using SNP markers, inbreeding and population size for the Brazilian Red Sindhi cattle. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
Livestock Science, v. 204, p. 33-38, 2017. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract Brazilian Red Sindhi was originated from a very small number of founders and showed a consistent growth during the last three decades. One relevant herd was kept without proper birth recording and the reconstruction of parentage was possible for this herd through the use of a panel with 3894 SNP markers. Pedigree errors were also identified and corrected for animals sampled in various herds distributed in different Brazilian regions. A panel containing 71 SNP markers was indicated as the minimum number for the effective parentage verification within the Red Sindhi population in Brazil. Corrected genealogy was used for the description of inbreeding and effective population size, which was accessed with the paired increases in coancestry approach. Average inbreeding was high (F = 9.03%) for 15,217 inbred animals (54.1% of the total). Nevertheless, a trend of decrease with time was observed for this parameter with the average individual increases in inbreeding approach (∆Fi). This population went through a bottleneck during the 1980s and beginning of the 1990s, reaching a minimum population size of Ne=55.86. After that period, a consistent increase in the number of breeders and animals has raised the effective population size to the current value of Ne=87.55. |
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Palavras-Chave: |
Bottleneck; Mendelian conflicts; Raça Sindi; Red Sindhi; SNP. |
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Thesagro: |
Produção animal. |
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Thesaurus Nal: |
Pedigree; zebu. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
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520 $aAbstract Brazilian Red Sindhi was originated from a very small number of founders and showed a consistent growth during the last three decades. One relevant herd was kept without proper birth recording and the reconstruction of parentage was possible for this herd through the use of a panel with 3894 SNP markers. Pedigree errors were also identified and corrected for animals sampled in various herds distributed in different Brazilian regions. A panel containing 71 SNP markers was indicated as the minimum number for the effective parentage verification within the Red Sindhi population in Brazil. Corrected genealogy was used for the description of inbreeding and effective population size, which was accessed with the paired increases in coancestry approach. Average inbreeding was high (F = 9.03%) for 15,217 inbred animals (54.1% of the total). Nevertheless, a trend of decrease with time was observed for this parameter with the average individual increases in inbreeding approach (∆Fi). This population went through a bottleneck during the 1980s and beginning of the 1990s, reaching a minimum population size of Ne=55.86. After that period, a consistent increase in the number of breeders and animals has raised the effective population size to the current value of Ne=87.55.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 9 | |
| 1. |  | MATIAS, F. I.; VIDOTTI, M. S.; MEIRELES, K. G. X.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do; CARLEY, C. A. S.; FRITSCHE-NETO, R. Association Mapping Considering Allele Dosage: An Example of Forage Traits in an Interspecific Segmental Allotetraploid Urochloa spp. Crop Science, v. 59, n. 5, p. 2062-2076, september-october, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 2. | | COLOMBARI FILHO, J. M.; DURÃO, R. da S.; RANGEL, P. H. N.; FERREIRA, M. E.; MENDONÇA, J. A.; VIDOTTI, M. S. Avaliação de progênies derivadas de cruzamentos envolvendo o acesso com espiguetas agrupadas da Embrapa. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ARROZ IRRIGADO, 8., 2013, Santa Maria. Avaliando cenários para a produção sustentável de arroz: anais. Santa Maria: UFSM; Porto Alegre: Sosbai, 2013. v.1. p. 117-120.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 3. | | COLOMBARI FILHO, J. M.; CARVALHO, M. da C. S.; VILLAR, M. L. P.; CONDÉ, A. B. T.; MORAIS, O. P. de; CASTRO, A. P. de; BRESEGHELLO, F.; VIDOTTI, M. S.; MORAIS JÚNIOR, O. P. de. Avaliação para tolerância à deficiência de fósforo no solo em seleção recorrente de arroz de terras altas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 7., 2013, Uberlândia. Variedade melhorada: a força da nossa agricultura: anais. Viçosa, MG: SBMP, 2013. p. 1935-1939.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 6. | | VIDOTTI, M. S.; COLOMBARI FILHO, J. M.; CARVALHO, M. da C. S.; FAGERIA, N. K.; MARTINS, S. M.; MORAIS, O. P. de; MELO, P. G. S. Screening para tolerância à deficiência de fósforo no solo com acessos de arroz (Oryza sativa). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 7., 2013, Uberlândia. Variedade melhorada: a força da nossa agricultura: anais. Viçosa, MG: SBMP, 2013. p. 3063-3068.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 8. | | BORBA, T. C. O.; VIDOTTI, M. S.; CASCÃO, L. M.; COLOMBARI FILHO, J. M.; ABREU, A. G. de; MELLO, R. N. de. Validação do QTL PUP1 e diversidade genética em genótipos de arroz de terras altas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 8., 2015, Goiânia. O melhoramento de plantas, o futuro da agricultura e a soberania nacional: anais. Goiânia: UFG: SBMP, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| Registros recuperados : 9 | |
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