BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






Registro Completo
Biblioteca(s):  Embrapa Gado de Corte.
Data corrente:  03/03/2017
Data da última atualização:  03/03/2017
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  SANTANA, M. H. de A.; OLIVEIRA JUNIOR, G. A.; CESAR, A. S. M.; FREUA, M. C.; GOMES, R. da C.; SILVA, S. da L.; LEME, P. R.; FUKUMASU, H.; CARVALHO, M. E.; VENTURA, R. V.; COUTINHO, L. L.; KADARMIDEEN, H. N.; FERRAZ, J. B. S.
Afiliação:  MIGUEL HENRIQUE DE ALMEIDA SANTANA; GERSON ANTÔNIO OLIVEIRA JUNIOR; ALINE SILVA MELLO CESAR; MATEUS CASTELANI FREUA; RODRIGO DA COSTA GOMES, CNPGC; SAULO DA LUZ E SILVA; PAULO ROBERTO LEME; HEIDGE FUKUMASU; MINOS ESPERÂNDIO CARVALHO; RICARDO VIEIRA VENTURA; LUIZ LEHMANN COUTINHO; HAJA N. KADARMIDEEN; JOSÉ BENTO STERMAN FERRAZ.
Título:  Copy number variations and genome-wide associations reveal putative genes and metabolic pathways involved with the feed conversion ratio in beef cattle.
Ano de publicação:  2016
Fonte/Imprenta:  Journal of Applied Gentics, v. 57, n. 4, p. 495-504, 2016
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  The use of genome-wide association results combined with other genomic approaches may uncover genes and metabolic pathways related to complex traits. In this study, the phenotypic and genotypic data of 1475 Nellore (Bos indicus) cattle and 941,033 single nucleotide polymorphisms (SNPs) were used for genome-wide association study (GWAS) and copy number variations (CNVs) analysis in order to identify candidate genes and putative pathways involved with the feed conversion ratio (FCR). The GWAS was based on the Bayes B approach analyzing genomic windows with multiple regression models to estimate the proportion of genetic variance explained by each window. The CNVs were detected with PennCNV software using the log R ratio and B allele frequency data. CNV regions (CNVRs) were identified with CNVRuler and a linear regression was used to associate CNVRs and the FCR. Functional annotation of associated genomic regions was performed with the Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery (DAVID) and the metabolic pathways were obtained from the Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG). We showed five genomic windows distributed over chromosomes 4, 6, 7, 8, and 24 that explain 12 % of the total genetic variance for FCR, and detected 12 CNVRs (chromosomes 1, 5, 7, 10, and 12) significantly associated [false discovery rate (FDR) < 0.05] with the FCR. Significant genomic regions (GWAS and CNV) harbor candidate genes involved in pathways related to energetic, lipid,... Mostrar Tudo
Palavras-Chave:  GWAS; Nellore cattle.
Thesaurus Nal:  Cattle; Cucumber necrosis virus; Feed conversion; Genomics; Single nucleotide polymorphism.
Categoria do assunto:  --
URL:  http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/157039/1/Copy-number-variations-and-genome-wide.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Gado de Corte (CNPGC)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPGC16767 - 1UPCAP - DD

Voltar







Ordenar por: RelevânciaAutorTítuloAnoImprime registros no formato resumido      Imprime registros no formato resumido
Registros recuperados : 9
Primeira ... 1 ... Última
1.Imagem marcado/desmarcadoOLIVEIRA JUNIOR, G. A.; REY, F. S. B.; SILVA, M. V. G. B.; SANTANA, M. H. A.; ALEXANDRE, P. A.; ELER, J. P.; FERRAZ, J. B. S. Analysis of copy number variation regions in a Nellore population evaluated for feed efficiency. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver. Proceedings... Champaign: ASAS, 2014. 3 p.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
Visualizar detalhes do registroAcesso restrito ao objeto digitalImprime registro no formato completo
2.Imagem marcado/desmarcadoOLIVEIRA JUNIOR, G. A.; CARMO, A. S.; UTSUNOMIYA, A. T. H.; CHUD, T. C. S.; REY, F. S. B.; FERRAZ, J. B. S.; SILVA, M. V. G. B. Common copy number variation regions affecting dairy traits in Gyr cattle In: ADSA ASAS JOINT ANNUAL MEETING, 2015, Orlando. Proceedings... Orlando: ADSA - ASAS, 2015.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
Visualizar detalhes do registroImprime registro no formato completo
3.Imagem marcado/desmarcadoOLIVEIRA JUNIOR, G. A.; VENTURA, R.; FREITAS, B. G. de; SANTANA, M. H. A.; SILVA, M. V. G. B.; FERRAZ, J. B. S.; GARRICK, D. J. Genome-wide association study in reproductive trait of Nellore heifers. In: PLANT & ANIMAL GENOME, 24., 2016, San Diego. [Proceedings...] San Diego, 2016.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
Visualizar detalhes do registroImprime registro no formato completo
4.Imagem marcado/desmarcadoCHUD, T. C. S.; SILVA, M. V. G. B.; CARMO, A. S.; SILVA, T. B. R.; OLIVEIRA JUNIOR, G. A.; REY, F. S. B.; MUNARI, D. P. Identification of copy number variation in Brazilian synthetic dairy cattle breed In: ADSA ASAS JOINT ANNUAL MEETING, 2015, Orlando. Proceedings... Orlando: ADSA - ASAS, 2015.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
Visualizar detalhes do registroImprime registro no formato completo
5.Imagem marcado/desmarcadoCARMO, A. S. do; OLIVEIRA JÚNIOR, G. A. de; CHUD, T. C. S.; PANETTO, J. C. do C.; VERNEQUE, R. da S.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B. Genome Wide CNVs analysis to identify variants associated with coat color in Gyr breed. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 52., 2015, Belo Horizonte. Zootecnia: otimizando recursos e potencialidades: anais. Belo Horizonte: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2015. 3 p.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
6.Imagem marcado/desmarcadoCARMO, A. S. do; OLIVEIRA JÚNIOR, G. A. de; CHUD, T. de O. S.; PANETTO, J. C. do C.; VERNEQUE, R. da S.; MACHADO, M. A.; COLE, J. B.; SILVA, M. V. G. B. Identificação de CNVs associados com características reprodutivas e produtivas em animais Gir Leiteiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 25., 2015, Fortaleza. Dimensões tecnológicas e sociais da zootecnia: anais. Fortaleza: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2015. 3 p. ZOOTEC
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
7.Imagem marcado/desmarcadoOLIVEIRA JÚNIOR, G. A.; CHUD, T. C. S.; VENTURA, R. V.; GARRICK, D. J.; COLE, J. B.; MUNARI, D. P.; FERRAZ, J. B. S.; MULLART, E.; DeNISE, S.; SMITH, S.; SILVA, M. V. G. B. Genotype imputation in a tropical crossbred dairy cattle population. Journal of Dairy Science, v. 100, n. 12, p. 9623-9634, 2017.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
Visualizar detalhes do registroImprime registro no formato completo
8.Imagem marcado/desmarcadoPEREZ, B. C.; BALIEIRO, J. C. C.; OLIVEIRA JUNIOR, G. A.; ANDRIETTA, L. T.; VIZONÁ, R. G.; VENTURA, R. V.; BRUNELI, F. A. T.; PEIXOTO, M. G. C. D. State of inbreeding and genetic trends for estimated breeding values in IVF embryos and oocyte donors in the Brazilian Guzera cattle. Theriogenology, v. 125, p. 71-78, 2019.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
Visualizar detalhes do registroAcesso restrito ao objeto digitalImprime registro no formato completo
9.Imagem marcado/desmarcadoSANTANA, M. H. de A.; OLIVEIRA JUNIOR, G. A.; CESAR, A. S. M.; FREUA, M. C.; GOMES, R. da C.; SILVA, S. da L.; LEME, P. R.; FUKUMASU, H.; CARVALHO, M. E.; VENTURA, R. V.; COUTINHO, L. L.; KADARMIDEEN, H. N.; FERRAZ, J. B. S. Copy number variations and genome-wide associations reveal putative genes and metabolic pathways involved with the feed conversion ratio in beef cattle. Journal of Applied Gentics, v. 57, n. 4, p. 495-504, 2016
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
Registros recuperados : 9
Primeira ... 1 ... Última
Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada.
 
 

Embrapa
Todos os direitos reservados, conforme Lei n° 9.610
Política de Privacidade
Área Restrita

Embrapa Informática Agropecuária
Av. André Tosello, 209 - Barão Geraldo
Caixa Postal 6041- 13083-886 - Campinas, SP
PABX: SAC (19) 3211-5743
SAC: https://www.embrapa.br/fale-conosco

Valid HTML 4.01 Transitional