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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
31/05/2016 |
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Data da última atualização: |
11/10/2016 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
GONÇALVES, F. J.; FILIPPI, M. C. C. de; LOBO, V. L. S.; ARAÚJO, L. G.; SILVA, G. B.; COELHO, A. S. G.; PRABHU, A. S. |
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Afiliação: |
FABIO JOSE GONÇALVES; MARTA CRISTINA CORSI DE FILIPPI, CNPAF; VALACIA LEMES DA SILVA LOBO, CNPAF; LEILA GARCÊS ARAÚJO, UFG; GISELE BARATA SILVA, UFRA; ALEXANDRE SIQUEIRA GUEDES COELHO, UFV; ANNE SITARAMA PRABHU, CNPAF. |
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Título: |
Polymorphism detection by microsatellite markers in a Magnaporthe oryzae population from different geographical areas of Brazil. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Phytopathology, v. 164, n. 9, p. 620-630, Sept. 2016. |
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ISSN: |
0931-1785 |
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DOI: |
10.1111/jph.12485 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
This study aimed to examine Brazilian M. oryzae populations using 18 microsatellites. Fifty cultivars were sown in plastic trays for the pathotyping of 847 isolates. The DNA of 494 isolates was extracted and purified using the modified Doyle and Doyle method, the genetic structure was determined by the software Structure, and the actual number was selected from the prediction method based on the K values. Nei's genetic distance among the subpopulations was determined with the aid of the program Genetix, and the amova was performed with the program Arlequin. Out of 847 inoculated monosporic isolates, 528 infected their respective cultivars; of the 528 isolates pathotyped, there was a prevalence of group IA and pathotype IF-1, which was the most frequent pathotype in the rice production areas of Brazil. The Bayesian clustering analysis indicated that 19 was the optimal value of K; this value was the lowest standard deviation and log (ln K) closest to zero, which predicted the 494 isolates of M. oryzae that were selected for molecular studies to be grouped into 19 subpopulations. The AMOVA detected a 37.13% variability within the 19 subpopulations and 62.87% variability among the subpopulations. The polymorphic information content (PIC) ranged from 0 to 0.756. Thirty three rare alleles were found distributed among 15 out of 19 subpopulations. The Margalef index ranged from 38.69 to 79.21 for all 18 analysed locus. The results indicated that the identification of different blast resistance genes must consider the composition of each subpopulation and that the identification is most effective when performed within a subpopulation and then between subpopulations. MenosThis study aimed to examine Brazilian M. oryzae populations using 18 microsatellites. Fifty cultivars were sown in plastic trays for the pathotyping of 847 isolates. The DNA of 494 isolates was extracted and purified using the modified Doyle and Doyle method, the genetic structure was determined by the software Structure, and the actual number was selected from the prediction method based on the K values. Nei's genetic distance among the subpopulations was determined with the aid of the program Genetix, and the amova was performed with the program Arlequin. Out of 847 inoculated monosporic isolates, 528 infected their respective cultivars; of the 528 isolates pathotyped, there was a prevalence of group IA and pathotype IF-1, which was the most frequent pathotype in the rice production areas of Brazil. The Bayesian clustering analysis indicated that 19 was the optimal value of K; this value was the lowest standard deviation and log (ln K) closest to zero, which predicted the 494 isolates of M. oryzae that were selected for molecular studies to be grouped into 19 subpopulations. The AMOVA detected a 37.13% variability within the 19 subpopulations and 62.87% variability among the subpopulations. The polymorphic information content (PIC) ranged from 0 to 0.756. Thirty three rare alleles were found distributed among 15 out of 19 subpopulations. The Margalef index ranged from 38.69 to 79.21 for all 18 analysed locus. The results indicated that the identification of different blast... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Arroz; Brusone; Marcador molecular; Oryza sativa. |
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Thesaurus Nal: |
Blast disease; Magnaporthe oryzae; Microsatellite repeats; Rice. |
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Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
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Marc: |
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005 2016-10-11
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260 $c2016
520 $aThis study aimed to examine Brazilian M. oryzae populations using 18 microsatellites. Fifty cultivars were sown in plastic trays for the pathotyping of 847 isolates. The DNA of 494 isolates was extracted and purified using the modified Doyle and Doyle method, the genetic structure was determined by the software Structure, and the actual number was selected from the prediction method based on the K values. Nei's genetic distance among the subpopulations was determined with the aid of the program Genetix, and the amova was performed with the program Arlequin. Out of 847 inoculated monosporic isolates, 528 infected their respective cultivars; of the 528 isolates pathotyped, there was a prevalence of group IA and pathotype IF-1, which was the most frequent pathotype in the rice production areas of Brazil. The Bayesian clustering analysis indicated that 19 was the optimal value of K; this value was the lowest standard deviation and log (ln K) closest to zero, which predicted the 494 isolates of M. oryzae that were selected for molecular studies to be grouped into 19 subpopulations. The AMOVA detected a 37.13% variability within the 19 subpopulations and 62.87% variability among the subpopulations. The polymorphic information content (PIC) ranged from 0 to 0.756. Thirty three rare alleles were found distributed among 15 out of 19 subpopulations. The Margalef index ranged from 38.69 to 79.21 for all 18 analysed locus. The results indicated that the identification of different blast resistance genes must consider the composition of each subpopulation and that the identification is most effective when performed within a subpopulation and then between subpopulations.
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 57 | |
| 1. |  | ARAÚJO, E. A. de; MOREIRA, W. C. de L.; SILVA, J. de F.; BARDALES, N. G.; AMARAL, E. F. do; PEREIRA, S. dos S.; OLIVEIRA, E. de; SOUZA, R. E. de; SILVA, S. S. da; MELO, A. W. F. de. Levantamento pedológico: aptidão agrícola e estratificação pedoambiental do Campus Floresta, Cruzeiro do Sul - Acre. Ananindeua, PA: Itacaiúnas, 2019. 113 p. Contém 1 mapa.| Tipo: Autoria/Organização/Edição de Livros |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 2. | | BIEGELMEYER, P.; ALVES, B. F.; DANELUZ, M. O.; TORRES, M. I. de T.; GOMES, C. C. G.; CARDOSO, F. F.; SANTOS, T. R. B. dos; SILVA, S. S. da; NIZOLI, L. Q.; DIONELLO, N. J. L. Efeito da resistência de bovinos ao carrapato sobre a eficiência reprodutiva de fêmeas de rhipicephalus (boophilus) microplus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MEDICINA VETERINARIA, 38., 2011, Florianópolis, SC. [Anais...]. Florianópolis: Sociedade Brasileira de Medicina Veterinária, 2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 3. | | BIEGELMEYER, P.; ALVES, B. F.; DANELUZ, M. O.; TORRES, M. I. de T.; GOMES, C. C. G.; CARDOSO, F. F.; SILVA, S. S. da; NIZOLI, L. Q.; DIONELLO, N. J. L. Relação entre o número de carrapatos e parâmetros hematológicos de bovinos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MEDICINA VETERINARIA, 38., 2011, Florianópolis, SC. [Anais...]. Florianópolis: Sociedade Brasileira de Medicina Veterinária, 2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 4. | | BIEGELMEYER, P.; GOMES, C. C. G.; CARDOSO, F. F.; ROSO, V. M.; NIZOLI, L. Q.; SILVA, S. S. da; DIONELLO, N. J. L. Distribuição de rhipicephalus (boophilus) microplus em diferentes regiões corporais de bovinos resistentes e suscetíveis ao carrapato. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MEDICINA VETERINARIA, 38., 2011, Florianópolis, SC. [Anais...]. Florianópolis: Sociedade Brasileira de Medicina Veterinária, 2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 5. | | BIEGELMEYER, P.; NIZOLI, L. Q.; SILVA, S. S. da; GOMES, C. C. G.; CARDOSO, F. F.; DIONELLO, N. J. L. Quadro eritrocitário e ganho de peso de bovinos resistentes e suscetíveis ao carrapato Rhipicephalus (Boophilus) microplus infestados artificialmente. In: ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO UFPEL, 13., 2011, Pelotas, RS. Anais... Pelotas: UFPEL, 2011. Organizado por: Márcio Nunes Corrêa, Valmor João Bianchi, Jacira Bolacell Braga e Valdecir Carlos Ferri.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 6. | | BIEGELMEYER, P.; NIZOLI, L. Q.; SILVA, S. S. da; SANTOS, T. R. B. dos; DIONELLO, N. J. L.; GULIAS-GOMES, C. C.; CARDOSO, F. F. Bovine genetic resistance effects on biological traits of Rhipicephalus (Boophilus) microplus. Veterinary Parasitology, v. 208, n. 3/4, p. 231-237, Mar. 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 7. | | BOTELHO, D. de O.; SILVA, S. S. da; AMÂNCIO, R.; PEREIRA, J. R.; AMÂNCIO, C. O. da G. Icms-ecológico como instrumento de política ambiental em Minas Gerais. In: CONGRESSO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ECONOMIA, ADMINISTRAÇÃO E SOCIOLOGIA RURAL, 45., 2007, Londrina. Conhecimentos para a agricultura do futuro. Brasília, DF: Sober; Londrina: Universidade Estadual de Londrina: IAPAR, 2007. 21 p. Disponível no CD2008.00008.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 9. | | CROUS, P. W.; WINGFIELD, M. J.; BURGESS, T. I.; HARDY, G. E. ST. J.; CRANE, C.; BARRETT, S.; CANO-LIRA, J. F.; LEROUX, J. J.; THANGAVEL, R.; GUARRO, J.; STCHIGEL, A. M.; MARTÍN, M. P.; ALFREDO, D. S.; BARBER, P. A.; BARRETO, R. W.; BASEIA, I. G.; CANO-CANALS, J.; CHEEWANGKOON, R.; FERREIRA, R. J.; GENÉ, J.; LECHAT, C.; MORENO, G.; ROETS, F.; SHIVAS, R. G.; SOUSA, J. O.; TAN, Y. P.; WIEDERHOLD, N. P.; ABELL, S. E.; ACCIOLY, T.; ALBIZU, J. L.; ALVES, J. L.; ANTONIOLLI, Z. I.; APLIN, N.; ARAÚJO, J.; ARZANLOU, M.; BEZERRA, J. D. P.; BOUCHARA, J.-P.; CARLAVILLA, J. R.; CASTILLO, A.; CASTROAGUDÍN, V. L.; CERESINI, P. C.; CLARIDGE, G. F.; COELHO, G.; COIMBRA, V. R. M.; COSTA, L. A.; CUNHA, K. C. da; SILVA, S. S. da; DANIEL, R.; DE BEER, Z. W.; DUEÑAS, M.; EDWARDS, J.; ENWISTLE, P.; FIUZA, P. O.; FOURNIER, J.; GARCÍA, D.; GIBERTONI, T. B.; GIRAUD, S.; GUEVARA-SUAREZ, M.; GUSMÃO, L. F. P.; HAITUK, S.; HEYKOOP, M.; HIROOKA, Y.; HOFMANN, T. A.; HOUBRAKEN, J.; HUGHES, D. P.; KAUTMANOVÁ, I.; KOPPEL, O.; KOUKOL, O.; LARSSON, E.; LATHA, K. P. D.; LEE, D. H.; LISBOA, D. O.; LISBOA, W. S.; LÓPEZ-VILLALBA, Á.; MACIEL, J. L. N.; MANIMOHAN, P.; MANJÓN, J. L.; MARINCOWITZ, S.; MARNEY, T. S.; MEIJER, M.; MILLER, A. N.; OLARIAGA, I.; PAIVA, L. M.; PIEPENBRING, M.; POVEDA-MOLERO, J. C.; RAJ, K. N. A.; RAJA, H. A.; ROUGERON, A.; SALCEDO, I.; SAMADI, R.; SANTOS, T. A. B.; SCARLETT, K.; SEIFERT, K. A.; SHUTTLEWORTH, L. A.; SILVA, G. A.; SILVA, M.; SIQUEIRA, J. P. Z.; SOUZA-MOTTA, C. M.; STEPHENSON, S. L. Fungal planet description sheets: 469-557. Persoonia, Leiden, v. 37, p. 218-403, Dec. 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 10. | | FIGUEIREDO, R. F. de; VASCONCELOS, M. A. M.; KATO, O. R.; FREITAS, L. de S.; SILVA, S. S. da. Zoneamento participativo e tipologia de sistemas de produção familiares - pista para uma intervenção dialogada de política pública no polo Rio Capim, nordeste paraense. In: ENCONTRO AMAZÔNICO DE AGRÁRIAS, 4., 2012, Belém, PA. Agricultura familiar: mecanismos de desenvolvimento no cenário amazônico: anais. Belém, PA: UFRA, 2012. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 11. | | GOMES, J. I.; SILVA, S. S. da. Aproveitamento de resíduos de madeira de três empresas madeireiras do Pará. In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 54.; REUNIÃO AMAZÔNICA DE BOTÂNICA, 3., 2003, Belém, PA. Botânica: desafios da botânica brasileira no novo milênio: inventário, sistematização, conservação e uso da diversidade vegetal: resumos. Belém, PA: Sociedade Botânica do Brasil: UFRA: Museu Paraense Emílio Goeldi: Embrapa Amazônia Oriental, 2003. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 12. | | LESSA, L. S.; OLIVEIRA, T. K. de; MORAES, R. N. de S.; SILVA, S. S. da. Aptidão natural para o cultivo de citros. In: MORAES, R. N. de S.; OLIVEIRA, T. K. de; VALENTIM, J. F. (org.). Aptidão natural dos solos do Pólo Agroflorestal Geraldo Mesquita, no município de Rio Branco, AC. Rio Branco, AC: Prefeitura Municipal, 2008. p. 123-131.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 13. | | LIMA, G. S. de; SOARES, L. A. dos A.; NOBRE, R. G.; GHEYI, H. R.; LOURENÇO, G. da S.; SILVA, A. O. da; SILVA, S. S. da. Efeito da adubação nitrogenada sobre os componentes de produção da mamoneira sob condições de estresse salino. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 5.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE OLEAGINOSAS ENERGÉTICAS, 2.; FÓRUM CAPIXABA DE PINHÃO-MANSO, 1., 2012, Guarapari. Desafios e Oportunidades: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2012. p. 81| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 14. | | LIMA, G. S. de; SOARES, L. A. dos A.; NOBRE, R. G.; GHEYI, H. R.; SILVA, A. O. da; SILVA, S. S. da; LOURENÇO, G. da S. Participação de fitomassa da mamoneira BRS ENERGIA sob estresse salino e adubação nitogenada. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 5.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE OLEAGINOSAS ENERGÉTICAS, 2.; FÓRUM CAPIXABA DE PINHÃO-MANSO, 1., 2012, Guarapari. Desafios e Oportunidades: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2012. p. 96| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 15. | | LIMA, G. S. de; SOARES, L. A. dos A.; NOBRE, R. G.; GHEYI, H. R.; SILVA, S. S. da; LOURENÇO, G. da S.; SILVA, A. O. da. Variáveis de crescimento da mamoneira BRS ENERGIA sob estresse salino e doses de nitrogênio. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 5.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE OLEAGINOSAS ENERGÉTICAS, 2.; FÓRUM CAPIXABA DE PINHÃO-MANSO, 1., 2012, Guarapari. Desafios e Oportunidades: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2012. p. 104| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 16. | | LIMA, G. S. de; SOARES, L. A. dos A.; NOBRE, R. G.; GHEYI, H. R.; SILVA, S. S. da; LOURENÇO, G. da S.; SILVA, A. O. da. Taxas de crescimento em altura e diâmetro caulinar da mamoneira cultivada com águas salinas e doses de nitrogênio. CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 5; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE OLEAGINOSAS ENERGÉTICAS, 2 & I FÓRUM CAPIXABA DEPINHÃO MANSO, 2012, Guarapari. Desafios e Oportunidades: Anais. Campina grande: Embrapa Algodão, 2012. p. 103| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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