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Biblioteca(s):  Embrapa Pecuária Sul; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Suínos e Aves.
Data corrente:  20/04/2016
Data da última atualização:  08/08/2017
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  ZANELLA, R.; PEIXOTO, J. de O.; CARDOSO, F. F.; CARDOSO, L. L.; BIEGELMEYER, P.; CANTAO, M. E.; OTAVIANO, A.; FREITAS, M. S.; CAETANO, A. R.; LEDUR, M. C.
Afiliação:  RICARDO ZANELLA, CNPSA; JANE DE OLIVEIRA PEIXOTO, CNPSA; FERNANDO FLORES CARDOSO, CPPSUL; Leandro L. Cardoso, BOLSISTA CPPSUL; PATRÍCIA BIEGELMEYER, UFPEL; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; ANTONIO OTAVIANO, BRF/SA; Marcelo S. Freitas, BRF/SA; ALEXANDRE RODRIGUES CAETANO, Cenargen; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA.
Título:  Genetic diversity analysis of two commercial breeds of pigs using genomic and pedigree data.
Ano de publicação:  2016
Fonte/Imprenta:  Genetics Selection Evolution, v. 48, 30 Mar. 2016.
Idioma:  Inglês
Notas:  Article 24.
Conteúdo:  Abstract Background: Genetic improvement in livestock populations can be achieved without significantly affecting genetic diversity if mating systems and selection decisions take genetic relationships among individuals into consideration. The objective of this study was to examine the genetic diversity of two commercial breeds of pigs. Genotypes from 1168 Landrace (LA) and 1094 Large White (LW) animals from a commercial breeding program in Brazil were obtained using the Illumina PorcineSNP60 Beadchip. Inbreeding estimates based on pedigree (Fx) and genomic information using runs of homozygosity (FROH) and the single nucleotide polymorphisms (SNP) by SNP inbreeding coefficient (FSNP) were obtained. Linkage disequilibrium (LD), correlation of linkage phase (r) and effective population size (Ne) were also estimated. Results: Estimates of inbreeding obtained with pedigree information were lower than those obtained with genomic data in both breeds. We observed that the extent of LD was slightly larger at shorter distances between SNPs in the LW population than in the LA population, which indicates that the LW population was derived from a smaller Ne. Estimates of Ne based on genomic data were equal to 53 and 40 for the current populations of LA and LW, respectively. The correlation of linkage phase between the two breeds was equal to 0.77 at distances up to 50 kb, which suggests that genome-wide association and selection should be performed within breed. Although selection intens... Mostrar Tudo
Palavras-Chave:  Mlhoramento genético animal.
Thesagro:  Genética animal; Raça; Suíno.
Thesaurus NAL:  Animal breeding; Swine production.
Categoria do assunto:  --
URL:  http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/148369/1/12711-2016-Article-203.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Pecuária Sul (CPPSUL)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status
CENARGEN36431 - 1UPCSP - DDSP 20921SP 20921
CNPSA20669 - 1UPCAP - DD
CPPSUL13856 - 1UMTAP - DD

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1.Imagem marcado/desmarcadoZANELLA, R.; PEIXOTO, J. de O.; CARDOSO, F. F.; CARDOSO, L. L.; BIEGELMEYER, P.; CANTAO, M. E.; OTAVIANO, A.; FREITAS, M. S.; CAETANO, A. R.; LEDUR, M. C. Genetic diversity analysis of two commercial breeds of pigs using genomic and pedigree data. Genetics Selection Evolution, v. 48, 30 Mar. 2016. Article 24.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Suínos e Aves.
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