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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
24/10/2012 |
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Data da última atualização: |
20/02/2015 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
RESENDE JUNIOR, M. F. R.; MUÑOZ, P.; RESENDE, M. D. V. de; GARRICK, D. J.; FERNANDO, R. L.; DAVIS, J. M.; JOKELA, E. J.; MARTIN, T. A.; PETER, G. F.; KIRST, M. |
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Afiliação: |
M. F. R. RESENDE JUNIOR, UNIVERSITY OF FLORIDA; P. MUÑOZ, UNIVERSITY OF FLORIDA; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; D. J. GARRICK, IOWA STATE UNIVERSITY; R. L. FERNANDO, IOWA STATE UNIVERSITY; J. M. DAVIS, UNIVERSITY OF FLORIDA; E. J. JOKELA, UNIVERSITY OF FLORIDA; T. A. MARTIN, UNIVERSITY OF FLORIDA; G. F. PETER, UNIVERSITY OF FLORIDA; M. KIRST, UNIVERSITY OF FLORIDA. |
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Título: |
Accuracy of genomic selection methods in a standard data set of loblolly pine (Pinus taeda L.) |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics, v. 190, p. 1503-1510, April 2012. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Genomic selection can increase genetic gain per generation through early selection. Genomic selection is expected to be particularly valuable for traits that are costly to phenotype and expressed late in the life cycle of long-lived species. Alternative approaches to genomic selection prediction models may perform differently for traits with distinct genetic properties. Here the performance of four different original methods of genomic selection that differ with respect to assumptions regarding distribution of marker effects, including (i) ridge regression–best linear unbiased prediction (RR–BLUP), (ii) Bayes A, (iii) Bayes Cp, and (iv) Bayesian LASSO are presented. In addition, a modified RR–BLUP (RR–BLUP B) that utilizes a selected subset of markers was evaluated. The accuracy of these methods was compared across 17 traits with distinct heritabilities and genetic architectures, including growth, development, and disease-resistance properties, measured in a Pinus taeda (loblolly pine) training population of 951 individuals genotyped with 4853 SNPs. The predictive ability of the methods was evaluated using a 10-fold, cross-validation approach, and differed only marginally for most method/trait combinations. Interestingly, for fusiform rust disease-resistance traits, Bayes Cp, Bayes A, and RR–BLUB B had higher predictive ability than RR–BLUP and Bayesian LASSO. Fusiform rust is controlled by few genes of large effect. A limitation of RR–BLUP is the assumption of equal contribution of all markers to the observed variation. However, RR-BLUP B performed equally well as the Bayesian approaches.The genotypic and phenotypic data used in this study are publically available for comparative analysis of genomic selection prediction models. MenosGenomic selection can increase genetic gain per generation through early selection. Genomic selection is expected to be particularly valuable for traits that are costly to phenotype and expressed late in the life cycle of long-lived species. Alternative approaches to genomic selection prediction models may perform differently for traits with distinct genetic properties. Here the performance of four different original methods of genomic selection that differ with respect to assumptions regarding distribution of marker effects, including (i) ridge regression–best linear unbiased prediction (RR–BLUP), (ii) Bayes A, (iii) Bayes Cp, and (iv) Bayesian LASSO are presented. In addition, a modified RR–BLUP (RR–BLUP B) that utilizes a selected subset of markers was evaluated. The accuracy of these methods was compared across 17 traits with distinct heritabilities and genetic architectures, including growth, development, and disease-resistance properties, measured in a Pinus taeda (loblolly pine) training population of 951 individuals genotyped with 4853 SNPs. The predictive ability of the methods was evaluated using a 10-fold, cross-validation approach, and differed only marginally for most method/trait combinations. Interestingly, for fusiform rust disease-resistance traits, Bayes Cp, Bayes A, and RR–BLUB B had higher predictive ability than RR–BLUP and Bayesian LASSO. Fusiform rust is controlled by few genes of large effect. A limitation of RR–BLUP is the assumption of equal contrib... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Precisão. |
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Thesagro: |
Pinus Taeda; Seleção Genética. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
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Data corrente: |
20/04/2018 |
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Data da última atualização: |
13/01/2023 |
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Autoria: |
COSTA, A. S. da; AGUIAR, S. H. S. |
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Afiliação: |
ANDRESA SOARES DA COSTA; STEPHANE HAYARA SILVA AGUIAR. |
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Título: |
Manejo da adubação fosfatada por meio da combinação de fontes de fosfato reativo e solúvel no desenvolvimento inicial de paricá (Schizolobium parahyba var.amazonicum) em Latossolo Amarelo no sudeste paraense. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
2014. |
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Páginas: |
38 f. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia Florestal) - Universidade Federal Rural da Amazônia, Belém, PA. Orientador: Rodrigo Silva do Vale; Co-orientador: Edilson Carvalho Brasil, Embrapa Amazônia Oriental. |
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Conteúdo: |
Na Amazônia, a busca de conhecimentos em silvicultura das espécies florestais vem se destacando ao longo dos anos, principalmente de espécies florestais nativas como o paricá (Schizolobium parahyba var. amazonicum). Este trabalho teve como objetivo avaliar o efeito da combinação de fosfato reativo e solúvel no desenvolvimento inicial de plantas de paricá em um Latossolo Amarelo no sudeste paraense. A área utilizada pertence à empresa Ciprasa situada na fazenda Nevada, localizada no município de Ulianópolis - PA. O experimento foi instalado em fevereiro de 2012. O paricá foi plantado em um módulo florestal consorciado com andiroba e castanha-do-pará, utilizando-se o espaçamento de 3x3 metros. Utilizou-se o delineamento experimental em blocos casualizados,com três repetições, sendo que cada parcela foi constituída por quatro plantas úteis. Os tratamentos consistiram na aplicação combinada de fontes de fosfato reativo (Bayóvar) e solúvel (super fosfato simples) em diferentes quantidades calculadas com base no teor total de 160 kg/ha-1 de P2O5. Foram utilizados oito tratamentos, totalizando 24 parcelas experimentais. A análise de variância pelo teste Tukey a 5% de probabilidade, evidenciou que somente houve efeito significativo dos tratamentos sobre a altura das plantas a partir dos 18 meses após o plantio. A combinação que obteve os melhores resultados no desenvolvimento das plantas foi a aplicação de 80 BAY + 60 SFS e 120 de BAY + 20 SFS. Essas duas combinações confirmam a utilização do fosfato natural Bayovar nas plantações de paricá, pois a quantidade usada deste nutriente foi que mostrou melhor desempenho em termos de crescimento em altura. A partir dos 18 meses de idade, o crescimento em diâmetro (DAP) das plantas de paricá também foi influenciado significativamente pela aplicação combinada das fontes fosfatadas. Nesse contexto, a combinação de fonte reativa e solúvel representa uma excelente opção para o aumento da eficiência da adubação fosfatada para cultivos comercias de paricá,aliado às práticas mais efetivas de conservação do solo e aumento da produtividade. MenosNa Amazônia, a busca de conhecimentos em silvicultura das espécies florestais vem se destacando ao longo dos anos, principalmente de espécies florestais nativas como o paricá (Schizolobium parahyba var. amazonicum). Este trabalho teve como objetivo avaliar o efeito da combinação de fosfato reativo e solúvel no desenvolvimento inicial de plantas de paricá em um Latossolo Amarelo no sudeste paraense. A área utilizada pertence à empresa Ciprasa situada na fazenda Nevada, localizada no município de Ulianópolis - PA. O experimento foi instalado em fevereiro de 2012. O paricá foi plantado em um módulo florestal consorciado com andiroba e castanha-do-pará, utilizando-se o espaçamento de 3x3 metros. Utilizou-se o delineamento experimental em blocos casualizados,com três repetições, sendo que cada parcela foi constituída por quatro plantas úteis. Os tratamentos consistiram na aplicação combinada de fontes de fosfato reativo (Bayóvar) e solúvel (super fosfato simples) em diferentes quantidades calculadas com base no teor total de 160 kg/ha-1 de P2O5. Foram utilizados oito tratamentos, totalizando 24 parcelas experimentais. A análise de variância pelo teste Tukey a 5% de probabilidade, evidenciou que somente houve efeito significativo dos tratamentos sobre a altura das plantas a partir dos 18 meses após o plantio. A combinação que obteve os melhores resultados no desenvolvimento das plantas foi a aplicação de 80 BAY + 60 SFS e 120 de BAY + 20 SFS. Essas duas combinações confirmam a uti... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Combinações fosfatadas; Modelo florestal; Tratamento silvicultural. |
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Categoria do assunto: |
K Ciência Florestal e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/175765/1/TCC-Stephane.pdf
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Marc: |
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245 $aManejo da adubação fosfatada por meio da combinação de fontes de fosfato reativo e solúvel no desenvolvimento inicial de paricá (Schizolobium parahyba var.amazonicum) em Latossolo Amarelo no sudeste paraense.$h[electronic resource]
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500 $aTrabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia Florestal) - Universidade Federal Rural da Amazônia, Belém, PA. Orientador: Rodrigo Silva do Vale; Co-orientador: Edilson Carvalho Brasil, Embrapa Amazônia Oriental.
520 $aNa Amazônia, a busca de conhecimentos em silvicultura das espécies florestais vem se destacando ao longo dos anos, principalmente de espécies florestais nativas como o paricá (Schizolobium parahyba var. amazonicum). Este trabalho teve como objetivo avaliar o efeito da combinação de fosfato reativo e solúvel no desenvolvimento inicial de plantas de paricá em um Latossolo Amarelo no sudeste paraense. A área utilizada pertence à empresa Ciprasa situada na fazenda Nevada, localizada no município de Ulianópolis - PA. O experimento foi instalado em fevereiro de 2012. O paricá foi plantado em um módulo florestal consorciado com andiroba e castanha-do-pará, utilizando-se o espaçamento de 3x3 metros. Utilizou-se o delineamento experimental em blocos casualizados,com três repetições, sendo que cada parcela foi constituída por quatro plantas úteis. Os tratamentos consistiram na aplicação combinada de fontes de fosfato reativo (Bayóvar) e solúvel (super fosfato simples) em diferentes quantidades calculadas com base no teor total de 160 kg/ha-1 de P2O5. Foram utilizados oito tratamentos, totalizando 24 parcelas experimentais. A análise de variância pelo teste Tukey a 5% de probabilidade, evidenciou que somente houve efeito significativo dos tratamentos sobre a altura das plantas a partir dos 18 meses após o plantio. A combinação que obteve os melhores resultados no desenvolvimento das plantas foi a aplicação de 80 BAY + 60 SFS e 120 de BAY + 20 SFS. Essas duas combinações confirmam a utilização do fosfato natural Bayovar nas plantações de paricá, pois a quantidade usada deste nutriente foi que mostrou melhor desempenho em termos de crescimento em altura. A partir dos 18 meses de idade, o crescimento em diâmetro (DAP) das plantas de paricá também foi influenciado significativamente pela aplicação combinada das fontes fosfatadas. Nesse contexto, a combinação de fonte reativa e solúvel representa uma excelente opção para o aumento da eficiência da adubação fosfatada para cultivos comercias de paricá,aliado às práticas mais efetivas de conservação do solo e aumento da produtividade.
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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