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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
14/03/2011 |
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Data da última atualização: |
14/03/2011 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
ALMEIDA, J. D. de; BARROS, L. M. G.; SANTOS, D. B. M.; COTTA, M. G.; BARBOSA, E. A.; CAÇÃO, S. B.; EIRA, M. T. S. da; ALVES, G. S. C.; VINECKY, F.; PEREIRA, L. F. P.; SILVA, F. R. da; ANDRADE, A. C.; MARRACCINI, P.; CARNEIRO, M. |
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Afiliação: |
JULIANA DANTAS DE ALMEIDA, CENARGEN; LEILA MARIA GOMES BARROS, CENARGEN; IAPAR; MIRIAN THEREZINHA SOUZA DA EIRA, SAPC; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, SAPC; ALAN CARVALHO ANDRADE, CENARGEN; CIRAD UMR-DAP; MAURO CARNEIRO, CENARGEN. |
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Título: |
Prospection of tissue specific promoters in coffee. |
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Ano de publicação: |
2008 |
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Fonte/Imprenta: |
In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 22. 2008, Campinas, São Paulo, Brazil. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The majority of transgenic organisms reported in the literature have been made using constitutive promoters. However, there are economic, environmental and biosecurity related restrictions involving indiscriminate (constitutive) expression of heterologous genes. The usage of tissue-specific and induced promoters can resolve those issues by limiting the expression of a transgene to the necessary tissues and conditions. The promoters currently used at Embrapa are transnational properties, burdening the research and causing technological dependence. Therefore, the objective of this work was to find and characterize tissue and organ specific promoter in Coffea spp. We have used the Coffee genome database in silico tools to find genes preferentially expressed in root, leaf and fruit. In this way we found 72 organ-specific candidates: 18 apparently preferentially expressed on leaves, 14 on roots and 40 on fruits. Some of those candidates were tested in vitro using RT-PCR, semiquantitative PCR, northern blotting and qPCR assays. All four leaf-specific candidates tested (GCFo1, GCFo2, GCFo3 and GCFo4) and at least one of the two fruit-specific candidates tested (GCFr1 e GCFr2) where confirmed to be preferentially expressed on their respective organs. Temporal and spatial expression assays showed that GCFr2 has its expression peak at the endosperm, 180 days after flowering. The highest expressed genes of leaf (GCFo3 and GCFo4) and fruit (GCFr2) were used as probes to isolate its respective promoter through a BAC libraries screening or using the Genome Walker Universal Kit (Clontech). Results concerning gene expression and the molecular characterization of these genes will be presented. MenosThe majority of transgenic organisms reported in the literature have been made using constitutive promoters. However, there are economic, environmental and biosecurity related restrictions involving indiscriminate (constitutive) expression of heterologous genes. The usage of tissue-specific and induced promoters can resolve those issues by limiting the expression of a transgene to the necessary tissues and conditions. The promoters currently used at Embrapa are transnational properties, burdening the research and causing technological dependence. Therefore, the objective of this work was to find and characterize tissue and organ specific promoter in Coffea spp. We have used the Coffee genome database in silico tools to find genes preferentially expressed in root, leaf and fruit. In this way we found 72 organ-specific candidates: 18 apparently preferentially expressed on leaves, 14 on roots and 40 on fruits. Some of those candidates were tested in vitro using RT-PCR, semiquantitative PCR, northern blotting and qPCR assays. All four leaf-specific candidates tested (GCFo1, GCFo2, GCFo3 and GCFo4) and at least one of the two fruit-specific candidates tested (GCFr1 e GCFr2) where confirmed to be preferentially expressed on their respective organs. Temporal and spatial expression assays showed that GCFr2 has its expression peak at the endosperm, 180 days after flowering. The highest expressed genes of leaf (GCFo3 and GCFo4) and fruit (GCFr2) were used as probes to isolate its resp... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Coffee. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Semiárido. |
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Data corrente: |
20/12/2018 |
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Data da última atualização: |
26/01/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
SILVA, F. F. S. da; OLIVEIRA, G. M. de; PELACANI, C. R.; TAURA, T. A.; DANTAS, B. F. |
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Afiliação: |
FABRÍCIO FRANCISCO SANTOS DA SILVA; GILMARA MOREIRA DE OLIVEIRA; CLAUDINÉIA REGINA PELACANI; TATIANA AYAKO TAURA, CPATSA; BARBARA FRANCA DANTAS, CPATSA. |
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Título: |
Árvores matrizes de Myracrodruon urundeuva em área de coleta de sementes. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
In: JORNADA DE INTEGRAÇÃO DA PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 3., 2018, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2018. |
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Páginas: |
p. 123-129. |
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Série: |
(Embrapa Semiárido. Documentos, 284). |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Todo o processo produtivo, desde a coleta até a comercialização de sementes florestais, envolve diversos trâmites burocráticos que garantem, de certa forma, a qualidade do material a ser comercializado. A marcação prévia de plantas matrizes economizaria tempo, principalmente para o pequeno produtor que detém algum remanescente de área florestal em sua propriedade. Objetivou--se com este estudo apresentar uma lista de plantas matrizes de Myracrodruon urundeuva possibilitando a coleta de sementes de forma rápida e eficiente. Foram marcadas 36 plantas matrizes de M. urundeuva entre os anos de 2015 e 2016. De cada planta, foram coletados dados dendrométricos, coordenadas geográficas e tipo de solo. As plantas marcadas pertencem a três biomas: Caatinga, Cerrado e Pantanal. A altura das plantas variou entre 5 m e 23,3 m. Foram categorizados quatro tipos de solos. As árvores matrizes marcadas na Caatinga apresentaram menor altura total (11 m) em relação às árvores do Pantanal (18 m) e do Cerrado (23 m). Os componentes principais demonstraram que a maior altura da planta está correlacionada com o tipo de solo e a região de estudo. Este trabalho serve de base para futuros estudos de campo de M. urundeuva e poderá ser utilizado em excursões de coleta de sementes desta espécie. |
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Palavras-Chave: |
Aroeira-do-sertão; Planta da Caatinga; Sementes florestais. |
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Thesagro: |
Caatinga; Myracrodruon Urundeuva; Semente. |
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Thesaurus NAL: |
Natural resources. |
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Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/189084/1/Fabricio.pdf
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Marc: |
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490 $a(Embrapa Semiárido. Documentos, 284).
520 $aTodo o processo produtivo, desde a coleta até a comercialização de sementes florestais, envolve diversos trâmites burocráticos que garantem, de certa forma, a qualidade do material a ser comercializado. A marcação prévia de plantas matrizes economizaria tempo, principalmente para o pequeno produtor que detém algum remanescente de área florestal em sua propriedade. Objetivou--se com este estudo apresentar uma lista de plantas matrizes de Myracrodruon urundeuva possibilitando a coleta de sementes de forma rápida e eficiente. Foram marcadas 36 plantas matrizes de M. urundeuva entre os anos de 2015 e 2016. De cada planta, foram coletados dados dendrométricos, coordenadas geográficas e tipo de solo. As plantas marcadas pertencem a três biomas: Caatinga, Cerrado e Pantanal. A altura das plantas variou entre 5 m e 23,3 m. Foram categorizados quatro tipos de solos. As árvores matrizes marcadas na Caatinga apresentaram menor altura total (11 m) em relação às árvores do Pantanal (18 m) e do Cerrado (23 m). Os componentes principais demonstraram que a maior altura da planta está correlacionada com o tipo de solo e a região de estudo. Este trabalho serve de base para futuros estudos de campo de M. urundeuva e poderá ser utilizado em excursões de coleta de sementes desta espécie.
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Registro original: |
Embrapa Semiárido (CPATSA) |
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