| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agricultura Digital. Para informações adicionais entre em contato com cnptia.biblioteca@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
|
Data corrente: |
20/04/2006 |
|
Data da última atualização: |
17/01/2020 |
|
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
|
Autoria: |
NARCISO, M. G.; YAMAGISHI, M. E. B.; QUINALIA, T.; BEZERRA, G. B. P.; NESHICH, G. |
|
Afiliação: |
MARCELO GONCALVES NARCISO, CNPAF; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; THIAGO QUINALIA; GEORGE B. P. BEZERRA; GORAN NESHICH, CNPTIA. |
|
Título: |
2D maps of protein interface surfaces. |
|
Ano de publicação: |
2005 |
|
Fonte/Imprenta: |
In: X-MEETING; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, Caxambu. [Proceedings...]. [S.l.]: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2005. p. 1. |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Notas: |
X-meeting 2005. Presented posters. |
|
Conteúdo: |
More than 50% of the Protein Data Bank - PDB - files have two or more chains. It is desirable to get a better understanding of how the protein complexes are gathered together. Although, surface complementarity is a key factor in complexes formation, physical-chemical properties also play an important role. Recently, the protein interface surfaces were rendered in 3D, and, over them, all the STING_DB physical-chemical properties could be painted, what greatly facilitated their analyses. In this work we propose an alternative way to visualize the protein interfaces. The 3D protein interface surfaces were modeled as Graphs and using the Shape Preserving algorithm, they were mapped onto the plane. This mapping introduce some inevitable deformation, nevertheless the local shape is preserved which is essential in the process of matching the corresponding regions in both surfaces. This matching task is almost impossible in 3D due the surface complexity in the space. |
|
Palavras-Chave: |
Bioinformática; Interface de superfícies; Mapa bidimensional. |
|
Thesagro: |
Mapa; Proteína. |
|
Thesaurus Nal: |
Bioinformatics. |
|
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
|
Marc: |
LEADER 01787nam a2200241 a 4500
001 1008757
005 2020-01-17
008 2005 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aNARCISO, M. G.
245 $a2D maps of protein interface surfaces.$h[electronic resource]
260 $aIn: X-MEETING; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, Caxambu. [Proceedings...]. [S.l.]: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2005. p. 1.$c2005
500 $aX-meeting 2005. Presented posters.
520 $aMore than 50% of the Protein Data Bank - PDB - files have two or more chains. It is desirable to get a better understanding of how the protein complexes are gathered together. Although, surface complementarity is a key factor in complexes formation, physical-chemical properties also play an important role. Recently, the protein interface surfaces were rendered in 3D, and, over them, all the STING_DB physical-chemical properties could be painted, what greatly facilitated their analyses. In this work we propose an alternative way to visualize the protein interfaces. The 3D protein interface surfaces were modeled as Graphs and using the Shape Preserving algorithm, they were mapped onto the plane. This mapping introduce some inevitable deformation, nevertheless the local shape is preserved which is essential in the process of matching the corresponding regions in both surfaces. This matching task is almost impossible in 3D due the surface complexity in the space.
650 $aBioinformatics
650 $aMapa
650 $aProteína
653 $aBioinformática
653 $aInterface de superfícies
653 $aMapa bidimensional
700 1 $aYAMAGISHI, M. E. B.
700 1 $aQUINALIA, T.
700 1 $aBEZERRA, G. B. P.
700 1 $aNESHICH, G.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
|
Data corrente: |
28/10/2016 |
|
Data da última atualização: |
05/12/2016 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
|
Autoria: |
SOUZA, I. R. P. de; MELLO, N. de O.; CARVALHO, S. G. M.; RODRIGUES, J. A. S.; SABATO, E. de O.; GONÇALVES, I. A. M.; BARROS, B. de A. |
|
Afiliação: |
ISABEL REGINA PRAZERES DE SOUZA, CNPMS; NAYARA DE OLIVEIRA MELLO, Faculdade Ciências da Vida, Sete Lagoas, MG .; SAMANTA GABRIELA MEDEIROS CARVALHO, UNIFEMM, Sete Lagoas, MG.; JOSE AVELINO SANTOS RODRIGUES, CNPMS; ELIZABETH DE OLIVEIRA SABATO, CNPMS; ISABELLA APARECIDA MAIA GONÇALVES, UNIFEMM, Sete Lagoas, MG.; BEATRIZ DE ALMEIDA BARROS, CNPMS. |
|
Título: |
Potyvirus causando mosaico em plantas daninhas nas culturas do milho e do sorgo. |
|
Ano de publicação: |
2016 |
|
Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 31., 2016, Bento Gonçalves. Milho e sorgo: inovações, mercados e segurança alimentar: anais. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2016. |
|
Idioma: |
Português |
|
Palavras-Chave: |
Mosaico-comum; PCR; Proteína capsidial; RT-PCR; SCMV. |
|
Thesaurus NAL: |
Coat proteins; Sugarcane mosaic virus. |
|
Categoria do assunto: |
V Taxonomia de Organismos |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/149832/1/Potyvirus-causando.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 00896nam a2200253 a 4500
001 2055590
005 2016-12-05
008 2016 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aSOUZA, I. R. P. de
245 $aPotyvirus causando mosaico em plantas daninhas nas culturas do milho e do sorgo.$h[electronic resource]
260 $aIn: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 31., 2016, Bento Gonçalves. Milho e sorgo: inovações, mercados e segurança alimentar: anais. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo$c2016
650 $aCoat proteins
650 $aSugarcane mosaic virus
653 $aMosaico-comum
653 $aPCR
653 $aProteína capsidial
653 $aRT-PCR
653 $aSCMV
700 1 $aMELLO, N. de O.
700 1 $aCARVALHO, S. G. M.
700 1 $aRODRIGUES, J. A. S.
700 1 $aSABATO, E. de O.
700 1 $aGONÇALVES, I. A. M.
700 1 $aBARROS, B. de A.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|
