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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
19/01/2011 |
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Data da última atualização: |
03/06/2011 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
SILLA, P. R.; CAMARGO-BRUNETTO, M. A. de O.; BINNECK, E. |
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Afiliação: |
PAULO R. SILLA, UEL; MARIA ANGÉLICA DE O. CAMARGO-BRUNETTO, UEL; ELISEU BINNECK, CNPSO. |
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Título: |
Using a support vector machine to identify Pre-miRNAs in soybean (Glycine max) introns. |
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Ano de publicação: |
2010 |
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Fonte/Imprenta: |
In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS DESIGN AND APPLICATIONS, 2010, Cairo. Proceedings... [Cairo]: IEEE, 2010. CD-ROM. |
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Páginas: |
P. 1235-1241. |
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ISBN: |
978-1-4244-8135-4 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
MicroRNAs (miRNAs) are small Ribonucleic Acid (RNA) molecules ?18?22 nucleotides (nt) in length that regulates gene expression in animals, plants and viruses. Due to its small size and occurrence in different development stages of organisms, the experimental identification of miRNAs becomes difficult, and computational approaches are being developed in order to precede and guide biological experiments. This paper describes our approach based on a Support Vector Machine (SVM) algorithm to identify miRNA?s precursor (pre-miRNA) in soybean (Glycine max) transcript introns, that was developed using a secondary structure predictor of pre-miRNAs sequences to establish the feature set for training, testing and validation phases of SVM algorithm. |
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Palavras-Chave: |
Bioinformática. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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005 2011-06-03
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245 $aUsing a support vector machine to identify Pre-miRNAs in soybean (Glycine max) introns.
260 $aIn: INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS DESIGN AND APPLICATIONS, 2010, Cairo. Proceedings... [Cairo]: IEEE, 2010. CD-ROM.$c2010
300 $aP. 1235-1241.
520 $aMicroRNAs (miRNAs) are small Ribonucleic Acid (RNA) molecules ?18?22 nucleotides (nt) in length that regulates gene expression in animals, plants and viruses. Due to its small size and occurrence in different development stages of organisms, the experimental identification of miRNAs becomes difficult, and computational approaches are being developed in order to precede and guide biological experiments. This paper describes our approach based on a Support Vector Machine (SVM) algorithm to identify miRNA?s precursor (pre-miRNA) in soybean (Glycine max) transcript introns, that was developed using a secondary structure predictor of pre-miRNAs sequences to establish the feature set for training, testing and validation phases of SVM algorithm.
653 $aBioinformática
700 1 $aCAMARGO-BRUNETTO, M. A. de O.
700 1 $aBINNECK, E.
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 12 | |
| 2. |  | SOUZA, I. N. G.; LAMEIRA, O. A.; COSTA, K. J. A.; BARROS, T. M. Efeitos de diferentes concentrações de nitrato de amônio e nitrato de potássio na micropropagação da Hypericum carvenicola (Hypericaceae). In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 22., 2018, Belém, PA. Anais... Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2018. p. 190-193.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 3. | | SOUZA, I. N. G.; LAMEIRA, O. A.; COSTA, K. J. A.; BARROS, T. M. Efeitos de diferentes concentrações de nitrato de amônio e nitrato de potássio na micropropagação da Hypericum teretiusculum A.St.-Hil. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 22., 2018, Belém, PA. Anais... Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2018. p. 194-197.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 4. | | BARROS, T. M.; LAMEIRA, O. A.; COSTA, K. J. A.; SOUZA, I. N. G. Efeitos de diferentes concentrações de nitrato de amônio e nitrato de potássio na micropropagação de Physalis angulata L. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 22., 2018, Belém, PA. Anais... Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2018. p. 208-212.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 6. | | SANTANA, P. R. de; DOURADO, S. B.; SILVA, W. P.; BARROS, T. M.; SOUSA, S. A.; LEITE, V. M. Avaliação morfométrica de componentes produtivos de diferentes cultivares de girassol no semiárido baiano. CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 5.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE OLEAGINOSAS ENERGÉTICAS, 2.; FÓRUM CAPIXABA DE PINHÃO-MANSO, 1., 2012, Guarapari. Desafios e Oportunidades: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2012. p. 269| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 8. | | FILIPI, M. C. de; BARROS, T. M. de; NÚÑEZ, B. N. da C.; CUNHA, T. A. da; MENEZES, E. B.; AGUIAR-MENEZES, E. de L. Ocorrência de Coptotermes gestroi em área municipal na cidade de Campinas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 22., 2008, Uberlândia. Ciência, tecnologia e inovação: anais... Uberlândia: Sociedade Entomológica do Brasil, 2008. 1 p. 1 CD-ROM. ResumoID:2055-2. Parceria: Expurga Guaçú; UFRRJ.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 9. | | SANTOS, A. C. S. dos; SILVA, W. P.; DOURADO, S. B.; SANTANA, P. R. de; BARROS, T. M.; SOUSA, S. A.; LEITE, V. M. Produção de oito genótipos de girassol cultivados em diferentes períodos e municípios da Bahia. CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 5.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE OLEAGINOSAS ENERGÉTICAS, 2.; FÓRUM CAPIXABA DE PINHÃO-MANSO, 1., 2012, Guarapari. Desafios e Oportunidades: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2012. p. 317| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 10. | | BARROS, T. M. de; SANTOS, S. da S.; ESPINDOLA, J. A. A.; GUERRA, J. G. M.; RISSO, I. A. M.; SOUZA, C. G. de; RIBEIRO, R. de L. D. Efeito de coberturas mortas vegetais do solo sobre o desempenho da cebola em cultivo orgânico. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DOBEREINER, 9., 19 a 23 de outubro de 2009, Seropédica. Ciência no Brasil: desafios, avanços e aplicações. Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 11. | | SANTOS, S. da S.; BARROS, T. M. de; SOUZA, C. G.; de; RISSO, I. A. M.; ESPÍNDOLA, J. A. A.; GUERRA, J. G. M.; RIBEIRO, R. de L. D. Eficiência do uso de coberturas mortas no desempenho de cebola cultivada com diferentes densidades de plantio sob manejo orgânico. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DOBEREINER, 9., 19 a 23 de outubro de 2009, Seropédica. Ciência no Brasil: desafios, avanços e aplicações. Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2009.| Tipo: Folder/Folheto/Cartilha |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 12. | | SANTOS, S. da S.; BARROS, T. M. de; SOUZA, C. G. de; RISSO, I. A. M.; ESPINDOLA, J. A. A.; GUERRA, J. G. M.; RIBEIRO, R. de L. D. Eficiência do uso de coberturas mortas no desempenho de cebola cultivada com diferentes densidades de plantio sob manejo orgânico. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DOBEREINER, 9., 19 a 23 de outubro de 2009, Seropédica. Ciência no Brasil: desafios, avanços e aplicações. Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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