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| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Meio Ambiente. Para informações adicionais entre em contato com cnpma.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Meio Ambiente. |
Data corrente: |
01/03/2023 |
Data da última atualização: |
01/03/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
LACERDA JÚNIOR, G. V.; PASTORE, R. A. A.; DELFORNO, T. P.; CENTURION, V. B.; NORONHA, M. F.; VENTURA, J. P.; SARTORATTO, A.; MELO, I. S. de; OLIVEIRA, V. M. |
Afiliação: |
GILENO VIEIRA LACERDA JÚNIOR; RENAN A A PASTORE; TIAGO PALLADINO DELFORNO, SENAI; VICTOR BORIN CENTURION, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS; MELLINE FONTES NORONHA, UNIVERSITY OF ILLINOIS; JOÃO PAULO VENTURA, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO; ADILSON SARTORATTO, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS; ITAMAR SOARES DE MELO, CNPMA; VALÉRIA M OLIVEIRA. |
Título: |
Taxonomic and functional dynamics of the soil microbiome from a tropical dry forest in kraft lignin-amended microcosms. |
Ano de publicação: |
2023 |
Fonte/Imprenta: |
Applied Soil Ecology, V. 183, article 104766, 2023. |
ISSN: |
0929-1393 |
DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.apsoil.2022.104766 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Abstract: The Caatinga, a Brazilian dry tropical forest that sheds its leaves seasonally, harbors diverse lignocellulose-degrading microbes as a valuable source of lignin-modifying enzymes useful for the chemical and biofuel industry. Nonetheless, the detailed process of lignin decomposition in soils is still poorly understood due to most studies focusing on the biodegradation of non-ligninolytic components of plant biomass (i.e., cellulose, hemicellulose, and oligosaccharides). Hence, the microbial dynamic was investigated in kraft lignin (KL) amended soil microcosms incubated at 45 °C for 9, 18, and 27 days. The changes in the GC-MS profile indicated rapid and complete biodegradation of lignin-derived compounds (i.e., phenol, guaiacol, paracyclophane, eugenol, benzene, ethisterone, and methadone N-oxide) by the microbial ligninolytic systems. Metabarcoding analyses showed that species richness (Chao 1 index from 14313,6 ± 338 to 7230,4 ± 1056) and diversity (H' index from 7,9 ± 0,05 to 5,6 ± 0,6) decreased in response to KL addition. However, the bacterial diversity was stabilized from the 18th to the 27th day, shaping a soil bacterial community dominated by members of the Proteobacteria (Bordetella and Roseomonas), Firmicutes (Bacillus, Pullulanibacillus, Lysinibacillus, Cohnela, and Ornithinibacilus), and Actinobacteria (Isoptericola, Saccharomonospora, and Beutenbergia) phyla, some of which have not yet been reported as able to degrade lignin. Although the KL addition has promoted the extinction of microbial taxa, the co-occurrence networks reveal high modularity values (0.92) of the microbial structure in the 18th and 27th days of KL-amended soil microcosms, indicating metabolic plasticity even with the ecological disturbance. Some individual taxa clustering into more distinct modules might be explained by the emergence of new ecological niches resulting from the heterogeneous features of KL. Metagenome-based evidence suggests that key bacterial (Bordetella and Streptomyces), and fungal (Aspergillus) members may play synergistic ecophysiological roles in decomposing lignin-derived compounds by carrying the most genes encoding lignin-modifying enzymes belonging to the auxiliary activity (AA) family. The great increase of Aspergillus-affiliated genes of the AA9 family (log ratio of 1.46), which includes the copper-dependent lytic polysaccharide monooxygenases (LPMOs), suggests a key role in lignin-derived compounds degradation. Overall, the insights gathered herein reveal the microbial dynamics of a tropical dry forest soil in kraft lignin-amended microcosms and open perspectives for a rational exploration of potentially novel enzymes and microbial candidates for biotechnological applications. MenosAbstract: The Caatinga, a Brazilian dry tropical forest that sheds its leaves seasonally, harbors diverse lignocellulose-degrading microbes as a valuable source of lignin-modifying enzymes useful for the chemical and biofuel industry. Nonetheless, the detailed process of lignin decomposition in soils is still poorly understood due to most studies focusing on the biodegradation of non-ligninolytic components of plant biomass (i.e., cellulose, hemicellulose, and oligosaccharides). Hence, the microbial dynamic was investigated in kraft lignin (KL) amended soil microcosms incubated at 45 °C for 9, 18, and 27 days. The changes in the GC-MS profile indicated rapid and complete biodegradation of lignin-derived compounds (i.e., phenol, guaiacol, paracyclophane, eugenol, benzene, ethisterone, and methadone N-oxide) by the microbial ligninolytic systems. Metabarcoding analyses showed that species richness (Chao 1 index from 14313,6 ± 338 to 7230,4 ± 1056) and diversity (H' index from 7,9 ± 0,05 to 5,6 ± 0,6) decreased in response to KL addition. However, the bacterial diversity was stabilized from the 18th to the 27th day, shaping a soil bacterial community dominated by members of the Proteobacteria (Bordetella and Roseomonas), Firmicutes (Bacillus, Pullulanibacillus, Lysinibacillus, Cohnela, and Ornithinibacilus), and Actinobacteria (Isoptericola, Saccharomonospora, and Beutenbergia) phyla, some of which have not yet been reported as able to degrade lignin. Although the KL addition h... Mostrar Tudo |
Thesagro: |
Biodegradação; Caatinga; Floresta Tropical; Lignina; Microbiologia do Solo; População Microbiana. |
Thesaurus Nal: |
Biodegradation; Dry forests; Lignin; Microbiome; Plant communities; Soil microorganisms. |
Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
Marc: |
LEADER 03895naa a2200385 a 4500 001 2152020 005 2023-03-01 008 2023 bl uuuu u00u1 u #d 022 $a0929-1393 024 7 $ahttps://doi.org/10.1016/j.apsoil.2022.104766$2DOI 100 1 $aLACERDA JÚNIOR, G. V. 245 $aTaxonomic and functional dynamics of the soil microbiome from a tropical dry forest in kraft lignin-amended microcosms.$h[electronic resource] 260 $c2023 520 $aAbstract: The Caatinga, a Brazilian dry tropical forest that sheds its leaves seasonally, harbors diverse lignocellulose-degrading microbes as a valuable source of lignin-modifying enzymes useful for the chemical and biofuel industry. Nonetheless, the detailed process of lignin decomposition in soils is still poorly understood due to most studies focusing on the biodegradation of non-ligninolytic components of plant biomass (i.e., cellulose, hemicellulose, and oligosaccharides). Hence, the microbial dynamic was investigated in kraft lignin (KL) amended soil microcosms incubated at 45 °C for 9, 18, and 27 days. The changes in the GC-MS profile indicated rapid and complete biodegradation of lignin-derived compounds (i.e., phenol, guaiacol, paracyclophane, eugenol, benzene, ethisterone, and methadone N-oxide) by the microbial ligninolytic systems. Metabarcoding analyses showed that species richness (Chao 1 index from 14313,6 ± 338 to 7230,4 ± 1056) and diversity (H' index from 7,9 ± 0,05 to 5,6 ± 0,6) decreased in response to KL addition. However, the bacterial diversity was stabilized from the 18th to the 27th day, shaping a soil bacterial community dominated by members of the Proteobacteria (Bordetella and Roseomonas), Firmicutes (Bacillus, Pullulanibacillus, Lysinibacillus, Cohnela, and Ornithinibacilus), and Actinobacteria (Isoptericola, Saccharomonospora, and Beutenbergia) phyla, some of which have not yet been reported as able to degrade lignin. Although the KL addition has promoted the extinction of microbial taxa, the co-occurrence networks reveal high modularity values (0.92) of the microbial structure in the 18th and 27th days of KL-amended soil microcosms, indicating metabolic plasticity even with the ecological disturbance. Some individual taxa clustering into more distinct modules might be explained by the emergence of new ecological niches resulting from the heterogeneous features of KL. Metagenome-based evidence suggests that key bacterial (Bordetella and Streptomyces), and fungal (Aspergillus) members may play synergistic ecophysiological roles in decomposing lignin-derived compounds by carrying the most genes encoding lignin-modifying enzymes belonging to the auxiliary activity (AA) family. The great increase of Aspergillus-affiliated genes of the AA9 family (log ratio of 1.46), which includes the copper-dependent lytic polysaccharide monooxygenases (LPMOs), suggests a key role in lignin-derived compounds degradation. Overall, the insights gathered herein reveal the microbial dynamics of a tropical dry forest soil in kraft lignin-amended microcosms and open perspectives for a rational exploration of potentially novel enzymes and microbial candidates for biotechnological applications. 650 $aBiodegradation 650 $aDry forests 650 $aLignin 650 $aMicrobiome 650 $aPlant communities 650 $aSoil microorganisms 650 $aBiodegradação 650 $aCaatinga 650 $aFloresta Tropical 650 $aLignina 650 $aMicrobiologia do Solo 650 $aPopulação Microbiana 700 1 $aPASTORE, R. A. A. 700 1 $aDELFORNO, T. P. 700 1 $aCENTURION, V. B. 700 1 $aNORONHA, M. F. 700 1 $aVENTURA, J. P. 700 1 $aSARTORATTO, A. 700 1 $aMELO, I. S. de 700 1 $aOLIVEIRA, V. M. 773 $tApplied Soil Ecology, V. 183, article 104766, 2023.
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Embrapa Meio Ambiente (CNPMA) |
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| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Algodão. Para informações adicionais entre em contato com cnpa.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Algodão. |
Data corrente: |
30/09/1999 |
Data da última atualização: |
25/08/2009 |
Autoria: |
BELTRÃO, N. E. de M. (Org.). |
Afiliação: |
Embrapa Algoadao (Campina Grande,PB). |
Título: |
O agronegócio do algodão no Brasil. |
Ano de publicação: |
1999 |
Fonte/Imprenta: |
Brasília, DF: Embrapa Comunicação para a Transferência de Tecnologia; Campina Grande: Embrapa Algodão, 1999. 2 v. |
Volume: |
v.1-2. |
Páginas: |
491p. |
ISBN: |
85-7383-060-3 |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
V. 1: Algodão brasileiro em relação ao mundo: situação e perspectivas; Agronegócio do algodão: crise no mercado brasileiro da matéria-prima agrícola; Fitologia do algodão herbáceo (sistemática, organografia e anatomia); Fisiologia; Edafologia; Adubação e calagem; Zoneamento do algodão herbáceo no Nordeste; O gênero, Gossypium e suas espécies cultivadas e silvestres; Contribuição do melhoramento ao cultivo do algodão no Brasil; Objetivos e métodos utilizados nos programas de melhoramento do algodão no Brasil; Melhoramento do algodoeiro para resistência às doenças; Resistência às pragas do algodoeiro; Caracteres de importância econômica no melhoramento do algodoeiro; Marcadores moleculares no melhoramento genético do algodoeiro; Engenharia genética no algodoeiro; Cultivo in vitro do algodão; Produção de sementes do algodoeiro; Armazenamento; Monitoramento do algodoeiro; V. 2: Manejo cultural; Plantas daninhas; Hormônios e reguladores do crescimento e do desenvolvimento; Destruição dos restos culturais; Irrigação do algodoeiro herbáceo; Importância da drenagem agrícola; Principais doenças do algodoeiro e seu controle; Manejo integrado de pragas do algodoeiro; Beneficiamento; Características da fibra e do fio do algodão: análise e interpretação dos resultados; Fisiologia da fibra do algodoeiro herbáceo; Industrialização; Qualidade extrínseca do algodão brasileiro e, em especial do nordestino: situação atual e como melhorá-la; Experimentação agrícola na cotonicultura herbácea; Comercialização do algodão. V. 2: Adubacao; Agribusiness; Agricultura; Agroindustria; Agroindustrial sector; Agronegócio; Algodao; Algodão - cultivo-producão; Algodao-cultivo-Brasil; Algodao-producao-Brasil; Armazenamento; Aspecto economico; Beneficiamento; Brasil; Brasil %% Cotton; Brazil; Breeding; Calagem; Campina Grande; Chemical control; Colheita; Comercializacao; Control; Controle; Controle quimico; Cotton; Crop; Crop management; Cultivation; Cultive; Cultivo; Cultivo do algodao; Cultura; Cultura in vitro; Cultural methods; Culture; Defesa vegetal; Deficiencia mineral; Disease resistance; Diseases; Doenca; Drainage; Drenagem; Economic situation; ex; Fertilizer application; Fertilizers application; Fibra; Fibres; Fisiologia; Fisiologia vegetal; Gossypium; Gossypium arboreum; Gossypium barbadense; Gossypium hirsutum; Harvest; In vitro culture; Industrializacao; Industrialization; Inseto; Irrigacao; Irrigation; Liming; Management; Manejo; Markets; Materia prima; Melhoramento; Melhoramento genetico vegetal; Mercado; Mineral defficiencies; Negocio agricola; Nordeste; Nutricao; Nutriton; Paraiba; Pest insects; Pest resistance; Pests; Pests of plants; Physiolocal functions; Plant breeding; Plant diseases; Plant growth substrances; Plant physiology; Planta daninha; Praga; Proceesing; Processing; Producao; Producao de semente; Production; Raw materials; Regulador de crescimento; Resistance; Resistencia; Resistencia a praga; Seed; Seed production; Semente; Soil; Solo; Storage; Trade; v; Variedade resistente; Weeds. MenosV. 1: Algodão brasileiro em relação ao mundo: situação e perspectivas; Agronegócio do algodão: crise no mercado brasileiro da matéria-prima agrícola; Fitologia do algodão herbáceo (sistemática, organografia e anatomia); Fisiologia; Edafologia; Adubação e calagem; Zoneamento do algodão herbáceo no Nordeste; O gênero, Gossypium e suas espécies cultivadas e silvestres; Contribuição do melhoramento ao cultivo do algodão no Brasil; Objetivos e métodos utilizados nos programas de melhoramento do algodão no Brasil; Melhoramento do algodoeiro para resistência às doenças; Resistência às pragas do algodoeiro; Caracteres de importância econômica no melhoramento do algodoeiro; Marcadores moleculares no melhoramento genético do algodoeiro; Engenharia genética no algodoeiro; Cultivo in vitro do algodão; Produção de sementes do algodoeiro; Armazenamento; Monitoramento do algodoeiro; V. 2: Manejo cultural; Plantas daninhas; Hormônios e reguladores do crescimento e do desenvolvimento; Destruição dos restos culturais; Irrigação do algodoeiro herbáceo; Importância da drenagem agrícola; Principais doenças do algodoeiro e seu controle; Manejo integrado de pragas do algodoeiro; Beneficiamento; Características da fibra e do fio do algodão: análise e interpretação dos resultados; Fisiologia da fibra do algodoeiro herbáceo; Industrialização; Qualidade extrínseca do algodão brasileiro e, em especial do nordestino: situação atual e como melhorá-la; Experimentação agrícola na cotonicultura herbácea; Co... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Agroindustria; Agroindustrial sector; Algodão - cultivo-producão; Algodao-cultivo-Brasil; Algodao-producao-Brasil; Aspecto economico; Brasil; Campina Grande; Control; Controle; Crop; Cultivation; Cultive; Cultivo; Cultivo do algodao; Cultura; Cultural methods; Culture; Diseases; Economic situation; Fertilizers application; Fibres; Harvest; Management; Mineral defficiencies; Negocio agricola; Nutriton; Paraiba; Pest insects; Pests of plants; Physiolocal functions; Plant diseases; Plant growth substrances; Planta daninha; Proceesing; Processing; Producao de semente; Production; Resistance; Resistencia a praga; Seed; Seed production. |
Thesagro: |
Adubação; Agricultura; Agronegócio; Algodão; Armazenamento; Beneficiamento; Calagem; Colheita; Comercialização; Controle Químico; Cultura In Vitro; Defesa Vegetal; Deficiência Mineral; Doença; Drenagem; Fibra; Fisiologia; Fisiologia Vegetal; Gossypium Arboreum; Gossypium Hirsutum; Industrialização; Inseto; Irrigação; Manejo; Matéria Prima; Melhoramento; Melhoramento Genético Vegetal; Mercado; Nutrição; Praga; Produção; Regulador de Crescimento; Resistência; Semente; Solo; Variedade Resistente. |
Thesaurus NAL: |
agribusiness; Brazil; breeding; chemical control; cotton; crop management; disease resistance; drainage; fertilizer application; Gossypium; Gossypium barbadense; in vitro culture; industrialization; irrigation; liming; markets; pest resistance; pests; plant breeding; plant physiology; raw materials; soil; storage; trade; weeds. |
Categoria do assunto: |
-- F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
Marc: |
LEADER 06597nam a2201381 a 4500 001 1271735 005 2009-08-25 008 1999 bl uuuu 00u1 u #d 020 $a85-7383-060-3 100 1 $aBELTRÃO, N. E. de M. (Org.). 245 $aO agronegócio do algodão no Brasil. 260 $aBrasília, DF: Embrapa Comunicação para a Transferência de Tecnologia; Campina Grande: Embrapa Algodão, 1999. 2 v.$c1999 300 $a491p. v.1-2. 490 $vv.1-2. 520 $aV. 1: Algodão brasileiro em relação ao mundo: situação e perspectivas; Agronegócio do algodão: crise no mercado brasileiro da matéria-prima agrícola; Fitologia do algodão herbáceo (sistemática, organografia e anatomia); Fisiologia; Edafologia; Adubação e calagem; Zoneamento do algodão herbáceo no Nordeste; O gênero, Gossypium e suas espécies cultivadas e silvestres; Contribuição do melhoramento ao cultivo do algodão no Brasil; Objetivos e métodos utilizados nos programas de melhoramento do algodão no Brasil; Melhoramento do algodoeiro para resistência às doenças; Resistência às pragas do algodoeiro; Caracteres de importância econômica no melhoramento do algodoeiro; Marcadores moleculares no melhoramento genético do algodoeiro; Engenharia genética no algodoeiro; Cultivo in vitro do algodão; Produção de sementes do algodoeiro; Armazenamento; Monitoramento do algodoeiro; V. 2: Manejo cultural; Plantas daninhas; Hormônios e reguladores do crescimento e do desenvolvimento; Destruição dos restos culturais; Irrigação do algodoeiro herbáceo; Importância da drenagem agrícola; Principais doenças do algodoeiro e seu controle; Manejo integrado de pragas do algodoeiro; Beneficiamento; Características da fibra e do fio do algodão: análise e interpretação dos resultados; Fisiologia da fibra do algodoeiro herbáceo; Industrialização; Qualidade extrínseca do algodão brasileiro e, em especial do nordestino: situação atual e como melhorá-la; Experimentação agrícola na cotonicultura herbácea; Comercialização do algodão. V. 2: Adubacao; Agribusiness; Agricultura; Agroindustria; Agroindustrial sector; Agronegócio; Algodao; Algodão - cultivo-producão; Algodao-cultivo-Brasil; Algodao-producao-Brasil; Armazenamento; Aspecto economico; Beneficiamento; Brasil; Brasil %% Cotton; Brazil; Breeding; Calagem; Campina Grande; Chemical control; Colheita; Comercializacao; Control; Controle; Controle quimico; Cotton; Crop; Crop management; Cultivation; Cultive; Cultivo; Cultivo do algodao; Cultura; Cultura in vitro; Cultural methods; Culture; Defesa vegetal; Deficiencia mineral; Disease resistance; Diseases; Doenca; Drainage; Drenagem; Economic situation; ex; Fertilizer application; Fertilizers application; Fibra; Fibres; Fisiologia; Fisiologia vegetal; Gossypium; Gossypium arboreum; Gossypium barbadense; Gossypium hirsutum; Harvest; In vitro culture; Industrializacao; Industrialization; Inseto; Irrigacao; Irrigation; Liming; Management; Manejo; Markets; Materia prima; Melhoramento; Melhoramento genetico vegetal; Mercado; Mineral defficiencies; Negocio agricola; Nordeste; Nutricao; Nutriton; Paraiba; Pest insects; Pest resistance; Pests; Pests of plants; Physiolocal functions; Plant breeding; Plant diseases; Plant growth substrances; Plant physiology; Planta daninha; Praga; Proceesing; Processing; Producao; Producao de semente; Production; Raw materials; Regulador de crescimento; Resistance; Resistencia; Resistencia a praga; Seed; Seed production; Semente; Soil; Solo; Storage; Trade; v; Variedade resistente; Weeds. 650 $aagribusiness 650 $aBrazil 650 $abreeding 650 $achemical control 650 $acotton 650 $acrop management 650 $adisease resistance 650 $adrainage 650 $afertilizer application 650 $aGossypium 650 $aGossypium barbadense 650 $ain vitro culture 650 $aindustrialization 650 $airrigation 650 $aliming 650 $amarkets 650 $apest resistance 650 $apests 650 $aplant breeding 650 $aplant physiology 650 $araw materials 650 $asoil 650 $astorage 650 $atrade 650 $aweeds 650 $aAdubação 650 $aAgricultura 650 $aAgronegócio 650 $aAlgodão 650 $aArmazenamento 650 $aBeneficiamento 650 $aCalagem 650 $aColheita 650 $aComercialização 650 $aControle Químico 650 $aCultura In Vitro 650 $aDefesa Vegetal 650 $aDeficiência Mineral 650 $aDoença 650 $aDrenagem 650 $aFibra 650 $aFisiologia 650 $aFisiologia Vegetal 650 $aGossypium Arboreum 650 $aGossypium Hirsutum 650 $aIndustrialização 650 $aInseto 650 $aIrrigação 650 $aManejo 650 $aMatéria Prima 650 $aMelhoramento 650 $aMelhoramento Genético Vegetal 650 $aMercado 650 $aNutrição 650 $aPraga 650 $aProdução 650 $aRegulador de Crescimento 650 $aResistência 650 $aSemente 650 $aSolo 650 $aVariedade Resistente 653 $aAgroindustria 653 $aAgroindustrial sector 653 $aAlgodão - cultivo-producão 653 $aAlgodao-cultivo-Brasil 653 $aAlgodao-producao-Brasil 653 $aAspecto economico 653 $aBrasil 653 $aCampina Grande 653 $aControl 653 $aControle 653 $aCrop 653 $aCultivation 653 $aCultive 653 $aCultivo 653 $aCultivo do algodao 653 $aCultura 653 $aCultural methods 653 $aCulture 653 $aDiseases 653 $aEconomic situation 653 $aFertilizers application 653 $aFibres 653 $aHarvest 653 $aManagement 653 $aMineral defficiencies 653 $aNegocio agricola 653 $aNutriton 653 $aParaiba 653 $aPest insects 653 $aPests of plants 653 $aPhysiolocal functions 653 $aPlant diseases 653 $aPlant growth substrances 653 $aPlanta daninha 653 $aProceesing 653 $aProcessing 653 $aProducao de semente 653 $aProduction 653 $aResistance 653 $aResistencia a praga 653 $aSeed 653 $aSeed production
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