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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
11/07/2022 |
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Data da última atualização: |
06/02/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
ROCHA, D. C. |
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Afiliação: |
DHIÔVANNA CORRÊIA ROCHA. |
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Título: |
Efeito da superexpressão do gene OVP1 em parâmetros fisiológicos e caracteres relacionados a produtividade de grãos em arroz de terras altas. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
2021. |
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Páginas: |
83 f. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Dissertação (Mestrado em Genética e Melhoramento de Plantas) - Escola de Agronomia, Universidade Federal de Goiás, Goiânia. Orientador: Claudio Brondani, CNPAF. |
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Conteúdo: |
O aumento populacional, as mudanças climáticas e a redução da área para cultivo são alguns dos desafios que a agricultura vem enfrentando nos últimos anos, fazendo com que seja necessário desenvolver cultivares que sejam mais produtivas para atender a demanda global por alimentos. A cultivar de arroz de terras altas BRSMG Curinga foi transformada via Agrobacterium tumefaciens para superexpressar o gene OVP1. O gene OVP1 codifica uma proteína capaz de bombear prótons através de membranas usando a energia da quebra do pirofosfato inorgânico (PPi), e pode causar diversas alterações metabólicas e morfológicas nas plantas. Este trabalho objetivou avaliar alguns caracteres relacionados a produtividade de grãos, a fisiologia e a expressão gênica do arroz geneticamente modificado (GM) para superexpressar o gene OVP1 (OVP1-E4) em relação ao BRSMG Curinga não geneticamente modificado (NGM). Foram realizados dois experimentos em condições controladas na Embrapa Arroz e Feijão, nas safras 2018/2019 e 2019/2020. |
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Palavras-Chave: |
RNAseq; RT-qPCR. |
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Thesagro: |
Arroz; Engenharia Genética; Grão; Oryza Sativa; Produtividade. |
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Thesaurus Nal: |
Gene overexpression; Genetic engineering; Grain yield; Rice. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
06/11/2008 |
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Data da última atualização: |
11/07/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
Internacional - C |
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Autoria: |
ANDREOTTI, R.; PEDROSO, M. S.; CAETANO, A. R.; MARTINS, N. F. |
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Afiliação: |
RENATO ANDREOTTI E SILVA, CNPGC; MARISELA S. PEDROSO, CENTRO DE INGENIERÍA GENÉTICA Y BIOTECNOLOGIA; ALEXANDRE RODRIGUES CAETANO, Cenargen; NATALIA FLORENCIO MARTINS, Cenargen. |
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Título: |
Comparison of predicted binders in Rhipicephalus (Boophilus) microplus intestine protein variants BM86 Campo Grande Strain, BM86 and BM95. |
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Ano de publicação: |
2008 |
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Fonte/Imprenta: |
Revista Brasileira de Parasitologia Veterinária, v. 17, n. 1, p. 93-98, abr./jun. 2008. |
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Idioma: |
Inglês
Português |
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Conteúdo: |
ABSTRACT - This paper reports the sequence analysis of Bm86 Campo Grande strain comparing it with Bm86 and Bm95 antigens from the preparations TickGardPLUS and GavacTM, respectively. The PCR product was cloned into pMOSBlue and sequenced. The secondary structure prediction tool PSIPRED was used to calculate alpha helices and beta strand contents of the predicted polypeptide. The hydrophobicity profile was calculated using the algorithms from the Hopp and Woods method, in addition to identification of potential MHC class-I binding regions in the antigens. Pair-wise alignment revealed that the similarity between Bm86 Campo Grande strain and Bm86 is 0.2% higher than that between Bm86 Campo Grande strain and Bm95 antigens. The identities were 96.5% and 96.3% respectively. Major suggestive differences in hydrophobicity were predicted among the sequences in two specific regions. RESUMO - O objetivo deste estudo foi analisar a seqüência de Bm86 cepa Campo Grande comparando-a com os antígenos Bm86 e Bm95 das preparações TickGardPLUS e GavacTM, respectivamente. O produto de PCR foi clonado em PMOSBlue e seqüenciado. Para calcular os conteúdos de alfa-hélice e fita beta do polipeptídio previsto, foi utilizada a ferramenta de prognóstico de estrutura secundária PSIPRED. O perfil de hidrofobicidade foi calculado usando os algoritmos de Hopp e Woods, além da identificação das possíveis regiões de ligação com MHC classe I nos antígenos. O alinhamento "pair-wise" revelou que a similaridade entre Bm86 cepa Campo Grande e Bm86 é 0,2% maior que aquela entre Bm86 cepa Campo Grande e Bm95. As identidades foram de 96,5% e 96,3%, respectivamente. Com relação à hidrofobicidade, os resultados sugerem que a maior diferença MenosABSTRACT - This paper reports the sequence analysis of Bm86 Campo Grande strain comparing it with Bm86 and Bm95 antigens from the preparations TickGardPLUS and GavacTM, respectively. The PCR product was cloned into pMOSBlue and sequenced. The secondary structure prediction tool PSIPRED was used to calculate alpha helices and beta strand contents of the predicted polypeptide. The hydrophobicity profile was calculated using the algorithms from the Hopp and Woods method, in addition to identification of potential MHC class-I binding regions in the antigens. Pair-wise alignment revealed that the similarity between Bm86 Campo Grande strain and Bm86 is 0.2% higher than that between Bm86 Campo Grande strain and Bm95 antigens. The identities were 96.5% and 96.3% respectively. Major suggestive differences in hydrophobicity were predicted among the sequences in two specific regions. RESUMO - O objetivo deste estudo foi analisar a seqüência de Bm86 cepa Campo Grande comparando-a com os antígenos Bm86 e Bm95 das preparações TickGardPLUS e GavacTM, respectivamente. O produto de PCR foi clonado em PMOSBlue e seqüenciado. Para calcular os conteúdos de alfa-hélice e fita beta do polipeptídio previsto, foi utilizada a ferramenta de prognóstico de estrutura secundária PSIPRED. O perfil de hidrofobicidade foi calculado usando os algoritmos de Hopp e Woods, além da identificação das possíveis regiões de ligação com MHC classe I nos antígenos. O alinhamento "pair-wise" revelou que a similaridade... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Antigen; Bm86; Bm95; Rhipicephalus (Boophilus) microplus; Tick. |
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Thesagro: |
Antígeno; Carrapato; Imunologia. |
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Thesaurus NAL: |
Antigens; immunology; Rhipicephalus microplus; Ticks. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/326689/1/Comparison-predicted-binders-2008.pdf
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Marc: |
LEADER 02649naa a2200301 a 4500
001 1326689
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100 1 $aANDREOTTI, R.
245 $aComparison of predicted binders in Rhipicephalus (Boophilus) microplus intestine protein variants BM86 Campo Grande Strain, BM86 and BM95.$h[electronic resource]
260 $c2008
520 $aABSTRACT - This paper reports the sequence analysis of Bm86 Campo Grande strain comparing it with Bm86 and Bm95 antigens from the preparations TickGardPLUS and GavacTM, respectively. The PCR product was cloned into pMOSBlue and sequenced. The secondary structure prediction tool PSIPRED was used to calculate alpha helices and beta strand contents of the predicted polypeptide. The hydrophobicity profile was calculated using the algorithms from the Hopp and Woods method, in addition to identification of potential MHC class-I binding regions in the antigens. Pair-wise alignment revealed that the similarity between Bm86 Campo Grande strain and Bm86 is 0.2% higher than that between Bm86 Campo Grande strain and Bm95 antigens. The identities were 96.5% and 96.3% respectively. Major suggestive differences in hydrophobicity were predicted among the sequences in two specific regions. RESUMO - O objetivo deste estudo foi analisar a seqüência de Bm86 cepa Campo Grande comparando-a com os antígenos Bm86 e Bm95 das preparações TickGardPLUS e GavacTM, respectivamente. O produto de PCR foi clonado em PMOSBlue e seqüenciado. Para calcular os conteúdos de alfa-hélice e fita beta do polipeptídio previsto, foi utilizada a ferramenta de prognóstico de estrutura secundária PSIPRED. O perfil de hidrofobicidade foi calculado usando os algoritmos de Hopp e Woods, além da identificação das possíveis regiões de ligação com MHC classe I nos antígenos. O alinhamento "pair-wise" revelou que a similaridade entre Bm86 cepa Campo Grande e Bm86 é 0,2% maior que aquela entre Bm86 cepa Campo Grande e Bm95. As identidades foram de 96,5% e 96,3%, respectivamente. Com relação à hidrofobicidade, os resultados sugerem que a maior diferença
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Registro original: |
Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
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