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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agroenergia. Para informações adicionais entre em contato com cnpae.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia. |
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Data corrente: |
15/09/2021 |
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Data da última atualização: |
15/09/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
MARQUES, H. P. |
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Afiliação: |
HETIENE PEREIRA MARQUES, Universidade Federal de Lavras. |
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Título: |
Panus Lecomtei e Pleurotus Pulmonarius: análise genômica e potencial enzimático dos macrobasidiomicetos aplicados a biomassas lignocelulósicas. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
2021. |
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Páginas: |
79 p. |
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Descrição Física: |
PDF: il. color. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Tese (Doutorado em Biotecnologia Vegetal) - Instituto de Ciências Naturais, Universidade Federal de Lavras, Lavras. Título em inglês: Panus Lecomtei and Pleurotus Pulmonarius: genomic and enzymatic potential analysis of macrobasidiomycetes applied to lignocellulosic biomass.
Orientador: Manoel Teixeira Souza Júnior (Embrapa Agroenergia); coorientador: Félix Gonçalves de Siqueira (Embrapa Agroenergia). |
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Conteúdo: |
Resumo: A aplicação de pré-tratamentos biológicos utilizando macrofungos tem sido uma alternativa viável para a obtenção de açucares fermentescíveis a partir da biomassa lignocelulósica devido a facilidade que esses microrganismos possuem naturalmente de biodegradar seletivamente polímeros naturais. Assim, a aplicação destes tem sido estudado a fim de aumentar as possibilidades de utilização da biomassa vegetal agregando valor as biorrefinarias. Estudos envolvendo análises genômicas em macrofungos tem sido empregado com intuito de entender processos e genes envolvidos na biodegradação da lignocelulose. Outro fato, está ligado a preservação das características fenotípicas desses fungos que ainda é pouco explorada para algumas espécies. Assim, nesse trabalho foi montado e anotado o genoma das espécies Panus lecomtei CC40 e Pleurotus pulmonarius EF88 a fim de melhor entender os genes e processos relacionados à biodegradação de biomassas lignocelulósicas. O sequenciamento foi feito com as plataformas ilumina e PacBio. Realizou-se uma montagem hibrida de 49 Mb do genoma de P. lecomtei CC40 com 16,562 genes preditos e 71Mb de tamanho para P. pulmonarius EF88 com 25,367 genes preditos. Em ambas espécies foi possível identificar famílias de proteínas CAZyme, relacionadas a biodegradação de polímeros de celulose, hemicelulose e lignina. Além disso, foram anotadas monooxigenases do citocromo P450, que estão relacionadas a biodegradação de compostos fenólicos e xenobióticos. Em adição, foi feita nesse trabalho a criopreservação de P. lecomtei CC40 para avaliar a viabilidade da produção de lacase, enzima atuante na desconstrução de parede celular vegetal. Como resultado, obteve-se a viabilidade das cepas criopreservadas, principalmente quando reativadas em meios de cultivo BDA e Malte. Além disso, as cepas criopreservadas apresentaram a produção de lacase em fermentação em estado sólido em fibra de prensagem de dendê, o que mostra que o processo de criopreservação não interferiu na atividade da enzima. Abstract: The application of biological pre-treatments using macrofungi has been a viable alternative to obtain fermentable sugars from lignocellulosic biomass due to the facility that these microorganisms naturally have to selectively biodegrade natural polymers. Thus, the application of these has been studied to increase the possibilities of using vegetable biomass adding value as biorefineries. Studies involving genomics in macrofungi have been used to understand the processes and genes involved in the biodegradation of lignocellulose. Another fact is linked to the preservation of the phenotypic characteristics of these fungi, which is still little explored for some species. Thus, in this work, the genome of the species Panus lecomtei CC40 and Pleurotus pulmonarius EF88 was assembled and annotated to better understand the genes and processes related to the biodegradation of lignocellulosic biomass. The sequencing was done with the platforms Illumina and PacBio. A hybrid assembly of 49 Mb of the genome of P. lecomtei CC40 was performed with 16,562 predicted genes and 71 MB in size for P. pulmonarius EF88 with 25,367 predicted genes. In both species, it was possible to identify families of CAZyme proteins, related to the biodegradation of cellulose, hemicellulose, and lignin polymers. Also, cytochrome P450 monooxygenases were noted, which are related to biodegradation of phenolic and xenobiotic compounds. Also, the cryopreservation of P. lecomtei CC40 was performed in this work to assess the viability of the production of laccase, an enzyme active in the deconstruction of plant cell walls. As a result, the viability of the cryopreserved strains was obtained, mainly when reactivated in BDA and Malt culture media. In addition, the cryopreserved strains dissipated the production of laccase in solid-state fermentation in palm oil pressing fiber, which shows that the cryopreservation process did not interfere with the enzyme activity. MenosResumo: A aplicação de pré-tratamentos biológicos utilizando macrofungos tem sido uma alternativa viável para a obtenção de açucares fermentescíveis a partir da biomassa lignocelulósica devido a facilidade que esses microrganismos possuem naturalmente de biodegradar seletivamente polímeros naturais. Assim, a aplicação destes tem sido estudado a fim de aumentar as possibilidades de utilização da biomassa vegetal agregando valor as biorrefinarias. Estudos envolvendo análises genômicas em macrofungos tem sido empregado com intuito de entender processos e genes envolvidos na biodegradação da lignocelulose. Outro fato, está ligado a preservação das características fenotípicas desses fungos que ainda é pouco explorada para algumas espécies. Assim, nesse trabalho foi montado e anotado o genoma das espécies Panus lecomtei CC40 e Pleurotus pulmonarius EF88 a fim de melhor entender os genes e processos relacionados à biodegradação de biomassas lignocelulósicas. O sequenciamento foi feito com as plataformas ilumina e PacBio. Realizou-se uma montagem hibrida de 49 Mb do genoma de P. lecomtei CC40 com 16,562 genes preditos e 71Mb de tamanho para P. pulmonarius EF88 com 25,367 genes preditos. Em ambas espécies foi possível identificar famílias de proteínas CAZyme, relacionadas a biodegradação de polímeros de celulose, hemicelulose e lignina. Além disso, foram anotadas monooxigenases do citocromo P450, que estão relacionadas a biodegradação de compostos fenólicos e xenobióticos. Em adição,... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Basidiomycetes; CAZymes; Mudanças fenotípicas; Sequenciamento; Sequencing. |
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Thesagro: |
Basidiomicetos; Biodegradação; Criopreservação. |
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Thesaurus Nal: |
Cryopreservation; Phenotypic variation. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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500 $aTese (Doutorado em Biotecnologia Vegetal) - Instituto de Ciências Naturais, Universidade Federal de Lavras, Lavras. Título em inglês: Panus Lecomtei and Pleurotus Pulmonarius: genomic and enzymatic potential analysis of macrobasidiomycetes applied to lignocellulosic biomass. Orientador: Manoel Teixeira Souza Júnior (Embrapa Agroenergia); coorientador: Félix Gonçalves de Siqueira (Embrapa Agroenergia).
520 $aResumo: A aplicação de pré-tratamentos biológicos utilizando macrofungos tem sido uma alternativa viável para a obtenção de açucares fermentescíveis a partir da biomassa lignocelulósica devido a facilidade que esses microrganismos possuem naturalmente de biodegradar seletivamente polímeros naturais. Assim, a aplicação destes tem sido estudado a fim de aumentar as possibilidades de utilização da biomassa vegetal agregando valor as biorrefinarias. Estudos envolvendo análises genômicas em macrofungos tem sido empregado com intuito de entender processos e genes envolvidos na biodegradação da lignocelulose. Outro fato, está ligado a preservação das características fenotípicas desses fungos que ainda é pouco explorada para algumas espécies. Assim, nesse trabalho foi montado e anotado o genoma das espécies Panus lecomtei CC40 e Pleurotus pulmonarius EF88 a fim de melhor entender os genes e processos relacionados à biodegradação de biomassas lignocelulósicas. O sequenciamento foi feito com as plataformas ilumina e PacBio. Realizou-se uma montagem hibrida de 49 Mb do genoma de P. lecomtei CC40 com 16,562 genes preditos e 71Mb de tamanho para P. pulmonarius EF88 com 25,367 genes preditos. Em ambas espécies foi possível identificar famílias de proteínas CAZyme, relacionadas a biodegradação de polímeros de celulose, hemicelulose e lignina. Além disso, foram anotadas monooxigenases do citocromo P450, que estão relacionadas a biodegradação de compostos fenólicos e xenobióticos. Em adição, foi feita nesse trabalho a criopreservação de P. lecomtei CC40 para avaliar a viabilidade da produção de lacase, enzima atuante na desconstrução de parede celular vegetal. Como resultado, obteve-se a viabilidade das cepas criopreservadas, principalmente quando reativadas em meios de cultivo BDA e Malte. Além disso, as cepas criopreservadas apresentaram a produção de lacase em fermentação em estado sólido em fibra de prensagem de dendê, o que mostra que o processo de criopreservação não interferiu na atividade da enzima. Abstract: The application of biological pre-treatments using macrofungi has been a viable alternative to obtain fermentable sugars from lignocellulosic biomass due to the facility that these microorganisms naturally have to selectively biodegrade natural polymers. Thus, the application of these has been studied to increase the possibilities of using vegetable biomass adding value as biorefineries. Studies involving genomics in macrofungi have been used to understand the processes and genes involved in the biodegradation of lignocellulose. Another fact is linked to the preservation of the phenotypic characteristics of these fungi, which is still little explored for some species. Thus, in this work, the genome of the species Panus lecomtei CC40 and Pleurotus pulmonarius EF88 was assembled and annotated to better understand the genes and processes related to the biodegradation of lignocellulosic biomass. The sequencing was done with the platforms Illumina and PacBio. A hybrid assembly of 49 Mb of the genome of P. lecomtei CC40 was performed with 16,562 predicted genes and 71 MB in size for P. pulmonarius EF88 with 25,367 predicted genes. In both species, it was possible to identify families of CAZyme proteins, related to the biodegradation of cellulose, hemicellulose, and lignin polymers. Also, cytochrome P450 monooxygenases were noted, which are related to biodegradation of phenolic and xenobiotic compounds. Also, the cryopreservation of P. lecomtei CC40 was performed in this work to assess the viability of the production of laccase, an enzyme active in the deconstruction of plant cell walls. As a result, the viability of the cryopreserved strains was obtained, mainly when reactivated in BDA and Malt culture media. In addition, the cryopreserved strains dissipated the production of laccase in solid-state fermentation in palm oil pressing fiber, which shows that the cryopreservation process did not interfere with the enzyme activity.
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Registro original: |
Embrapa Agroenergia (CNPAE) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Gado de Corte. Para informações adicionais entre em contato com cnpgc.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte. |
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Data corrente: |
15/09/2008 |
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Data da última atualização: |
15/10/2008 |
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Autoria: |
MONTAGNER, D. B.; NASCIMENTO JÚNIOR, D. do; SILVA, S. C. da; VALLE, C. B. do; SILVEIRA, M. C. T. da; PENA, K. da S.; ZANINE, A. de M.; SILVA, W. L. da; FONSECA, D. M. da. |
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Afiliação: |
Denise Baptaglin Montagner, Doutoranda em Zootecnia UFV, Bolsista CNPq; Domício do Nascimento Júnior, Professor Titular do Departamento de Zootecnia - UFV, Viçosa, MG; Sila Carneiro da Silva, ) Professor Associado do Departamento de Zootecnia, USP/ESALQ. |
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Título: |
Caracterização morfogência de gramíneas dos gêneros "Brachiaria" e "Panicum". |
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Ano de publicação: |
2006 |
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Fonte/Imprenta: |
In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 43., 2006, João Pessoa. Produção animal em biomas tropicais: anais. João Pessoa: Sociedade Brasileira de Zootecnia: UFPB, 2006. |
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Páginas: |
4 p. |
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Descrição Física: |
1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O experimento foi realizado em área do Departamento de Zootecnia da UFV, de dezembro de 2004 a junho de 2005. Foram avaliados oito cultivares de "Brachiaria" ("B. brizantha": Piatã, Marandu, Xaraés, Capiporã, Arapoty; "B. decumbens": Basilisk; "B. humidicola": Comercial e Tupi) e dois cultivares de "Panicum maximum" (Tanzânia e Mombaça) em condições de crescimento livre. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos completos casualizados, com três repetições. Foram calculadas: taxas de aparecimento (TApF, folhas/perfilho.dia), alongamento (TAlF, cm/perfilho.dia) e senescência de folhas (TSeF, cm/perfilho.dia), alongamento de colmos (TAlC, cm/perfilho.dia), número de folhas vivas por perfilho (NFV), duração de vida da folha (DVF, dias), comprimento final da folha (CFiF, cm) e filocrono (dias). Subtraindo-se o número de folhas surgidas (NFS) do NFV se obteve o número de folhas mortas (NFM), estimando-se o fluxo de tecidos das gramíneas. As características morfogênicas apresentaram grande variação entre gêneros, espécies e cultivares, o que é um indicativo de que práticas de manejo para essas plantas deverão ser diferenciadas. O conhecimento do fluxo de tecidos durante o período vegetativo, é uma informação importante para auxiliar na tomada de decisões relativas ao manejo de gramíneas forrageiras tropicais e extremamente relevante no processo de seleção de genitores, avaliação e melhoramento de plantas forrageiras, permitindo integração entre essas áreas da pesquisa |
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Palavras-Chave: |
Brasil; Brquiária; Feed crops; Feed grasses; Minas Gerais. |
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Thesagro: |
Brachiaria; Gramínea Forrageira; Morfologia Vegetal; Pastagem; Planta Forrageira. |
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Thesaurus NAL: |
Brazil; Panicum; pastures; plant anatomy. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 02737naa a2200397 a 4500
001 1326636
005 2008-10-15
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520 $aO experimento foi realizado em área do Departamento de Zootecnia da UFV, de dezembro de 2004 a junho de 2005. Foram avaliados oito cultivares de "Brachiaria" ("B. brizantha": Piatã, Marandu, Xaraés, Capiporã, Arapoty; "B. decumbens": Basilisk; "B. humidicola": Comercial e Tupi) e dois cultivares de "Panicum maximum" (Tanzânia e Mombaça) em condições de crescimento livre. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos completos casualizados, com três repetições. Foram calculadas: taxas de aparecimento (TApF, folhas/perfilho.dia), alongamento (TAlF, cm/perfilho.dia) e senescência de folhas (TSeF, cm/perfilho.dia), alongamento de colmos (TAlC, cm/perfilho.dia), número de folhas vivas por perfilho (NFV), duração de vida da folha (DVF, dias), comprimento final da folha (CFiF, cm) e filocrono (dias). Subtraindo-se o número de folhas surgidas (NFS) do NFV se obteve o número de folhas mortas (NFM), estimando-se o fluxo de tecidos das gramíneas. As características morfogênicas apresentaram grande variação entre gêneros, espécies e cultivares, o que é um indicativo de que práticas de manejo para essas plantas deverão ser diferenciadas. O conhecimento do fluxo de tecidos durante o período vegetativo, é uma informação importante para auxiliar na tomada de decisões relativas ao manejo de gramíneas forrageiras tropicais e extremamente relevante no processo de seleção de genitores, avaliação e melhoramento de plantas forrageiras, permitindo integração entre essas áreas da pesquisa
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Registro original: |
Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
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