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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
23/08/2016 |
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Data da última atualização: |
23/02/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
MUNIZ, M. M. M.; CAETANO, A. R.; McMANUS, C.; CAVALCANTI, L. C. G.; FAÇANHA, D. A. E.; LEITE, J. H. G. M.; FACO, O.; PAIVA, S. R. |
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Afiliação: |
Maria Malane Magalhães Muniz, Universidade de Brasília (UnB) - Brasília, DF, Brazil; ALEXANDRE RODRIGUES CAETANO, Cenargen; Concepta McManus, Universidade de Brasília (UnB) - Brasília, DF, Brazil; Lillian Cristina Gomes Cavalcanti, Universidade de Brasília (UnB) - Brasília, DF, Brazil; Débora Andrea Evangelista Façanha, Universidade Federal Rural do Semi-Árido (UFERSA) - Mossoró, RN, Brazil; Jacinara Hody Gurgel Morais Leite, Universidade Federal Rural do Semi-Árido (UFERSA) - Mossoró, RN, Brazil; OLIVARDO FACO, CNPC; SAMUEL REZENDE PAIVA, SRI. |
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Título: |
Application of genomic data to assist a community-based breeding program: A preliminary study of coat color genetics in Morada Nova sheep. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
Livestock Science, v. 190, p. 89-93, Aug. 2016. |
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DOI: |
http://dx.doi.org/10.1016/j.livsci.2016.06.006 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: The Brazilian Sheep Breeders' Association recognizes two varieties of the Morada Nova hair breed, white and red. However, the black variety and/or animals with a pigmented nose has frequently been disqualified from genealogical records. Previous studies suggest that this genetic group might be similar to the red variety. Thus, the aim of this study was to conduct a Genome-wide association study (GWAS) to identify genomic regions related to hair color and confirm the position of black relative to other Morada Nova varieties. After quality controls, 48 animals were genotyped for 45.982 SNPs using the OvineSNP50k BeadChip. Estimated Fst values between white and red animals, white and black, and red and black were 10.78% (p<0.00001), 9.23% (p<0.00001), and 2.93% (p<0.00001), respectively. The comparison between white and red (n=30) versus black (n=18) animals revealed 10 highly significant SNPs, most located in a 6.8 Mb window in Oar14 which contains the MC1R gene. Differences between black and red coats are the result of the expression of different alleles of the same gene without directly affecting productive/reproductive characteristics. These two varieties showed low genetic variation, insufficient to define them as different groups, and to increase the breeding herd, the animals with black hair and/or pigmentation of the nose should be used breeding purposes. The results of this study contribute to the discussion of the importance in reconciling conservation, traditional breed standards and breeding of farm animals. MenosAbstract: The Brazilian Sheep Breeders' Association recognizes two varieties of the Morada Nova hair breed, white and red. However, the black variety and/or animals with a pigmented nose has frequently been disqualified from genealogical records. Previous studies suggest that this genetic group might be similar to the red variety. Thus, the aim of this study was to conduct a Genome-wide association study (GWAS) to identify genomic regions related to hair color and confirm the position of black relative to other Morada Nova varieties. After quality controls, 48 animals were genotyped for 45.982 SNPs using the OvineSNP50k BeadChip. Estimated Fst values between white and red animals, white and black, and red and black were 10.78% (p<0.00001), 9.23% (p<0.00001), and 2.93% (p<0.00001), respectively. The comparison between white and red (n=30) versus black (n=18) animals revealed 10 highly significant SNPs, most located in a 6.8 Mb window in Oar14 which contains the MC1R gene. Differences between black and red coats are the result of the expression of different alleles of the same gene without directly affecting productive/reproductive characteristics. These two varieties showed low genetic variation, insufficient to define them as different groups, and to increase the breeding herd, the animals with black hair and/or pigmentation of the nose should be used breeding purposes. The results of this study contribute to the discussion of the importance in reconciling conservation, trad... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Coat color pigmentation; GWAS; MC1R; Recurso genético animal. |
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Thesagro: |
Marcador genético; Ovino. |
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Thesaurus Nal: |
Animal genetic resources; Genetic markers; genome-wide association study; Sheep. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Caprinos e Ovinos (CNPC) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
19/01/2017 |
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Data da última atualização: |
19/01/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 2 |
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Autoria: |
DIAS, P. C.; XAVIER, A.; RESENDE, M. D. V. de; BIERNASKI, F. A.; ESTOPA, R. A. |
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Afiliação: |
Poliana Coqueiro Dias, Universidade Federal Rural do Semi-Árido; Aloisio Xavier, UFV; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; Fabrício Antonio Biernaski, Klabin S.A.; Regiane Abjaud Estopa, Klabin S.A. |
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Título: |
Parâmetros genéticos para a capacidade de propagação de Pinus taeda por embriogênese somática. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
Revista Árvore, Viçosa, MG, v. 39, n. 6, p. 1093-1102, 2015. |
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DOI: |
http://dx.doi.org/10.1590/0100-67622015000600012 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Objetivou-se com este trabalho avaliar a capacidade de propagação de famílias de Pinus taeda por embriogênese somática utilizando estimativas de parâmetros genéticos. Para a embriogênese somática, foram selecionados cones imaturos de 65 famílias-elite de Pinus taeda. O germoplasma utilizado para a implantação dos testes de campo foi composto por 238 clones de 31 famílias. O estudo foi realizado por meio de análise genetíoco-estatística pelo procedimento de estimação de componentes de variância via máxima verossimilhança residual (Reml) e de predição de valores genéticos via melhor predição linear não viesada (Blup), usando-se o software Selegen-Reml/Blup. De acordo com os resultados, a variabilidade genética possibilita ganhos genéticos altos pela seleção entre famílias, para os caracteres presença de embriões somáticos e número de clones por famílias de Pinus taeda. Há baixa ou nenhuma correlação genética entre o número de clones propagados via embriogênese somática e as características altura, diâmetro, sobrevivência e volume avaliados aos 4 anos de idade em testes clonais. Conclui-se que há maior ganho genético para a capacidade de propagação por embriogênese somática com a seleção de famílias de Pinus taeda. |
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Palavras-Chave: |
Clonal propagation; Espécie exótica; Ganho genético; Propagação clonal. |
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Thesagro: |
Controle genético; Pinus Taeda; Propagação vegetativa; Reprodução vegetal. |
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Thesaurus NAL: |
Breeding and Genetic Improvement; Gene expression regulation. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/153554/1/2015-M.Deon-RA-ParametrosGeneticos.pdf
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Marc: |
LEADER 02260naa a2200301 a 4500
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520 $aObjetivou-se com este trabalho avaliar a capacidade de propagação de famílias de Pinus taeda por embriogênese somática utilizando estimativas de parâmetros genéticos. Para a embriogênese somática, foram selecionados cones imaturos de 65 famílias-elite de Pinus taeda. O germoplasma utilizado para a implantação dos testes de campo foi composto por 238 clones de 31 famílias. O estudo foi realizado por meio de análise genetíoco-estatística pelo procedimento de estimação de componentes de variância via máxima verossimilhança residual (Reml) e de predição de valores genéticos via melhor predição linear não viesada (Blup), usando-se o software Selegen-Reml/Blup. De acordo com os resultados, a variabilidade genética possibilita ganhos genéticos altos pela seleção entre famílias, para os caracteres presença de embriões somáticos e número de clones por famílias de Pinus taeda. Há baixa ou nenhuma correlação genética entre o número de clones propagados via embriogênese somática e as características altura, diâmetro, sobrevivência e volume avaliados aos 4 anos de idade em testes clonais. Conclui-se que há maior ganho genético para a capacidade de propagação por embriogênese somática com a seleção de famílias de Pinus taeda.
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650 $aControle genético
650 $aPinus Taeda
650 $aPropagação vegetativa
650 $aReprodução vegetal
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653 $aEspécie exótica
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653 $aPropagação clonal
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773 $tRevista Árvore, Viçosa, MG$gv. 39, n. 6, p. 1093-1102, 2015.
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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