BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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1.Imagem marcado/desmarcadoSILVA JUNIOR, O. B. da. Development and applications of high-throughput SNP genotyping technologies in non-model plant genomes. 2017 169 f. Tese (Doutorado em Ciências Genômicas) - Universidade Católica de Brasília, Brasília, DF. Orientador: Dário Grattapaglia, Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

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2.Imagem marcado/desmarcadoSILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D. Genome-wide patterns of recombination, linkage disequilibrium and nucleotide diversity from pooled resequencing and single nucleotide polymorphism genotyping unlock the evolutionary history of Eucalyptus grandis. New Phytologist, v. 208, p. 830-845, 2015.

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3.Imagem marcado/desmarcadoSILVA JUNIOR, O. B. da; FARIA, D. A.; GRATTAPAGLIA, D. A flexible multi-species genome-wide 60K SNP chip developed from pooled resequencing of 240 Eucalyptus tree genomes across 12 species. New Phytologist, v. 206, n. 4, p. 1527(14), 2015.

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4.Imagem marcado/desmarcadoSILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; NOVAES, E.; COLLEVATTI, R. G. Design and evaluation of a sequence capture systemfor genome-wide SNP genotyping in highly heterozygous plant genomes: a case studywith a keystone Neotropical hardwood tree genome. DNA Research, v. 25, n. 5, p. 535-545, 2018. Na publicação: Orzenil Bonfim Silva-Junior.

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5.Imagem marcado/desmarcadoCARNEIRO, F. de A.; MARRACCINI, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C. Desenvolvimento e validação do chip de genotipagem 26K Axiom® SNP array em Coffea canephora. In: CONGRESSO DA PÓS-GRADUAÇÃO DA UFLA, 26., 2017, Lavras. Anais... Lavras: UFLA, 2017.

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6.Imagem marcado/desmarcadoGRATTAPAGLIA, D.; SILVA JUNIOR, O. B. da; RESENDE, L. V.; SILVA, P. I. T. A five-species 50K Axiom SNP microarray allows high quality genotyping of coffee, cashew, cassava, brazilian pine and eucalyptus. In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 25., 2017, San Diego. [Abstracts...]. San Diego, CA: [s.n.], 2017.

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7.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, L. V.; SOUSA, V. A. de; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D. Desenvolvimento de novos microssatélites em Araucaria angustifolia via redução de complexidade genômica e sequenciamento. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. CD-ROM. Resumo.

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8.Imagem marcado/desmarcadoCARNEIRO, F. de A.; MARRACCINI, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C. Development and validation of a 26K Axiom® SNP array for Coffea canephora. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE GENÉTICA E MELHORAMENTO, 8., 2017, Viçosa, MG. Ômicas: do gene ao fenótipo. [Proceedings...] Viçosa, MG: UFV, 2017.

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9.Imagem marcado/desmarcadoANDRADE, A. C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; CARNEIRO, F. de A.; MARRACCINI, P.; GRATTAPAGLIA, D. Towards GWAS and genomic prediction in coffee: development and validation of a 26K SNP chip for Coffea canephora. In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 25., 2017, San Diego. [Abstracts...]. San Diego, CA: [s.n.], 2017. W173.

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10.Imagem marcado/desmarcadoCAPPA, E. P.; LIMA, B. M. de; SILVA JUNIOR, O. B. da; GARCIA, C. C.; MANSFIELD, S. D.; GRATTAPAGLIA, D. Improving genomic prediction of growth and wood traits in Eucalyptus using phenotypes from non-genotyped trees by single-step GBLUP. Plant Science, v. 284, p. 9-15, 2019.

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11.Imagem marcado/desmarcadoCHAGAS, A. S.; SILVA JUNIOR, O. B. da; SOUSA, H. R.; ALMEIDA, J. D. de; BARROS, L. M. G. Isolamento de promotor putativo específico de folha de Coffea arabica utilizando o método genome walker. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 15., 2010, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. Resumo 028.

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12.Imagem marcado/desmarcadoGRATTAPAGLIA, D.; SILVA JUNIOR, O. B. da; KIRST, M.; LIMA, B. M.; FARIA, D. A.; PAPPAS JUNIOR, G. J. High-throughput SNP genotyping in the highly heterozygous genome of Eucalyptus: assay success, polymorphism and transferability across species. BMC Plant Biology, 11:65, 2011. (Open acess)

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13.Imagem marcado/desmarcadoBARROS, L. M. G.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GARCIA, R. A.; ANDRADE, L. R. M. de. Metodologia para análise de transcritoma de pontas de raÍzes de árvore tropical por RNA-Seq. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2012, Belém, PA. Anais... [S.l.]: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2012. 1 CD-ROM.

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14.Imagem marcado/desmarcadoCOLLEVATTI, R. G.; NOVAES, E.; SILVA JUNIOR, O. B. da; VIEIRA, L. D.; LIMA-RIBEIRO, M. S.; GRATTAPAGLIA, D. A genome-wide scan shows evidence for local adaptation in a widespread keystone Neotropical forest tree. Heredity, v. 123, p. 117-137, 2019. Na publicação: Orzenil B. Silva-Junior.

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15.Imagem marcado/desmarcadoTELFER, E. J.; STOVOLD, G. T.; LI, Y.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; DUNGEY, H. S. Parentage reconstruction in eucalyptus nitens using SNPs and microsatellite markers: a comparative analysis of marker data power and robustness. Plos One, July 9, 2015. (Open Access)

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16.Imagem marcado/desmarcadoALENCAR; SILVA JUNIOR, O. B. da; TOGAWA, R. C.; COSTA, M.; REVERS, L. F.; PAPPAS JUNIOR, G. J. SNP discovery in apple cultivars using next generation sequencing. BMC Proceedings, v. 5, Suppl 7,p. P42, 2011. Edição dos resumos do IUFRO Tree Biotechnology Conference 2011: From Genomes to Integration, 2011, Arraial d Ajuda, Bahia.

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17.Imagem marcado/desmarcadoMARTINS, A. M.; SILVA JUNIOR, O. B. da; NOVAES, E.; PAPPAS, M. de C. R.; FARIA, D. A. de; SCHMUTZ, J.; GRATTAPAGLIA, D.; PAPPAS JUNIOR, G. J. Allelic BAC sequencing in the highly heterozygous Eucalyptus genome reveals microcollinearity with variable patterns of haplotype diversity due to the movement of transposons. In: IUFRO TREE BIOTECHNOLOGY CONFERENCE, 2009, Whislter. Abstracts. [S.l.]: IUFRO, 2009. p. 51

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18.Imagem marcado/desmarcadoPESSOA FILHO, M. A. C. de P.; SILVA, P. I. T.; RESENDE, L. V.; VIEIRA, E. A.; FALEIRO, F. G.; GRATTAPAGLIA, D.; SILVA JUNIOR, O. B. da. Application of the Axiom 3K SNP genotyping array in cassava breeding and genetics. In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 26., 2018, San Diego. Proceedings... Jersey City, NJ: Scherago International, 2018. PAG XXVI

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19.Imagem marcado/desmarcadoPESSOA FILHO, M. A. C. de P.; SOUZA SOBRINHO, F. de; FRAGOSO, R. da R.; SILVA JUNIOR, O. B. da; FERREIRA, M. E. A draft genome assembly for the forage grass Urochloa ruziziensis based on single-molecule real-time sequencing. In: BRAZILIAN BIOTECHNOLOGY CONGRESS, 7.; BIOTECHNOLOGY IBERO-AMERICAN CONGRESS, 2., 2018, Brasília, DF. Proceedings... Brasília, DF: SBBiotec, 2018.

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20.Imagem marcado/desmarcadoPESSOA FILHO, M. A. C. de P.; SOUZA SOBRINHO, F. de; FRAGOSO, R. da R.; SILVA JUNIOR, O. B. da; FERREIRA, M. E. Improving the use of genomic tools in tropical forage grass breeding with diploid ruzigrass as a reference. In: INTERNATIONAL FORAGE & TURF BREEDING CONFERENCE, 2019, Lake Buena Vista, FL. A global vision for innovation: abstract book... Lake Buena Vista: University of Florida, 2019. p. 92.

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1.Imagem marcado/desmarcadoSILVA JUNIOR, O. B. da. Development and applications of high-throughput SNP genotyping technologies in non-model plant genomes. 2017 169 f. Tese (Doutorado em Ciências Genômicas) - Universidade Católica de Brasília, Brasília, DF. Orientador: Dário Grattapaglia, Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Tipo: Orientação de Tese de Pós-Graduação
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2.Imagem marcado/desmarcadoSILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D. Genome-wide patterns of recombination, linkage disequilibrium and nucleotide diversity from pooled resequencing and single nucleotide polymorphism genotyping unlock the evolutionary history of Eucalyptus grandis. New Phytologist, v. 208, p. 830-845, 2015.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
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3.Imagem marcado/desmarcadoSILVA JUNIOR, O. B. da; FARIA, D. A.; GRATTAPAGLIA, D. A flexible multi-species genome-wide 60K SNP chip developed from pooled resequencing of 240 Eucalyptus tree genomes across 12 species. New Phytologist, v. 206, n. 4, p. 1527(14), 2015.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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4.Imagem marcado/desmarcadoCARNEIRO, F. de A.; MARRACCINI, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C. Development and validation of a 26K Axiom® SNP array for Coffea canephora. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE GENÉTICA E MELHORAMENTO, 8., 2017, Viçosa, MG. Ômicas: do gene ao fenótipo. [Proceedings...] Viçosa, MG: UFV, 2017.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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5.Imagem marcado/desmarcadoANDRADE, A. C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; CARNEIRO, F. de A.; MARRACCINI, P.; GRATTAPAGLIA, D. Towards GWAS and genomic prediction in coffee: development and validation of a 26K SNP chip for Coffea canephora. In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 25., 2017, San Diego. [Abstracts...]. San Diego, CA: [s.n.], 2017. W173.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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6.Imagem marcado/desmarcadoGRATTAPAGLIA, D.; SILVA JUNIOR, O. B. da; RESENDE, L. V.; SILVA, P. I. T. A five-species 50K Axiom SNP microarray allows high quality genotyping of coffee, cashew, cassava, brazilian pine and eucalyptus. In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 25., 2017, San Diego. [Abstracts...]. San Diego, CA: [s.n.], 2017.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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7.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, L. V.; SOUSA, V. A. de; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D. Desenvolvimento de novos microssatélites em Araucaria angustifolia via redução de complexidade genômica e sequenciamento. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. CD-ROM. Resumo.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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8.Imagem marcado/desmarcadoCARNEIRO, F. de A.; MARRACCINI, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C. Desenvolvimento e validação do chip de genotipagem 26K Axiom® SNP array em Coffea canephora. In: CONGRESSO DA PÓS-GRADUAÇÃO DA UFLA, 26., 2017, Lavras. Anais... Lavras: UFLA, 2017.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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9.Imagem marcado/desmarcadoSILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; NOVAES, E.; COLLEVATTI, R. G. Design and evaluation of a sequence capture systemfor genome-wide SNP genotyping in highly heterozygous plant genomes: a case studywith a keystone Neotropical hardwood tree genome. DNA Research, v. 25, n. 5, p. 535-545, 2018. Na publicação: Orzenil Bonfim Silva-Junior.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
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10.Imagem marcado/desmarcadoCHAGAS, A. S.; SILVA JUNIOR, O. B. da; SOUSA, H. R.; ALMEIDA, J. D. de; BARROS, L. M. G. Isolamento de promotor putativo específico de folha de Coffea arabica utilizando o método genome walker. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 15., 2010, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. Resumo 028.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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11.Imagem marcado/desmarcadoCAPPA, E. P.; LIMA, B. M. de; SILVA JUNIOR, O. B. da; GARCIA, C. C.; MANSFIELD, S. D.; GRATTAPAGLIA, D. Improving genomic prediction of growth and wood traits in Eucalyptus using phenotypes from non-genotyped trees by single-step GBLUP. Plant Science, v. 284, p. 9-15, 2019.
Tipo: Artigo em Periódico Indexado
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12.Imagem marcado/desmarcadoTELFER, E. J.; STOVOLD, G. T.; LI, Y.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; DUNGEY, H. S. Parentage reconstruction in eucalyptus nitens using SNPs and microsatellite markers: a comparative analysis of marker data power and robustness. Plos One, July 9, 2015. (Open Access)
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
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13.Imagem marcado/desmarcadoBARROS, L. M. G.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GARCIA, R. A.; ANDRADE, L. R. M. de. Metodologia para análise de transcritoma de pontas de raÍzes de árvore tropical por RNA-Seq. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2012, Belém, PA. Anais... [S.l.]: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2012. 1 CD-ROM.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
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14.Imagem marcado/desmarcadoGRATTAPAGLIA, D.; SILVA JUNIOR, O. B. da; KIRST, M.; LIMA, B. M.; FARIA, D. A.; PAPPAS JUNIOR, G. J. High-throughput SNP genotyping in the highly heterozygous genome of Eucalyptus: assay success, polymorphism and transferability across species. BMC Plant Biology, 11:65, 2011. (Open acess)
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
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15.Imagem marcado/desmarcadoCOLLEVATTI, R. G.; NOVAES, E.; SILVA JUNIOR, O. B. da; VIEIRA, L. D.; LIMA-RIBEIRO, M. S.; GRATTAPAGLIA, D. A genome-wide scan shows evidence for local adaptation in a widespread keystone Neotropical forest tree. Heredity, v. 123, p. 117-137, 2019. Na publicação: Orzenil B. Silva-Junior.
Tipo: Artigo em Periódico Indexado
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16.Imagem marcado/desmarcadoALENCAR; SILVA JUNIOR, O. B. da; TOGAWA, R. C.; COSTA, M.; REVERS, L. F.; PAPPAS JUNIOR, G. J. SNP discovery in apple cultivars using next generation sequencing. BMC Proceedings, v. 5, Suppl 7,p. P42, 2011. Edição dos resumos do IUFRO Tree Biotechnology Conference 2011: From Genomes to Integration, 2011, Arraial d Ajuda, Bahia.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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17.Imagem marcado/desmarcadoSILVA JUNIOR, O. B. da; TOGAWA, R. C.; NOVAES, E.; FARIA, D. A. de; PAPPAS JUNIOR, G. J.; MATIAS, K.; GRATTAPAGLIA, D. Assessment of predicted assay functionality of Eucalyptus SNP derived from large interspecific collections of ESTs. In: IUFRO TREE BIOTECHNOLOGY CONFERENCE, 2009, Whislter. Abstracts. [S.l.]: IUFRO, 2009. p-52
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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18.Imagem marcado/desmarcadoLIMA, B. M.; SILVA JUNIOR, O. B. da; FARIA, D. A.; MAMANI, E. M. C.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; GRATTAPAGLIA, D. Assessment of SNPs for linkage mapping in Eucalyptus: construction of a consensus SNP/microsatellite map from two unrelated pedigrees. BMC Proceedings, v. 5, suppl, P31, 2012. (Open access) Edição do Proceedings IUFRO Tree Biotechnology Conference, Arraial d?Ajuda, 2011.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
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19.Imagem marcado/desmarcadoSILVA JUNIOR, O. B. da; RESENDE, L. V.; VIDAL, R. F.; BORDALLO, P. N.; SILVA, P. I. T.; MELO, D. S.; TOGAWA, R. C.; GRATTAPAGLIA, D. A chromosome-scale assembly of the cashew tree genome: leveraging the combined power of PacBio, DNA-Chromatin Proximity Ligation and SNP linkage maps. In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 25., 2017, San Diego. [Abstracts...]. San Diego, CA: [s.n.], 2017. W354.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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20.Imagem marcado/desmarcadoPESSOA FILHO, M. A. C. de P.; SILVA, P. I. T.; RESENDE, L. V.; VIEIRA, E. A.; FALEIRO, F. G.; GRATTAPAGLIA, D.; SILVA JUNIOR, O. B. da. Application of the Axiom 3K SNP genotyping array in cassava breeding and genetics. In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 26., 2018, San Diego. Proceedings... Jersey City, NJ: Scherago International, 2018. PAG XXVI
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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