BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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1.Imagem marcado/desmarcadoSILVA JUNIOR, O. B. da. Development and applications of high-throughput SNP genotyping technologies in non-model plant genomes. 2017 169 f. Tese (Doutorado em Ciências Genômicas) - Universidade Católica de Brasília, Brasília, DF. Orientador: Dário Grattapaglia, Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

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2.Imagem marcado/desmarcadoSILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D. Genome-wide patterns of recombination, linkage disequilibrium and nucleotide diversity from pooled resequencing and single nucleotide polymorphism genotyping unlock the evolutionary history of Eucalyptus grandis. New Phytologist, v. 208, p. 830-845, 2015.

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3.Imagem marcado/desmarcadoSILVA JUNIOR, O. B. da; FARIA, D. A.; GRATTAPAGLIA, D. A flexible multi-species genome-wide 60K SNP chip developed from pooled resequencing of 240 Eucalyptus tree genomes across 12 species. New Phytologist, v. 206, n. 4, p. 1527(14), 2015.

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4.Imagem marcado/desmarcadoGRATTAPAGLIA, D.; SILVA JUNIOR, O. B. da; RESENDE, L. V.; SILVA, P. I. T. A five-species 50K Axiom SNP microarray allows high quality genotyping of coffee, cashew, cassava, brazilian pine and eucalyptus. In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 25., 2017, San Diego. [Abstracts...]. San Diego, CA: [s.n.], 2017.

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5.Imagem marcado/desmarcadoCARNEIRO, F. de A.; MARRACCINI, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C. Desenvolvimento e validação do chip de genotipagem 26K Axiom® SNP array em Coffea canephora. In: CONGRESSO DA PÓS-GRADUAÇÃO DA UFLA, 26., 2017, Lavras. Anais... Lavras: UFLA, 2017.

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6.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, L. V.; SOUSA, V. A. de; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D. Desenvolvimento de novos microssatélites em Araucaria angustifolia via redução de complexidade genômica e sequenciamento. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. CD-ROM. Resumo.

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7.Imagem marcado/desmarcadoSILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; NOVAES, E.; COLLEVATTI, R. G. Design and evaluation of a sequence capture systemfor genome-wide SNP genotyping in highly heterozygous plant genomes: a case studywith a keystone Neotropical hardwood tree genome. DNA Research, v. 25, n. 5, p. 535-545, 2018. Na publicação: Orzenil Bonfim Silva-Junior.

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8.Imagem marcado/desmarcadoCARNEIRO, F. de A.; MARRACCINI, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C. Development and validation of a 26K Axiom® SNP array for Coffea canephora. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE GENÉTICA E MELHORAMENTO, 8., 2017, Viçosa, MG. Ômicas: do gene ao fenótipo. [Proceedings...] Viçosa, MG: UFV, 2017.

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9.Imagem marcado/desmarcadoTANNO, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; RESENDE, L. V.; SOUSA, V. A. de; GRATTAPAGLIA, D. A genotyping array of 3,400 Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) advances the genetic analysis of the iconic tree Araucaria angustifolia, showing that the natural populations ar e more differentiated than previously reported. Pesquisa Florestal Brasileira, Colombo, v. 39, (nesp), e201902043, 2019. p. 188. Edição especial dos resumos do IUFRO World Congress, 25., 2019, Curitiba.

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10.Imagem marcado/desmarcadoANDRADE, A. C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; CARNEIRO, F. de A.; MARRACCINI, P.; GRATTAPAGLIA, D. Towards GWAS and genomic prediction in coffee: development and validation of a 26K SNP chip for Coffea canephora. In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 25., 2017, San Diego. [Abstracts...]. San Diego, CA: [s.n.], 2017. W173.

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11.Imagem marcado/desmarcadoBARROS, L. M. G.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GARCIA, R. A.; ANDRADE, L. R. M. de. Metodologia para análise de transcritoma de pontas de raÍzes de árvore tropical por RNA-Seq. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2012, Belém, PA. Anais... [S.l.]: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2012. 1 CD-ROM.

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12.Imagem marcado/desmarcadoCHAGAS, A. S.; SILVA JUNIOR, O. B. da; SOUSA, H. R.; ALMEIDA, J. D. de; BARROS, L. M. G. Isolamento de promotor putativo específico de folha de Coffea arabica utilizando o método genome walker. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 15., 2010, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. Resumo 028.

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13.Imagem marcado/desmarcadoGRATTAPAGLIA, D.; SILVA JUNIOR, O. B. da; KIRST, M.; LIMA, B. M.; FARIA, D. A.; PAPPAS JUNIOR, G. J. High-throughput SNP genotyping in the highly heterozygous genome of Eucalyptus: assay success, polymorphism and transferability across species. BMC Plant Biology, 11:65, 2011. (Open acess)

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14.Imagem marcado/desmarcadoCAPPA, E. P.; LIMA, B. M. de; SILVA JUNIOR, O. B. da; GARCIA, C. C.; MANSFIELD, S. D.; GRATTAPAGLIA, D. Improving genomic prediction of growth and wood traits in Eucalyptus using phenotypes from non-genotyped trees by single-step GBLUP. Plant Science, v. 284, p. 9-15, 2019.

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15.Imagem marcado/desmarcadoCOLLEVATTI, R. G.; NOVAES, E.; SILVA JUNIOR, O. B. da; VIEIRA, L. D.; LIMA-RIBEIRO, M. S.; GRATTAPAGLIA, D. A genome-wide scan shows evidence for local adaptation in a widespread keystone Neotropical forest tree. Heredity, v. 123, p. 117-137, 2019. Na publicação: Orzenil B. Silva-Junior.

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16.Imagem marcado/desmarcadoALENCAR; SILVA JUNIOR, O. B. da; TOGAWA, R. C.; COSTA, M.; REVERS, L. F.; PAPPAS JUNIOR, G. J. SNP discovery in apple cultivars using next generation sequencing. BMC Proceedings, v. 5, Suppl 7,p. P42, 2011. Edição dos resumos do IUFRO Tree Biotechnology Conference 2011: From Genomes to Integration, 2011, Arraial d Ajuda, Bahia.

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17.Imagem marcado/desmarcadoTELFER, E. J.; STOVOLD, G. T.; LI, Y.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; DUNGEY, H. S. Parentage reconstruction in eucalyptus nitens using SNPs and microsatellite markers: a comparative analysis of marker data power and robustness. Plos One, July 9, 2015. (Open Access)

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18.Imagem marcado/desmarcadoSILVA JUNIOR, O. B. da; PESSOA FILHO, M. A. C. de P.; SA, M. E. L.; DEAL, R.; RAGOUSSIS, I.; GRATTAPAGLIA, D.; RECH FILHO, E. L. Coupling in-depth genome annotations with genome editing technology for harnessing genomic variation to promote precision breeding in tropical soybean. In: BRAZILIAN BIOTECHNOLOGY CONGRESS, 7.; BIOTECHNOLOGY IBERO-AMERICAN CONGRESS, 2., 2018, Brasília, DF. Proceedings... Brasília, DF: SBBiotec, 2018.

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19.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, R. T.; TANNO, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; AGUIAR, A. V. de; SOUSA, V. A. de; SEBBENN, A.; GRATTAPAGLIA, D. Genetic analysis of growth curves of individual trees and country-wide provenances of Araucaria angustifolia shows huge potential for enhanced domestication, breeding and conservation of this iconic Brazilian conifer. Pesquisa Florestal Brasileira, Colombo, v. 39, (nesp), e201902043, 2019. p. 48. Edição especial dos resumos do IUFRO World Congress, 25., 2019, Curitiba.

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20.Imagem marcado/desmarcadoMILLER, R. N. G.; PASSOS, M. A. N.; EMEDIATO, F. L.; TEIXEIRA, C. C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; PAPPAS JUNIOR, G. J. Gene expression analysis in Musa acuminata-Mycosphaerella interactions. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 45., 2012, Manaus. Fito 2012. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 37, 2012. Suplemento. 1 CD-ROM.

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1.Imagem marcado/desmarcadoSILVA JUNIOR, O. B. da. Development and applications of high-throughput SNP genotyping technologies in non-model plant genomes. 2017 169 f. Tese (Doutorado em Ciências Genômicas) - Universidade Católica de Brasília, Brasília, DF. Orientador: Dário Grattapaglia, Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Tipo: Orientação de Tese de Pós-Graduação
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2.Imagem marcado/desmarcadoSILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D. Genome-wide patterns of recombination, linkage disequilibrium and nucleotide diversity from pooled resequencing and single nucleotide polymorphism genotyping unlock the evolutionary history of Eucalyptus grandis. New Phytologist, v. 208, p. 830-845, 2015.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
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3.Imagem marcado/desmarcadoSILVA JUNIOR, O. B. da; FARIA, D. A.; GRATTAPAGLIA, D. A flexible multi-species genome-wide 60K SNP chip developed from pooled resequencing of 240 Eucalyptus tree genomes across 12 species. New Phytologist, v. 206, n. 4, p. 1527(14), 2015.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
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4.Imagem marcado/desmarcadoCARNEIRO, F. de A.; MARRACCINI, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C. Development and validation of a 26K Axiom® SNP array for Coffea canephora. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE GENÉTICA E MELHORAMENTO, 8., 2017, Viçosa, MG. Ômicas: do gene ao fenótipo. [Proceedings...] Viçosa, MG: UFV, 2017.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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5.Imagem marcado/desmarcadoCARNEIRO, F. de A.; MARRACCINI, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C. Desenvolvimento e validação do chip de genotipagem 26K Axiom® SNP array em Coffea canephora. In: CONGRESSO DA PÓS-GRADUAÇÃO DA UFLA, 26., 2017, Lavras. Anais... Lavras: UFLA, 2017.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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6.Imagem marcado/desmarcadoSILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; NOVAES, E.; COLLEVATTI, R. G. Design and evaluation of a sequence capture systemfor genome-wide SNP genotyping in highly heterozygous plant genomes: a case studywith a keystone Neotropical hardwood tree genome. DNA Research, v. 25, n. 5, p. 535-545, 2018. Na publicação: Orzenil Bonfim Silva-Junior.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
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7.Imagem marcado/desmarcadoTANNO, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; RESENDE, L. V.; SOUSA, V. A. de; GRATTAPAGLIA, D. A genotyping array of 3,400 Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) advances the genetic analysis of the iconic tree Araucaria angustifolia, showing that the natural populations ar e more differentiated than previously reported. Pesquisa Florestal Brasileira, Colombo, v. 39, (nesp), e201902043, 2019. p. 188. Edição especial dos resumos do IUFRO World Congress, 25., 2019, Curitiba.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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8.Imagem marcado/desmarcadoGRATTAPAGLIA, D.; SILVA JUNIOR, O. B. da; RESENDE, L. V.; SILVA, P. I. T. A five-species 50K Axiom SNP microarray allows high quality genotyping of coffee, cashew, cassava, brazilian pine and eucalyptus. In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 25., 2017, San Diego. [Abstracts...]. San Diego, CA: [s.n.], 2017.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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9.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, L. V.; SOUSA, V. A. de; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D. Desenvolvimento de novos microssatélites em Araucaria angustifolia via redução de complexidade genômica e sequenciamento. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. CD-ROM. Resumo.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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10.Imagem marcado/desmarcadoANDRADE, A. C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; CARNEIRO, F. de A.; MARRACCINI, P.; GRATTAPAGLIA, D. Towards GWAS and genomic prediction in coffee: development and validation of a 26K SNP chip for Coffea canephora. In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 25., 2017, San Diego. [Abstracts...]. San Diego, CA: [s.n.], 2017. W173.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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11.Imagem marcado/desmarcadoALENCAR; SILVA JUNIOR, O. B. da; TOGAWA, R. C.; COSTA, M.; REVERS, L. F.; PAPPAS JUNIOR, G. J. SNP discovery in apple cultivars using next generation sequencing. BMC Proceedings, v. 5, Suppl 7,p. P42, 2011. Edição dos resumos do IUFRO Tree Biotechnology Conference 2011: From Genomes to Integration, 2011, Arraial d Ajuda, Bahia.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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12.Imagem marcado/desmarcadoBARROS, L. M. G.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GARCIA, R. A.; ANDRADE, L. R. M. de. Metodologia para análise de transcritoma de pontas de raÍzes de árvore tropical por RNA-Seq. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2012, Belém, PA. Anais... [S.l.]: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2012. 1 CD-ROM.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
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13.Imagem marcado/desmarcadoTELFER, E. J.; STOVOLD, G. T.; LI, Y.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; DUNGEY, H. S. Parentage reconstruction in eucalyptus nitens using SNPs and microsatellite markers: a comparative analysis of marker data power and robustness. Plos One, July 9, 2015. (Open Access)
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
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14.Imagem marcado/desmarcadoCOLLEVATTI, R. G.; NOVAES, E.; SILVA JUNIOR, O. B. da; VIEIRA, L. D.; LIMA-RIBEIRO, M. S.; GRATTAPAGLIA, D. A genome-wide scan shows evidence for local adaptation in a widespread keystone Neotropical forest tree. Heredity, v. 123, p. 117-137, 2019. Na publicação: Orzenil B. Silva-Junior.
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15.Imagem marcado/desmarcadoGRATTAPAGLIA, D.; SILVA JUNIOR, O. B. da; KIRST, M.; LIMA, B. M.; FARIA, D. A.; PAPPAS JUNIOR, G. J. High-throughput SNP genotyping in the highly heterozygous genome of Eucalyptus: assay success, polymorphism and transferability across species. BMC Plant Biology, 11:65, 2011. (Open acess)
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16.Imagem marcado/desmarcadoCAPPA, E. P.; LIMA, B. M. de; SILVA JUNIOR, O. B. da; GARCIA, C. C.; MANSFIELD, S. D.; GRATTAPAGLIA, D. Improving genomic prediction of growth and wood traits in Eucalyptus using phenotypes from non-genotyped trees by single-step GBLUP. Plant Science, v. 284, p. 9-15, 2019.
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17.Imagem marcado/desmarcadoCHAGAS, A. S.; SILVA JUNIOR, O. B. da; SOUSA, H. R.; ALMEIDA, J. D. de; BARROS, L. M. G. Isolamento de promotor putativo específico de folha de Coffea arabica utilizando o método genome walker. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 15., 2010, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. Resumo 028.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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18.Imagem marcado/desmarcadoMARTINS, A. M.; SILVA JUNIOR, O. B. da; NOVAES, E.; PAPPAS, M. de C. R.; FARIA, D. A. de; SCHMUTZ, J.; GRATTAPAGLIA, D.; PAPPAS JUNIOR, G. J. Allelic BAC sequencing in the highly heterozygous Eucalyptus genome reveals microcollinearity with variable patterns of haplotype diversity due to the movement of transposons. In: IUFRO TREE BIOTECHNOLOGY CONFERENCE, 2009, Whislter. Abstracts. [S.l.]: IUFRO, 2009. p. 51
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19.Imagem marcado/desmarcadoPESSOA FILHO, M. A. C. de P.; SILVA, P. I. T.; RESENDE, L. V.; VIEIRA, E. A.; FALEIRO, F. G.; GRATTAPAGLIA, D.; SILVA JUNIOR, O. B. da. Application of the Axiom 3K SNP genotyping array in cassava breeding and genetics. In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 26., 2018, San Diego. Proceedings... Jersey City, NJ: Scherago International, 2018. PAG XXVI
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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20.Imagem marcado/desmarcadoSILVA JUNIOR, O. B. da; TOGAWA, R. C.; NOVAES, E.; FARIA, D. A. de; PAPPAS JUNIOR, G. J.; MATIAS, K.; GRATTAPAGLIA, D. Assessment of predicted assay functionality of Eucalyptus SNP derived from large interspecific collections of ESTs. In: IUFRO TREE BIOTECHNOLOGY CONFERENCE, 2009, Whislter. Abstracts. [S.l.]: IUFRO, 2009. p-52
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