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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
24/10/2014 |
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Data da última atualização: |
16/11/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SOMAVILLA, A. L.; SONSTEGARD, T. S.; HIGA, R. H.; ROSA, A. do N.; SIQUEIRA, F.; SILVA, L. O. C. da; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; COUTINHO, L. L.; MUDADU, M. de A.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A. |
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Afiliação: |
A. L. SOMAVILLA, Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento Animal, UNESP/FCAV, Jaboticabal, Brasil; T. S. SONSTEGARD, Bovine Functional Genomics Laboratory, ANRI, USDA-ARS, Beltsville, MD, USA; ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; ANTONIO DO NASCIMENTO ROSA, CNPGC; FABIANE SIQUEIRA, CNPGC; LUIZ OTAVIO CAMPOS DA SILVA, CNPGC; ROBERTO AUGUSTO DE A TORRES JUNIOR, CNPGC; L. L. COUTINHO, Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (Esalq), USP, Piracicaba, Brasil; MAURICIO DE ALVARENGA MUDADU, CPPSE; MAURICIO MELLO DE ALENCAR, CPPSE; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
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Título: |
A genome-wide scan for selection signatures in Nellore cattle. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
Animal Genetics, v. 45, n. 6, p. 771-781, dec. 2014 |
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DOI: |
10.1111/age.12210 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Brazilian Nellore cattle (Bos indicus) have been selected for growth traits for over more than four decades. In recent years, reproductive and meat quality traits have become more important because of increasing consumption, exports and consumer demand. The identification of genome regions altered by artificial selection can potentially permit a better understanding of the biology of specific phenotypes that are useful for the development of tools designed to increase selection efficiency. Therefore, the aims of this study were to detect evidence of recent selection signatures in Nellore cattle using extended haplotype homozygosity methodology and BovineHD marker genotypes (>777 000 single nucleotide polymorphisms) as well as to identify corresponding genes underlying these signals. Thirty-one significant regions (P < 0.0001) of possible recent selection signatures were detected, and 19 of these overlapped quantitative trait loci related to reproductive traits, growth, feed efficiency, meat quality, fatty acid profiles and immunity. In addition, 545 genes were identified in regions harboring selection signatures. Within this group, 58 genes were associated with growth, muscle and adipose tissue metabolism, reproductive traits or the immune system. Using relative extended haplotype homozygosity to analyze high-density single nucleotide polymorphism marker data allowed for the identification of regions potentially under artificial selection pressure in the Nellore genome, which might be used to better understand autozygosity and the effects of selection on the Nellore genome. MenosBrazilian Nellore cattle (Bos indicus) have been selected for growth traits for over more than four decades. In recent years, reproductive and meat quality traits have become more important because of increasing consumption, exports and consumer demand. The identification of genome regions altered by artificial selection can potentially permit a better understanding of the biology of specific phenotypes that are useful for the development of tools designed to increase selection efficiency. Therefore, the aims of this study were to detect evidence of recent selection signatures in Nellore cattle using extended haplotype homozygosity methodology and BovineHD marker genotypes (>777 000 single nucleotide polymorphisms) as well as to identify corresponding genes underlying these signals. Thirty-one significant regions (P < 0.0001) of possible recent selection signatures were detected, and 19 of these overlapped quantitative trait loci related to reproductive traits, growth, feed efficiency, meat quality, fatty acid profiles and immunity. In addition, 545 genes were identified in regions harboring selection signatures. Within this group, 58 genes were associated with growth, muscle and adipose tissue metabolism, reproductive traits or the immune system. Using relative extended haplotype homozygosity to analyze high-density single nucleotide polymorphism marker data allowed for the identification of regions potentially under artificial selection pressure in the Nellore genome, whic... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Desequilíbrio de ligação; Homozigose do haplótipo estendido; Polimorfismo de nucleotídeo único; Relative extended haplotype homozygosity; Single nucleotid; Single nucleotide polymorphisms. |
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Thesagro: |
Bos Indicus; Gado de corte. |
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Thesaurus Nal: |
Beef cattle; Genotyping; Linkage disequilibrium; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético
S Ciências Biológicas |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/110576/1/PROCI-2014.00083-2.pdf
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Marc: |
LEADER 02827naa a2200397 a 4500
001 1998406
005 2022-11-16
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024 7 $a10.1111/age.12210$2DOI
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520 $aBrazilian Nellore cattle (Bos indicus) have been selected for growth traits for over more than four decades. In recent years, reproductive and meat quality traits have become more important because of increasing consumption, exports and consumer demand. The identification of genome regions altered by artificial selection can potentially permit a better understanding of the biology of specific phenotypes that are useful for the development of tools designed to increase selection efficiency. Therefore, the aims of this study were to detect evidence of recent selection signatures in Nellore cattle using extended haplotype homozygosity methodology and BovineHD marker genotypes (>777 000 single nucleotide polymorphisms) as well as to identify corresponding genes underlying these signals. Thirty-one significant regions (P < 0.0001) of possible recent selection signatures were detected, and 19 of these overlapped quantitative trait loci related to reproductive traits, growth, feed efficiency, meat quality, fatty acid profiles and immunity. In addition, 545 genes were identified in regions harboring selection signatures. Within this group, 58 genes were associated with growth, muscle and adipose tissue metabolism, reproductive traits or the immune system. Using relative extended haplotype homozygosity to analyze high-density single nucleotide polymorphism marker data allowed for the identification of regions potentially under artificial selection pressure in the Nellore genome, which might be used to better understand autozygosity and the effects of selection on the Nellore genome.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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| Registros recuperados : 72 | |
| 4. |  | LIMA, N. D.; VERZIGNASSI, J. R.; FERNANDES, C. D.; MACEDO, M. C. M.; JESUS, L. de; CORADO, H. S. Produtividade e qualidade da produção de sementes de Brachiaria spp. em função de épocas de uniformização e adubação. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 10., 2014, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2014. p. 78-79. 2 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 208). Comissão organizadora: Grácia Maria Soares Rosinha, Alexandra Rocha de Oliveir, Rodrigo Carvalho Alva.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 5. | | MONTEIRO, L. C.; VERZIGNASSI, J. R.; BARRIOS, S. C. L.; FERNANDES, C. D.; JESUS, L. de; CORADO, H. S. Seleção de híbridos intraespecíficos de Brachiaria decumbens para produção de sementes. Informativo ABRATES, Curitiba, v. 25, n. 2, set. 2015. 1 p. Resumo apresentado no XIX Congresso Brasileiro de Sementes, Foz do Iguaçu, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 6. | | VERZIGNASSI, J. R.; PEREIRA, F. A. R.; PAIVA, A. S.; FERNANDES, C. D.; JESUS, L. de; MIRANDA, J. C. P. de; CORADO, H. S.; ROOS, J. L. B. Herbicidas em pós-emergência em campo de produção de sementes de braquiária BRS Piatã. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CIÊNCIA DAS PLANTAS DANINHAS, 28., 2012, Campo Grande, MS. Ciências das plantas daninhas na era da biotecnologia: anais. Campo Grande, MS: SBCPD, 2012. p.109-113| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 7. | | VERZIGNASSI, J. R.; PEREIRA, F. A. R.; PAIVA, A. S.; FERNANDES, C. D.; JESUS, L. de; MIRANDA, J. C. P. de; CORADO, H. S.; ROOS, J. L. B. Herbicidas em pós-emergência em campos de produção de sementes de Stylosanthes guianensis genótipos gc1463+gc1480. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CIÊNCIA DAS PLANTAS DANINHAS, 28., 2012, Campo Grande, MS. Ciências das plantas daninhas na era da biotecnologia: anais. Campo Grande, MS: SBCPD, 2012. p.104-108| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 8. | | VERZIGNASSI, J. R.; PEREIRA, F. A. R.; PAIVA, A. S.; FERNANDES, C. D.; JESUS, L. de; MIRANDA, J. C. P. de; CORADO, H. S.; ROOS, J. L. B. Herbicidas em pré-emergência em Stylosanthes guianensis genótipos gc1463+gc1480. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CIÊNCIA DAS PLANTAS DANINHAS, 28., 2012, Campo Grande, MS. Ciências das plantas daninhas na era da biotecnologia: anais. Campo Grande, MS: SBCPD, 2012. p.99-103| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 9. | | VERZIGNASSI, J. R.; CARVALHO JÚNIOR, A. A.; FERNANDES, C. D.; BATISTA, M. V.; QUEIROZ, C. A.; INÁCIO, C. A.; CORADO, H. S.; SILVA, J. I.; MALLMANN, G. Puccinia stylosanthis em Stylosanthes guianensis em Mato Grosso do Sul: Primeiro relato In: Congresso Paulista de Fitopatologia, 36., 2013, São Paulo. Anais... São Paulo: Instituto Biológico, 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 10. | | VERZIGNASSI, J. R.; FERNANDES, C. D.; LEDO, F. J. da S.; BATISTA, M. V.; QUEIROZ, C. A.; CORADO, H. S.; MACHADO, J. C.; SILVA, J. I.; MALLMANN, G. Manchas foliares em BRS capileto (Pennisetum purpureum x Pennisetum glaucum) causadas por Pyricularia grisea. In: CONGRESSO PAULISTA DE FITOPATOLOGIA, 36., 2013, São Paulo. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Fitopatologia, 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 11. | | VERZIGNASSI, J. R.; FERNANDES, C. D.; LEDO, F. J. da S.; BATISTA, M. V.; QUEIROZ, C. A.; CORADO, H. S.; MACHADO, J. C.; SILVA, J. I.; MALMANN, G. Manchas foliares em BRS capileto (Pennisetum purpureum x Pennisetum glaucum) causadas por Pyricularia grisea. In: CONGRESSO PAULISTA DE FITOPATOLOGIA, 36., 2013, São Paulo. Anais... São Paulo: Instituto Biológico, 2013. Summa Phytopathologica, v. 39, suplemento, 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Gado de Leite. |
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| 12. | | SILVA, M. R.; VERZIGNASSI, J. R.; COELHO, M. de B.; SILVA, J. I.; MONTEIRO, L. C.; RAMOS, A. R.; FERNANDES, C. D.; JESUS, L. de; CORADO, H. S. Nanotecnologia aplicada a produtos agroflorestais. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 8., 2012, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2012. 2 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 198).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 13. | | CARDOSO, L. C. M. C.; VERZIGNASSI, J. R.; FERNANDES, C. D.; COELHO, M. de B.; MONTEIRO, L. C.; JESUS, L. de; CORADO, H. S. Polímeros no recobrimento de sementes de forrageiras tropicais para fixação de agrotóxicos e longevidade de sementes. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 10., 2014, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2014. p. 58-59. 2 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 208). Comissão organizadora: Grácia Maria Soares Rosinha, Alexandra Rocha de Oliveir, Rodrigo Carvalho Alva.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 14. | | VALERIO, J. R.; VERZIGNASSI, J. R.; MORAES, L. R. O.; KALACHE, S. H.; CORADO, H. S.; OLIVEIRA, M. C. M.; LEDO, F. J. da S. Ocorrência de Mahanarva fimbriolata em BRS capileto submetido a doses de nitrogênio e cortes de uniformização para produção de sementes em Campo Grande, MS In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SEMENTES, 18., 2013, Florianópolis. A semente na produtividade agrícola e na conservação de recursos genéticos: resumos. Informativo Abrates, v. 23, n, 2., ago. 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 15. | | VERZIGNASSI, J. R.; SILVA, J. I.; FERNANDES, C. D.; JESUS, L. de; CORADO, H. S.; LIBÓRIO, C. B.; SILVA, M. R.; MONTEIRO, L. C. 8; BENTEO, G. L.; PUTRICK, T. C. Ácido sulfúrico na superação de dormência em sementes de Brachiaria humidicola BRS Tupi. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SEMENTES, 18., 2013, Florianópolis. A semente na produtividade agrícola e na conservação de recursos genéticos: resumos. Informativo Abrates, v. 23, n, 2., ago. 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 16. | | VIDA, R. M.; VERZIGNASSI, J. R.; PEREIRA, F. A. R.; FERNANDES, C. D.; LIBÓRIO, C. B.; LIMA, N. D.; MONTEIRO, L. C.; BENTEO, G. L.; KARMOUCHE, P. J. P. S.; JESUS, L. de; CORADO, H. S. Brachiaria brizantha cv. BRS Paiaguás e brachiaria híbrida BRS RB331 Ipyporã: seletividade de herbicidas pós-emergentes em campos de produção de sementes. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 11., 2015, Campo Grande, MS. Anais... Campo Grande: Embrapa Gado de Corte, 2015. 114 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 213).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 17. | | LIBORIO, C. B.; VERZIGNASSI, J. R.; FERNANDES, C. D.; LIMA, N. D.; MONTEIRO, L. C.; BENTEO, G. L.; KARMOUCHE, P. J. P. S.; VIDA, R. M.; JESUS, L. de; CORADO, H. S. Causas e superação de dormência em Brachiaria humidicola cv. BRS Tupi. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 11., 2015, Campo Grande, MS. Anais... Campo Grande: Embrapa Gado de Corte, 2015. 114 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 213).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 18. | | VERZIGNASSI, J. R.; SILVA, J. I.; FERNANDES, C. D.; JESUS, L. de; CORADO, H. S.; LIBÓRIO, C. B.; SILVA, M. R.; MONTEIRO, L. C.; BENTEO, G. L; PUTRICK, T. C. Etileno na superação de dormência em sementes de Brachiaria humidicola BRS Tupi. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SEMENTES, 18., 2013, Florianópolis. A semente na produtividade agrícola e na conservação de recursos genéticos: resumos. Informativo Abrates, v. 23, n, 2., ago. 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 19. | | VERZIGNASSI, J. R.; MACEDO, M. C. M.; PAIVA, A. S. de; FERNANDES, C. D.; JESUS, L. de; MIRANDA, J. C. P. de; CORADO, H. S.; ROOS, J. L. B. Cortes de uniformização e doses de N na produção de sementes de Brachiaria humidicola BRS Tupi. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., 2012, Brasília. A produção animal no mundo em transformação: anais. Brasília, DF: SBZ, 2012. 3 p. 1 CD-ROM. SBZ 2012. Trabalho 4QPQ.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 20. | | VERZIGNASSI, J. R.; PEREIRA, F. A. R.; JANK, L.; FERNANDES, C. D.; SILVA, J. L.; CORADO, H. S.; JESUS, L. de; MIRANDA, J. C. P. de; BATISTA, M. V. Herbicidas pré-emergentes na produção de sementes de Panicum maximum cv. Tanzânia-1. O Biológico, São Paulo, SP, v. 74, n. 2, p 62, jul./dez. 2012. Edição dos resumos da 25ª Reunião Anual do Instituto Biológico, São Paulo, 2012 e 10º Congresso de Iniciação Científica em Ciências Agrárias Biológicas e Ambientais - CICAM, agosto, 2012. Resumo 044| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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