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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Acre. |
Data corrente: |
11/06/2014 |
Data da última atualização: |
06/07/2021 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SILVA, C. C.; MANTELLO, C. C.; CAMPOS, T. de; SOUZA, L. M.; GONÇALVES, P. S.; SOUZA, A. P. |
Afiliação: |
Carla C. Silva, Universidade Estadual de Campinas (Unicamp); Camila C. Mantello, Universidade Estadual de Campinas (Unicamp); TATIANA DE CAMPOS, CPAF-AC; Livia M. Souza, Universidade Estadual de Campinas (Unicamp); Paulo S. Gonçalves, Instituto Agronômico de Campinas (IAC); Anete P. Souza, Universidade Estadual de Campinas (Unicamp). |
Título: |
Leaf-, panel- and latex-expressed sequenced tags from the rubber tree (Hevea brasiliensis) under cold-stressed and suboptimal growing conditions: the development of gene-targeted Functional markers for stress response. |
Ano de publicação: |
2014 |
Fonte/Imprenta: |
Molecular Breeding, Berlim, v. 34, n. 3, p. 1035-1053, Oct. 2014. |
ISSN: |
1380-3743 (impresso) / 1572-9788 (on-line) |
DOI: |
10.1007/s11032-014-0095-2 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Hevea brasiliensis is a native species of the Amazon Basin of South America and the primary source of natural rubber worldwide. Due to the occurrence of South American Leaf Blight disease in this area, rubber plantations have been extended to suboptimal regions. Rubber tree breeding is time-consuming and expensive, but molecular markers can serve as a tool for early valuation, thus reducing time and costs. In this work, we constructed six different cDNA libraries with the aim of developing gene-targeted molecular markers for the rubber tree. A total of 8,263 reads were assembled, generating 5,025 unigenes that were analyzed; 912 expressed sequence tags (ESTs) represented new transcripts, and two sequences were highly up-regulated by cold stress. These unigenes were scanned for microsatellite (SSR) regions and single nucleotide polymorphisms (SNPs). In total, 169 novel EST-SSR markers were developed; 138 loci were polymorphic in the rubber tree, and 98 % presented transferability to six other Hevea species. Locus duplication was observed in H. brasil-iensis and other species. Additionally, 43 SNP markers in 13 sequences that showed similarity to proteins involved in stress response, latex biosynthesis and developmental processes were characterized. cDNA libraries are a rich source of SSR and SNP markers and enable the identification of new transcripts. The new markers developed here will be a valuable resource for linkage mapping, QTL identification and other studies in the rubber tree and can also be used to evaluate the genetic variability of other Hevea species, which are valuable assets in rubber tree breeding. MenosHevea brasiliensis is a native species of the Amazon Basin of South America and the primary source of natural rubber worldwide. Due to the occurrence of South American Leaf Blight disease in this area, rubber plantations have been extended to suboptimal regions. Rubber tree breeding is time-consuming and expensive, but molecular markers can serve as a tool for early valuation, thus reducing time and costs. In this work, we constructed six different cDNA libraries with the aim of developing gene-targeted molecular markers for the rubber tree. A total of 8,263 reads were assembled, generating 5,025 unigenes that were analyzed; 912 expressed sequence tags (ESTs) represented new transcripts, and two sequences were highly up-regulated by cold stress. These unigenes were scanned for microsatellite (SSR) regions and single nucleotide polymorphisms (SNPs). In total, 169 novel EST-SSR markers were developed; 138 loci were polymorphic in the rubber tree, and 98 % presented transferability to six other Hevea species. Locus duplication was observed in H. brasil-iensis and other species. Additionally, 43 SNP markers in 13 sequences that showed similarity to proteins involved in stress response, latex biosynthesis and developmental processes were characterized. cDNA libraries are a rich source of SSR and SNP markers and enable the identification of new transcripts. The new markers developed here will be a valuable resource for linkage mapping, QTL identification and other studies in the r... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Biblioteca cDNA; CDNA library; Fitomejoramiento; Marcador microssatélite; Marcador SNP; Marcadores genéticos; Repeticiones de microsatélite; Rubber tree. |
Thesagro: |
Caucho; DNA; Hevea brasiliensis; Marcador genético; Melhoramento genético vegetal; Seringueira. |
Thesaurus Nal: |
Genetic markers; Microsatellite repeats; Plant breeding. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/160345/1/25073.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Acre (CPAF-AC) |
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| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Unidades Centrais. Para informações adicionais entre em contato com biblioteca@embrapa.br. |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Unidades Centrais. |
Data corrente: |
18/02/2002 |
Data da última atualização: |
18/02/2002 |
Autoria: |
VOLL, E.; FILHO VICTÓRIA, R.; CORBIN, F. T.; WORSHAM, A. D. |
Título: |
Absorção, Acúmulo e Metabolização de 14C-Linuron. |
Ano de publicação: |
1990 |
Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, V. 25, n.6, p. 801-813, jun. 1990 |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Com o objetivo de obter indicações no processo fisiológico de controle de plantas daninhas para o herbicida linuron em mistura com alachlor foram conduzidos experimentos com soja (Glycine max (L.) Merr. cv. Ramson) e com pepino (Cucunis sativus L. cv. Wisc. SMR58 Pickles) e ançarinha-branca (Chenopothum albun? L.) em vasos com terra e em solução nutritiva. Nesta foi usado 14C-linuron com atividade específica de 6,84 uCi/mg. Em vasos com terra, alachlor protegeu as plântulas de pepino, e não as de soja e ançarinha-branca, da fitotoxicidade de linuron, quando incorporados juntos por ocasião do plantio. Em solução nutritiva contendo alachlor e linuron, plântulas de soja e pepino introduzidas com três dias de idade não manifestaram a proteção de alachlor contra o efeito fitot6xico do linuron, somando-se os efeitos fitot6xicos de ambos. Soja absorveu e metabolizou maiores quantidades de linuron que pepino, mostrando, assim, maior susceptibilidade. Maiores concentrações de linuron foram encontradas nas folhas unifolioladas da soja e nos cotilédones do Pepino. Linuron provocou redução da biornassa de soja e pepino, com exceção dos cotil6dones e do hipoc6tilo da soja. Linuron sozinho reduziu a absorção de água em soja e pepino essa redução foi acentuada quando em mistura com alachlor.
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Palavras-Chave: |
Glycine mar. |
Thesagro: |
Fitotoxicidade; Metabolismo; Pepino; Soja. |
Categoria do assunto: |
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Marc: |
LEADER 01908naa a2200217 a 4500 001 1106372 005 2002-02-18 008 1990 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aVOLL, E. 245 $aAbsorção, Acúmulo e Metabolização de 14C-Linuron. 260 $c1990 520 $aCom o objetivo de obter indicações no processo fisiológico de controle de plantas daninhas para o herbicida linuron em mistura com alachlor foram conduzidos experimentos com soja (Glycine max (L.) Merr. cv. Ramson) e com pepino (Cucunis sativus L. cv. Wisc. SMR58 Pickles) e ançarinha-branca (Chenopothum albun? L.) em vasos com terra e em solução nutritiva. Nesta foi usado 14C-linuron com atividade específica de 6,84 uCi/mg. Em vasos com terra, alachlor protegeu as plântulas de pepino, e não as de soja e ançarinha-branca, da fitotoxicidade de linuron, quando incorporados juntos por ocasião do plantio. Em solução nutritiva contendo alachlor e linuron, plântulas de soja e pepino introduzidas com três dias de idade não manifestaram a proteção de alachlor contra o efeito fitot6xico do linuron, somando-se os efeitos fitot6xicos de ambos. Soja absorveu e metabolizou maiores quantidades de linuron que pepino, mostrando, assim, maior susceptibilidade. Maiores concentrações de linuron foram encontradas nas folhas unifolioladas da soja e nos cotilédones do Pepino. Linuron provocou redução da biornassa de soja e pepino, com exceção dos cotil6dones e do hipoc6tilo da soja. Linuron sozinho reduziu a absorção de água em soja e pepino essa redução foi acentuada quando em mistura com alachlor. 650 $aFitotoxicidade 650 $aMetabolismo 650 $aPepino 650 $aSoja 653 $aGlycine mar 700 1 $aFILHO VICTÓRIA, R. 700 1 $aCORBIN, F. T. 700 1 $aWORSHAM, A. D. 773 $tPesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, V. 25$gn.6, p. 801-813, jun. 1990
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