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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
Data corrente: |
25/01/2011 |
Data da última atualização: |
08/02/2011 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
Autoria: |
SILVA, P. H. da; FERREIRA, C. F.; VILARINHOS, A. D.; AMORIM, E. P.; ANA YAMAGUISHI CIAMPI; MILLER, R. N. G.; SOUZA JUNIOR, M. T. |
Afiliação: |
PAULO HENRIQUE DA SILVA, UFRB; CLAUDIA FORTES FERREIRA, CNPMF; ALBERTO DUARTE VILARINHOS, CNPMF; EDSON PERITO AMORIM, CNPMF; ROBERT NEIL GERARD MILLER, PUC, DF; MANOEL TEIXEIRA SOUZA JUNIOR, CNPAE. |
Título: |
Validação de marcadores moleculares do tipo microssatélites em bananeira. |
Ano de publicação: |
2010 |
Fonte/Imprenta: |
In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 4., 2010, Cruz das Almas. [Anais...] Cruz das Almas: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2010. (Embrapa Mandioca e Fruticultura. Documentos, 190). 1 CD-ROM. |
Idioma: |
Português |
Notas: |
PDF. 033. |
Conteúdo: |
A banana é um dos produtos alimentares mais produzidos no mundo atualmente, com mais de 130 países produtores. Torna-se muito importante pois é grande geradora de fonte e renda empregando milhões de pessoas em todo o território nacional, principalmente no Nordeste do pais, onde a maioria dos produtores são de baixa renda. Dentre os fatores limitantes da cultura está o cultivo de variedades pouco resistentes a pragas e doenças; e uma estratégia para a solução deste problema é a do programa de melhoramento na busca de variedades mais produtivas e resistentes. Sendo assim os marcadores moleculares torna-se uma ferramenta acessória aos programas de melhoramento. Dentre os marcadores moleculares mais utilizados nos estudos genéticos em bananeira, os marcadores microssatélites, destacam-se por serem altamente informativos, multialélicos e por apresentarem alta reprodutibilidade. Este trabalho objetivou a validação de marcadores moleculares microssatélites EST e BAC ? SSRs para auxílio ao programa de mapeamento genético da bananeira, em diplóides de bananeira contrastantes para resistência a Sigatoka amarela e negra. |
Palavras-Chave: |
Musa spp; PCR; Primers. |
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/26277/1/033-Paulo-Claudia-ok.pdf
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Marc: |
LEADER 01945nam a2200229 a 4500 001 1874272 005 2011-02-08 008 2010 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aSILVA, P. H. da 245 $aValidação de marcadores moleculares do tipo microssatélites em bananeira. 260 $aIn: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 4., 2010, Cruz das Almas. [Anais...] Cruz das Almas: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2010. (Embrapa Mandioca e Fruticultura. Documentos, 190). 1 CD-ROM.$c2010 500 $aPDF. 033. 520 $aA banana é um dos produtos alimentares mais produzidos no mundo atualmente, com mais de 130 países produtores. Torna-se muito importante pois é grande geradora de fonte e renda empregando milhões de pessoas em todo o território nacional, principalmente no Nordeste do pais, onde a maioria dos produtores são de baixa renda. Dentre os fatores limitantes da cultura está o cultivo de variedades pouco resistentes a pragas e doenças; e uma estratégia para a solução deste problema é a do programa de melhoramento na busca de variedades mais produtivas e resistentes. Sendo assim os marcadores moleculares torna-se uma ferramenta acessória aos programas de melhoramento. Dentre os marcadores moleculares mais utilizados nos estudos genéticos em bananeira, os marcadores microssatélites, destacam-se por serem altamente informativos, multialélicos e por apresentarem alta reprodutibilidade. Este trabalho objetivou a validação de marcadores moleculares microssatélites EST e BAC ? SSRs para auxílio ao programa de mapeamento genético da bananeira, em diplóides de bananeira contrastantes para resistência a Sigatoka amarela e negra. 653 $aMusa spp 653 $aPCR 653 $aPrimers 700 1 $aFERREIRA, C. F. 700 1 $aVILARINHOS, A. D. 700 1 $aAMORIM, E. P. 700 1 $aANA YAMAGUISHI CIAMPI 700 1 $aMILLER, R. N. G. 700 1 $aSOUZA JUNIOR, M. T.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
Data corrente: |
12/09/2014 |
Data da última atualização: |
29/04/2024 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
A - 1 |
Autoria: |
MÜLLER, B. S. de F.; SAKAMOTO, T.; SILVEIRA, R. D. D.; ZAMBUSSI-CARVALHO, P. F.; PEREIRA, M.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; COSTA, M. M. do C.; GUIMARÃES, C. M.; PEREIRA, W. J.; BRONDANI, C.; VIANELLO-BRONDANI, R. P. |
Afiliação: |
BÁRBARA SALOMÃO DE FARIA MÜLLER, BIOAGRO - UFV; TETSU SAKAMOTO, UFMG; RICARDO DIÓGENES DIAS SILVEIRA; PATRICIA FERNANDA ZAMBUSSI-CARVALHO, UFG; MARISTELA PEREIRA, UFG; GEORGIOS JOANIS PAPPAS JUNIOR, UNB; MARCOS MOTA DO CARMO COSTA, CENARGEN; CLEBER MORAIS GUIMARAES, CNPAF; WENDELL JACINTO PEREIRA; CLAUDIO BRONDANI, CNPAF; ROSANA PEREIRA VIANELLO, CNPAF. |
Título: |
Differentially expressed genes during flowering and grain filling in common bean (Phaseolus vulgaris) grown under drought stress conditions. |
Ano de publicação: |
2014 |
Fonte/Imprenta: |
Plant Molecular Biology Reporter, Athens, v. 32, p. 438-451, 2014. |
DOI: |
10.1007/s11105-013-0651-7 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Drought stress, particularly during the flowering and grain-filling stages of growth, contributes to serious yield loss in common bean (Phaseolus vulgaris L.). The aim of this study was to identify genes induced in response to drought stress using transcriptome analysis of contrasting genotypes. Using leaf tissues of tolerant (BAT 477) and susceptible common bean genotypes (Pérola), collected at the flowering and grain-filling stages, four complementary deoxyribonucleic acid representational difference analysis subtractive libraries were constructed and then sequenced. A total of 7,203 (77.6 %) sequences with an average sequence size of 570 bp were considered valid, for a combined 4 Mbp sequence. According to a differential display analysis, 802 expressed sequence tags, distributed across 67 contigs, were differentially expressed by the tolerant (37 contigs) and susceptible genotypes (30 contigs) after identification under drought conditions during the two investigated plant developmental stages. Of these differential contigs, the 13 most frequent genes were exclusive to the tolerant genotype. Based on BLAST2GO, 73 % of the gene sequences were annotated and 12 % showed mapping results, with the highest similarity rate corresponding to Glycine max (41 %). According to gene ontology functional analysis, 48 % of the sequences were attributed to cell metabolic processes. Overall, 8.3 % of the transcribed sequences exhibited similarity to transcription factors, predominantly those of the AP2-EREBP family (97.8 %). Of the target sequences validated by quantitative real-time polymerase chain reaction, most genes showed an expression level that agreed with that predicted by in silico analysis. Thus, the drought transcriptome dataset is a valuable resource on the variation in these gene sequences, offering the opportunity to identify robust molecular markers tightly linked to trait-controlling loci for use in marker-assisted breeding. MenosDrought stress, particularly during the flowering and grain-filling stages of growth, contributes to serious yield loss in common bean (Phaseolus vulgaris L.). The aim of this study was to identify genes induced in response to drought stress using transcriptome analysis of contrasting genotypes. Using leaf tissues of tolerant (BAT 477) and susceptible common bean genotypes (Pérola), collected at the flowering and grain-filling stages, four complementary deoxyribonucleic acid representational difference analysis subtractive libraries were constructed and then sequenced. A total of 7,203 (77.6 %) sequences with an average sequence size of 570 bp were considered valid, for a combined 4 Mbp sequence. According to a differential display analysis, 802 expressed sequence tags, distributed across 67 contigs, were differentially expressed by the tolerant (37 contigs) and susceptible genotypes (30 contigs) after identification under drought conditions during the two investigated plant developmental stages. Of these differential contigs, the 13 most frequent genes were exclusive to the tolerant genotype. Based on BLAST2GO, 73 % of the gene sequences were annotated and 12 % showed mapping results, with the highest similarity rate corresponding to Glycine max (41 %). According to gene ontology functional analysis, 48 % of the sequences were attributed to cell metabolic processes. Overall, 8.3 % of the transcribed sequences exhibited similarity to transcription factors, predominantly thos... Mostrar Tudo |
Thesagro: |
Deficiência hídrica; Feijão; Phaseolus vulgaris. |
Thesaurus NAL: |
Abiotic stress; Beans; Water stress. |
Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/180004/1/Muller2014-Article-DifferentiallyExpressedGenesDu.pdf
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Marc: |
LEADER 02986naa a2200325 a 4500 001 1994817 005 2024-04-29 008 2014 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1007/s11105-013-0651-7$2DOI 100 1 $aMÜLLER, B. S. de F. 245 $aDifferentially expressed genes during flowering and grain filling in common bean (Phaseolus vulgaris) grown under drought stress conditions.$h[electronic resource] 260 $c2014 520 $aDrought stress, particularly during the flowering and grain-filling stages of growth, contributes to serious yield loss in common bean (Phaseolus vulgaris L.). The aim of this study was to identify genes induced in response to drought stress using transcriptome analysis of contrasting genotypes. Using leaf tissues of tolerant (BAT 477) and susceptible common bean genotypes (Pérola), collected at the flowering and grain-filling stages, four complementary deoxyribonucleic acid representational difference analysis subtractive libraries were constructed and then sequenced. A total of 7,203 (77.6 %) sequences with an average sequence size of 570 bp were considered valid, for a combined 4 Mbp sequence. According to a differential display analysis, 802 expressed sequence tags, distributed across 67 contigs, were differentially expressed by the tolerant (37 contigs) and susceptible genotypes (30 contigs) after identification under drought conditions during the two investigated plant developmental stages. Of these differential contigs, the 13 most frequent genes were exclusive to the tolerant genotype. Based on BLAST2GO, 73 % of the gene sequences were annotated and 12 % showed mapping results, with the highest similarity rate corresponding to Glycine max (41 %). According to gene ontology functional analysis, 48 % of the sequences were attributed to cell metabolic processes. Overall, 8.3 % of the transcribed sequences exhibited similarity to transcription factors, predominantly those of the AP2-EREBP family (97.8 %). Of the target sequences validated by quantitative real-time polymerase chain reaction, most genes showed an expression level that agreed with that predicted by in silico analysis. Thus, the drought transcriptome dataset is a valuable resource on the variation in these gene sequences, offering the opportunity to identify robust molecular markers tightly linked to trait-controlling loci for use in marker-assisted breeding. 650 $aAbiotic stress 650 $aBeans 650 $aWater stress 650 $aDeficiência hídrica 650 $aFeijão 650 $aPhaseolus vulgaris 700 1 $aSAKAMOTO, T. 700 1 $aSILVEIRA, R. D. D. 700 1 $aZAMBUSSI-CARVALHO, P. F. 700 1 $aPEREIRA, M. 700 1 $aPAPPAS JUNIOR, G. J. 700 1 $aCOSTA, M. M. do C. 700 1 $aGUIMARÃES, C. M. 700 1 $aPEREIRA, W. J. 700 1 $aBRONDANI, C. 700 1 $aVIANELLO-BRONDANI, R. P. 773 $tPlant Molecular Biology Reporter, Athens$gv. 32, p. 438-451, 2014.
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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