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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Meio-Norte. |
Data corrente: |
10/03/2008 |
Data da última atualização: |
14/09/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
DINIZ, F. M.; IYENGAR, A.; LIMA, P. S. da C.; MACLEAN, N.; BENTZEN, P. |
Afiliação: |
FABIO MENDONCA DINIZ, CPAMN; ARATI IYENGAR; PAULO SARMANHO DA COSTA LIMA, CPAMN; NORMAN MACLEAN; PAUL BENTZEN. |
Título: |
Application of a double-enrichment procedure for microsatellite isolation and the use tailed primers for high throughput genotyping. |
Ano de publicação: |
2007 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, São Paulo, v. 30, n. 2, p. 380-384, mar. 2007. |
ISSN: |
1415-4757 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The number of microsatellite loci and their allelic diversity contribute to increase accuracy and informativity of genetic estimates, however, the isolation of microsatellite loci is not only laborious but also quite expensive. We used (GATA)n and (GACA)n tetranucleotide probes and single- and double-enrichment hybridization to construct and screen a genomic library with an increased proportion of DNA fragments containing repeat motifs. Repeats were found using both types of hybridization but the double-enrichment procedure recovered sequences of which 100% contained (GATA)n and (GACA)n motifs. Microsatellite loci primers were then designed with an M13R-tail or CAG-tag to produce scorable PCR products with minimal stutter. The approach used in this study suggests that double-enrichment is a worthwhile strategy when isolating repeat motifs from eukaryotic genomes. Moreover, the use of tailed microsatellite primers provides increased resolution for compound microsatellite loci, with a significant decrease in costs. |
Palavras-Chave: |
Banda polimórfica; double-enrichment; double-hybridization; Enriquecimento duplo; Hibridação dupla; Microssatélite; stutter bands; tailed microsatellite primer. |
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/65872/1/Application-21449.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Meio-Norte (CPAMN) |
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Registros recuperados : 50 | |
24. | | FREITAS-ÁSTUA, J.; BASTIANEL, M.; LOCALI-FABRIS, E. C.; NOVELLI, V. M.; SILVA-PINHATI, A. C.; BASÍLIO-PALMIERI, A. C.; TARGON, M. L. P. N.; MACHADO, M. A. Differentially expressed stress-related genes in the compatible citrus-Citrus leprosis virus interaction. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 30, n. 3, p. 980-990, 2007.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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26. | | GUIDETTI-GONZALEZ, S.; FREITAS-ÁSTUA, J.; AMARAL, A. M. do; MARTINS, N. F.; MEHTA, A.; SILVA, M. S. S.; CARRER, H. Genes associated with hypersensitive response (HR) in the citrus EST database (CitEST). Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 30, n. 3, p. 943-967, 2007.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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29. | | YAMANAKA, N.; SATO, H.; YANG, Z.; XU, D. H.; CATELLI, L. L.; BINNECK, E.; ARIAS, C. A. A.; ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L. Genetic relationships between chinese, japanese, and brazilian soybean gene pools revealed by simple sequence repeat (SSR) markers. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 30, n. 1, p. 85-88, 2007.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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30. | | RIBEIRO, A. S.; TOLEDO, J. F. F. de; ARIAS, C. A. A.; GODOY, C. V.; SOARES, R. M.; MOREIRA, J. U. V.; PIEROZZI, P. H. B.; VIDIGAL, M. C. G.; OLIVEIRA, M. F. de. Genetic control of soybean (Glycine max) yield in the absence and presence of the Asian rust fungus (Phakopsora pachyrhizi). Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 31, n. 1, p. 98-105, 2008.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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31. | | AMORIM, E. P.; VILARINHOS, A. D.; COHEN, K. O.; AMORIM, V. B. O.; SANTOS-SEREJO, J. A. dos; SILVA, S. O. e; PESTANA, K. N.; SANTOS, V. J. dos; PAES, N. S.; MONTE, D. C.; REIS, R. V. dos. Genetic diversity of carotenoid-rich bananas evalueted by Diversity Arrays Technology (DArT). Genetics Molecular Biology, Ribeirão Preto, v.32, n.1, p. 96-103, 2009.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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32. | | POERSCH-BORTOLON, L. B.; PEREIRA, J. F.; NHANI JUNIOR, A.; SOTO GONZÁLES, H. H.; TORRES, G. A. M.; CONSOLI, L.; ARENHART, R. A.; BODANESE-ZANETTINI, M. H.; MARGIS-PINHEIRO, M. Gene expression analysis reveals important pathways for drought response in leaves and roots of a wheat cultivar adapted to rainfed cropping in the Cerrado Biome. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 39, n. 4, p. 629-645, 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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34. | | BRAMMER, S. P.; MORAES FERNANDES, M. I. B. de; MINELLA, E.; ARIAS, G.; SÓ e SILVA, M.; IORCZESKI, E.; PANDOLFI, V.; BOSCARDIN, D. Eficiência do meio FHGA para a haplodiploidização de cevada na Embrapa Trigo. Genetics and Molecular Biology, v. 22, n. 3, p. 675-676, Oct. 1999. Supplement. Programa e Resumos do 45. Congresso Nacional de Genética, Gramado, 1999. Resumo 17-055.Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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39. | | SCHEEREN, P. L.; MORAES FERNANDES, M. I. B. de; BRAMMER, S. P.; ZANATTA, A. C. A.; IORCZESKI, E. J.; SÓ e SILVA, M.; MOREIRA, J. C. S.; SOUSA, C. N. A. de; DEL DUCA, L. de J. A.; SILVA, S. D. dos A. e.; PANDOLFI, V.; MARTINS, L. F.; GABRIEL, N. E.; LUZA, J. Melhoramento genético de trigo via linhagens duplo-haplóides, na Embrapa Trigo, no período 1995-1998. Genetics and Molecular Biology, v. 22, n. 3, p. 692, Oct. 1999. Supplement. Programa e Resumos do 45. Congresso Nacional de Genética, Gramado, 1999. Resumo 17-092.Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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40. | | BRUNELLI, K. R.; DUNKLE, L. D.; ATHAYDE SOBRINHO, C.; FAZZA, A. C.; CAMARGO, L. E. A. Molecular variability in the maize grey leaf spot pathogens in Brazil. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 31, n. 4, p. 938-942, 2008.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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