Data/hora: 09/06/2024 10:27:05

Biblioteca(s): | Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Roraima; Embrapa Unidades Centrais.
Data corrente: | 04/09/2006
Data da última atualização: | 07/08/2020
Autoria: | PANTALIÃO, G. F.; VIANELLO, R. P.; BUENO, L. G.; MENDONÇA, J. A.; COELHO, A. S. G.; CORDEIRO, A. C. C.; VALDISSER, P. A. M. R.; VIEIRA, A. F.; BRONDANI, C.
Afiliação: | GABRIEL FERESIN PANTALIAO; ROSANA PEREIRA VIANELLO, CNPAF; LUICE GOMES BUENO GALVANI, CNPC; JOAO ANTONIO MENDONCA, CNPAF; ALEXANDRE SIQUEIRA GUEDES COELHO, UFG; ANTONIO CARLOS CENTENO CORDEIRO, CPAF-RR; PAULA ARIELLE M RIBEIRO VALDISSER, CNPAF; ARIADNA FARIA VIEIRA; CLAUDIO BRONDANI, CNPAF.
Título: | Development of SNP markers for grain yield screening of Brazilian rice cultivars.
Ano de publicação: | 2020
Fonte/Imprenta: | Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 55, e01643, 2020.
ISSN: | 1678-3921
DOI: | https://doi. org/10.1590/S1678-3921.pab2020.v55.01643
Idioma: | Inglês

Conteúdo:

Abstrct - The objective of this work was to identify and validate single nucleotide polymorphism (SNP) markers related to grain yield in rice (Oryza sativa) core collection. The genome-wide association studies (GWAS) methodology was applied for genotyping of 541 rice accessions by 167,470 SNPs. The grain yield of these accessions was estimated through the joint analysis of nine field experiments carried out in six Brazilian states. Fifteen SNPs were significantly associated with grain yield, and out of the ten SNPs converted to TaqMan assays, four discriminated the most productive accessions. These markers were used for the screening of rice accessions with favorable alleles. The selected accessions were, then, evaluated in field experiments in target environments, in order to select the most productive ones. This screening reduces the number of accessions evaluated experimentally, making it possible to prioritize those with higher productive potential, which allows of the increase of the number of replicates and, consequently, of the experimental accuracy.

Resumo - O  objetivo  deste  trabalho  foi  identificar  e  validar  marcadores  de  polimorfismo  de  nucleotídeo  único  (SNP)  relacionados  à  produtividade  de  grãos  em  coleção  nuclear  de  arroz  (Oryza  sativa).  A  metodologia  de  estudos  de  associação  genômica  ampla  (GWAS)  foi  aplicada  à  genotipagem  de  541  genótipos  por  167.470  SNPs.  A  produtividade  de  grãos  desses  acessos  foi  estimada  por  meio  da  análise  conjunta  de  nove  experimentos  de  campo,  realizados  em  seis  estados  brasileiros.  Quinze  SNPs  foram  significativamente  associados  à  produtividade  de  grãos  e,  dos  dez  SNPs  que   foram   convertidos   em   ensaios   TaqMan,   quatro   discriminaram   os   acessos  com  maior  produtividade.  Esses  marcadores  foram  utilizados  para  identificar acessos de arroz com os alelos favoráveis. Em seguida, os acessos selecionados foram avaliados em experimentos de campo, em ambientes-alvo, para identificar os mais produtivos. Essa triagem reduz o número de acessos avaliados  experimentalmente,  pois  torna  possível  priorizar  aqueles  com  maior potencial produtivo, o que permite aumentar o número de repetições e, consequentemente, a precisão experimental

Palavras-Chave: | GWAS; Seleção assistida por marcadores.
Thesagro: | Arroz; Marcador Molecular; Oryza Sativa; Produtividade; Seleção Genética.
Thesaurus Nal: | Genome-wide association study; Marker-assisted selection; Rice; Single nucleotide polymorphism.
Categoria do assunto: | X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia
URL: | http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/214500/1/Development-snp-markers.pdf
Registro original: | Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF)

Exemplares:

CNPAF - (24035-1) - UPC - AP - DD - 2020 -  - 2020 - DIS
CNPC - (39604-1) - UPC - AP - DD -  -  -  - DIS
AI-SEDE - (64853-1) - UPE - AP - DD -  -  -  - DIS
CPAF-RR - (16085-1) - UPC - AP - DD -  -  -  - DIS