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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
09/01/2023 |
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Data da última atualização: |
07/12/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
MENDONÇA, H. C.; PEREIRA, L. F. P.; SANTOS, J. V. M. dos; MEDA, A. R.; SANT?ANA, G. C. |
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Afiliação: |
HEITOR CALUX MENDONÇA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE LONDRINA; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, CNPCa; JOÃO VITOR MALDONADO DOS SANTOS, TROPICAL MELHORAMENTO E GENÉTICA; ANDERSON ROTTER MEDA, TROPICAL MELHORAMENTO E GENÉTICA; GUSTAVO CÉSAR SANT'ANA, TROPICAL MELHORAMENTO E GENÉTICA. |
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Título: |
Genetic diversity and selection footprints in the genome of brazilian soybean cultivars. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Frontiers in Plant Science, v. 13, 2022. |
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Páginas: |
12 p. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Although Brazil is currently the largest soybean producer in the world, only a small number of studies have analyzed the genetic diversity of Brazilian soybean. These studies have shown the existence of a narrow genetic base. The objectives of this work were to analyze the population structure and genetic diversity, and to identify selection signatures in the genome of soybean germplasms from different companies in Brazil. A panel consisting of 343 soybean lines from Brazil, North America, and Asia was genotyped using genotyping by sequencing (GBS). Population structure was assessed by Bayesian and multivariate approaches. Genetic diversity was analyzed using metrics such as the fixation index, nucleotide diversity, genetic dissimilarity, and linkage disequilibrium. The software BayeScan was used to detect selection signatures between Brazilian and Asian accessions as well as among Brazilian germplasms. Region of origin, company of origin, and relative maturity group (RMG) all had a significant influence on population structure. Varieties belonging to the same company and especially to the same RMG exhibited a high level of genetic similarity. This result was exacerbated among early maturing accessions. Brazilian soybean showed significantly lower genetic diversity when compared to Asian accessions. This was expected, because the crop?s region of origin is its main genetic diversity reserve. We identified 7 genomic regions under selection between the Brazilian and Asian accessions, and 27 among Brazilian varieties developed by different companies. Associated with these genomic regions, we found 96 quantitative trait loci (QTLs) for important soybean breeding traits such as flowering, maturity, plant architecture, productivity components, pathogen resistance, and seed composition. Some of the QTLs associated with the markers under selection have genes of great importance to soybean?s regional adaptation. The results reported herein allowed to expand the knowledge about the organization of the genetic variability of the Brazilian soybean germplasm. Furthermore, it was possible to identify genomic regions under selection possibly associated with the adaptation of soybean to Brazilian environments. MenosAlthough Brazil is currently the largest soybean producer in the world, only a small number of studies have analyzed the genetic diversity of Brazilian soybean. These studies have shown the existence of a narrow genetic base. The objectives of this work were to analyze the population structure and genetic diversity, and to identify selection signatures in the genome of soybean germplasms from different companies in Brazil. A panel consisting of 343 soybean lines from Brazil, North America, and Asia was genotyped using genotyping by sequencing (GBS). Population structure was assessed by Bayesian and multivariate approaches. Genetic diversity was analyzed using metrics such as the fixation index, nucleotide diversity, genetic dissimilarity, and linkage disequilibrium. The software BayeScan was used to detect selection signatures between Brazilian and Asian accessions as well as among Brazilian germplasms. Region of origin, company of origin, and relative maturity group (RMG) all had a significant influence on population structure. Varieties belonging to the same company and especially to the same RMG exhibited a high level of genetic similarity. This result was exacerbated among early maturing accessions. Brazilian soybean showed significantly lower genetic diversity when compared to Asian accessions. This was expected, because the crop?s region of origin is its main genetic diversity reserve. We identified 7 genomic regions under selection between the Brazilian and Asian acce... Mostrar Tudo |
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Thesaurus Nal: |
Genetic variance; Genome; Soybeans. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1150814/1/Genetic-Diversity-and-Selection.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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| Registros recuperados : 26 | |
| 2. |  | PEREIRA, G. A.; MARCÍLIO, H. de C.; GASPAROTTO, L.; PETERS, V.; SANTOS, C. C. dos. Avaliação da bananeira cultivar BRS Conquista em Cáceres-MT. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 20.; ANNUAL MEETING OF THE INTERAMERICAN SOCIETY FOR TROPICAL HORTICULTURE, 54., 2008, Vitória. Frutas para todos: estratégias, tecnologias e visão sustentável. Vitória: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2008. 1 DVD.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 4. | | SILVA, J. M. da; FERNANDES, M. F.; TALAMINI, V.; OLIVEIRA, F. A. de; SANTOS, C. C. dos. Análise da estrutura da comunidade microbiana em solo de áreas com resinose submetidas a tratamentos com fungicidas. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TABULEIROS COSTEIROS, 5., 2015, Aracaju. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2015. p. 280, ref. 273-279. 1 CD-ROM. Editor Técnico: Marcelo Ferreira Fernandes.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 5. | | SILVA, E. C.; MARCILIO, H. de C.; RAMOS, M. J. M.; GASPAROTTO, L.; SANTOS, C. C. dos. Avaliação da resistência de genótipos de bananeira à Sigatoka negra, no sudoeste do Estado de Mato Grosso. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 23., 2014, Cuiabá. Anais... Cuiabá: SBF, 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 6. | | DAMASO, M. C. T.; ABDELNUR, P. V.; RODRIGUES, C. M.; SANTOS, C. C. dos; GONZALEZ, W. de A. Bioconversion of glycerin derived from biodiesel in aggregated-value chemicals. In: ENCUENTRO LATINOAMERICANO Y DEL CARIBE DE BIOTECNOLOGÍA, 8., 2013, Buenos Aires, Argentina. Abstracts. Argentina: RedBio, 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 7. | | CRUZ, L. S. da; TALAMINI, V.; SANTOS, J. M. S. M.; OLIVEIRA, F. A. de; SANTOS, C. C. dos. Caracterização da eficiência de Trichoderma spp. contra Thielaviopsis paradoxa, agente etiológico da resinose do coqueiro. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TABULEIROS COSTEIROS, 5., 2015, Aracaju. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2015. p. 280, ref. 214-219. 1 CD-ROM. Editor Técnico: Marcelo Ferreira Fernandes.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 8. | | CRUZ, L. S. da; TALAMINI, V.; SANTOS, J. M. S. M.; FERREIRA, J. M. S.; SANTOS, C. C. dos. Estudo do progresso da resinose do coqueiro em Sergipe. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFI CA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TABULEIROS COSTEIROS, 4., 2014, Aracaju. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 9. | | SANTO, J. M. S. M.; TALAMINI, V.; SABATO, E. de O.; OLIVEIRA, F. A. de; SANTOS, C. C. dos. Monitoramento da incidência de enfezamentos causados por molicutes e de cigarrinhas na cultura de milho no estado de Sergipe. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TABULEIROS COSTEIROS, 3., 2013, Aracaju. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2013. 1 CD-ROM. p. 101-106.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 11. | | SANTOS, C. C. dos; FRIZZAS, M. R.; OLIVEIRA, C. M. de; BOTHONA, C. A.; GOMES, M. de S.; DUARTE, J. M.; SALDANHA, L. de A. Avaliação do efeito de milho geneticamente modificado resistente a insetos sobre o predador Doru luteipes. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 22., 2008, Uberlândia. Ciência, tecnologia e inovação: anais. Viçosa, MG: UFV, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 12. | | SANTOS, C. C. dos; OLIVEIRA, F. A. de; SANTOS, M. S. dos; TALAMINI, V.; FERREIRA, J. M. S.; SANTOS, F. J. dos. Avaliação In Vitro da ação antagonista de Trichoderma spp. sobre Thielaviopsis paradoxa. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TABULEIROS COSTERIOS, 1., 2011, Aracaju. Anais... Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2011. 1 CD-ROM. Artigo em anais.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 13. | | SANTOS, C. C. dos; FRIZZAS, M. R.; OLIVEIRA, C. M. de; BOTHONA, C. A.; GOMES, M. de S.; DUARTE, J. M.; SALDANHA, L. de A. Avaliação da influência do milho geneticamente modificado resistente a insetos na entomofauna do solo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 22., 2008, Uberlândia. Ciência, tecnologia e inovação: anais. Viçosa, MG: UFV, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 15. | | SANTOS, C. C. dos; SANTOS, A. K. N. dos; IVO, W. M. P. de M.; SILVA, P. A.; MARAFON, A. C.; SILVA, E. F. da. Características físicas e químicas de um Argissolo Amarelo, em área cultivada com cana-de-açúcar sob diferentes proporções de palhada no solo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 35., 2015, Natal. O solo e suas múltiplas funções: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 16. | | NEVES, J. A. das; SANTOS, C. C. dos; AMARAL, A. F. C.; SANTANA, S. A. C. de; SILVA, P. A.; IVO, W. M. P. de M. Emissões de gases de efeito estufa em áreas de cana-de-açúcar colhida crua e queimada. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TABULEIROS COSTEIROS, 8., 2018, Aracaju. Anais... Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2018. Editor técnico: Ronaldo Souza Resende. p. 144-148.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 17. | | OLIVEIRA, F. A. de; MATOS, C. G.; MELO, C. A.; SANTOS, C. C. dos; TALAMINI, V.; FERREIRA, J. M. S.; SANTOS, F. J. dos. Etiologia da queda de frutos de coqueiro no Estado de Sergipe. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TABULEIROS COSTERIOS, 1., 2011, Aracaju. Anais... Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2011. 1 CD-ROM. Artigo em anais.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 18. | | SANTOS, C. C. dos; TALAMINI, V.; FERREIRA, J. M. S.; OLIVEIRA, F. A. de; SANTOS, J. M. S. M.; SANTOS, F. J. dos. Estudo da epidemiologia da resinose do coqueiro em Sergipe. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TABULEIROS COSTEIROS, 3., 2013, Aracaju. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2013. 1 CD-ROM. p. 107-113.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 19. | | IVO, W. M. P. de M.; SANTOS, C. C. dos; SILVA, P. de A.; AMARAL, A. F. C.; SANTIAGO, A. D. Estoques de carbono e nitrogênio do solo como indicadores para o estabelecimento do manejo da palhada da cana-de-açúcar, em solos de Tabuleiro Costeiro. In: ENCONTRO BRASILEIRO DE SUBSTÂNCIAS HÚMICAS E MATÉRIA ORGÂNICA NATURAL, 12., 2018, Mato Grosso. Matéria orgânica e suas mutifuncionalidades: anais. Mato Grosso: SINOP, 2018.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 20. | | SANTOS, J. M. S. M.; TALAMINI, V.; SABATO, E. de O.; OLIVIERA, F. A. de; DINIZ, L. E. C.; SANTOS, C. C. dos. Monitoramento de enfezamentos causados por Molicutes e de ciigarrinhas na cultura do milho nos estados de Sergipe e Bahia na safra 2013. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFI CA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TABULEIROS COSTEIROS, 4., 2014, Aracaju. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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