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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia; Embrapa Meio-Norte. |
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Data corrente: |
26/01/2022 |
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Data da última atualização: |
21/02/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SILVA, T. L. C. da; SILVA, V. N. B.; BRAGA, I. de O.; RODRIGUES NETO, J. C.; LEAO, A. P.; RIBEIRO, J. A. de A.; VALADARES, L. F.; ABDELNUR, P. V.; SOUSA, C. A. F. de; SOUZA JUNIOR, M. T. |
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Afiliação: |
THALLITON LUIZ CARVALHO DA SILVA, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Vegetal, Universidade Federal de Lavras, MG, Brasil.; VIVIANNY NAYSE BELO SILVA, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Vegetal, Universidade Federal de Lavras, MG, Brasil.; ÍTALO DE OLIVEIRA BRAGA, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Vegetal, Universidade Federal de Lavras, MG, Brasil.; JORGE CANDIDO RODRIGUES NETO, Instituto de Química, Universidade Federal de Goiás, Goiânia, GO, Brasil.; ANDRE PEREIRA LEAO, CNPAE; JOSE ANTONIO DE AQUINO RIBEIRO, CNPAE; LEONARDO FONSECA VALADARES, CNPAE; PATRICIA VERARDI ABDELNUR, CNPAE; CARLOS ANTONIO FERREIRA DE SOUSA, CPAMN; MANOEL TEIXEIRA SOUZA JUNIOR, CNPAE. |
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Título: |
Integration of metabolomics and transcriptomics data to further characterize Gliricidia sepium (Jacq.) Kunth under high salinity stress. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Plant Genome, e20182, 2021. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Soil salinity is one abiotic stress that threatens agriculture in more than 100 countries. Gliricidia [Gliricidia sepium (Jacq.) Kunth] is a multipurpose tree known for its ability to adapt to a wide range of soils; however, its tolerance limits and responses to salt stress are not yet well understood. In this study, after characterizing the morphophysiological responses of young gliricidia plants to salinity stress, leaf metabolic and transcription profiles were generated and submitted to single and integrated analyses. RNA from leaf samples were subjected to RNA sequencing using an Illumina HiSeq platform and the paired-end strategy. Polar and lipidic fractions from leaf samples were extracted and analyzed on an ultra-high-performance liquid chromatography (UHPLC) coupled with electrospray ionization quadrupole time-offlight high-resolution mass spectrometry (MS) system. Acquired data were analyzed using the OmicsBox, XCMS Online, MetaboAnalyst, and Omics Fusion platforms. The substrate salinization protocol used allowed the identification of two distinct responses to salt stress: tolerance and adaptation. Single analysis on transcriptome and metabolome data sets led to a group of 5,672 transcripts and 107 metabolites differentially expressed in gliricidia leaves under salt stress. The phenylpropanoid biosynthesis was the most affected pathway, with 15 metabolites and three genes differentially expressed. Results showed that the differentially expressed metabolites and genes from this pathway affect mainly short-term salt stress (STS). The single analysis of the transcriptome identified 12 genes coding for proteins that might play a role in gliricidia response at both STS and long-termsalt stress (LTS). Further studies are needed to reveal the mechanisms behind the adaptation response. MenosSoil salinity is one abiotic stress that threatens agriculture in more than 100 countries. Gliricidia [Gliricidia sepium (Jacq.) Kunth] is a multipurpose tree known for its ability to adapt to a wide range of soils; however, its tolerance limits and responses to salt stress are not yet well understood. In this study, after characterizing the morphophysiological responses of young gliricidia plants to salinity stress, leaf metabolic and transcription profiles were generated and submitted to single and integrated analyses. RNA from leaf samples were subjected to RNA sequencing using an Illumina HiSeq platform and the paired-end strategy. Polar and lipidic fractions from leaf samples were extracted and analyzed on an ultra-high-performance liquid chromatography (UHPLC) coupled with electrospray ionization quadrupole time-offlight high-resolution mass spectrometry (MS) system. Acquired data were analyzed using the OmicsBox, XCMS Online, MetaboAnalyst, and Omics Fusion platforms. The substrate salinization protocol used allowed the identification of two distinct responses to salt stress: tolerance and adaptation. Single analysis on transcriptome and metabolome data sets led to a group of 5,672 transcripts and 107 metabolites differentially expressed in gliricidia leaves under salt stress. The phenylpropanoid biosynthesis was the most affected pathway, with 15 metabolites and three genes differentially expressed. Results showed that the differentially expressed metabolites and gen... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Adaptation; Salinization protocol. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/230514/1/The-Plant-Genome-2022-Integration.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agroenergia (CNPAE) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Trigo. |
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Data corrente: |
06/02/2015 |
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Data da última atualização: |
06/02/2015 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
B - 1 |
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Autoria: |
SANTOS, H. P. dos; FONTANELI, R. S.; PIRES, J. L. F.; LAMPERT, E. A.; VARGAS, A. M.; VERDI, A. C. |
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Afiliação: |
HENRIQUE PEREIRA DOS SANTOS, CNPT; RENATO SERENA FONTANELI, CNPT; JOAO LEONARDO FERNANDES PIRES, CNPT; EVANDRO ADEMIR LAMPERT, CNPT; ANA MARIA VARGAS; AMAURI COLET VERDI, UPF. |
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Título: |
Rendimento de grãos e características agronômicas de soja em função de sistemas de rotação de culturas. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
Bragantia, Campinas, v. 73, n. 3, p. 263-273, 2014. |
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ISSN: |
0006-8705 |
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DOI: |
http://dx.doi.org/10.1590/1678-4499.0136 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Avalia o efeito dos sistemas de rotação de culturas (SRC) sobre o rendimento de grãos e as características agronômicas de soja no período de 1996/1997 a 2010/2011 em Latossolo Vermelho distrófico típico, na Embrapa Trigo, em Passo Fundo, RS. Foram comparados quatro tipos de manejo de solo (TMS): 1) sistema plantio direto (SPD); 2) cultivo mínimo (CM); 3) preparo convencional de solo com arado de discos (PCD); e 4) preparo convencional de solo com arado de aivecas (PCA) e três SRC: sistema I (monocultura de trigo/monocultura de soja); sistema II (trigo/soja e ervilhaca/milho ou sorgo); e III (trigo/soja, aveia branca/soja e ervilhaca/milho ou sorgo). O delineamento experimental foi em blocos completos ao acaso, com parcelas subdivididas e três repetições. A parcela foi constituída pelos TMS, e as subparcelas, pelos SRC. No presente trabalho serão abordados somente os dados sobre sistemas de rotação de culturas. A análise conjunta dos dados obtidos não indicou diferença entre os SRC em relação ao número de grãos por planta, à massa de mil grãos e à altura de inserção das primeiras vagens de soja. A rotação de culturas por um verão utilizando milho ou sorgo propicia maior rendimento de grãos de soja em comparação com os demais sistemas estudados e com a soja em monocultura. A combinação de sistemas conservacionistas (SPD e CM) e SRC favoreceu o maior rendimento de grãos de soja. Os menores rendimentos de grãos e massa de grãos ocorreram em monocultura de soja. |
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Palavras-Chave: |
Grain mass per plant; Massa de grãos por planta; Number grain; Number legumes; Número de grãos; Número de vagens; Soybean. |
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Thesaurus NAL: |
crop rotation; grain yield. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/117469/1/2014-bragantia-v73n3p263.pdf
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Marc: |
LEADER 02466naa a2200313 a 4500
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520 $aAvalia o efeito dos sistemas de rotação de culturas (SRC) sobre o rendimento de grãos e as características agronômicas de soja no período de 1996/1997 a 2010/2011 em Latossolo Vermelho distrófico típico, na Embrapa Trigo, em Passo Fundo, RS. Foram comparados quatro tipos de manejo de solo (TMS): 1) sistema plantio direto (SPD); 2) cultivo mínimo (CM); 3) preparo convencional de solo com arado de discos (PCD); e 4) preparo convencional de solo com arado de aivecas (PCA) e três SRC: sistema I (monocultura de trigo/monocultura de soja); sistema II (trigo/soja e ervilhaca/milho ou sorgo); e III (trigo/soja, aveia branca/soja e ervilhaca/milho ou sorgo). O delineamento experimental foi em blocos completos ao acaso, com parcelas subdivididas e três repetições. A parcela foi constituída pelos TMS, e as subparcelas, pelos SRC. No presente trabalho serão abordados somente os dados sobre sistemas de rotação de culturas. A análise conjunta dos dados obtidos não indicou diferença entre os SRC em relação ao número de grãos por planta, à massa de mil grãos e à altura de inserção das primeiras vagens de soja. A rotação de culturas por um verão utilizando milho ou sorgo propicia maior rendimento de grãos de soja em comparação com os demais sistemas estudados e com a soja em monocultura. A combinação de sistemas conservacionistas (SPD e CM) e SRC favoreceu o maior rendimento de grãos de soja. Os menores rendimentos de grãos e massa de grãos ocorreram em monocultura de soja.
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700 1 $aVERDI, A. C.
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Registro original: |
Embrapa Trigo (CNPT) |
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