| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Cerrados. |
|
Data corrente: |
12/12/2018 |
|
Data da última atualização: |
12/12/2018 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
STAFUZZA, N. B.; SILVA, R. M. de O.; PERIPOLLI, E.; BEZERRA, L. A. F.; LOBO, R. B.; MAGNABOSCO, C. de U.; DI CROCE, F.; OSTERSTOCK, J.; MUNARI, D. P.; LOURENCO, D. A. L.; BALDI, F. |
|
Afiliação: |
Nedenia Bonvino Stafuzza, UNESP; Rafael Medeiros de Oliveira Silva, University of Georgia; ELISA PERIPOLLI, UNESP; Luiz Antônio Framartino Bezerra, USP; Raysildo Barbosa Lôbo, Associaçao Nacional dos Criadores e Pesquisadores; CLAUDIO DE ULHOA MAGNABOSCO, CPAC; Fernando Di Croce, Zoetis; Jason Osterstock, Zoetis; Danísio Prado Munari, UNESP; Daniela A. Lino Lourenco, University of Georgia; Fernando Baldi, UNESP. |
|
Título: |
Genome-wide association study provides insights into genes related with horn development in Nelore beef cattle. |
|
Ano de publicação: |
2018 |
|
Fonte/Imprenta: |
PLoS ONE, v. 13, n. 8, e0202978, August 30, 2018. |
|
DOI: |
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0202978 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Abstract The causal mutation for polledness in Nelore (Bos taurus indicus) breed seems to have appeared first in Brazil in 1957. The expression of the polled trait is known to be ruled by a few groups of alleles in taurine breeds; however, the genetic basis of this trait in indicine cattle is still unclear. The aim of this study was to identify genomic regions associated with the hornless trait in a commercial Nelore population. A total of 107,294 animals had phenotypes recorded and 2,238 were genotyped/imputed for 777k SNP. The weighted single-step approach for genome-wide association study (WssGWAS) was used to estimate the SNP effects and variances accounted for by 1 Mb sliding SNP windows. A centromeric region of chromosome 1 with 3.11 Mb size (BTA1: 878,631?3,987,104 bp) was found to be associated with hornless in the studied population. A total of 28 protein-coding genes are mapped in this region, including the taurine Polled locus and the IFNAR1, IFNAR2, IFNGR2, KRTAP11-1, MIS18A, OLIG1, OLIG2, and SOD1 genes, which expression can be related to the horn formation as described in literature. The functional enrichment analysis by DAVID tool revealed cytokine-cytokine receptor interaction, JAK-STAT signaling, natural killer cell mediated cytotoxicity, and osteoclast differentiation pathways as significant (P < 0.05). In addition, a runs of homozygosity (ROH) analysis identified a ROH island in polled animals with 2.47 Mb inside the region identified by WssGWAS. Polledness in Nelore cattle is associated with one region in the genome with 3.1 Mb size in chromosome 1. Several genes are harbored in this region, and they may act together in the determination of the polled/horned phenotype. Fine mapping the locus responsible for polled trait in Nelore breed and the identification of the molecular mechanisms regulating the horn growth deserve further investigation. MenosAbstract The causal mutation for polledness in Nelore (Bos taurus indicus) breed seems to have appeared first in Brazil in 1957. The expression of the polled trait is known to be ruled by a few groups of alleles in taurine breeds; however, the genetic basis of this trait in indicine cattle is still unclear. The aim of this study was to identify genomic regions associated with the hornless trait in a commercial Nelore population. A total of 107,294 animals had phenotypes recorded and 2,238 were genotyped/imputed for 777k SNP. The weighted single-step approach for genome-wide association study (WssGWAS) was used to estimate the SNP effects and variances accounted for by 1 Mb sliding SNP windows. A centromeric region of chromosome 1 with 3.11 Mb size (BTA1: 878,631?3,987,104 bp) was found to be associated with hornless in the studied population. A total of 28 protein-coding genes are mapped in this region, including the taurine Polled locus and the IFNAR1, IFNAR2, IFNGR2, KRTAP11-1, MIS18A, OLIG1, OLIG2, and SOD1 genes, which expression can be related to the horn formation as described in literature. The functional enrichment analysis by DAVID tool revealed cytokine-cytokine receptor interaction, JAK-STAT signaling, natural killer cell mediated cytotoxicity, and osteoclast differentiation pathways as significant (P < 0.05). In addition, a runs of homozygosity (ROH) analysis identified a ROH island in polled animals with 2.47 Mb inside the region identified by WssGWAS. Pollednes... Mostrar Tudo |
|
Thesagro: |
Bos Indicus; Gado Nelore; Mutação. |
|
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/188280/1/Genome-wide-association-study-provides-apagar.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02768naa a2200289 a 4500
001 2101347
005 2018-12-12
008 2018 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1371/journal.pone.0202978$2DOI
100 1 $aSTAFUZZA, N. B.
245 $aGenome-wide association study provides insights into genes related with horn development in Nelore beef cattle.$h[electronic resource]
260 $c2018
520 $aAbstract The causal mutation for polledness in Nelore (Bos taurus indicus) breed seems to have appeared first in Brazil in 1957. The expression of the polled trait is known to be ruled by a few groups of alleles in taurine breeds; however, the genetic basis of this trait in indicine cattle is still unclear. The aim of this study was to identify genomic regions associated with the hornless trait in a commercial Nelore population. A total of 107,294 animals had phenotypes recorded and 2,238 were genotyped/imputed for 777k SNP. The weighted single-step approach for genome-wide association study (WssGWAS) was used to estimate the SNP effects and variances accounted for by 1 Mb sliding SNP windows. A centromeric region of chromosome 1 with 3.11 Mb size (BTA1: 878,631?3,987,104 bp) was found to be associated with hornless in the studied population. A total of 28 protein-coding genes are mapped in this region, including the taurine Polled locus and the IFNAR1, IFNAR2, IFNGR2, KRTAP11-1, MIS18A, OLIG1, OLIG2, and SOD1 genes, which expression can be related to the horn formation as described in literature. The functional enrichment analysis by DAVID tool revealed cytokine-cytokine receptor interaction, JAK-STAT signaling, natural killer cell mediated cytotoxicity, and osteoclast differentiation pathways as significant (P < 0.05). In addition, a runs of homozygosity (ROH) analysis identified a ROH island in polled animals with 2.47 Mb inside the region identified by WssGWAS. Polledness in Nelore cattle is associated with one region in the genome with 3.1 Mb size in chromosome 1. Several genes are harbored in this region, and they may act together in the determination of the polled/horned phenotype. Fine mapping the locus responsible for polled trait in Nelore breed and the identification of the molecular mechanisms regulating the horn growth deserve further investigation.
650 $aBos Indicus
650 $aGado Nelore
650 $aMutação
700 1 $aSILVA, R. M. de O.
700 1 $aPERIPOLLI, E.
700 1 $aBEZERRA, L. A. F.
700 1 $aLOBO, R. B.
700 1 $aMAGNABOSCO, C. de U.
700 1 $aDI CROCE, F.
700 1 $aOSTERSTOCK, J.
700 1 $aMUNARI, D. P.
700 1 $aLOURENCO, D. A. L.
700 1 $aBALDI, F.
773 $tPLoS ONE$gv. 13, n. 8, e0202978, August 30, 2018.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Cerrados (CPAC) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Caprinos e Ovinos. |
|
Data corrente: |
20/11/2013 |
|
Data da última atualização: |
05/04/2019 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Circulação/Nível: |
A - 2 |
|
Autoria: |
GOMES, G. M. F.; VASCONCELOS, A. M.; EGITO, A. S. do; LIMA, A. R.; CARNEIRO, J. da C.; LANDIM, A. V.; FONTELES, N. L. O.; SALLES, H. O. S. |
|
Afiliação: |
Universidade Estadual Vale do Acaraú (UVA) Sobral, CE, Brasil.; UVA - Sobral, CE, Brasil.; ANTONIO SILVIO DO EGITO, CNPC; ADRIANO RODRIGUES LIMA, CNPC; JAILTON DA COSTA CARNEIRO, CNPGL; UVA - Sobral, CE, Brasil.; UVA - Sobral, CE, Brasil.; HEVILA OLIVEIRA SALLES, CNPC. |
|
Título: |
Degradabilidade in situ do bagaço de cana-de-açúcar para pequenos ruminantes de raças naturalizadas do Nordeste brasileiro. |
|
Ano de publicação: |
2013 |
|
Fonte/Imprenta: |
Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, v. 65, n. 6, p. 1792-1800, 2013. |
|
Idioma: |
Português |
|
Conteúdo: |
Resumo: Com o crescimento da indústria sucroalcooleira, buscam-se alternativas de uso dos resíduos gerados por ela. Os pequenos ruminantes de raças naturalizadas do Nordeste brasileiro mostram-se como grupos potenciais para que seja utilizado o bagaço de cana-de-açúcar (BCA) nas dietas. Nesse contexto, objetivou-se determinar a degradabilidade ruminal in situ da matéria seca (MS) e da fibra em detergente neutro (FDN) do BCA e os parâmetros ruminais em caprinos Moxotó e ovinos Morada Nova, fistulados no rúmen. Contidos em sacos de náilon, 3g de BCA foram incubados no rúmen nos tempos seis, 24 e 96 horas, determinando-se o conteúdo de MS e FDN nos resíduos obtidos. Nos tempos zero, seis e 12 horas após a primeira refeição, mediram-se no líquido ruminal pH e nitrogênio amoniacal (N-NH3) ruminal. O CMS não diferiu entre caprinos e ovinos. O potencial de máxima degradação da MS foi semelhante entre espécies, e da FDN foi superior em caprinos. Ovinos apresentaram maiores tempo de colonização, taxa de degradação e degradabilidade efetiva da MS e FDN. O pH não diferiu entre as espécies. Observou-se maior concentração de N-NH3 ruminal em caprinos, no tempo zero. Diante da maior velocidade de degradação da MS do BCA pelos ovinos, essa espécie se mostra detentora de uma microbiota ruminal com crescimento mais eficiente sobre o BCA. [In situ degradability of sugarcane bagasse for naturalized small ruminant breeds from the northeastern Brazil]. Abstract: With the increase of the sugar and alcohol industries, alternative uses for residue are sought, and the small ruminants from the naturalized breeds of northeastern Brazil are potential groups to make use of the sugarcane bagasse (SCB) in their diets. In this context, the objective was to determine the in situ degradability of dry matter (DM) and neutral detergent fiber (NDF) of SCB and ruminal parameters in Moxotó goats and Morada Nova sheep rumen fistulated. Three grams of SCB were placed in naylon bags and incubated in the rumen at 6, 24 and 96 hours, and the residues analyzed for DM and NDF. Rumen fluid was collected at zero, 6 and 12 hours after the first meal and pH and ammonia nitrogen (N-NH3) were determined. DMI did not differ between goats and sheep. The maximum degradation potential of DM was similar between species and the A of NDF was higher in goats. Sheep had higher colonization time, rate of degradation and effective degradability of DM and NDF. The pH did not differ between species. The highest concentration of ruminal N-NH3 in goats was at time zero. Given the higher rate of degradation of bagasse dry matter by sheep, this specie shows a more efficient rumen microbial growth on SCB. MenosResumo: Com o crescimento da indústria sucroalcooleira, buscam-se alternativas de uso dos resíduos gerados por ela. Os pequenos ruminantes de raças naturalizadas do Nordeste brasileiro mostram-se como grupos potenciais para que seja utilizado o bagaço de cana-de-açúcar (BCA) nas dietas. Nesse contexto, objetivou-se determinar a degradabilidade ruminal in situ da matéria seca (MS) e da fibra em detergente neutro (FDN) do BCA e os parâmetros ruminais em caprinos Moxotó e ovinos Morada Nova, fistulados no rúmen. Contidos em sacos de náilon, 3g de BCA foram incubados no rúmen nos tempos seis, 24 e 96 horas, determinando-se o conteúdo de MS e FDN nos resíduos obtidos. Nos tempos zero, seis e 12 horas após a primeira refeição, mediram-se no líquido ruminal pH e nitrogênio amoniacal (N-NH3) ruminal. O CMS não diferiu entre caprinos e ovinos. O potencial de máxima degradação da MS foi semelhante entre espécies, e da FDN foi superior em caprinos. Ovinos apresentaram maiores tempo de colonização, taxa de degradação e degradabilidade efetiva da MS e FDN. O pH não diferiu entre as espécies. Observou-se maior concentração de N-NH3 ruminal em caprinos, no tempo zero. Diante da maior velocidade de degradação da MS do BCA pelos ovinos, essa espécie se mostra detentora de uma microbiota ruminal com crescimento mais eficiente sobre o BCA. [In situ degradability of sugarcane bagasse for naturalized small ruminant breeds from the northeastern Brazil]. Abstract: With the increase of the sugar an... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Cana-de-açúcar; Degradabilidade in situ; Fiber; Goat; In situ degradability; Residue; Rumen degradability. |
|
Thesagro: |
Bagaço; Caprino; Fibra; Materia seca; Ovino; Resíduo; Rúmen; Subproduto. |
|
Thesaurus NAL: |
Sheep; Sugarcane byproducts. |
|
Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/92786/1/API-Degradabilidade-in-situ.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 03882naa a2200409 a 4500
001 1971597
005 2019-04-05
008 2013 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aGOMES, G. M. F.
245 $aDegradabilidade in situ do bagaço de cana-de-açúcar para pequenos ruminantes de raças naturalizadas do Nordeste brasileiro.$h[electronic resource]
260 $c2013
520 $aResumo: Com o crescimento da indústria sucroalcooleira, buscam-se alternativas de uso dos resíduos gerados por ela. Os pequenos ruminantes de raças naturalizadas do Nordeste brasileiro mostram-se como grupos potenciais para que seja utilizado o bagaço de cana-de-açúcar (BCA) nas dietas. Nesse contexto, objetivou-se determinar a degradabilidade ruminal in situ da matéria seca (MS) e da fibra em detergente neutro (FDN) do BCA e os parâmetros ruminais em caprinos Moxotó e ovinos Morada Nova, fistulados no rúmen. Contidos em sacos de náilon, 3g de BCA foram incubados no rúmen nos tempos seis, 24 e 96 horas, determinando-se o conteúdo de MS e FDN nos resíduos obtidos. Nos tempos zero, seis e 12 horas após a primeira refeição, mediram-se no líquido ruminal pH e nitrogênio amoniacal (N-NH3) ruminal. O CMS não diferiu entre caprinos e ovinos. O potencial de máxima degradação da MS foi semelhante entre espécies, e da FDN foi superior em caprinos. Ovinos apresentaram maiores tempo de colonização, taxa de degradação e degradabilidade efetiva da MS e FDN. O pH não diferiu entre as espécies. Observou-se maior concentração de N-NH3 ruminal em caprinos, no tempo zero. Diante da maior velocidade de degradação da MS do BCA pelos ovinos, essa espécie se mostra detentora de uma microbiota ruminal com crescimento mais eficiente sobre o BCA. [In situ degradability of sugarcane bagasse for naturalized small ruminant breeds from the northeastern Brazil]. Abstract: With the increase of the sugar and alcohol industries, alternative uses for residue are sought, and the small ruminants from the naturalized breeds of northeastern Brazil are potential groups to make use of the sugarcane bagasse (SCB) in their diets. In this context, the objective was to determine the in situ degradability of dry matter (DM) and neutral detergent fiber (NDF) of SCB and ruminal parameters in Moxotó goats and Morada Nova sheep rumen fistulated. Three grams of SCB were placed in naylon bags and incubated in the rumen at 6, 24 and 96 hours, and the residues analyzed for DM and NDF. Rumen fluid was collected at zero, 6 and 12 hours after the first meal and pH and ammonia nitrogen (N-NH3) were determined. DMI did not differ between goats and sheep. The maximum degradation potential of DM was similar between species and the A of NDF was higher in goats. Sheep had higher colonization time, rate of degradation and effective degradability of DM and NDF. The pH did not differ between species. The highest concentration of ruminal N-NH3 in goats was at time zero. Given the higher rate of degradation of bagasse dry matter by sheep, this specie shows a more efficient rumen microbial growth on SCB.
650 $aSheep
650 $aSugarcane byproducts
650 $aBagaço
650 $aCaprino
650 $aFibra
650 $aMateria seca
650 $aOvino
650 $aResíduo
650 $aRúmen
650 $aSubproduto
653 $aCana-de-açúcar
653 $aDegradabilidade in situ
653 $aFiber
653 $aGoat
653 $aIn situ degradability
653 $aResidue
653 $aRumen degradability
700 1 $aVASCONCELOS, A. M.
700 1 $aEGITO, A. S. do
700 1 $aLIMA, A. R.
700 1 $aCARNEIRO, J. da C.
700 1 $aLANDIM, A. V.
700 1 $aFONTELES, N. L. O.
700 1 $aSALLES, H. O. S.
773 $tArquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia$gv. 65, n. 6, p. 1792-1800, 2013.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Caprinos e Ovinos (CNPC) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|
