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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
29/12/2014 |
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Data da última atualização: |
30/12/2014 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
POLIZEL-PODANOSQUI, A. M.; CARVALHO, M. C. C. G. de; ROCHA, C. S.; DARBEN, L. M.; LOPES-CAITAR, V. S.; AOYAOGI, L. N.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. |
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Afiliação: |
CNPSO - estagiário; UENP; CNPSO - estagiário; UENP; CNPSO - estagiário; CNPSO - estagiário; FRANCISMAR CORREA MARCELINO-GUIMARÃES, CNPSO. |
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Título: |
Temporal gene expression analysis of effector candidates of Phakopsora pachyrhizi across the infection cycle. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
In: INTERNATIONAL CONGRESS ON MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS, 16., 2014, Rhodes. [Abstracts...]. Atenas: International Society of Molecular Plant-Microbe Interactions, 2014. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Phakopsora pachyrhizi is the causer of the Asian soybean rust, the most aggressive foliar disease that attacks the soybean plants in cultivated areas. To design effective breeding strategies for durable disease resistance it is important to understand the molecular basis of this plant-pathogen interaction. In particular, the characterization of the secreted effector proteins can help the breeding programs. Our recent analysis of the P. pachyrhizi secretome has revealed the presence of potential effectors genes. In this work, the temporal expression of 58 effector candidate genes were characterized from spores, germinated spores and infected soybean leaves at 0, 6, 12, 24, 36, 48, 72, 96, 192 and 240 hours after inoculation (hai) using RT-qPCR. Expression analysis showed differential temporal gene expression of these candidate effectors. Clustering analysis revealed three main clusters with coordinated expression of candidates across the infection cycle. The first has candidates expressed in specific steps of infection and almost sequences have the common motifs Y/F/WxC frequently found in haustoria-producing rust fungi effectors. The second cluster has candidates expressed during initial steps of infection that matches germ tube and appressorium formation (0 – 24 hai) and almost sequences have ?3 cysteine residues, other common features of the effectors. Third cluster has candidates expressed only in contact with the host, suggesting that these candidates are host-induced. The sequences in this cluster have the CFEM domain associated with pathogenicity. Functional analyses are in progress with more promising candidates effectors to validate the potential effectors from soybean rust. MenosPhakopsora pachyrhizi is the causer of the Asian soybean rust, the most aggressive foliar disease that attacks the soybean plants in cultivated areas. To design effective breeding strategies for durable disease resistance it is important to understand the molecular basis of this plant-pathogen interaction. In particular, the characterization of the secreted effector proteins can help the breeding programs. Our recent analysis of the P. pachyrhizi secretome has revealed the presence of potential effectors genes. In this work, the temporal expression of 58 effector candidate genes were characterized from spores, germinated spores and infected soybean leaves at 0, 6, 12, 24, 36, 48, 72, 96, 192 and 240 hours after inoculation (hai) using RT-qPCR. Expression analysis showed differential temporal gene expression of these candidate effectors. Clustering analysis revealed three main clusters with coordinated expression of candidates across the infection cycle. The first has candidates expressed in specific steps of infection and almost sequences have the common motifs Y/F/WxC frequently found in haustoria-producing rust fungi effectors. The second cluster has candidates expressed during initial steps of infection that matches germ tube and appressorium formation (0 – 24 hai) and almost sequences have ?3 cysteine residues, other common features of the effectors. Third cluster has candidates expressed only in contact with the host, suggesting that these candidates are host-induced. T... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Ferrugem asiática da soja. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/114606/1/Temporal-gene-expression-analysis-of-effector-candidates-of-Phakopsora-pachyrhizi-across-the-infection-cycle.pdf
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Marc: |
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520 $aPhakopsora pachyrhizi is the causer of the Asian soybean rust, the most aggressive foliar disease that attacks the soybean plants in cultivated areas. To design effective breeding strategies for durable disease resistance it is important to understand the molecular basis of this plant-pathogen interaction. In particular, the characterization of the secreted effector proteins can help the breeding programs. Our recent analysis of the P. pachyrhizi secretome has revealed the presence of potential effectors genes. In this work, the temporal expression of 58 effector candidate genes were characterized from spores, germinated spores and infected soybean leaves at 0, 6, 12, 24, 36, 48, 72, 96, 192 and 240 hours after inoculation (hai) using RT-qPCR. Expression analysis showed differential temporal gene expression of these candidate effectors. Clustering analysis revealed three main clusters with coordinated expression of candidates across the infection cycle. The first has candidates expressed in specific steps of infection and almost sequences have the common motifs Y/F/WxC frequently found in haustoria-producing rust fungi effectors. The second cluster has candidates expressed during initial steps of infection that matches germ tube and appressorium formation (0 – 24 hai) and almost sequences have ?3 cysteine residues, other common features of the effectors. Third cluster has candidates expressed only in contact with the host, suggesting that these candidates are host-induced. The sequences in this cluster have the CFEM domain associated with pathogenicity. Functional analyses are in progress with more promising candidates effectors to validate the potential effectors from soybean rust.
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 6. | | FELIX, G. A.; PAZ, I. C. de L. A.; PIOVEZAN, U.; CALDARA, F. R.; LIMA, K. A. O.; GARCIA, R. G.; BELLONI, M.; ALVES, F. M. S. Características da carne de capivaras (Hydrochoerus hydrochaeris) de vida livre. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 23., 2013, Foz do Iguaçu. Zootecnia do futuro: Produção Animal Sustentável: [anais]. Foz do Iguaçu: Universidade Estadual do Oeste do Paraná, 2013. 3p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 7. | | FELIX, G. A.; PAZ, I. C. de L. A.; PIOVEZAN, U.; GARCIA, R. G.; PINHEIRO, M. S.; FERNANDES, A. R. M.; LIMA, K. A. O.; REZENDE, M. A. Características de carne y de las canales de capibaras (Hydrochoerus hydrochaeris) en vida libre Meat and carcass characteristics of free-living capybaras (Hydrochoerus hydrochaeris). Nacameh, v. 8, n. 1, p. 23‐ 38, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 8. | | FERREIRA, V. M. O. dos S.; CALDARA, F. R.; FEIJO, G. L. D.; GARCIA, R. G.; PAZ, I. C. de L.; SANTOS, L. S. dos. Características sensoriais da carne PSE (pale, soft and exudative) de suínos. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA ZOOTECNIA, 47., 2010, Salvador. Empreendedorismo e progresso científicos na zootecnia brasileira de vanguarda: anais. Salvador: SBZ: UFBA, 2010. 3 p. R4122| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 9. | | FELIX, G. A.; PAZ, I. C. de L. A.; PIOVEZAN, U.; GARCIA, R. G.; CALDARA, F. R.; SANTOS, L. S. dos. Composição nutricional da carne de capivaras (Hydrochoerus hydrochaeris L. 1766) de vida livre em áreas agrícolas1. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., Brasília, DF. A produção animal no mundo em transformação: Anais. Brasília: SBZ, 2012. 3p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 10. | | FELIX, G. A.; ALMEIDA PAZ, I. C. L.; PIOVEZAN, U.; GARCIA, R. G.; LIMA, K. A. O.; NAAS, I. A.; SALGADO, D. D.; PILECCO, M.; BELLONI, M. Feeding behavior and crop damage caused by capybaras (Hydrochoerus hydrochaeris) in an agricultural landscape. Brazilian Journal of Biology, v.74, n. 4, p. 779-786, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 11. | | FELIX, G. A.; PAZ, I. C. de L. A.; PIOVEZAN, U.; GARCIA, R. G.; LIMA, K. A. O. de; SALGADO, D. D. Danos causados por capivaras (Hydrochoerus hydrochaeris) livres em áreas agrícolas1. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., Brasília, DF. A produção animal no mundo em transformação: Anais. Brasília: SBZ, 2012. 3p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 12. | | FELIX, G. A.; PAZ, I. C. de L. A.; PIOVEZAN, U.; GARCIA, R. G.; PINHEIRO, M. S.; FERNANDES, A. R. M.; LIMA, K. A. O.; REZENDE, M. A. Meat and carcass characteristics of free-living capybaras (Hydrochoerus hydrochaeris). Nacameh, v. 8, n. 1, p. 23-38, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
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| 13. | | NEGRÃO, F. J.; FREITAS, L. W. de; GABRIEL, A. M. de A.; CAVICHIOLO, F.; GARCIA, R. G.; CASTRO, K. N. de C.; NEGRÃO, S. L. Responsabilidade zootécnica e posse responsável de animais domésticos. In: ENCONTRO DE EXTENSÃO DA UNIVERSIDADE FEDERAL DA GRANDE DOURADOS, 2.; ENCONTRO DE BOLSISTAS DE EXTENSÃO DE MATO GROSSO DO SUL, 2., 2008, Dourados. Economia solidária. Dourados: UFGD, PROEX, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 14. | | BARRETO, B.; FELIX, G. A. F; PAZ, I. C. de L. A.; PIOVEZAN, U.; NÄÄS, I. de A.; GARCIA, R. G.; MIRANDA, G. A.; MOI, M. Uso do método AHP para avaliar o comportamento alimentar das capivaras (Hydrochoerus hydrochaeris linnaeus, 1766) em áreas agrícolas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 22., 2012, Cuiabá. A importância da zootecnia para a segurança alimentar. Cuiaba: UFMT, 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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