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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Acre. |
Data corrente: |
05/10/2011 |
Data da última atualização: |
06/07/2021 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
PERSEGUINI, J. M. C. K.; CHIORATTO, A. F.; ZUCCHI, M. I.; COLOMBO, C. A.; CARBONELL, S. A. M.; MONDEGO, J. M. C.; GAZAFFI, R.; GARCIA, A. A. F.; CAMPOS, T. de; SOUZA, A. P. de; RUBIANO, L. B. |
Afiliação: |
Juliana Morini Küpper Cardoso Perseguini, IAC; Alisson F ernando Chioratto, IAC; Maria Imaculada Zucchi, IAC; Carlos Augusto Colombo, IAC; Sérgio Augusto Moraes Carbonell, IAC; Jorge Mauricio Costa Mondego, IAC; Rodrigo Gazaffi, ESALQ; Antonio Augusto Franco Garcia, ESALQ; TATIANA DE CAMPOS, CPAF-AC; Anete Pereira de Souza, UNICAMP; Luciana Benchimol Rubiano, IAC. |
Título: |
Genetic diversity in cultivated carioca common beans based on molecular marker analysis. |
Ano de publicação: |
2011 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 34, n. 1, p. 88-102, 2011. |
DOI: |
10.1590/S1415-47572011000100017 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
A wide array of molecular markers has been used to investigate the genetic diversity among common bean species. However, the best combination of markers for studying such diversity among common bean cultivars has yet to be determined. Few reports have examined the genetic diversity of the carioca bean, commercially one of the most important common beans in Brazil. In this study, we examined the usefulness of two molecular marker systems (simple sequence repeats - SSRs and amplified fragment length polymorphisms - AFLPs) for assessing the genetic diversity of carioca beans. The amount of information provided by Roger?s modified genetic distance was used to analyze SSR data and Jaccards similarity coefficient was used for AFLP data. Seventy SSRs were polymorphic and 20 AFLP primer combinations produced 635 polymorphic bands. Molecular analysis showed that carioca genotypes were quite diverse. AFLPs revealed greater genetic differentiation and variation within the carioca genotypes (Gst = 98% and Fst = 0.83, respectively) than SSRs and provided better resolution for clustering the carioca genotypes. SSRs and AFLPs were both suitable for assessing the genetic diversity of Brazilian carioca genotypes since the number of markers used in each system provided a low coefficient of variation. However, fingerprint profiles were generated faster with AFLPs, making them a better choice for assessing genetic diversity in the carioca germplasm. |
Palavras-Chave: |
Feijão carioca; Fitomejoramiento; Frijoles; Marcador microssatélite; Marcadores genéticos; Repeticiones de microsatélite; Variación genética. |
Thesagro: |
Feijão; Marcador genético; Melhoramento genético vegetal; Phaseolus vulgaris; Polimorfismo genético; Variação genética. |
Thesaurus Nal: |
Beans; Genetic markers; Genetic polymorphism; Genetic variation; Microsatellite repeats; Plant breeding. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/56462/1/23952.pdf
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Marc: |
LEADER 02912naa a2200481 a 4500 001 1902577 005 2021-07-06 008 2011 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1590/S1415-47572011000100017$2DOI 100 1 $aPERSEGUINI, J. M. C. K. 245 $aGenetic diversity in cultivated carioca common beans based on molecular marker analysis.$h[electronic resource] 260 $c2011 520 $aA wide array of molecular markers has been used to investigate the genetic diversity among common bean species. However, the best combination of markers for studying such diversity among common bean cultivars has yet to be determined. Few reports have examined the genetic diversity of the carioca bean, commercially one of the most important common beans in Brazil. In this study, we examined the usefulness of two molecular marker systems (simple sequence repeats - SSRs and amplified fragment length polymorphisms - AFLPs) for assessing the genetic diversity of carioca beans. The amount of information provided by Roger?s modified genetic distance was used to analyze SSR data and Jaccards similarity coefficient was used for AFLP data. Seventy SSRs were polymorphic and 20 AFLP primer combinations produced 635 polymorphic bands. Molecular analysis showed that carioca genotypes were quite diverse. AFLPs revealed greater genetic differentiation and variation within the carioca genotypes (Gst = 98% and Fst = 0.83, respectively) than SSRs and provided better resolution for clustering the carioca genotypes. SSRs and AFLPs were both suitable for assessing the genetic diversity of Brazilian carioca genotypes since the number of markers used in each system provided a low coefficient of variation. However, fingerprint profiles were generated faster with AFLPs, making them a better choice for assessing genetic diversity in the carioca germplasm. 650 $aBeans 650 $aGenetic markers 650 $aGenetic polymorphism 650 $aGenetic variation 650 $aMicrosatellite repeats 650 $aPlant breeding 650 $aFeijão 650 $aMarcador genético 650 $aMelhoramento genético vegetal 650 $aPhaseolus vulgaris 650 $aPolimorfismo genético 650 $aVariação genética 653 $aFeijão carioca 653 $aFitomejoramiento 653 $aFrijoles 653 $aMarcador microssatélite 653 $aMarcadores genéticos 653 $aRepeticiones de microsatélite 653 $aVariación genética 700 1 $aCHIORATTO, A. F. 700 1 $aZUCCHI, M. I. 700 1 $aCOLOMBO, C. A. 700 1 $aCARBONELL, S. A. M. 700 1 $aMONDEGO, J. M. C. 700 1 $aGAZAFFI, R. 700 1 $aGARCIA, A. A. F. 700 1 $aCAMPOS, T. de 700 1 $aSOUZA, A. P. de 700 1 $aRUBIANO, L. B. 773 $tGenetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto$gv. 34, n. 1, p. 88-102, 2011.
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Registro original: |
Embrapa Acre (CPAF-AC) |
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61. | | SOUSA, A. C. B.; CARVALHO, M. A.; CAMPOS, T. de; SFORÇA, D. A.; ZUCCHI, M. I.; JANK, L.; SOUZA, A. P. Molecular diversity, genetic structure and mating system of Calopogonium mucunoides Desv. Genetic Resources and Crop Evolution, v. 59, n. 7, p. 1449-1464, Oct. 2012.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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62. | | BELINI, C. M. B.; ZUCCHI, M. I.; BAJAY, M. M.; MARQUES, M. O. M.; FACANALI, R.; VIEIRA, M. A. R.; FIGUEIRA, G. M.; HABER, L. L. Medical and aromatic plant collection of Baccharis dracunculifolia DC. germplasm bank. Acta Horticulturae, v. 1125, p. 229-234, 2016. Edition of Proceedings of the Symposia of the V world congress on medicinal and aromatic plants and international symposia on plants, as factories of natural substances, edible and essential oils.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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63. | | SOUSA, A. C. B. de; CARVALHO, M. A.; CAMPOS, T. de; SILVA, G. de T. e; ZUCCHI, M. I.; JANK, L.; ANETE PEREIRA DE SOUZA. Outcrossing Rate in Calopogonium mucunoides Desv. Based on Microsatellite Markers. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON FORAGE BREEDING, 3., 2011, Bonito, MS. Breeding forage for climate change adaptation and mitigation - eco-efficient animal produtction: proceedings. [Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte], 2011. 6-9 1 CD-ROMTipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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64. | | FERREIRA, T. G. T.; PENHA, H. A.; ZUCCHI, M. I.; SANTOS, A. A.; HANAI, L. R.; JUNQUEIRA, N. T. V.; BRAGA, M. F.; VENCOVSKY, R.; VIEIRA, L. C. Outcrossing rate in sweet passion fruit based on molecular markers. Plant Breeding, v. 129, n. 6, p. 727-730, Feb. 2010.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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65. | | CIDADE, F. W.; SOUZA-CHIES, T. T.; SOUZA, F. H. D. de; VALLS, J. F. M.; DALL´AGNOL, M.; ZUCCHI, M. I.; SOUZA, A. P. Paspalum L. (Poaceae, Panicoideae, Paniceae) species identification using molecular genetic evaluation. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 56., 2011, Águas de kibdoia. Anais... Águas de Lindóia: SBG, 2011Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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66. | | VIEIRA, M. A. R.; MARQUES, M. O. M.; HABER, L. L.; VIGNA, B. B. Z.; BAJAY, M. M.; SOUZA, A. P.; SEMIR, J.; ZUCCHI, M. I. New loci of Lychnophora ericoides and transferability to Lychnophora pinaster, endangered medicinal species from Brazil Genetics and Molecular Research, v 13, n. 4, p. 878-882, 2014.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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67. | | VALDISSER, P. A. M. R.; PEREIRA, W. J.; MORAIS JUNIOR, O. P. de; MENDONÇA, J. A.; SARTORI, D. E. L.; LIMA, LUANN V. V. O.; BORBA, T. C. de O.; BRONDANI, C.; ZUCCHI, M. I.; VIANELLO, R. P. Análise de associação genômica ampla (GWAS) para tolerância à seca em feijoeiro comum. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 12., 2017, Piracicaba. Produtividade e sustentabilidade da cultura do feijão: do campo para a mesa: resumos. Piracicaba: CENA: IAC, 2017. p. 67. CONAFETipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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68. | | RIGOTTI, M.; FACANALI, R.; HABER, L. L.; VIEIRA, M. A. R.; ISOBE, M. T. C.; CAVALLARI, M. M.; BAJAY, M. M.; ZUCCHI, M. I.; PINHEIRO, J. B.; MARQUES, M. O. M. Chemical and genetic diversity of Baccharis dracunculifolia DC. (Asteraceae) from the Cerrado biome. Biochemical Systematics and Ecology, v. 111, dec. 2023, 104735. 8 p.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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69. | | SANTOS-GARCIA, M. O.; TOLEDO-SILVA, G. de; SASSAKI, R. P.; FERREIRA, T. H.; RESENDE, R. M. S.; CHIARI, L.; KARIA, C. T.; CARVALHO, M. A.; FALEIRO, F. G.; ZUCCHI, M. I.; SOUZA, A. P. de. Using genetic diversity information to establish core collections of Stylosanthes capitata and Stylosanthes macrocephala. Genetics and Molecular Biology, São Paulo, v.35, n.4, p.847-861,Nov. 2012Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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70. | | SANTOS-GARCIA, M. O.; TOLEDO-SILVA, G.; SASSAKI, R. P.; FERREIRA, T. H.; RESENDE, R. M. S.; CHIARI, L.; KARIA, C. T.; CARVALHO, M. A.; FALEIRO, F. G.; ZUCCHI, M. I.; SOUZA, A. P. Using genetic diversity information to establish core collections of Stylosanthes capitata and Stylosanthes macrocephala. Genetics and Molecular Biology, online ahead of print 2012.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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71. | | JUNGMANN, L.; VIGNA, B. B. Z.; BOLDRINI, K. R.; SOUZA, A. C. B.; VALLE, C. B. do; RESENDE, R. M. S.; PAGLIARINI, M. S.; ZUCCHI, M. I.; SOUZA, A. P. de. A survey of a germplasm collection of Brachiaria humidicola (Rendle) Scweick. using microssatellite markers, cytogenetics, morphological traits and geographical origin. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON THE MOLECULAR BREEDING OF FORAGE AND TURF: MBFT, 2010, 6., 2010, Buenos Aires. [Resumos...]. Buenos Aires: Ediciones INTA, 2010. p. 22-23Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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72. | | PERSEGUINI, J. M. C. K.; CHIORATTO, A. F.; ZUCCHI, M. I.; COLOMBO, C. A.; CARBONELL, S. A. M.; MONDEGO, J. M. C.; GAZAFFI, R.; GARCIA, A. A. F.; CAMPOS, T. de; SOUZA, A. P. de; RUBIANO, L. B. Genetic diversity in cultivated carioca common beans based on molecular marker analysis. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 34, n. 1, p. 88-102, 2011.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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74. | | OLIVEIRA, E. J. de; GARCIA, A. A. F.; MUNHOZ, C. de F.; MARGARIDO, G. R. A.; CONSOLI, L.; MATTA, F. de P.; MORAES, M. C. de; ZUCCHI, M. I.; FUNGARO, M. H. P.; VIEIRA, M. L. C. Integração de mapas genético-moleculares de maracujá-amarelo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 4., 2007, São Lourenço. São Lourenço:[s.n.], 2007.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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