Data/hora: 09/06/2024 01:20:08

Biblioteca(s): | Embrapa Café.
Data corrente: | 18/11/2011
Data da última atualização: | 18/11/2011
Autoria: | ALVARENGA, S. M.; CAIXETA, E. T.; ANDRADE, F. T.; MACIEL, B. H.; ZAMBOLIM, E. M.; XAVIER, K. V.; SAKIYAMA, N. S.
Afiliação: | SAMUEL MAZZINGHY ALVARENGA, UFV/BIOAGRO; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA, SAPC; FLÁVIA THIEBAUT ANDRADE, UFV/BIOAGRO; BÁRBARA HUFNAGEL MACIEL, UFV/BIOAGRO; EUNIZE MACIEL ZAMBOLIM, UFV//BIOAGRO; KÁTIA VIANA XAVIER, UFV; NEY SUSSUMU SAKIYAMA, UFV/BIOAGRO.
Título: | Localização de marcador molecular derivado de EST potencialmente associado ao domínio LRR em mapa genético de Coffea arabica.
Ano de publicação: | 2007
Fonte/Imprenta: | In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007.
Idioma: | Português
Conteúdo: | O Projeto Brasileiro do Genoma Café (PBGC) gerou um banco de dados de 200.000 ESTs (Expressed Sequence Tags). O banco de dados foi minerado por meio de análise in silico e 12009 seqüências potencialmente envolvidas na resistência do cafeeiro a doenças foram identificadas. A partir dessas seqüências foram desenhados 40 oligonucleotídeos, iniciadores específicos para amplificar seqüências do DNA genômico do cafeeiro. As condições de reação e amplificação dos iniciadores sintetizados foram ajustadas. Vinte e nove iniciadores amplificaram fragmentos de aproximadamente 400 pb, exibindo bandas únicas e bem definidas, e apenas um deles foi polimórfico entre os indivíduos resistentes e susceptíveis. O iniciador CARF 005 amplificou um fragmento nos 154 indivíduos F2 da população H464-2. Essa análise permitiu verificar o posicionamento desse marcador no grupo de ligação 9, a 36,2 cM do marcador K13c no mapa genético de Coffea arabica previamente desenvolvido com marcadores RAPD.
Palavras-Chave: | Genoma café; Oligonucleotídeos iniciadores específicos.
Thesaurus Nal: | Coffea.
Categoria do assunto: | --
URL: | http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/46989/1/Localizacao-de-marcador.pdf
Registro original: | Embrapa Café (CNPCa)
Exemplares: | CNPCa - (471-1) - UPC - AA - DD -  -  -  - DIS