| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Amazônia Oriental. Para informações adicionais entre em contato com cpatu.biblioteca@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
|
Data corrente: |
30/09/2014 |
|
Data da última atualização: |
19/10/2022 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
CHRISTOFFERSEN, B. O.; RESTREPO-COUPE, N.; ARAIN, M. A.; BAKER, I. T.; CESTARO, B. P.; CIAIS, P.; FISHER, J. B.; GALBRAITH, D.; GUAN, X.; GULDEN, L.; HURK, B. van den; ICHII, K.; IMBUZEIRO, H.; JAIN, A.; LEVINE, N.; MIGUEZ-MACHO, G.; POULTER, B.; ROBERTI, D. R.; SAKAGUCHI, K.; SAHOO, A.; SCHAEFER, K.; SHI, M.; VERBEECK, H.; YANG, Z.-L.; ARAUJO, A. C.; KRUIJT, B.; MANZI, A. O.; ROCHA, H. R. da; RANDOW, C. von; MUZA, M. N.; BORAK, J.; COSTA, M. H.; GONÇALVES, L. G. G. de; ZENG, X.; SALESKA, S. R. |
|
Afiliação: |
Bradley O. Christoffersen, University of Arizona; Natalia Restrepo-Coupe, University of Arizona / University of Technology, Sydney, Australia; M Altaf Arain, McMaster University; Ian T. Baker, Colorado State University; Bruno P. Cestaro, USP; Phillippe Ciais, LSCE CEA-CNRS-UVSQ, Orme des Merisiers; Joshua B. Fisher, California Institute of Technology; David Galbraith, University of Oxford / University of Leeds; Xiaodan Guan, The University of Texas at Austin; Lindsey Gulden, The University of Texas at Austin / ExxonMobil Upstream Research Company; Bart van den Hurk, Royal Netherlands Meteorological Institute (KNMI); Kazuhito Ichii, Fukushima University; Hewlley Imbuzeiro, UFV; Atul Jain, University of Illinois at Urbana-Champaign; Naomi Levine, Harvard University; Gonzalo Miguez-Macho, Universidade de Santiago de Compostela; Ben Poulter, Swiss Federal Research Institute WSL; Debora R. Roberti, UFSM; Koichi Sakaguchi, University of Arizona; Alok Sahoo, Center for Research on Environment and Water, IGES; Kevin Schaefer, University of Colorado at Boulder; Mingjie Shi, The University of Texas at Austin; Hans Verbeeck, Ghent University; Zong-Liang Yang, The University of Texas at Austin; ALESSANDRO CARIOCA DE ARAUJO, CPATU; Bart Kruijt, Wageningen University & Research Center; Antonio O. Manzi, INPA; Humberto R. da Rocha, USP; Celso von Randow, INPE; Michel N. Muza, University of Maryland, College Park, Hydrological Sciences Laboratory, NASA Goddard Space Flight Center; Jordan Borak, INPE; Marcos H. Costa, UFV; Luis Gustavo Gonçalves de Gonçalves, University of Maryland, College Park, Hydrological Sciences Laboratory, NASA Goddard Space Flight Center / INPE; Xubin Zeng, University of Arizona; Scott R. Saleska, University of Arizona. |
|
Título: |
Mechanisms of water supply and vegetation demand govern the seasonality and magnitude of evapotranspiration in Amazonia and Cerrado. |
|
Ano de publicação: |
2014 |
|
Fonte/Imprenta: |
Agricultural and Forest Meteorology, v. 191, p. 33-50, June 2014. |
|
DOI: |
10.1016/j.agrformet.2014.02.008 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Evapotranspiration (E) in the Amazon connects forest function and regional climate via its role in precipitation recycling However, the mechanisms regulating water supply to vegetation and its demand for water remain poorly understood, especially during periods of seasonal water deficits In this study, we address two main questions: First, how do mechanisms of water supply (indicated by rooting depth and groundwater) and vegetation water demand (indicated by stomatal conductance and intrinsic water use efficiency) control evapotranspiration (E) along broad gradients of climate and vegetation from equatorial Amazonia to Cerrado, and second, how do these inferred mechanisms of supply and demand compare to those employed by a suite of ecosystem models? We used a network of eddy covariance towers in Brazil coupled with ancillary measurements to address these questions With respect to the magnitude and seasonality of E, models have much improved in equatorial tropical forests by eliminating most dry season water limitation, diverge in performance in transitional forests where seasonal water deficits are greater, and mostly capture the observed seasonal depressions in E at Cerrado However, many models depended universally on either deep roots or groundwater to mitigate dry season water deficits, the relative importance of which we found does not vary as a simple function of climate or vegetation In addition, canopy stomatal conductance (gs) regulates dry season vegetation demand for water at all except the wettest sites even as the seasonal cycle of E follows that of net radiation In contrast, some models simulated no seasonality in gs, even while matching the observed seasonal cycle of E. We suggest that canopy dynamics mediated by leaf phenology may play a significant role in such seasonality, a process poorly represented in models Model bias in gs and E, in turn, was related to biases arising from the simulated light response (gross primary productivity, GPP) or the intrinsic water use efficiency of photosynthesis (iWUE). We identified deficiencies in models which would not otherwise be apparent based on a simple comparison of simulated and observed rates of E. While some deficiencies can be remedied by parameter tuning, in most models they highlight the need for continued process development of belowground hydrology and in particular, the biological processes of root dynamics and leaf phenology, which via their controls on E, mediate vegetation-climate feedbacks in the tropics. MenosEvapotranspiration (E) in the Amazon connects forest function and regional climate via its role in precipitation recycling However, the mechanisms regulating water supply to vegetation and its demand for water remain poorly understood, especially during periods of seasonal water deficits In this study, we address two main questions: First, how do mechanisms of water supply (indicated by rooting depth and groundwater) and vegetation water demand (indicated by stomatal conductance and intrinsic water use efficiency) control evapotranspiration (E) along broad gradients of climate and vegetation from equatorial Amazonia to Cerrado, and second, how do these inferred mechanisms of supply and demand compare to those employed by a suite of ecosystem models? We used a network of eddy covariance towers in Brazil coupled with ancillary measurements to address these questions With respect to the magnitude and seasonality of E, models have much improved in equatorial tropical forests by eliminating most dry season water limitation, diverge in performance in transitional forests where seasonal water deficits are greater, and mostly capture the observed seasonal depressions in E at Cerrado However, many models depended universally on either deep roots or groundwater to mitigate dry season water deficits, the relative importance of which we found does not vary as a simple function of climate or vegetation In addition, canopy stomatal conductance (gs) regulates dry season vegetation demand f... Mostrar Tudo |
|
Thesagro: |
Água; Cerrado; Evapotranspiração; Floresta Tropical. |
|
Thesaurus Nal: |
Amazonia. |
|
Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
|
Marc: |
LEADER 04155naa a2200601 a 4500
001 1996137
005 2022-10-19
008 2014 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1016/j.agrformet.2014.02.008$2DOI
100 1 $aCHRISTOFFERSEN, B. O.
245 $aMechanisms of water supply and vegetation demand govern the seasonality and magnitude of evapotranspiration in Amazonia and Cerrado.$h[electronic resource]
260 $c2014
520 $aEvapotranspiration (E) in the Amazon connects forest function and regional climate via its role in precipitation recycling However, the mechanisms regulating water supply to vegetation and its demand for water remain poorly understood, especially during periods of seasonal water deficits In this study, we address two main questions: First, how do mechanisms of water supply (indicated by rooting depth and groundwater) and vegetation water demand (indicated by stomatal conductance and intrinsic water use efficiency) control evapotranspiration (E) along broad gradients of climate and vegetation from equatorial Amazonia to Cerrado, and second, how do these inferred mechanisms of supply and demand compare to those employed by a suite of ecosystem models? We used a network of eddy covariance towers in Brazil coupled with ancillary measurements to address these questions With respect to the magnitude and seasonality of E, models have much improved in equatorial tropical forests by eliminating most dry season water limitation, diverge in performance in transitional forests where seasonal water deficits are greater, and mostly capture the observed seasonal depressions in E at Cerrado However, many models depended universally on either deep roots or groundwater to mitigate dry season water deficits, the relative importance of which we found does not vary as a simple function of climate or vegetation In addition, canopy stomatal conductance (gs) regulates dry season vegetation demand for water at all except the wettest sites even as the seasonal cycle of E follows that of net radiation In contrast, some models simulated no seasonality in gs, even while matching the observed seasonal cycle of E. We suggest that canopy dynamics mediated by leaf phenology may play a significant role in such seasonality, a process poorly represented in models Model bias in gs and E, in turn, was related to biases arising from the simulated light response (gross primary productivity, GPP) or the intrinsic water use efficiency of photosynthesis (iWUE). We identified deficiencies in models which would not otherwise be apparent based on a simple comparison of simulated and observed rates of E. While some deficiencies can be remedied by parameter tuning, in most models they highlight the need for continued process development of belowground hydrology and in particular, the biological processes of root dynamics and leaf phenology, which via their controls on E, mediate vegetation-climate feedbacks in the tropics.
650 $aAmazonia
650 $aÁgua
650 $aCerrado
650 $aEvapotranspiração
650 $aFloresta Tropical
700 1 $aRESTREPO-COUPE, N.
700 1 $aARAIN, M. A.
700 1 $aBAKER, I. T.
700 1 $aCESTARO, B. P.
700 1 $aCIAIS, P.
700 1 $aFISHER, J. B.
700 1 $aGALBRAITH, D.
700 1 $aGUAN, X.
700 1 $aGULDEN, L.
700 1 $aHURK, B. van den
700 1 $aICHII, K.
700 1 $aIMBUZEIRO, H.
700 1 $aJAIN, A.
700 1 $aLEVINE, N.
700 1 $aMIGUEZ-MACHO, G.
700 1 $aPOULTER, B.
700 1 $aROBERTI, D. R.
700 1 $aSAKAGUCHI, K.
700 1 $aSAHOO, A.
700 1 $aSCHAEFER, K.
700 1 $aSHI, M.
700 1 $aVERBEECK, H.
700 1 $aYANG, Z.-L.
700 1 $aARAUJO, A. C.
700 1 $aKRUIJT, B.
700 1 $aMANZI, A. O.
700 1 $aROCHA, H. R. da
700 1 $aRANDOW, C. von
700 1 $aMUZA, M. N.
700 1 $aBORAK, J.
700 1 $aCOSTA, M. H.
700 1 $aGONÇALVES, L. G. G. de
700 1 $aZENG, X.
700 1 $aSALESKA, S. R.
773 $tAgricultural and Forest Meteorology$gv. 191, p. 33-50, June 2014.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Gado de Leite. Para informações adicionais entre em contato com cnpgl.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
|
Data corrente: |
20/01/2017 |
|
Data da última atualização: |
20/01/2017 |
|
Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
|
Autoria: |
MENDONÇA, J. F. M. de. |
|
Afiliação: |
JULIANA FRANÇA MONTEIRO DE MENDONÇA. |
|
Título: |
Detecção de células viáveis de Salmonella spp. e Staphylococcus aureus em queijo de coalho pela técnica de PCR em tempo real. |
|
Ano de publicação: |
2016 |
|
Fonte/Imprenta: |
2016. |
|
Páginas: |
70 f. |
|
Idioma: |
Português |
|
Notas: |
Dissertação (Mestrado em Ciência e Tecnologia do Leite e Derivados) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Juiz de Fora, MG. Orientadora, Marta Fonseca Martins, Embrapa Gado de Leite. Co-orientador, João Batista Ribeiro, Embrapa Gado de Leite. |
|
Conteúdo: |
Resumo: Em muitos casos, o leite e seus derivados são responsáveis por causar doenças transmitidas por alimentos pela veiculação de micro-organismos, como Salmonella spp. e Staphylococcus aureus. A contaminação desses produtos pode ocorrer, principalmente, devido ao processamento térmico ineficiente ou à falta de observação das práticas de higiene e limpeza durante as diversas etapas do processo produtivo, como na manipulação do alimento ou, até mesmo, após o tratamento térmico. Assim, a identificação rápida de patógenos presentes em alimentos é de extrema importância, tanto para a garantia da qualidade dos produtos, quanto em casos de surtos. Nestes casos o uso de métodos altamente sensíveis e específicos para detectar patógenos alimentares se torna indispensável. Uma das técnicas que tem sido utilizada para este fim é a PCR em Tempo Real (qPCR), devido a sua rapidez e eficiência na identificação de patógenos em alimentos. Contudo, uma das grandes desvantagens dessa técnica é a sua incapacidade em diferenciar o DNA de células viáveis e inviáveis dos patógenos. Para suplantar tal ponto, o brometo de etídeo monoazida (EMA) pode ser usado para detectar somente células viáveis. O EMA é um intercalante de DNA que pode entrar seletivamente em células com membrana danificada (consideradas inviáveis) e se ligar covalentemente ao seu DNA, quando exposto à luz halógena, inibindo sua amplificação durante a qPCR. Desse modo, o objetivo do presente trabalho foi estabelecer um protocolo para detecção em multiplex de células viáveis de Salmonella spp. e S. aureus em culturas puras e em Queijo de Coalho pelo uso do EMA combinado à qPCR. O protocolo estabelecido foi eficaz para a identificação de células viáveis de Salmonella spp., tanto em culturas puras quanto em Queijo de Coalho. Entretanto, foi observado que a diferenciação de células viáveis e inviáveis de S. aureus pelo uso do EMA não foi eficiente. Portanto, não foi possível realizar a detecção de células viáveis dos patógenos em multiplex em culturas puras e em Queijo de Coalho. Além disso, observou-se que o protocolo estabelecido, combinando a técnica de qPCR aliada ao uso do EMA, foi capaz de detectar concentrações tão baixas de células viáveis de Salmonella typhimurium quanto 101 UFC/10g de Queijo de Coalho. Contudo, somente foi possível diferenciar estatisticamente as médias dos valores de Cycle threshold (Ct) em concentrações de células superiores a 103 UFC/10 g de queijo. O protocolo desenvolvido é, portanto, uma ferramenta útil para a vigilância de alimentos, uma vez que fornece identificação rápida e específica de células viáveis de Salmoenlla spp. em Queijo de Coalho. MenosResumo: Em muitos casos, o leite e seus derivados são responsáveis por causar doenças transmitidas por alimentos pela veiculação de micro-organismos, como Salmonella spp. e Staphylococcus aureus. A contaminação desses produtos pode ocorrer, principalmente, devido ao processamento térmico ineficiente ou à falta de observação das práticas de higiene e limpeza durante as diversas etapas do processo produtivo, como na manipulação do alimento ou, até mesmo, após o tratamento térmico. Assim, a identificação rápida de patógenos presentes em alimentos é de extrema importância, tanto para a garantia da qualidade dos produtos, quanto em casos de surtos. Nestes casos o uso de métodos altamente sensíveis e específicos para detectar patógenos alimentares se torna indispensável. Uma das técnicas que tem sido utilizada para este fim é a PCR em Tempo Real (qPCR), devido a sua rapidez e eficiência na identificação de patógenos em alimentos. Contudo, uma das grandes desvantagens dessa técnica é a sua incapacidade em diferenciar o DNA de células viáveis e inviáveis dos patógenos. Para suplantar tal ponto, o brometo de etídeo monoazida (EMA) pode ser usado para detectar somente células viáveis. O EMA é um intercalante de DNA que pode entrar seletivamente em células com membrana danificada (consideradas inviáveis) e se ligar covalentemente ao seu DNA, quando exposto à luz halógena, inibindo sua amplificação durante a qPCR. Desse modo, o objetivo do presente trabalho foi estabelecer um protocolo ... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Derivados Lácteos; Doenças Transmitidas por Alimentos; Intercalantes de DNA; Micro-organismos patogênicos; Viabilidade Celular. |
|
Categoria do assunto: |
Q Alimentos e Nutrição Humana |
|
Marc: |
LEADER 03605nam a2200193 a 4500
001 2061337
005 2017-01-20
008 2016 bl uuuu m 00u1 u #d
100 1 $aMENDONÇA, J. F. M. de
245 $aDetecção de células viáveis de Salmonella spp. e Staphylococcus aureus em queijo de coalho pela técnica de PCR em tempo real.
260 $a2016.$c2016
300 $a70 f.
500 $aDissertação (Mestrado em Ciência e Tecnologia do Leite e Derivados) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Juiz de Fora, MG. Orientadora, Marta Fonseca Martins, Embrapa Gado de Leite. Co-orientador, João Batista Ribeiro, Embrapa Gado de Leite.
520 $aResumo: Em muitos casos, o leite e seus derivados são responsáveis por causar doenças transmitidas por alimentos pela veiculação de micro-organismos, como Salmonella spp. e Staphylococcus aureus. A contaminação desses produtos pode ocorrer, principalmente, devido ao processamento térmico ineficiente ou à falta de observação das práticas de higiene e limpeza durante as diversas etapas do processo produtivo, como na manipulação do alimento ou, até mesmo, após o tratamento térmico. Assim, a identificação rápida de patógenos presentes em alimentos é de extrema importância, tanto para a garantia da qualidade dos produtos, quanto em casos de surtos. Nestes casos o uso de métodos altamente sensíveis e específicos para detectar patógenos alimentares se torna indispensável. Uma das técnicas que tem sido utilizada para este fim é a PCR em Tempo Real (qPCR), devido a sua rapidez e eficiência na identificação de patógenos em alimentos. Contudo, uma das grandes desvantagens dessa técnica é a sua incapacidade em diferenciar o DNA de células viáveis e inviáveis dos patógenos. Para suplantar tal ponto, o brometo de etídeo monoazida (EMA) pode ser usado para detectar somente células viáveis. O EMA é um intercalante de DNA que pode entrar seletivamente em células com membrana danificada (consideradas inviáveis) e se ligar covalentemente ao seu DNA, quando exposto à luz halógena, inibindo sua amplificação durante a qPCR. Desse modo, o objetivo do presente trabalho foi estabelecer um protocolo para detecção em multiplex de células viáveis de Salmonella spp. e S. aureus em culturas puras e em Queijo de Coalho pelo uso do EMA combinado à qPCR. O protocolo estabelecido foi eficaz para a identificação de células viáveis de Salmonella spp., tanto em culturas puras quanto em Queijo de Coalho. Entretanto, foi observado que a diferenciação de células viáveis e inviáveis de S. aureus pelo uso do EMA não foi eficiente. Portanto, não foi possível realizar a detecção de células viáveis dos patógenos em multiplex em culturas puras e em Queijo de Coalho. Além disso, observou-se que o protocolo estabelecido, combinando a técnica de qPCR aliada ao uso do EMA, foi capaz de detectar concentrações tão baixas de células viáveis de Salmonella typhimurium quanto 101 UFC/10g de Queijo de Coalho. Contudo, somente foi possível diferenciar estatisticamente as médias dos valores de Cycle threshold (Ct) em concentrações de células superiores a 103 UFC/10 g de queijo. O protocolo desenvolvido é, portanto, uma ferramenta útil para a vigilância de alimentos, uma vez que fornece identificação rápida e específica de células viáveis de Salmoenlla spp. em Queijo de Coalho.
653 $aDerivados Lácteos
653 $aDoenças Transmitidas por Alimentos
653 $aIntercalantes de DNA
653 $aMicro-organismos patogênicos
653 $aViabilidade Celular
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|
