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Biblioteca(s):  Embrapa Agricultura Digital.
Data corrente:  08/01/2010
Data da última atualização:  15/01/2020
Tipo da produção científica:  Resumo em Anais de Congresso
Autoria:  GIACHETTO, P. F.; SANTOS, E. H. dos; KUSER-FALCÃO, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.
Afiliação:  POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; EDGARD HENRIQUE DOS SANTOS, CNPTIA; PAULA REGINA KUSER-FALCAO, CNPTIA; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA.
Título:  Identification of cattle-tick interaction-related genes by means of transcript co-expression analysis.
Ano de publicação:  2009
Fonte/Imprenta:  In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55., 2009, Águas de Lindóia, SP. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2009.
Páginas:  p. 211.
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Given the existence of microarray data obtained from cattle exposed to the tick Riphicephalus (Boophilus) microplus (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo), this study used a co-expression based analysis in search for new genes that may be involved in the host-parasite resistance mechanism. This approach is based on the assumption that co-expressed genes may be involved in the same biological pathway, with similar or related function. Two bovine microarray data sets (Affymetrix platform) were included in this study. Raw data were processed using the Affy package developed for the R programm. The background was corrected by RMA and normalization made by the quantile method.
Palavras-Chave:  Bioinformática; Cattle-tick interaction related genes.
Thesagro:  Genética.
Thesaurus Nal:  Bioinformatics; Microarray technology; Rhipicephalus microplus.
Categoria do assunto:  --
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPTIA14437 - 2UPCRA - DD
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41.Imagem marcado/desmarcadoHERAI, R. H.; SANTOS, E. H. dos; YAMAGISHI, M. E. B. Algoritmos de bioinformática para detecção de nullomers no transcriptoma humano. In: ENCONTRO ACADÊMICO DE MODELAGEM COMPUTACIONAL, 2.,2009, Petrópolis. Resumos... Petrópolis: Laboratório nacional de computação científica, 2009. p. 35-36. IIEAMC/LNCC 2009.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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42.Imagem marcado/desmarcadoMANCINI, A. L.; HIGA, R. H.; FALCÃO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; NESHICH, G. Cálculo de possíveis contatos atômicos internos a uma proteína ou entre proteínas no software SMS. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2003. 8 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado Técnico, 59).
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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43.Imagem marcado/desmarcadoNARCISO, M. G.; YAMAGISHI, M. E. B.; KUSER-FALCAO, P. R. ConvolutionTR: comprehensive study of SNPs within tandem repeats. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 20., 2012, San Diego. Abstract... Jersey City: Scherago International, 2012. Não paginado.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Arroz e Feijão.
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44.Imagem marcado/desmarcadoVIEIRA, F. D.; AGOSTINHO, G. C.; REGITANO, L. C. A.; YAMAGISHI, M. E. B. Database modeling and web interface system: on-line genomic association studies. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book... Angra dos Reis: ABBCB, 2009. Não paginado. X-Meeting 2009.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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45.Imagem marcado/desmarcadoCARDOSO, F. F.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; HIGA, R. H. Statistical tools to uncover genetic architecture of tick resistance using highdensity oligonucleotide gene expression microarrays. In: SÃO PAULO ADVANCED SCHOOL OF SCIENCE, 1., 2011, São Carlos, SP. Advances in the knowledge of parasite resistance of ruminant hosts and parasites: proceedings. São São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste, 2011. p. 34-38.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sul.
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46.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; FALCÃO, P. R. K.; VIEIRA, F. D.; HERAI, R. H. An indirect evidence of the Fibonacci String model for DNA repetitive sequence growth. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 3., 2007, São Paulo. Proceedings... Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2007. p. 58. X-Meeting 2007.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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47.Imagem marcado/desmarcadoARBEX, W.; CARVALHO, L. A. V. de; SILVA, M. V. B. da; YAMAGISHI, M. E. B. Modelagem difusa para suporte à decisão na descoberta de SNPs em sequências de cDNA. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROINFORMÁTICA, 7., 2009, Viçosa, MG. Anais... Viçosa, MG: UFV, 2009. Não paginado. SBIAgro 2009.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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48.Imagem marcado/desmarcadoLACERDA, T. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; FACO, O.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R. Identificação de polimorfimos de base única (SNPs) em genes relacionados à taxa de ovulação em ovinos. In. CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. Resumo. 708. 1 CD-ROM.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos.
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49.Imagem marcado/desmarcadoLACERDA, T. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; FACÓ, O.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R. Identificação de polimorfimos de base única (SNPs) em genes relacionados à taxa de ovulação em ovinos. In. CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. Não paginado. Resumo 708.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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50.Imagem marcado/desmarcadoGIACHETTO, P. F.; SANTOS, E. H. dos; YAMAGISHI, M. E. B. Identificando redes gênicas a partir de dados de expressão de microarranjos. In: SIMPÓSIO SOBRE INOVAÇÃO E CRIATIVIDADE CIENTÍFICA NA EMBRAPA, 2., 2010, Brasília, DF. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2010. Não paginado. Pôster 92.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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51.Imagem marcado/desmarcadoGIACHETTO, P. F.; SANTOS, E. H. dos; KUSER-FALCÃO, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B. Identification of cattle-tick interaction-related genes by means of transcript co-expression analysis. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55., 2009, Águas de Lindóia, SP. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2009. p. 211.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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52.Imagem marcado/desmarcadoIBELLE, A. M. G.; REGITANO, L. C. de A.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B. Identification of genes involved in cattle-tick response mechanism by differentiall co-expression. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA, 3., 2010, Forlaleza. Programas e resumos... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Biotecnologia, 2010. p. 305.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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53.Imagem marcado/desmarcadoIBELLI, A. M. G.; REGITANO, L. C. de A.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B. Identification of genes involved in cattle-tick response mechanism by differentiall co-expression. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA, 3., 2010, Forlaleza. Programas e resumos... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Biotecnologia, 2010. p. 305.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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54.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, G. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; YAMAGISHI, M. E. B. Reconstructing the whole mitochondrial DNA (mtDNA) from nuclear genome. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 11.; BRAZILIAN SYMPOSIUM OF BIOINFORMATICS, 2015, São Paulo. Proceedings... [S.l.]: AB3C, 2015. p. 42. X-meeting 2015.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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55.Imagem marcado/desmarcadoBOARETO, M.; YAMAGISHI, M. E. B.; CATICHA, N.; LEITE, V. B. P. Relationship between global structural parameters and Enzyme Commission hierarchy: implications for function prediction. Computational Biology and Chemistry, Oxford, v. 40, p. 15-19, 2012.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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56.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H.; FERNANDES, M. A. C.; YAMAGISHI, M. E. B. Plataforma de bancos de dados e ferramentas para visualização de dados moleculares no contexto genômico. In: WORKSHOP EM GENÔMICA ANIMAL, 1., 2009, Fortaleza. Resumos... Fortaleza: UECE, 2009. Não paginado.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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57.Imagem marcado/desmarcadoBOARETO, M.; LEITE, V. B. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; CATICHA, N. Predição de classes de enzimas usando método de agrupamento super-paramagnético. In: ENCONTRO NACIONAL DE FÍSICA DE MATÉRIA CONDENSADA, 31., 2008, Águas de Lindóia. São Paulo: SBF, 2008. Não paginado.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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58.Imagem marcado/desmarcadoBOARETO, M.; YAMAGISHI, M. E. B.; CATICHA, N.; LEITE, V. B. P. Predicting enzyme class from protein structure using super paramagnetic cluster. In: INTERNATIONAL WORKSHOP ON BAYESIAN INFERENCE AND MAXIMUM ENTROPY METHODS IN SCIENCE AND ENGINEERING, 28., 2008, São Sebastião, SP. Proceedings... São Paulo: USP, 2008. Não paginado. MaxEnt 2008.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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59.Imagem marcado/desmarcadoVENÂNCIO, F. C.; MEYER, J. F. C. A.; YAMAGISHI, M. E. B. Visualização das superfícies de interação em complexos protéicos através de transformações conformacionais. In: CONGRESSO NACIONAL DE MATEMÁTICA APLICADA E COMPUTACIONAL, 27., 2004, Porto Alegre. Anais... Porto Alegre: PUC-RS, 2004. Não paginado.
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60.Imagem marcado/desmarcadoCIRÍACO, A. L. de S.; SOUSA, T. F.; QUEIROZ, C. A. de; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, G. F. da. Análise in silico do potencial metabólico de Streptomyces APUR 36.1 isolada de sedimentos do Rio Purus. In: SIMPÓSIO DE BIOTECNOLOGIA DA UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS, 1., 2022, Manaus. Anais [recurso eletrônico]: resumos expandidos. Manaus: EDUA, 2022. p. 36.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.
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