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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
27/12/2016 |
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Data da última atualização: |
07/06/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
PEZENTI, L. F.; GONÇALVES, K. B.; SOUZA, R. F.; VILAS-BOAS, L. A.; SOSA-GOMEZ, D. R.; ROSA, R. da. |
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Afiliação: |
DANIEL RICARDO SOSA GOMEZ, CNPSO. |
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Título: |
Montagem de novo do transcriptoma de Anticarsia gemmatalis. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
In: ENCONTRO PARANAENSE DE GENÉTICA, 13., GENÉTICA NAS FÉRIAS, 10., 2016. Tempos modernos: anais. Londrina: UEL, 2016. |
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Páginas: |
p. 43. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Anticarsia gemmatalis Hübner 1818 (Lepidoptera: Noctuidae), conhecida como lagarta-da-soja é a desfolhadora mais comum da soja no Brasil, ocasionando perdas consideráveis na produtividade da cultura. Informações relevantes têm sido obtidas a respeito das bases genéticas e fisiológicas associadas à resistência de insetos a vários tipos de inseticidas, através da aplicação de técnicas moleculares para determinar padrões de expressão gênica. Entre elas, destaca-se o RNA-seq que permite quantificar o nível de expressão gênica, além de analisar a estrutura do transcriptoma sem a necessidade de um conhecimento prévio do genoma estudado. Dessa maneira, neste trabalho foram obtidos os transcritos de diferentes populações de A. gemmatalis (resistentes e suscetíveis, tratadas e não-tratadas com a proteína bioinseticida de Bacillus thuringiensis - Cry1Ac), e analisados o seu perfil transcricional através do RNA-seq. Foram construídas doze bibliotecas de cDNA (protocolo Illumina TruSeq Stranded mRNA LS) a partir de doze amostras de RNA extraídas conforme protocolo adaptado utilizando TRIzol® Reagent e o SV Total RNA Isolation System Promega. O sequenciamento foi realizado na plataforma Illumina HiSeq 2500 V4 com leitura paired-end de 125pb. A qualidade dos reads obtidos foram verificados com FastQC v0.11.4, e trimados com Prinseq v0.20.4. A montagem do transcriptoma foi realizada na plataforma Trinity v2.2.0 com a estratégia de novo, pois não existe um genoma de referência para o mapeamento dos transcritos e construção de contigs. Os transcritos de uma das bibliotecas foram anotados e categorizados usando o software Blast2go v3.2.7, logo após a busca por similaridade dos transcritos contra banco de dados. O transcriptoma das doze bibliotecas de A. gemmatalis apresentou 754.280 transcritos, montados a partir de 503.590.692 reads, com uma média de 41.965.891 milhões de reads por biblioteca, e N50 variando de 1146 a 1520. Os dados apresentados são preliminares, porém este estudo nos permite reportar a montagem do transcriptoma de A. gemmatalis e apresentar dados preliminares de anotação funcional. Estes resultados abrem novas perspectivas para o estudo genômico de A. gemmatalis, e possibilitará a posterior identificação de genes candidatos relacionados aos mecanismos de resistência de importantes pragas agrícolas. MenosAnticarsia gemmatalis Hübner 1818 (Lepidoptera: Noctuidae), conhecida como lagarta-da-soja é a desfolhadora mais comum da soja no Brasil, ocasionando perdas consideráveis na produtividade da cultura. Informações relevantes têm sido obtidas a respeito das bases genéticas e fisiológicas associadas à resistência de insetos a vários tipos de inseticidas, através da aplicação de técnicas moleculares para determinar padrões de expressão gênica. Entre elas, destaca-se o RNA-seq que permite quantificar o nível de expressão gênica, além de analisar a estrutura do transcriptoma sem a necessidade de um conhecimento prévio do genoma estudado. Dessa maneira, neste trabalho foram obtidos os transcritos de diferentes populações de A. gemmatalis (resistentes e suscetíveis, tratadas e não-tratadas com a proteína bioinseticida de Bacillus thuringiensis - Cry1Ac), e analisados o seu perfil transcricional através do RNA-seq. Foram construídas doze bibliotecas de cDNA (protocolo Illumina TruSeq Stranded mRNA LS) a partir de doze amostras de RNA extraídas conforme protocolo adaptado utilizando TRIzol® Reagent e o SV Total RNA Isolation System Promega. O sequenciamento foi realizado na plataforma Illumina HiSeq 2500 V4 com leitura paired-end de 125pb. A qualidade dos reads obtidos foram verificados com FastQC v0.11.4, e trimados com Prinseq v0.20.4. A montagem do transcriptoma foi realizada na plataforma Trinity v2.2.0 com a estratégia de novo, pois não existe um genoma de referência para o mapeam... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Lagarta-da-soja; Transcriptoma. |
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Thesagro: |
Genética; RNA. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/152327/1/Anais.2016.p.43.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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| Registros recuperados : 304 | |
| 161. |  | REATTO, A.; MARTINS, E. de S.; FARIAS, M. F. R.; SILVA, A. V. da; BLOISE, G. L. F.; CARDOSO, E. A. Aptidão agrícola das terras da margem direita do Córrego Divisa, Bacia do São Bartolomeu-DF, escala 1:10.000. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2002. 16 p. (Embrapa Cerrados. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 49).| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 162. | | BENITES, V. de M.; TANNUS, V. R.; MENEZES, J. F. S.; SIMON, G. A.; COSTA, K. A. de P.; MARTINS, E. de S. Avaliação da capacidade de extração de nutrientes por plantas de cobertura, adubadas com pó de rocha obtido a partir da brecha alcalina de Santo Antônio da Barra-GO. Centro Tecnológico COMIGO Resultados 2009, Goiânia, p. 56-57, 2009.| Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 163. | | SOUZA, F. P. de; MARTINS, E. de S.; KRAHL, L. L.; VIEIRA, E. A.; FIALHO, J. de F.; RIBEIRO, G. S. Avaliação do uso de pó de rocha no desempenho de duas variedades de mandioca de mesa. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ROCHAGEM, 2., 2013, Poços de Caldas. Anais... Visconde do Rio Branco: Suprema, 2013. p. 109-114| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 165. | | RAMALHO, L. de S.; COUTO JUNIOR, A. F.; GOMES, M. P.; BRAGA, A. R. dos S.; MARTINS, E. de S.; THOME, I. de M.; REIS, A. M. Avaliação temporal da cobertura do solo da Bacia Experimental do Sarandi (DF). In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA CERRADOS, 2012, Planaltina, DF. Jovens Talentos 2012: resumos. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2012. (Embrapa Cerrados. Documentos, 313). p. 77| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 166. | | ARAUJO, R.; ANDRADE, L. R. M.; COELHO, D. M.; FERREIRA, E. A. B.; RODRIGUES, L. O.; MARTINS, E. de S.; MENDES, I. C. Avaliacao da rocha carbonatada como corretivo de acidez do solo. In: ENCONTRO DE JOVENS TALENTOS DA EMBRAPA CERRADOS: CONSTRUINDO O CONHECIMENTO DO FUTURO, 1., 2000, Planaltina, DF. Resumos. Planaltina: Embrapa Cerrados, 2000. p.25. (Embrapa Cerrados. Documentos, 14).| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 167. | | KRAHL, L. L.; MARCHI, G.; PAZ, S. P. A.; ANGÉLICA, R. S.; SOUZA-SILVA, J. C.; VALADARES, L. F.; MARTINS, E. de S. Increase in cation exchange capacity by the action of maize rhizosphere on Mg or Fe biotite-rich rocks. Aumento na capacidade de troca de cátions em rochas biotitas ricas em Mg ou Fe pela ação da rizosfera do milho. Pesquisa Agropecuária Tropical, v. 52, e72376, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 168. | | BRAGA, F. C. S.; LEITE, A. A. da S.; OLIVEIRA, M. A. de; MARTINS, E. de S.; GABOS, M. B.; ANGÉLICA, R. S. K-alternative fertilizer project: biotite-bearing ultrapotassic deposit in Bahia State. In: WORLD FERTILIZER CONGRESS OF CIEC, 16., 2014, Rio de Janeiro. Technological innovation for a sustainable tropical agriculture: proceedings. Rio de Janeiro: International Scientific Centre of Fertilizers, 2014. p. 164-166.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 169. | | BRAGA, F. C. S.; LEITE, A. A. da S.; ANGÉLICA, R. S.; MARTINS, E. de S.; OLIVEIRA, M. I. L. de; WENDER, I. G. K-alternative fertilizer project: utrapotassic syenite deposit in Pernambuco State. In: WORLD FERTILIZER CONGRESS OF CIEC, 16., 2014, Rio de Janeiro. Technological innovation for a sustainable tropical agriculture: proceedings. Rio de Janeiro: International Scientific Centre of Fertilizers, 2014. p. 167-169.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 170. | | CARVALHO JÚNIOR, O. A. de; GUIMARÃES, R. F.; MONTGOMERY, D. R.; GILLESPIE, A. R.; GOMES, R. A. T.; MARTINS, E. de S.; SILVA, N. C. Karst depression detection using ASTER, ALOS/PRISM and SRTM-Derived digital elevation models in the Bambuí Group, Brazil. Remote sensing, v. 6, p. 330-351, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 171. | | OLIVEIRA, M. A. de; LEITE, A. A. da S.; NOVAES, L. A. A.; ANGÉLICA, R. S.; OLIVEIRA, M. I. L. de; MARTINS, E. de S. K, Ca and Mg-bearing agrominerals from ultramafic rocks: soil conditioners and k-fertilizers source. In: WORLD FERTILIZER CONGRESS OF CIEC, 16., 2014, Rio de Janeiro. Technological innovation for a sustainable tropical agriculture: proceedings. Rio de Janeiro: International Scientific Centre of Fertilizers, 2014. p. 170-172.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 173. | | LEITE, A. A. da S.; OLIVEIRA, M. A. de; ALVES, C. A. L.; GABOS, M. B.; MARTINS, E. de S.; ANGÉLICA, R. S. K-silicate from the ultrapotassic rocks of the Brazilian Cerrado. In: WORLD FERTILIZER CONGRESS OF CIEC, 16., 2014, Rio de Janeiro. Technological innovation for a sustainable tropical agriculture: proceedings. Rio de Janeiro: International Scientific Centre of Fertilizers, 2014. p. 173-175.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 174. | | REATTO, A.; MARTINS, E. de S.; FARIAS, M. F. R.; SILVA, A. V. da; SPERA, S. T.; CARVALHO JÚNIOR, O. A. de; GUIMARÃES, R. F. Levantamento pedológico da bacia hidrográfica do Ribeirão Taguatinga, DF, escala 1:25.000. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2004. 54 p. (Embrapa Cerrados. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 135).| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 175. | | LIMA, A. A. de S.; BRAGA, A. R. dos S.; MARTINS, E. de S.; MESSIAS, A.; COUTO JÚNIOR, A. F.; RAMALHO, L. S.; THOMÉ, I.; ROIG, H. L. Levantamento preliminar de solos da Bacia Experimental do Sarandi, DF, escala 1:30:000. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA CERRADOS, 2012, Planaltina, DF. Jovens Talentos 2012: resumos. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2012. (Embrapa Cerrados. Documentos, 313). p. 32 (Embrapa Cerrados. Documentos, 313).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 176. | | MARTINS, E. de S.; CARVALHO JÚNIOR, O. A. de; SOUZA, V. V. de; COUTO JÚNIOR, A. F.; OLIVEIRA, S. N. de; GOMES, R. A. T.; REATTO, A. Levantamento de reconhecimento de média intensidade dos solos do Parque Nacional da Serra dos Órgãos - Parnaso, Rio de Janeiro, escala 1:100.000. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2008. (Embrapa Cerrados. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 209).| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 177. | | REATTO, A.; MARTINS, E. de S.; CARDOSO, E. A.; SPERA, S. T.; CARVALHO JÚNIOR.; O. A. de; GUIMARÃES, R.; SILVA, A. V. da; FARIAS, M. F. R. Levantamento de reconhecimento de solos de alta intensidade do alto curso do Rio Descoberto, DF/GO, escala 1:100.000. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2003. 55 p. (Embrapa Cerrados. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 92).| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 179. | | REATTO, A.; CORREIA, J. R.; SPERA, S. T.; CHAGAS, C. da S.; MARTINS, E. de S.; ANDAHUR, J. P.; GODOY, M. J. S.; ASSAD, M. L. C. L. Levantamento semidetalhado dos solos da bacia Rio Jardim-DF escala 1:50.000. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2000. 1 CD-ROM. (Embrapa Cerrados. Boletim de Pesquisa, 18).| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 180. | | FARIAS, M. F. R.; CARVALHO, A. P. F. de; MARTINS, E. de S.; CARVALHO JÚNIOR, O. A. de; REATTO, A.; GOMES, R. A. T. Levantamento de solos do Parque Nacional de Brasília, escala 1:50.000. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2008. (Embrapa Cerrados. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 220).| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
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