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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
24/10/2013 |
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Data da última atualização: |
24/10/2013 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SILVA, F. F. e; VIANA, J. M. S.; FARIA, V. R.; RESENDE, M. D. V. de. |
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Afiliação: |
Fabyano Fonseca e Silva, UFV; José Marcelo Soriano Viana, UFV; Vinícius Ribeiro Faria, UFV; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF. |
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Título: |
Bayesian inference of mixed models in quantitative genetics of crop species. |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
Theoretical and Applied Genetics, v. 126, p. 1749-1761, 2013. |
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DOI: |
10.1007/s00122-013-2089-6 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The objectives of this study were to implement a Bayesian framework for mixed models analysis in crop species breeding and to exploit alternatives for informative prior elicitation. Bayesian inference for genetic evaluation in annual crop breeding was illustrated with the first two half-sib selection cycles in a popcorn population. The Bayesian framework was based on the Just Another Gibbs Sampler software and the R2jags package. For the first cycle, a non-informative prior for the inverse of the variance components and an informative prior based on meta-analysis were used. For the second cycle, a noninformative prior and an informative prior defined as the posterior from the non-informative and informative analyses of the first cycle were used. Regarding the first cycle, the use of an informative prior from the meta-analysis provided clearly distinct results relative to the analysis with a non-informative prior only for the grain yield. Regarding the second cycle, the results for the expansion volume and grain yield showed differences among the three analyses. The differences between the non-informative and informative prior analyses were restricted to variance components and heritability. The correlations between the predicted breeding values from these analyses were almost perfect. |
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Palavras-Chave: |
Bayesian inference; BLUP; Genética quantitativa; Inferência Bayesiana; Mixed models; Modelo mixto; REML. |
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Thesaurus Nal: |
quantitative genetics. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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| 22. |  | VALENTE, M. S.; VIANA, J. M. S.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; LOPES, M. T. G. Seleção genômica para melhoramento vegetal com diferentes estruturas populacionais. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 51, n. 11, p. 1857-1867, nov. 2016. Título em inglês: Genomic selection for plant breeding with different population structures.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 23. | | BONOMO, P.; CRUZ, C. D.; VIANA, J. M. S.; PEREIRA, A. A.; OLIVEIRA, V. R.; CARNEIRO, P. C. S. Seleção antecipada de progênies de café descendentes de "híbrido de Timor" x "Catuaí Amarelo" e "Catuaí Vermelho". Acta Scientiarum Agronomy, Maringá, v. 26, n. 1, p. 97-96, 2004.| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 25. | | TRINDADE, R. dos S.; RODRIGUES, R.; AMARAL JÚNIOR, A. T. do; GONÇALVES, L. S. A.; VIANA, J. M. S.; SUDRÉ, C. P. Combining ability for common bacterial blight resistance in snap and dry bean (Phaseolus vulgaris L.). Acta Scientiarum. Agronomy, Maringá, v. 37, n. 1, p. 37-43, jan./mar. 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 26. | | SAWAZAKI, E.; GALLO, P. B.; CASTRO, J. L.; SAWAZAKI, H. E.; DUARTE, A.; VIANA, J. M. S.; MIRANDA, G. V.; PACHECO, C. A. P. Comportamento de genótipos de milho pipoca na região Centro-Sul do Estado de São Paulo. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 26.; SIMPÓSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 2.; SIMPÓSIO SOBRE COLLETOTRICHUM GRAMINICOLA, 1., 2006, Belo Horizonte, Inovação para sistemas integrados de produção: trabalhos apresentados. [Sete Lagoas]: ABMS, 2006. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 27. | | SAWAZAKI, E.; GALLO, P. B.; CASTRO, J. L.; SAWAZAKI, H. E.; DUARTE, A.; VIANA, J. M. S.; MIRANDA, G. V.; PACHECO, C. A. P. Comportamento de genótipos de milho pipoca na região Centro-Sul do Estado de São Paulo. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 26.; SIMPÓSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 2.; SIMPÓSIO SOBRE COLLETOTRICHUM GRAMINICOLA, 1., 2006, Belo Horizonte. Inovação para sistemas integrados de produção: resumos. Sete Lagoas: ABMS: Embrapa Milho e Sorgo, 2006. p. 257.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 29. | | MARIGUELE, K. H.; RESENDE, M. D. V. de; VIANA, J. M. S.; SILVA, F. F. e; SILVA, P. S. L. de; KNOP, F. de C. Métodos de análise de dados longitudinais para o melhoramento genético da pinha. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v. 46, n. 12, p. 1657-1664, dez. 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 30. | | AZEVEDO, C. F.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; VIANA, J. M. S.; VALENTE, M. S. F.; RESENDE JUNIOR, M. F. R.; MUÑOZ, P. Ridge, Lasso and Bayesian additive dominance genomic models. BMC Genetics, v. 16, art. 105, Aug. 2015. 13 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 31. | | PINTO, V. B.; FERREIRA, P. G.; VIDIGAL, P. M. P.; MENDES, T. A. de O.; DAL-BIANCO, M.; MAGALHAES, J. V. de; VIANA, J. M. S. Uncovering the transcriptional response of popcorn (Zea mays L. var. everta) under long-term aluminum toxicity. Scientific Reports, v. 11, 19644, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 32. | | LIMA, L. P.; AZEVEDO, C. F.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; VIANA, J. M. S.; OLIVEIRA, E. J. de. Triple categorical regression for genomic selection: application to cassava breeding. Scientia Agricola, v. 76, n. 5, p. 368-375, Sept./Oct. 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 33. | | VIANA, J. M. S.; DELIMA, R. O.; FARIA, V. R.; MUNDIM, G. B.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e. Relevance of pedigree, historical data, dominance, and data unbalance for selection efficiency. Agronomy Journal, v. 104, n. 3, p. 722-728, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 35. | | AZEVEDO, C. F.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F.; VIANA, J. M. S.; VALENTE, M. S. F.; RESENDE JUNIOR, M. F. R.; OLIVEIRA, E. J. de. New accuracy estimators for genomic selection with application in a cassava (Manihot esculenta) breeding program. Genetics and Molecular Research, v. 15, n. 4, gmr.15048838, Oct. 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 36. | | LIMA L. P.; AZEVEDO, C. F.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; SUELA, M. M.; NASCIMENTO, M.; VIANA, J. M. S. New insights into genomic selection through population-based non-parametric prediction methods. Scientia Agricicola, v. 76, n. 4, p. 290-298, July/Aug. 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 37. | | AZEVEDO, C. F.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; NASCIMENTO, M.; VIANA, J. M. S.; VALENTE, M. S. F. Population structure correction for genomic selection through eigenvector covariates. Crop Breeding and Applied Biotechnology, Viçosa, v. 17, n. 4, p.350-358, Oct./Dec. 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 38. | | LANES, E. C. M.; VIANA, J. M. S.; PAES, G. P.; PAULA, M. F. B.; MAIA, C.; CAIXETA, E. T.; MIRANDA, G. V. Population structure and genetic diversity of maize inbreds derived from tropical hybrids. Genetics and Molecular Research, v. 13, n. 3, p. 7365-7376, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 40. | | OLIVEIRA, L. T. de; BONAFÉ, C. M.; SIVA, F. F. e; VENTURA, H. T.; OLIVEIRA, H. R. de; MENEZES, G. R. de O.; RESENDE, M. D. V. de; VIANA, J. M. S. Bayesian random regression threshold models for genetic evaluation of pregnancy probability in Red Sindhi heifers. Livestock Science, v. 202, p. 166-170, August, 2017. Short communication| Tipo: Nota Técnica/Nota Científica |
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