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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Solos. |
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Data corrente: |
29/11/2017 |
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Data da última atualização: |
29/11/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
TEIXEIRA, W. G.; VASQUES, G. de M.; NOGUEIRA, J. |
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Afiliação: |
WENCESLAU GERALDES TEIXEIRA, CNPS; GUSTAVO DE MATTOS VASQUES, CNPS; JÚLIA NOGUEIRA, PUC-RJ. |
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Título: |
Uso de espectrômetro de fluorescência de raios x portátil (PXRF) para avaliação de teores de ferro e manganês em amostras de solo. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GEOQUÍMICA, 16., 2017, Armação dos Búzios. Anais... Rio de Janeiro: Sociedade Brasileira de Geoquímica, 2017. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Os espectrômetros de fluorescência de raios X vem sendo utilizados para determinar teores totais de elementos químicos em amostras de rocha, plantas e solos. Algoritmos automáticos permitem detectar a presença e os teores dos elementos químicos nas amostras. O uso de equipamentos de menor potência e portáteis (pXRF), na avaliação de amostras de solo, ainda é pouco estudado. O objetivo deste trabalho foi comparar os teores totais de Ferro e Manganês em amostras de solo. Inicialmente foi feita a avaliação dos teores de Fe e Mn em amostras de solos certificadas com dois algoritmos, posteriormente foram avaliadas diferentes formas de preparo nas estimativas dos teores de Fe e Mn em amostras de um Latossolo Amarelo, os resultados foram comparados com valores de ICP - OES e MS. Há diferenças entre os teores de Fe e Mn estimados pelos algoritmos. Há efeito de concentração quando do peneiramento sem moagem da amostra. De forma global foi observada boa precisão e acurácia nas estimativas de Mn e Fn em amostras de solo. |
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Palavras-Chave: |
Geofísica; ICP; Sensoriamento proximal do solo. |
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Thesagro: |
Latossolo. |
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Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/167729/1/2017-061.pdf
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Marc: |
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653 $aGeofísica
653 $aICP
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700 1 $aVASQUES, G. de M.
700 1 $aNOGUEIRA, J.
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Registro original: |
Embrapa Solos (CNPS) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Amazônia Ocidental. |
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Data corrente: |
06/03/2023 |
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Data da última atualização: |
01/09/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 3 |
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Autoria: |
CASTRO, G. S.; SOUZA, T. F.; SILVA, G. F. da; PEDROSO, R. C. N.; MENEZES, K. S.; SOARES, M. A.; DIAS, G. M.; SANTOS, A. O.; YAMAGISHI, M. E. B.; FARIA, J. V.; JANUÁRIO, A. H.; KOOLEN, H. H. F. |
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Afiliação: |
GLEUCINEI S. CASTRO, UNIVERSIDADE DO ESTADO DO AMAZONAS; THIAGO F. SOUSA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS; GILVAN FERREIRA DA SILVA, CPAA; RITA C. N. PEDROSO, UNIVERSIDADE DE FRANCA; KELLY S. MENEZES, UNIVERSIDADE DO ESTADO DO AMAZONAS; MARCOS A. SOARES, UNIVERSIDADE FEDERAL DE MATO GROSSO; GUSTAVO M. DIAS, UNIVERSIDADE FEDERAL DO ABC; ALINE O. SANTOS, UNIVERSIDADE DO ESTADO DO AMAZONAS; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; JÉSSICA V. FARIA, UNIVERSIDADE DO ESTADO DO AMAZONAS; ANA H. JANUÁRIO, UNIVERSIDADE DE FRANCA; HECTOR H. F. KOOLEN, UNIVERSIDADE DO ESTADO DO AMAZONAS. |
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Título: |
Characterization of peptaibols produced by a marine strain of the fungus Trichoderma endophyticum via Mass Spectrometry, genome mining and phylogeny-based prediction. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Metabolites, v. 13, n. 2, 221, Feb. 2023. |
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DOI: |
https://doi.org/10.3390/metabo13020221 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract. Trichoderma is recognized as a prolific producer of nonribosomal peptides (NRPs) known as peptaibols, which have remarkable biological properties, such as antimicrobial and anticancer activities, as well as the ability to promote systemic resistance in plants against pathogens. In this study, the sequencing of 11-, 14- and 15-res peptaibols produced by a marine strain of Trichoderma isolated from the ascidian Botrylloides giganteus was performed via liquid chromatography coupled to high-resolution tandem mass spectrometry (LC-MS/MS). Identification, based on multilocus phylogeny, revealed that our isolate belongs to the species T. endophyticum, which has never been reported in marine environments. Through genome sequencing and genome mining, 53 biosynthetic gene clusters (BGCs) were identified as being related to bioactive natural products, including two NRP-synthetases: one responsible for the biosynthesis of 11- and 14-res peptaibols, and another for the biosynthesis of 15-res. Substrate prediction, based on phylogeny of the adenylation domains in combination with molecular networking, permitted extensive annotation of the mass spectra related to two new series of 15-res peptaibols, which are referred to herein as "endophytins". The analyses of synteny revealed that the origin of the 15-module peptaibol synthetase is related to 18, 19 and 20-module peptaibol synthetases, and suggests that the loss of modules may be a mechanism used by Trichoderma species for peptaibol diversification. This study demonstrates the importance of combining genome mining techniques, mass spectrometry analysis and molecular networks for the discovery of new natural products. MenosAbstract. Trichoderma is recognized as a prolific producer of nonribosomal peptides (NRPs) known as peptaibols, which have remarkable biological properties, such as antimicrobial and anticancer activities, as well as the ability to promote systemic resistance in plants against pathogens. In this study, the sequencing of 11-, 14- and 15-res peptaibols produced by a marine strain of Trichoderma isolated from the ascidian Botrylloides giganteus was performed via liquid chromatography coupled to high-resolution tandem mass spectrometry (LC-MS/MS). Identification, based on multilocus phylogeny, revealed that our isolate belongs to the species T. endophyticum, which has never been reported in marine environments. Through genome sequencing and genome mining, 53 biosynthetic gene clusters (BGCs) were identified as being related to bioactive natural products, including two NRP-synthetases: one responsible for the biosynthesis of 11- and 14-res peptaibols, and another for the biosynthesis of 15-res. Substrate prediction, based on phylogeny of the adenylation domains in combination with molecular networking, permitted extensive annotation of the mass spectra related to two new series of 15-res peptaibols, which are referred to herein as "endophytins". The analyses of synteny revealed that the origin of the 15-module peptaibol synthetase is related to 18, 19 and 20-module peptaibol synthetases, and suggests that the loss of modules may be a mechanism used by Trichoderma species for pept... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
De novo sequencing; Fungo marinho; Marine fungus; Molecular networking; Nonribosomal peptides; Peptídeos não ribossomais; Rede molecular; Synteny analysis; Tricoderma. |
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Thesagro: |
Peptídeo. |
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Thesaurus NAL: |
Hypocreaceae. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1152102/1/metabolites-13-00221-v2.pdf
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Marc: |
LEADER 02911naa a2200397 a 4500
001 2152102
005 2023-09-01
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100 1 $aCASTRO, G. S.
245 $aCharacterization of peptaibols produced by a marine strain of the fungus Trichoderma endophyticum via Mass Spectrometry, genome mining and phylogeny-based prediction.$h[electronic resource]
260 $c2023
520 $aAbstract. Trichoderma is recognized as a prolific producer of nonribosomal peptides (NRPs) known as peptaibols, which have remarkable biological properties, such as antimicrobial and anticancer activities, as well as the ability to promote systemic resistance in plants against pathogens. In this study, the sequencing of 11-, 14- and 15-res peptaibols produced by a marine strain of Trichoderma isolated from the ascidian Botrylloides giganteus was performed via liquid chromatography coupled to high-resolution tandem mass spectrometry (LC-MS/MS). Identification, based on multilocus phylogeny, revealed that our isolate belongs to the species T. endophyticum, which has never been reported in marine environments. Through genome sequencing and genome mining, 53 biosynthetic gene clusters (BGCs) were identified as being related to bioactive natural products, including two NRP-synthetases: one responsible for the biosynthesis of 11- and 14-res peptaibols, and another for the biosynthesis of 15-res. Substrate prediction, based on phylogeny of the adenylation domains in combination with molecular networking, permitted extensive annotation of the mass spectra related to two new series of 15-res peptaibols, which are referred to herein as "endophytins". The analyses of synteny revealed that the origin of the 15-module peptaibol synthetase is related to 18, 19 and 20-module peptaibol synthetases, and suggests that the loss of modules may be a mechanism used by Trichoderma species for peptaibol diversification. This study demonstrates the importance of combining genome mining techniques, mass spectrometry analysis and molecular networks for the discovery of new natural products.
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653 $aMolecular networking
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653 $aRede molecular
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700 1 $aSOUZA, T. F.
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700 1 $aYAMAGISHI, M. E. B.
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700 1 $aJANUÁRIO, A. H.
700 1 $aKOOLEN, H. H. F.
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Ocidental (CPAA) |
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