|
|
Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
Data corrente: |
22/12/2005 |
Data da última atualização: |
22/12/2005 |
Autoria: |
BINDE, D. R.; CHUEIRE, L. M. O.; LUCASI. H.; NICOLÁS, M. F.; VASCONCELOS, A. T. R.; GONZAGA, L. P.; SOUZA, R. C.; MARTINEZ-ROMERO, E.; FERNANDO GOMES BARCELLOS, F. G.; SILVA, M. F.; GARCIA, J. E.; HUNGRIA, H. |
Título: |
Seqüenciamento do plasmídeo simbiótico da estirpe CFN 299 de Rhizobium tropici. |
Ano de publicação: |
2005 |
Fonte/Imprenta: |
In: SEMANA DE BIOTECNOLOGIA, 1., 2005, Londrina. [Resumos]. Londrina: UEL, 2005. |
Descrição Física: |
1 CD-ROM. |
Idioma: |
Português |
Notas: |
Resumo - Pdf. 41. |
Conteúdo: |
O objetivo desse trabalho foi seqüenciar parcialmente o plasmídeo simbiótico da estirpe
CFN 299 de Rhizobium tropici, que se associa simbioticamente ao feijoeiro ( Phaseolus
vulgaris), estabelecendo o processo de fixação biológica do nitrogênio. Inicialmente foram
construídas bibliotecas "shotgun" pela fragmentação do DNA ao acaso, por nebulização, obtendo fragmentos de 500 pares de bases (pb) a2 kb. Os fragmentos foram reparados e fosforilados por Klenow da DNA polimerase de Escherichia coli e separados em gel de agarose "low melting". A seguir, foram recuperados e ligados ao vetor pUC18, digerido com a enzima de restrição SmaI-BAP e defosforilados com a enzima T4 DNA ligase. Após a ligação, o material foi utilizado para transformação por eletroporação de células de E. coli estirpe DH10B. As células foram plaqueadas em meio contendo ampicilina, IPTG e X-gal e foram crescidas durante a noite, a 37° C. Colônias brancas individuais ( clones recombinantes) foram inoculadas em meio de cultura com ampicilina e crescidas, procedendo-se ao estoque a -80% e a novo crescimento, conforme descrito, para extração do DNA, realizado pelo método de rompimento alcalino. Após a precipitação, filtragem e verificação da concentração, o seqüenciamento foi realizado pelo método dos terminadores fluorescentes, em um seqüenciador automático MegaBACE ( Amersham Pharmacia Biotech). As leituras obtidas foram submetidas a análises de bioinformática. Até o presente momento foram construídas duas bibliotecas e foram realizadas 1.325 leituras, com o depósito de 1.220.032 pb. MenosO objetivo desse trabalho foi seqüenciar parcialmente o plasmídeo simbiótico da estirpe
CFN 299 de Rhizobium tropici, que se associa simbioticamente ao feijoeiro ( Phaseolus
vulgaris), estabelecendo o processo de fixação biológica do nitrogênio. Inicialmente foram
construídas bibliotecas "shotgun" pela fragmentação do DNA ao acaso, por nebulização, obtendo fragmentos de 500 pares de bases (pb) a2 kb. Os fragmentos foram reparados e fosforilados por Klenow da DNA polimerase de Escherichia coli e separados em gel de agarose "low melting". A seguir, foram recuperados e ligados ao vetor pUC18, digerido com a enzima de restrição SmaI-BAP e defosforilados com a enzima T4 DNA ligase. Após a ligação, o material foi utilizado para transformação por eletroporação de células de E. coli estirpe DH10B. As células foram plaqueadas em meio contendo ampicilina, IPTG e X-gal e foram crescidas durante a noite, a 37° C. Colônias brancas individuais ( clones recombinantes) foram inoculadas em meio de cultura com ampicilina e crescidas, procedendo-se ao estoque a -80% e a novo crescimento, conforme descrito, para extração do DNA, realizado pelo método de rompimento alcalino. Após a precipitação, filtragem e verificação da concentração, o seqüenciamento foi realizado pelo método dos terminadores fluorescentes, em um seqüenciador automático MegaBACE ( Amersham Pharmacia Biotech). As leituras obtidas foram submetidas a análises de bioinformática. Até o presente momento foram construídas duas biblio... Mostrar Tudo |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 02422naa a2200277 a 4500 001 1468689 005 2005-12-22 008 2005 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aBINDE, D. R. 245 $aSeqüenciamento do plasmídeo simbiótico da estirpe CFN 299 de Rhizobium tropici. 260 $c2005 300 $c1 CD-ROM. 500 $aResumo - Pdf. 41. 520 $aO objetivo desse trabalho foi seqüenciar parcialmente o plasmídeo simbiótico da estirpe CFN 299 de Rhizobium tropici, que se associa simbioticamente ao feijoeiro ( Phaseolus vulgaris), estabelecendo o processo de fixação biológica do nitrogênio. Inicialmente foram construídas bibliotecas "shotgun" pela fragmentação do DNA ao acaso, por nebulização, obtendo fragmentos de 500 pares de bases (pb) a2 kb. Os fragmentos foram reparados e fosforilados por Klenow da DNA polimerase de Escherichia coli e separados em gel de agarose "low melting". A seguir, foram recuperados e ligados ao vetor pUC18, digerido com a enzima de restrição SmaI-BAP e defosforilados com a enzima T4 DNA ligase. Após a ligação, o material foi utilizado para transformação por eletroporação de células de E. coli estirpe DH10B. As células foram plaqueadas em meio contendo ampicilina, IPTG e X-gal e foram crescidas durante a noite, a 37° C. Colônias brancas individuais ( clones recombinantes) foram inoculadas em meio de cultura com ampicilina e crescidas, procedendo-se ao estoque a -80% e a novo crescimento, conforme descrito, para extração do DNA, realizado pelo método de rompimento alcalino. Após a precipitação, filtragem e verificação da concentração, o seqüenciamento foi realizado pelo método dos terminadores fluorescentes, em um seqüenciador automático MegaBACE ( Amersham Pharmacia Biotech). As leituras obtidas foram submetidas a análises de bioinformática. Até o presente momento foram construídas duas bibliotecas e foram realizadas 1.325 leituras, com o depósito de 1.220.032 pb. 700 1 $aCHUEIRE, L. M. O. 700 1 $aLUCASI. H. 700 1 $aNICOLÁS, M. F. 700 1 $aVASCONCELOS, A. T. R. 700 1 $aGONZAGA, L. P. 700 1 $aSOUZA, R. C. 700 1 $aMARTINEZ-ROMERO, E. 700 1 $aFERNANDO GOMES BARCELLOS, F. G. 700 1 $aSILVA, M. F. 700 1 $aGARCIA, J. E. 700 1 $aHUNGRIA, H. 773 $tIn: SEMANA DE BIOTECNOLOGIA, 1., 2005, Londrina. [Resumos]. Londrina: UEL, 2005.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
Registros recuperados : 44 | |
3. | | CARVALHO, F. M.; SOUZA, R. C.; BARCELLOS, F. G.; HUNGRIA, M.; VASCONCELOS, A. T. R. Genomic and evolutionary comparisons of diazotrophic and pathogenic bacteria of the order Rhizobiales. BMC Microbiology, London, v. 10, n. 37, p. 1-15, Feb. 2010.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
7. | | SIQUEIRA, A. F.; NAKATANI, A. S.; VASCONCELOS, A. T. R. de; ALMEIDA, L. G. P. de; HUNGRIA, M. Anotação Genômica de Bradyrhizobium japonicum estirpes CPAC 15 e CPAC 7: Resultados parciais e sua importância para a cultura de soja. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 30.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 14.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 12.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 9.; SIMPÓSIO SOBRE SELÊNIO NO BRASIL, 1., 2012, Maceió. A responsabilidade socioambiental da pesquisa agrícola: anais. Viçosa: SBCS, 2012. 3 p. Trab. 1190. 1 CD-ROM. Fertbio.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
8. | | SOUZA, R. C. de; CANTÃO, M. E.; NOGUEIRA, M. A.; VASCONCELOS, A. T. R.; NICOLAS, M. F.; HUNGRIA, M. Biodiversidade de procariotos em solo sob plantio direto e plantio convencional em rotação ou sucessão de culturas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBILOGIA, 26.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE BACTÉRIAS LÁTICAS; ENCONTRO NACIONAL DE PROFESSORES DE MICROBIOLOGIA; SIMPÓSIO DE COLEÇÕES DE CULTURAS, 4., 2011, Foz do Iguaçu. Anais... São Paulo: SBM, 2011. Resumo, 365-1.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
9. | | CARVALHO, F. M.; GOMES, D. F.; ORTIZ, M.; ALMEIDA, L. G.; SOUSA, R. C.; VASCONCELOS, A. T. R.; HUNGRIA, M. Genomic panorama, focused on the symbiotic context, of bradyrhizobium elkanii strains semia 587, semia 5019 and usda 76t (t é sobrescrito). In: REUNIÃO LATINOAMERICANA DE RIZOBIOLOGIA - RELAR, 27., 2016, Londrina. Fortalecendo as parcerias Sul-Sul: anais. Curitiba: SBCS-NEPAR, 2016. p. 178. Editores: Mariangela Hungria, Douglas Fabiano Gomes, Arnaldo Colozzi Filho.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
12. | | HUNGRIA, M.; NICOLAS, M. F.; GUIMARAES, C. T.; JARDIM, S. N.; GOMES, E. A.; VASCONCELOS, A. T. R. de. Tolerance to stress and environmental adaptability of Chromobacterium violaceum. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 3, n. 1, p. 102-116, 2004.Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
13. | | MEDEIROS, J. D.; CANTAO, M. E.; CESAR, D. E.; NICOLÁS, M. F.; DINIZ, C. G.; SILVA, V. L.; VASCONCELOS, A. T. R. de; COELHO, C. M. Comparative metagenome of a stream impacted by the urbanization phenomenon. Brazilian Journal of Microbiology, São Paulo, SP, v. 47, n. 4, p. 835-845, 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
14. | | DELAMUTA, J. R. M.; GOMES, D. F.; RIBEIRO, R. A.; CHUEIRE, L. M. O.; SOUZA, R. C.; ALMEIDA, L. G. P.; VASCONCELOS, A. T. R.; HUNGRIA, M. Genome sequence of Bradyrhizobium tropiciagri Strain CNPSo 1112T , isolated from a root nodule of Neonotonia wightii. Genome Announcements, v. 3, n. 6, e01482-15, Nov./Dec. 2015.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
15. | | HELENE, L. C. F.; GOMES, D. F.; DELAMUTA, J. R. M.; RIBEIRO, R. A.; SOUZA, R. C.; ALMEIDA, L. G. P.; VASCONCELOS, A. T. R.; HUNGRIA, M. Genome sequence of Bradyrhizobium viridifuturi strain SEMIA 690T, a nitrogen-fixing symbiont of Centrosema pubescens. Genome Announcements, v. 3, n. 6, e01481-15, Nov./Dec. 2015.Tipo: Nota Técnica/Nota Científica |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
16. | | GODOY, L. P.; VASCONCELOS, A. T. R.; CHUEIRE, L. M. O.; SOUZA, R. C.; NICOLÁS, M. F.; BARCELLOS, F. G.; HUNGRIA, M. Genomic panorama of Bradyrhizobium japonicum CPAC 15, a commercial inoculant strain largely established in Brazilian soils and belonging to the same serogroup as USDA 123. Soil Biology & Biochemistry, v. 40, n. 11, p. 2743-2753, 2008.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
17. | | BABUJIA, L. C.; SILVA, A. P.; NAKATANI, A. S.; CANTAO, M. E.; VASCONCELOS, A. T. R.; VISENTAINER, J. V.; HUNGRIA, M. Impact of long-term cropping of glyphosate-resistant transgenic soybean [Glycine max (L.) Merr.] on soil microbiome. Transgenic Research, Feb., p.1-6, 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Soja; Embrapa Suínos e Aves. |
| |
18. | | PINTO, F. G. da S.; CHUEIRE, L. M. de O.; VASCONCELOS, A. T. R.; NICOLÁS, M. F.; GONZAGA, L.; SOUZA, R. C.; HUNGRIA, M. Panorama genômico e bioprospecção de genes de Rhizobium tropici estirpe PRF 81 (SEMIA 4080) utilizada em inoculantes comerciais para a cultura do feijoeiro. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 27.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 11.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 9.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 6., 2006, Bonito, MS. A busca das raízes: anais. Dourados: Embrapa Agropecuária Oeste, 2006. 1 CD-ROM. (Embrapa Agropecuária Oeste. Documentos, 82).Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
19. | | GODOY, L. P.; CHUEIRE, L. M. de O.; BARCELLOS, F. G.; VASCONCELOS, A. T. R.; GONZAGA, L. de P.; NICOLÁS, M. F.; HUNGRIA, M. Panorama genômico da estirpe de Bradyrhizobium japonicum CPAC 15, recomendada para o uso em inoculantes comerciais para a cultura da soja. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 2005, Londrina. Resumos expandidos. Londrina: Embrapa Soja, 2005. p. 98-103. (Embrapa Soja. Documentos, 268).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
20. | | GODOY, L. P.; CHUEIRE, L. M. de O.; BARCELLOS, F. G.; VASCONCELOS, A. T. R.; GONZAGA, L. de P.; NICOLÁS, M. F; SOUZA, R. C.; HUNGRIA, M. Panorama genômico da estirpe de Bradyrhizobium japonicum CPAC 15, recomendada para o uso em inoculantes comerciais para a cultura da soja. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 2., 2006, Londrina. Resumos expandidos. Londrina: Embrapa Soja, 2006. p. 156-161. (Embrapa Soja. Documentos, 276).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
Registros recuperados : 44 | |
|
Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|