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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
Data corrente: |
02/01/2018 |
Data da última atualização: |
02/01/2018 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
AZEVEDO, C. F.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; NASCIMENTO, M.; VIANA, J. M. S.; VALENTE, M. S. F. |
Afiliação: |
Camila Ferreira Azevedo, UFV; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; Fabyano Fonseca e Silva, UFV; Moysés Nascimento, UFV; José Marcelo Soriano Viana, UFV; Magno Sávio Ferreira Valente, UFV. |
Título: |
Population structure correction for genomic selection through eigenvector covariates. |
Ano de publicação: |
2017 |
Fonte/Imprenta: |
Crop Breeding and Applied Biotechnology, Viçosa, v. 17, n. 4, p.350-358, Oct./Dec. 2017. |
DOI: |
10.1590/1984- 70332017v17n4a53 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
We proposed a population structure correction for genome-wide selection based on covariance analysis via eigenvector (EVG) decomposition. The agreement between the predicted and true breeding values was evaluated by independent cross-validation data sets. Other correction methods such as correction via principal components, best linear unbiased prediction, and deregressed phenotype were also evaluated. Based on different simulation scenarios, the proposed EVG out performed the other methods in the prediction of accuracy. |
Palavras-Chave: |
Deregressed phenotype; Mendelian segregation; Principal component; Short-term genomic prediction. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/170156/1/2017-M.Deon-CBAB-Population.pdf
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Marc: |
LEADER 01323naa a2200241 a 4500 001 2084041 005 2018-01-02 008 2017 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1590/1984- 70332017v17n4a53$2DOI 100 1 $aAZEVEDO, C. F. 245 $aPopulation structure correction for genomic selection through eigenvector covariates.$h[electronic resource] 260 $c2017 520 $aWe proposed a population structure correction for genome-wide selection based on covariance analysis via eigenvector (EVG) decomposition. The agreement between the predicted and true breeding values was evaluated by independent cross-validation data sets. Other correction methods such as correction via principal components, best linear unbiased prediction, and deregressed phenotype were also evaluated. Based on different simulation scenarios, the proposed EVG out performed the other methods in the prediction of accuracy. 653 $aDeregressed phenotype 653 $aMendelian segregation 653 $aPrincipal component 653 $aShort-term genomic prediction 700 1 $aRESENDE, M. D. V. de 700 1 $aSILVA, F. F. e 700 1 $aNASCIMENTO, M. 700 1 $aVIANA, J. M. S. 700 1 $aVALENTE, M. S. F. 773 $tCrop Breeding and Applied Biotechnology, Viçosa$gv. 17, n. 4, p.350-358, Oct./Dec. 2017.
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registros recuperados : 32 | |
4. | | MISSIAGGIA, A. A.; BUENO, N. W.; DEHON, G.; GRATTAPAGLIA, D. Mapeamento de QTL para características da madeira em clones híbridos de Eucalyptus sp. com base em microssatélites. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 51., 2005, Águas de Lindóia, SP. A era da genômica: da bioestatística à bioinformática: anais. Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2005. p. 599.Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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7. | | MISSIAGGIA, A. A.; BUENO, N. W.; REZENDE, G. D.; GRATTAPAGLIA, D. Extensão do mapa genético referência de eucalipto utilizando marcadores microssatélites com detecção fluorescente e mapeamento de qtl para características de interesse comercial. ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENETICOS E BIOTECNOLOGIA, 8., 2003, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2003. p. 75Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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8. | | BRONDANI, R. P. V.; GAIOTTO, F. A.; MISSIAGGIA, A. A.; KIRST, M.; GRIBELS, R.; GRATTAPAGLIA, D. Microsatellite markers for Ceiba pentandra (Bombacaceae), an endangered tree species of the amazon forest Molecular Ecology Notes, v.3, p.177-179, 2003.Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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9. | | NOVAES, E.; COELHO, A. S. G.; MAMANI, E.; MISSIAGGIA, A. A.; GRATTAPAGLIA, D. Mapeamento de QTLs para crescimento e qualidade da madeira em Eucalyptus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 50., 2004, Costão do Santinho, Florianópolis. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2004. p. 1281.Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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11. | | VIEIRA, M. C.; PÁDUA, J. G.; MISSIAGGIA, A. A.; GRATTAPAGLIA, D. Reconstruindo a história de clones elite de Eucalyptus no Brasil com base em SNPs, microssatélites e morfometria. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 11., 2006, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2006. p. 192.Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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12. | | EIRAS, M.; MISSIAGGIA, A. A.; RESENDE, R. de O.; BEZERRA, I. C.; AVILA, A. C. de. Strategies for tospovirus direction by RT-PCR. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 22, p. 333, ago. 1997. Suplemento. Resumo 592. Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 30., 1997.Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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13. | | MISSIAGGIA, A. A.; KIRST, M.; SILVEIRA, F. Q.; GAIOTTO, F. A.; BRONDANI, R. P. V.; GRIBEL, R.; GRATTAPAGLIA, D. Análise da herança de locos microsatélites marcados com fluorescência em sumaúma (Ceiba pentandra) e estimativa de fecundação cruzada em populações naturais. In: WORKSHOP DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 4., 1999, Brasília. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: EMBRAPA-CENARGEN, 1999. p. 67.Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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14. | | LAIA, M. L. de; GERHARDT, I. R.; ABAD, J. I. M.; DEGENHARDT-GOLDBACH, J.; GONÇALVES, J. F.; MISSIAGGIA, A. A. A biotecnologia e o eucalipto do futuro. In: VALE, A. B. do; MACHADO, C. C.; PIRES, J. M. M.; VILAR, M. B.; COSTA, C. B.; NACIF, A. de P. (Ed.). Eucaliptocultura no Brasil: silvicultura, manejo e ambiência. Viçosa, MG: SIF, 2014. p. 39-67.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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15. | | SILVEIRA, F. Q. de P.; BRONDANI, R. V.; MISSIAGGIA, A. A.; GAIOTTO, F. A.; GRIBEL, R.; COUTINHO, S.; GRATAPAGLIA, D. Desenvolvimento e otimização de locos ssr para estudos de espécies nativas em risco de extinção no Brasil. In: TALENTO Estudantil da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia 1998: resumo dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 1998. p. 40. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 34).Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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16. | | RESENDE, M. D. V. de; RESENDE JUNIOR, M. F. R.; AGUIAR, A. M.; ABAD, J. I. M.; MISSIAGGIA, A. A.; SANSALONI, C. P.; PETROLI, C. D.; GRATTAPAGLIA, D. Computação da Seleção Genômica Ampla (GWS). Colombo: Embrapa Florestas, 2010. CD-ROM. (Embrapa Florestas. Documentos, 210).Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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17. | | GRATTAPAGLIA, D.; RESENDE, M. D. V. de; RESENDE, M. F. R.; SANSALONI, C. P.; PETROLI, C. D.; MISSIAGGIA, A. A.; TAKAHASHI, E. K.; ZAMPROGNO, K. C.; KILIAN, A. High realized accuracies of genomic selection for volume growth and wood density in Eucalyptus breeding populations with contrasting effective sizes. In: PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 19., 2011, San Diego. Conference... [S.l.]: International Plant & Animal Genome, 2011. Abstract. W235: Forest Trees.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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18. | | GRATTAPAGLIA, D.; RESENDE, M. D. V. de; RESENDE, M. F. R.; SANSALONI, C. P.; PETROLI, C. D.; MISSIAGGIA, A. A.; TAKAHASHI, E. K.; ZAMPROGNO, K. C.; KILIAN, A. High realized accuracies of genomic selection for volume growth and wood density in Eucalyptus breeding populations with contrasting effective sizes. In: PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 19., 2011, San Diego. Conference... [S.l.]: International Plant & Animal Genome, 2011. W235: Forest Trees.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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19. | | GRATTAPAGLIA, D.; RESENDE, M. D. V. de; RESENDE, M. R.; SANSALONI, C. P.; PETROLI, C. D.; MISSIAGGIA, A. A.; TAKAHASHI, E. K.; ZAMPROGNO, K. C.; KILIAN, A. Genomic selection for growth traits in Eucalyptus: accuracy within and across breeding populations. In: IUFRO TREE BIOTECHNOLOGY CONFERENCE, 2011, Arraial d'Ajuda. From genomes do integration and delivery: extended abstracts proceedings. [S.l.]: Embrapa: Veracel: IUFRO, 2011.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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20. | | GRATTAPAGLIA, D.; RESENDE, M. D. V. de; RESENDE, M. R.; SANSALONI, C. P.; PETROLI, C. D.; MISSIAGGIA, A. A.; TAKAHASHI, E. K.; ZAMPROGNO, K. C.; KILIAN, A. Genomic selection for growth traits in Eucalyptus: accuracy within and across breeding populations. In: IUFRO TREE BIOTECHNOLOGY CONFERENCE, 2011, Arraial d'Ajuda. From genomes do integration and delivery: extended abstracts proceedings. [S.l.]: Embrapa: Veracel: IUFRO, 2011. 1 CD-ROMTipo: Artigo em Anais de Congresso |
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