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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agroindústria Tropical; Embrapa Rondônia. |
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Data corrente: |
03/09/2020 |
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Data da última atualização: |
18/12/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
RUDNICK, V. A. de S.; VIEIRA JÚNIOR, J. R.; FERNANDES, C. de F.; ROCHA, R. B.; TEIXEIRA, A. L.; RAMALHO, A. R.; ESPINDULA, M. C.; SANTOS, A. V.; ANJOS, E. F. M. dos; UCHÔA, F. P. |
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Afiliação: |
Vaneide Araújo de Sousa Rudnick, Universidade Federal de Rondônia (UNIR); JOSE ROBERTO VIEIRA JUNIOR, CNPAT; CLEBERSON DE FREITAS FERNANDES, CNPAT; RODRIGO BARROS ROCHA, CPAF-RO; ALEXSANDRO LARA TEIXEIRA, CPAF-RO; ANDRE ROSTAND RAMALHO, CPAF-RO; MARCELO CURITIBA ESPINDULA, CPAF-RO; Anderson Vieira Santos, Universidade Luterana do Brasil (ULBRA); Elize Francisca Mendes dos Anjos, Universidade Federal de Rondônia (UNIR); Francisco Paiva Uchôa, Universidade Federal de Rondônia (UNIR). |
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Título: |
Resistance of new Coffea canephora clones to root-knot nematode (Meloidogyne incognita) in the western amazon. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Coffee Science, v. 15, e151708, 2020. |
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DOI: |
https://doi.org/10.25186/.v15i.1708 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Root-knot disease is among the main diseases affecting coffee crop. The plant selection to the development new resistant cultivars is among one the most efficient methods of control. The present work aimed to quantify the resistance responses of Coffea canephora clones to root-knot nematode Meloidogyne incognita in the Western Amazon. For this, 17 previously selected clones were evaluated in three experimental trials, carried out in the municipalities of Ji-Paraná and Porto Velho, Rondônia. The resistance to root-knot nematodes M. incognita were evaluated by the numbers of gall in the roots (NG) and by the reproductive factor (RF). The resistance response was also interpreted according the genetic diversity of the clones based in their morphological traits. The clones BRS3210, C12, BRS2314, BRS3137 and BRS1216 are resistant to M. incognita with RF of 0.34, 0.62, 0.79, 0.86 and 0.98, respectively. BRS3213, C125, C15, BRS2336, BRS3220 and C09 clones were classified as susceptible, with RF of 1.93, 1.95, 2.00, 2.31, 2.32 and 2.35. The BRS3193, C160 and BRS2357 clones were classified as very susceptible, with RF values of 3.03, 4.41 and 5.82, respectively. The clustering based on the genetic diversity of morphological traits indicated that genotypes more similar to the Robusta botanic variety had lower RF. The hybrid plants showed intermediate degrees of resistance indicating the segregation for the character of the M. incognita resistance. The clones BRS3210, C12, BRS2299, BRS2314, BRS3137 and BRS1216 expressed resistance responses to M. incognita with potential for growing resistant genotypes in the Western Amazon. MenosRoot-knot disease is among the main diseases affecting coffee crop. The plant selection to the development new resistant cultivars is among one the most efficient methods of control. The present work aimed to quantify the resistance responses of Coffea canephora clones to root-knot nematode Meloidogyne incognita in the Western Amazon. For this, 17 previously selected clones were evaluated in three experimental trials, carried out in the municipalities of Ji-Paraná and Porto Velho, Rondônia. The resistance to root-knot nematodes M. incognita were evaluated by the numbers of gall in the roots (NG) and by the reproductive factor (RF). The resistance response was also interpreted according the genetic diversity of the clones based in their morphological traits. The clones BRS3210, C12, BRS2314, BRS3137 and BRS1216 are resistant to M. incognita with RF of 0.34, 0.62, 0.79, 0.86 and 0.98, respectively. BRS3213, C125, C15, BRS2336, BRS3220 and C09 clones were classified as susceptible, with RF of 1.93, 1.95, 2.00, 2.31, 2.32 and 2.35. The BRS3193, C160 and BRS2357 clones were classified as very susceptible, with RF values of 3.03, 4.41 and 5.82, respectively. The clustering based on the genetic diversity of morphological traits indicated that genotypes more similar to the Robusta botanic variety had lower RF. The hybrid plants showed intermediate degrees of resistance indicating the segregation for the character of the M. incognita resistance. The clones BRS3210, C12, BRS2299, BRS2... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Amazônia Ocidental; Ji-Paraná (RO); Nó da raiz; Porto Velho (RO); Rondônia; Western Amazon. |
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Thesagro: |
Café; Coffea Canephora; Comportamento de Variedade; Doença de Planta; Melhoramento Genético Vegetal; Meloidogyne Incognita; Nematóide; Resistência Genética. |
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Thesaurus Nal: |
Disease resistance; Plant breeding; Root diseases; Root-knot nematodes; Variety trials. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/215835/1/ART20076.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agroindústria Tropical (CNPAT) |
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Cutter |
Registro |
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URL |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Para informações adicionais entre em contato com cenargen.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
18/05/2007 |
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Data da última atualização: |
21/12/2023 |
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Autoria: |
MORETZSOHN, M. de C. |
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Título: |
Desenvolvimento e mapeamento de marcadores microssatélites e identificação de QTLs ligados à produtividade e à resistência à mancha preta em Arachis spp. |
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Ano de publicação: |
2006 |
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Fonte/Imprenta: |
2006. |
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Páginas: |
142 f. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Tese (Doutorado em Biologia Molecular) - Universidade de Brasília, Departamento de Biologia Celular, Brasília, DF. Orientador: David John Bertioli. |
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Conteúdo: |
O amendoim cultivado (Arachis hypogaea) é uma cultura importante, amplamente cultivada nas regiões tropicais e subtropicais do mundo. É bastante susceptível a diversos estresses bióticos e abióticos, para os quais muitas das espécies silvestres são resistentes. Como um primeiro passo visando a introgressão desses genes de resistência no amendoim cultivado, um mapa de ligação foi construído, usando uma população F2' obtida do cruzamento entre duas espécies silvestres diplóides de genoma AA (A. duranensis e A. stenosperma). Esse mapa foi baseado em marcadores microssatélites e marcadores âncoras, ambos codominantes e transferíveis entre espécies aparentadas. Um total de 271 novos marcadores microssatélites foi desenvolvido no presente trabalho, a partir de bibliotecas genômicas enriquecidas para microssatélites, de bibliotecas de etiquetas de seqüências expressas (ESTs ou "expressed sequence tags") e por mineração ("data mining") de seqüências disponíveis no GenBank. Para facilitar o desenvolvimento dos marcadores a partir de um grande número de seqüências, foi utilizado um módulo de programas desenvolvido em parceria com a Universidade Católica de Goiás e com a Universidade Católica de Brasnia. Esse módulo integra um programa para busca de microssatélites (TROLL), um conjunto de programas para agrupamento e processamento das seqüências (Staden package) e um terceiro programa, para desenho de primers (Primer3). Com isso, o desenvolvimento dos marcadores pôde ser automatizado, tornando o processo bem mais rápido e eficiente. Dos 271 novos marcadores microssatélites, 66 mostraram-se polimórficos para o amendoim cultivado e 62 deles foram utilizados para análise das relações genéticas entre acessos representando as seis variedades botânicas descritas de A. hypogaea. Os resultados obtidos foram consistentes com a classificação taxonômica atual, exceto para as variedades fastigiata/peruviana e fastigiata/aequatoriana, que formaram um grupo separado e distante das outras duas variedades da subespécie fastigiata. Os 271 novos marcadores microssatélites, além de outros 218 publicados ou em publicação para o amendoim foram testados, usando-se os dois progenitores. Desses 489 marcadores microssatélites, 215 (44,0%) mostraram-se polimórficos, sendo 181 codominantes e 34 dominantes (amplificaram alelos nulos em um dos progenitores). Os 99 marcadores microssatélites codominantes que não apresentaram distorções da segregação 1 :2: 1 esperada (p < 0,05), junto aos 40 marcadores âncoras não distorcidos (de um total de 72), foram utilizados para o estabelecimento dos grupos de ligação. Em seguida, os marcadores distorcidos e os dominantes foram incluídos no mapa. Usando um LOD escore mínimo de 11, 182 marcadores microssatélites, 66 marcadores âncoras e 12 RGAs foram mapeados em 1 ° grupos de ligação, como esperado, uma vez que Arachis duranensis e A. stenosperma são espécies diplóides com 2n = 20 cromossomos. Um comprimento de mapa total igual a 1645,1 cM foi obtido, com uma distância média de 6,32 cM entre marcadores. Esse mapa foi utilizado para o mapeamento de QTLs que controlam três características de interesse para o melhoramento do amendoim. Dez OTLs que controlam o peso de sementes, oito OTLs que controlam o número de sementes produzidas por planta e dois OTLs para resistência ao fungo causador da mancha preta (Cercosporidium personatum) foram significativamente identificados pelo método de mapeamento por intervalo múltiplo. Esse é o primeiro mapa baseado em marcadores microssatélites desenvolvido para Arachis. Além disso, os primeiros OTLs para componentes da produtividade e para resistência à mancha preta foram mapeados em Arachis spp. Uma vez que a maioria dos marcadores microssatélites utilizados foi desenvolvida a partir de ESTs e de bibliotecas genômicas digeridas com enzimas de restrição sensíveis a metilação, mais da metade dos marcadores mapeados, incluindo os marcadores âncoras, são provavelmente gênicos. Os grupos de ligação identificados nesse trabalho, as ordens dos marcadores obtidas e os QTLs mapeados estão sendo validados em outras populações de mapeamento, visando a construção de um mapa de referência para Arachis e a obtenção de estimativas mais robustas sobre os OTLs identificados, para uso dessas informações nos programas de melhoramento do amendoim. MenosO amendoim cultivado (Arachis hypogaea) é uma cultura importante, amplamente cultivada nas regiões tropicais e subtropicais do mundo. É bastante susceptível a diversos estresses bióticos e abióticos, para os quais muitas das espécies silvestres são resistentes. Como um primeiro passo visando a introgressão desses genes de resistência no amendoim cultivado, um mapa de ligação foi construído, usando uma população F2' obtida do cruzamento entre duas espécies silvestres diplóides de genoma AA (A. duranensis e A. stenosperma). Esse mapa foi baseado em marcadores microssatélites e marcadores âncoras, ambos codominantes e transferíveis entre espécies aparentadas. Um total de 271 novos marcadores microssatélites foi desenvolvido no presente trabalho, a partir de bibliotecas genômicas enriquecidas para microssatélites, de bibliotecas de etiquetas de seqüências expressas (ESTs ou "expressed sequence tags") e por mineração ("data mining") de seqüências disponíveis no GenBank. Para facilitar o desenvolvimento dos marcadores a partir de um grande número de seqüências, foi utilizado um módulo de programas desenvolvido em parceria com a Universidade Católica de Goiás e com a Universidade Católica de Brasnia. Esse módulo integra um programa para busca de microssatélites (TROLL), um conjunto de programas para agrupamento e processamento das seqüências (Staden package) e um terceiro programa, para desenho de primers (Primer3). Com isso, o desenvolvimento dos marcadores pôde ser automatizado, ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Bibliotecas ESTs; Bibliotecas genômicas; Cercosporidium personatum; Espécies diplóides; GeneBank; Mapa genético; Marcadoes microssatélites; QTLs; RGAs. |
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Thesagro: |
Amendoim; Fungo; Mancha Preta; Produtividade; Resistência Genética. |
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Thesaurus NAL: |
Arachis. |
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Categoria do assunto: |
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Marc: |
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650 $aFungo
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650 $aProdutividade
650 $aResistência Genética
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653 $aEspécies diplóides
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653 $aMapa genético
653 $aMarcadoes microssatélites
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653 $aRGAs
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