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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
25/04/2006 |
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Data da última atualização: |
17/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
HIGA, R. H.; TOZZI, C. L. |
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Afiliação: |
ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; CLÉSIO LUIS TOZZI, FEEC/Unicamp. |
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Título: |
Prediction of protein-protein interaction sites: comparing neural networks and support vector machines approaches. |
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Ano de publicação: |
2005 |
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Fonte/Imprenta: |
In: X-MEETING; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, [Proceedings...]. [S.l.]: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2005. |
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Páginas: |
p. 113. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
X-meeting 2005. Presented Posters. |
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Conteúdo: |
Protein-protein interaction plays a central role in a number of biological process such as cellular signaling, immune systems and enzyme catalysis. The knowledge of the residues that contribute to the specificity and affinity of protein interactions have important implications for applications such as drug design and analysis of metabolic networks. In silico studies of protein-protein interaction pursue two main objectives: the identification of the network of protein interactions and the identification of the residues involved in these interactions [7]. Recently, a number of studies pursuing the identification of protein-protein interaction sites have been proposed [3][6][7][8][9]. They differ in several aspects such as the information considered to do the prediction, the approach used by the predictors and the database considered to perform the training and testing of the predictors. These differences make difficult to establish a comparison among them. In this study, we use the database of protein-protein complexes used by Fariselli et al. [3] to compare the performance of the two prevalent approaches used to make predictors: Neural Networks -NN [4] and Support Vector Machines - SVM [2]. |
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Palavras-Chave: |
Redes neurais. |
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Thesagro: |
Proteina. |
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Thesaurus Nal: |
Neural networks; Proteins; Support vector machines. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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520 $aProtein-protein interaction plays a central role in a number of biological process such as cellular signaling, immune systems and enzyme catalysis. The knowledge of the residues that contribute to the specificity and affinity of protein interactions have important implications for applications such as drug design and analysis of metabolic networks. In silico studies of protein-protein interaction pursue two main objectives: the identification of the network of protein interactions and the identification of the residues involved in these interactions [7]. Recently, a number of studies pursuing the identification of protein-protein interaction sites have been proposed [3][6][7][8][9]. They differ in several aspects such as the information considered to do the prediction, the approach used by the predictors and the database considered to perform the training and testing of the predictors. These differences make difficult to establish a comparison among them. In this study, we use the database of protein-protein complexes used by Fariselli et al. [3] to compare the performance of the two prevalent approaches used to make predictors: Neural Networks -NN [4] and Support Vector Machines - SVM [2].
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650 $aProteins
650 $aSupport vector machines
650 $aProteina
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 22 | |
| 3. |  | JUNQUEIRA, N. T. V.; BRAGA, M. F.; JUNQUEIRA, K. P.; LAGE, D. A. da C. Manejo das principais doenças da gravioleira. In: POLTRONIERI, L. S.; TRINDADE, D. R.; SANTOS, I. P. dos (Ed.). Pragas e doenças de cultivos amazônicos. 2. ed. rev. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental; Brasília, DF: Embrapa Informação Tecnológica, 2008. cap. 9, p. 157-184.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 8. | | MAROUELLI, W. A.; LAGE, D. A. da C.; MACEDO, T. C. de; BARRETO, Y. C.; BRAGA, M. B. Avaliação de sistemas de irrigação e estratégias de manejo na produção orgânica de tomate de mesa. Horticultura Brasileira, Brasília, DF, v. 30, n. 2, p. S5725-S5732, jul. 2012. CD-ROM. Suplemento. Trabalho apresentado no 52. Congresso Brasileiro de Olericultura, Salvador, 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 10. | | MAROUELLI, W. A.; MACEDO, T. C. de; BARRETO, Y. C.; LAGE, D. A. da C.; RESENDE, F. V. Produção orgânica de tomate com diferentes sistemas e sníveis de irrigação e coberturas de solo. In: Cadernos de Agroecologia, v. 6, n. 2, 2011. Resumo 10594. Trabalho apresentado no VII Congresso Brasileiro de Agroecologia, Fortaleza, 2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 11. | | CABRAL, R. N.; MAROUELLI, W. A.; LAGE, D. A. da C.; LAPIDUS, G. A.; CAFE FILHO, A. C. Incidência da murcha bacteriana em tomateiro orgânico sob diferentes sistemas de irrigação, níveis de água e coberturas de solo. Cadernos de Agroecologia, Porto Alegre, v. 6, n. 2, 2011. Resumo 10688. Trabalho apresentado no 7. Congresso Brasileiro de Agroecologia, Fortaleza, 2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 12. | | MAROUELLI, W. A.; LAGE, D. A. da C.; GRAVINA, C. S.; MICHEREFF FILHO, M.; SOUZA, R. B. de. Irrigação por aspersão e gotejamento em tomateiro orgânico em cultivo solteiro e consorciado com coentro. Revista Ciência Agronômica, Fortaleza, v. 44, n. 4, p. 825-833, out./dez. 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 13. | | MAROUELLI, W. A.; LAGE, D. A. da C.; GRAVINA, C. S.; MICHEREFF FILHO, M.; SOUZA, R. B. de. Sprinkler and drip irrigation in the organic tomato for single crops and when interropped with coriander. Revista Ciência Agronômica, Fortaliza, v. 44, n. 4, p. 825-833, out-dez 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 15. | | JUNQUEIRA, N. T. V.; SILVA, A. P. de O.; MISAEL, L. P.; LAGE, D. A. da C.; SILVA, D. M.; FIALHO, J. de F.; JUNQUEIRA, L. P. Potencial de defensivos biológicos no controle da antracnose e na conservação de bananas na pós-colheita. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2003. 14 p. (Embrapa Cerrados. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 94).| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 16. | | BORGES, T. A.; JUNQUEIRA, N. T. V.; LAGE, D. A. da C.; ALMEIDA, D. A. de; SILVA, D. M.; PEIXOTO, J. R.; FIALHO, J. de F. Índices de cruzabilidade do maracujazeiro-azedo comercial com espécies de passifloras silvestres e progênies de retrocruzamentos, visando a obtenção de resistência a doenças e autocompatibilidade. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA, 9., 2003, Brasília, DF. Anais. Brasília: UnB, 2003. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 17. | | BORGES, T. A.; JUNQUEIRA, N, T. V.; LAGE, D, A. da C.; ALMEIDA, D. A. de; SILVA, D. M.; PEIXOTO, J. R.; FIALHO, J. de F. Indices de cruzabilidade do maracujazeiro-azedo comercial (Passiflora edulis f. flavicarpa) com especies de passifloras silvestres e progenies de retrocruzamentos, visando a obtencao de resistencia a doencas e autocompatibilidade. Planaltina: Embrapa Cerrados, 2003. 1 folder.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 18. | | JUNQUEIRA, N. T. V.; LAGE, D. A. da C.; BRAGA, M. F.; PEIXOTO, J. R.; BORGES, T. A.; ANDRADE, S. R. M. de; ALENCAR, C. M. Efeito de métodos de propagação no desenvolvimento de doenças e na produtividade de um clone de maracujazeiro-azedo. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2004. 16 p. (Embrapa Cerrados. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 139).| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 19. | | JUNQUEIRA, N. T. V.; NASCIMENTO, A. C. do; VARGAS RAMOS, V. H.; LAGE, D. A. da C.; KRAHL, L. L.; ALMEIDA, D. A.; CABRAL, G. de A. Efeito de produtos biológicos e químicos no controle da antracnose e na conservação da manga cv. Palmer em pós-colheita. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2003. 14 p. (Embrapa Cerrados. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 95).| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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