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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte. |
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Data corrente: |
27/02/2019 |
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Data da última atualização: |
27/02/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
FERREIRA, R. C. U.; LARA, L. A. de C.; CHIARI, L.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do; VALERIO, J. R.; TORRES, F. Z. V.; GARCIA, A. A. F.; SOUZA, A. P. de. |
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Afiliação: |
Rebecca Caroline Ulbricht Ferreira, Universidade de Campinas - Unicamp/Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética; Letícia Aparecida de Castro Lara, Universidade de São Paulo - USP/Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz - ESALQ/Departameto de Genética; LUCIMARA CHIARI, CNPGC; SANZIO CARVALHO LIMA BARRIOS, CNPGC; CACILDA BORGES DO VALLE, CNPGC; JOSE RAUL VALERIO, CNPGC; FABRICIA ZIMERMANN VILELA TORRES, CNPGC; Antonio Augusto Franco Garcia, Universidade de São Paulo - USP/Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz - ESALQ/Departameto de Genética; Anete Pereira de Souza, Universidade de Campinas - Unicamp/Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética. |
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Título: |
Genetic Mapping With Allele Dosage Information in Tetraploid Urochloa decumbens (Stapf) R. D. Webster Reveals Insights Into Spittlebug (Notozulia entreriana Berg) Resistance. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Frontiers in Plant Science, v. 10, February, 2019. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Urochloa decumbens (Stapf) R. D. Webster is one of the most important African forage grasses in Brazilian beef production. Currently available genetic-genomic resources for this species are restricted mainly due to polyploidy and apomixis. Therefore, crucial genomic-molecular studies such as the construction of genetic maps and the mapping of quantitative trait loci (QTLs) are very challenging and consequently affect the advancement of molecular breeding. The objectives of this work were to (i) construct an integrated U. decumbens genetic map for a full-sibling progeny using GBS-based markers with allele dosage information, (ii) detect QTLs for spittlebug (Notozulia entreriana) resistance, and (iii) seek putative candidate genes involved in defense against biotic stresses. We used the Setaria viridis genome a reference to align GBS reads and selected 4,240 high-quality SNP markers with allele dosage information. Of these markers, 1,000 were distributed throughout nine homologous groups with a cumulative map length of 1,335.09 cM and an average marker density of 1.33 cM. We detected QTLs for resistance to spittlebug, an important pasture insect pest, that explained between 4.66 and 6.24% of the phenotypic variation. These QTLs are in regions containing putative candidate genes related to defense against biotic stresses. Because this is the first genetic map with SNP autotetraploid dosage data and QTL detection in U. decumbens, it will be useful for future evolutionary studies, genome assembly, and other QTL analyses in Urochloa spp. Moreover, the results might facilitate the isolation of spittlebug-related candidate genes and help clarify the mechanism of spittlebug resistance. These approaches will improve selection efficiency and accuracy in U. decumbens molecular breeding and shorten the breeding cycle. MenosUrochloa decumbens (Stapf) R. D. Webster is one of the most important African forage grasses in Brazilian beef production. Currently available genetic-genomic resources for this species are restricted mainly due to polyploidy and apomixis. Therefore, crucial genomic-molecular studies such as the construction of genetic maps and the mapping of quantitative trait loci (QTLs) are very challenging and consequently affect the advancement of molecular breeding. The objectives of this work were to (i) construct an integrated U. decumbens genetic map for a full-sibling progeny using GBS-based markers with allele dosage information, (ii) detect QTLs for spittlebug (Notozulia entreriana) resistance, and (iii) seek putative candidate genes involved in defense against biotic stresses. We used the Setaria viridis genome a reference to align GBS reads and selected 4,240 high-quality SNP markers with allele dosage information. Of these markers, 1,000 were distributed throughout nine homologous groups with a cumulative map length of 1,335.09 cM and an average marker density of 1.33 cM. We detected QTLs for resistance to spittlebug, an important pasture insect pest, that explained between 4.66 and 6.24% of the phenotypic variation. These QTLs are in regions containing putative candidate genes related to defense against biotic stresses. Because this is the first genetic map with SNP autotetraploid dosage data and QTL detection in U. decumbens, it will be useful for future evolutionary studies... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Allele dosage; Linkage map; Signalgrass; SNP. |
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Thesagro: |
Brachiaria. |
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Thesaurus Nal: |
Polyploidy; Quantitative traits. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/193444/1/Genetic-mapping-with-alele-dosage-information.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 74 | |
| 63. |  | TORRES, F. Z. V.; SOUZA, D. A. de; LIRA, E. C.; FARIA, M. R. de; SUJII, E. R.; LOPES, R. B. Occurrence of Ophiocordyceps myrmicarum on a non-Formicidae insect in integrated crop-livestock farming systems. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 27.; CONGRESSO LATINO-AMERICANO DE ENTOMOLOGIA, 10., Gramado. Saúde, ambiente e agricultura: anais. Gramado: SEB, 2018. p. 315 Na publicação: Fabricia Z. V. Torres; Daniela A. Souza; Marcos Faria; Edison Sujii; Rogerio B. Lopes.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 64. | | LIRA, E. DA C.; TORRES, F. Z. V.; VALERIO, J. R.; WEIS, G. M.; BARBOSA, V. L. A; OLIVEIRA, M. C. M. Seleção de gramíneas forrageiras com base na resistência às cigarrinhas- das-pastagens. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 11., 2015, Campo Grande, MS. Anais... Campo Grande: Embrapa Gado de Corte, 2015. 114 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 213).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 65. | | VALERIO, J. R.; TORRES, F. Z. V.; SILVA, L. C. da; RÔDAS, P. L.; ARAÚJO NETO, A.; OLIVEIRA, M. C. M. Seleção de híbridos intraespecíficos de Brachiaria decumbens com base no nível de antibiose à cigarrinha-das-pastagens Notozulia entreriana (Hemiptera: Cercopidae). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 14., 2012, Curitiba. SEB - 40 anos de avanços da Ciência Entomológica Brasileira: anais web. Curitiba: SEB, 2012. 1 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 66. | | VENTURA, E. F.; RAGALZI, C. M.; RESENDE, R. M. S.; TORRES, F. Z. V.; VILELA, M. de M.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do. Seleção genômica ampla para resistência a Notozulia entreriana e modo de reprodução em Brachiaria. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 11., 2015, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 67. | | TORRES, F. Z. V.; VALERIO, J. R.; SILVA, L. C. da; RÔDAS, P. L.; ARAÚJO NETO, A.; OLIVEIRA, M. da C. M.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do. Avaliação de híbridos de Brachiaria decumbens quanto à resistência à cigarrinha-das-pastagens Deois flavopicta. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 14., 2012, Curitiba. SEB - 40 anos de avanços da Ciência Entomológica Brasileira: anais web. Curitiba: SEB, 2012. 1 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 68. | | FERREIRA, R. C. U.; LARA, L. A. de C.; CHIARI, L.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do; VALERIO, J. R.; TORRES, F. Z. V.; GARCIA, A. A. F.; SOUZA, A. P. de. Genetic Mapping With Allele Dosage Information in Tetraploid Urochloa decumbens (Stapf) R. D. Webster Reveals Insights Into Spittlebug (Notozulia entreriana Berg) Resistance. Frontiers in Plant Science, v. 10, February, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 69. | | TORRES, F. Z. V.; VALERIO, J. R.; SILVA, L. C. da; RÔDAS, P. L.; ARAÚJO NETO, A.; OLIVEIRA, M. da C. M.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do. Resistência de híbridos intraespecíficos de Brachiaria decumbens à cigarrinha-das-pastagens Deois flavopicta. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 14., 2012, Curitiba. SEB - 40 anos de avanços da Ciência Entomológica Brasileira: anais web. Curitiba: SEB, 2012. 1 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 70. | | TORRES, F. Z. V.; AMARAL, B. B.; ANGELO, T. M.; MONTAGNER, D. B.; ARAUJO, A. R. de; BARBOSA, R. A.; SUJII, E. R.; LIRA, E. da C.; WEISS, G. Ocorrência, flutuação populacional e danos de percevejo castanho em cultivares de pastagens. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2020. 35 p. (Embrapa Gado de Corte. Boletim de pesquisa em desenvolvimento, 44).| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 71. | | VALLE, C. B. do; EUCLIDES, V. P. B.; MONTAGNER, D. B.; VALERIO, J. R.; MENDES-BONATTO, A. B.; VERZIGNASSI, J. R.; TORRES, F. Z. V.; MACEDO, M. C. M.; FERNANDES, C. D.; BARRIOS, S. C. L.; DIAS FILHO, M. B.; MACHADO, L. A. Z.; ZIMMER, A. H. BRS Ipyporã ("belo começo" em guarani): híbrido de Brachiaria da Embrapa. Brasília, DF: Embrapa, 2017. 17 p. (Embrapa Gado de Corte. Comunicado técnico, 137).| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Gado de Corte. |
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| 72. | | SOUZA, J. M. de; FRAGOSO, K. N. da S.; ORILIO, A. F.; MELO, F. L.; NAGATA, T.; FERNANDES, C. D.; VALÉRIO, J. R.; TORRES, F. Z. V.; AMARAL, B. B.; PEREIRA, T. B. C.; OLIVEIRA, A. S. de; RESENDE, R. O. Two viruses from Stylosanthes guianensis may represent a new genus within Potyviridae. Virus Research, n. 293, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 73. | | MATIAS, F. I.; CANDIDO, A. R.; MACHADO, W. K. R.; AMARAL, P. N. C. do; DIAS, A. M.; VALLE, C. B. do; BARRIOS, S. C. L.; VALERIO, J. R.; TORRES, F. Z. V.; VERZIGNASSI, J. R.; ARRUDA, C. O. C. B. de; GOUVEIA, B. T.; NOBRE, A. A. A. Urochloa spp. multivariate performance: Similarities and divergences among intra- and interspecific populations. Crop Breeding e Genetics, p. 1-13, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: C - 0 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 74. | | ZIMMER, A. H.; ARAUJO, A. R. de; GOMIDE, C. A. de M.; ANDRADE, C. M. S. de; FERNANDES, C. D.; MONTARDO, D. P.; MONTAGNER, D. B.; TORRES, F. Z. V.; FERNANDES, F. D.; LEDO, F. J. da S.; MACIEL, G. A.; ASSIS, G. M. L. de; BRAGA, G. J.; VERZIGNASSI, J. R.; RODRIGUES, J. G.; VALERIO, J. R.; VALENTIM, J. F.; JANK, L.; MACHADO, L. A. Z.; MACEDO, M. C. M.; SANTOS, M. F.; COSTA, N. de L.; BARBOSA, R. A.; GARCIA, R. A.; GOMES, R. da C. O capim-BRS Zuri (Panicum maximum Jacq.) na diversificação e intensificação das pastagens. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2022. 46 p. (Embrapa Gado de Corte. Comunicado técnico, 163). Objetivos de Desenvolvimento Sustentável 1, 2, 3 e 8.
Autores: Ademir Hugo Zimmer, pesquisador da Embrapa Gado de Corte. Alexandre Romeiro de Araújo, pesquisador da Embrapa Gado de Corte. Carlos Augusto de Miranda Gomide, pesquisador da...| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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