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Biblioteca(s):  Embrapa Agrobiologia.
Data corrente:  02/08/2019
Data da última atualização:  28/08/2023
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  TERRA, L. A.; SOARES, C. de P.; MENESES, C. H. G. de; SFEIR, T.; SOUZA, E. M. de; SILVEIRA, V.; VIDAL, M. S.; BALDANI, J. I.; SCHWAB, S.
Afiliação:  UFRRJ; UENF; UEPB; UFPR; UFPR; MARCIA SOARES VIDAL, CNPAB; JOSE IVO BALDANI, CNPAB; STEFAN SCHWAB, CNPAB.
Título:  Transcriptome and proteome profiles of the diazotroph Nitrospirillum amazonense strain CBAmC in response to the sugarcane apoplast fluid
Ano de publicação:  2020
Fonte/Imprenta:  Plant and Soil, v. 451, p. 145-168, 2020.
ISSN:  1573-5036
DOI:  https://doi.org/10.1007/s11104-019-04201-y
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  The endophytic diazotrophic strain CBAmC of Nitrospirillum amazonense has been reported as a plant growth promoter of sugarcane variety RB867515 when grown under field conditions. The present work aimed to assess the influence of apoplast fluid from RB867515 on the transcriptomic and proteomic profiles of CBAmC cultured in vitro. NA-Seq in Ion Proton? and ESI-LC-MS/MS peptide analysis were used to evaluate the transcriptomic and proteomic profiles, respectively, of CBAmC exposed for 2 h to the sugarcane apoplast fluid. Results The bacterial transcriptomic and proteomic profiles were well correlated. The overall response of CBAmC to the apoplast fluid included overexpression of defense systems against reactive oxygen species (ROS) and osmotic stress, RND efflux pumps for toxic compounds, Sec and Tat secretory systems, and assimilative metabolism of iron. In contrast, active transporters of organic compounds, chemotaxis system and flagellum structure were underexpressed. Conclusions The bacterial metabolic pathways / functions activated in response to the sugarcane apoplast fluid are most likely related to its adaptation to the peculiar characteristics of the fluid. The activation of some of those functions could be determinant for its adaptation to the sugarcane apoplastic niche, and perhaps be involved in the previously observed effect of promoting plant growth.
Palavras-Chave:  Bacteria plant interaction; Saccharum spp; Transcripts Proteins.
Categoria do assunto:  S Ciências Biológicas
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Agrobiologia (CNPAB)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPAB41197 - 1UPCAP - DD
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1.Imagem marcado/desmarcadoTERRA, L. A. Genômica funcional da bactéria fixadora de nitrogênio Nitrospirillum amazonense em interação com o fluido do apoplasto de cana-de-açúcar: abordagens transcriptômica e proteômica. 2018. Tese. (Doutorado em Ciência, Inovação e Tecnologia Agropecuária) - Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Seropédica. Orientação de Stafan Schwab. Coorientação de Márcia Soares Vidal.
Tipo: Orientação de Tese de Pós-Graduação
Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia.
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2.Imagem marcado/desmarcadoSCHWAB, S.; TERRA, L. A.; BALDANI, J. I. Genomic characterization of Nitrospirillum amazonense strain CBAmC, a nitrogen-fixing bacterium isolated from surface-sterilized sugarcane stems. Molecular Genetics and Genomics, v. 293, n. 4, p. 997-1016, 2018.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia.
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3.Imagem marcado/desmarcadoTERRA, L. A.; SILVA, E.; TEIXEIRA, K. R. dos S. Obtenção e análise de proteínas presentes em sobrenadantes de meio de cultura de Gluconacetobacter diazotrophicus. Embrapa Agrobiologia, 2012
Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas
Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia.
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4.Imagem marcado/desmarcadoMENDES, V. S.; TERRA, L. A.; SILVA, E.; GALVÃO, P. G.; TEIXEIRA, K. R. dos S. Caracterização do perfil proteômico de estirpe de G. diazotrophicus e mutantes alterados em proteínas da menbrana celular. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 12., 2012. Economia verde, sustentabilidade e erradicação da pobreza: caderno de resumos. Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2012.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia.
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5.Imagem marcado/desmarcadoTERRA, L. A.; SILVA, E. DA; GALVÃO, P. G.; TEIXEIRA, K. R. dos S. Extração de proteínas presentes em sobrenadantes de meio de cultivo para análise de exoproteoma de Gluconacetobacter diazotróficas In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UNIVERSIDADE FEDERAL RURAL DO RIO DE JANEIRO, 21., 2011, Seropédica. 46 p. Publicado também na SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 11., 2011.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia.
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6.Imagem marcado/desmarcadoSTEPHAN, M. P.; AZEVEDO, T. de L.; TERRA, L. A.; SILVA, E. da; TEIXEIRA, K. R. dos S. Caracterização de exoproteínas por eletroforese bidimensional utilizando cultivo bacteriano como modelo de análise: adequação de metodologia. Rio de Janeiro: Embrapa Agroindústria de Alimentos, 2013. (Embrapa Agroindústria de Alimentos. Comunicado técnico, 200).
Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos.
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7.Imagem marcado/desmarcadoSOARES, C. de P.; TERRA, L. A.; TADRA-SFEIR, M. Z.; VIDAL, M. S.; BALDANI, J. I. Transcriptome analysis of Gluconacetobacter diazotrophicus PAL5 strain in response to iron. In: SYMPOSIUM ON BIOLOGICAL NITROGEN FIXATION, 16., LATINAMERICAN WORKSHOP OF PGPR, 4., RELARE, 19., 2018, Foz do Iguaçu. Book of abstract....Foz do Iguaçu: Emprapa, 2018. p. 50 Session 4, Poster IV.1
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia.
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8.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, C. G. N. da; MONTEIRO, E. de C.; DINIZ, P. P.; TERRA, L. A.; SCHWAB, S.; REIS, V. M.; ARAUJO, J. L. S. de; URQUIAGA, S. Designing and validation of specifc primers for the quantitative detection of bacteria in sugarcane inoculant. Brazilian Journal of Microbiology, v. 54, p. 2627–2640, 2023.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia.
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9.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, C. G. N. da; MONTEIRO, E. de C.; DINIZ, P. P.; TERRA, L. A.; SCHWAB, S.; REIS, V. M.; ARAUJO, J. L. S. de; URQUIAGA, S. Designing and validation of specific primers for the quantitative detection of bacteria in sugarcane inoculant. Brazilian Journal of Microbiology,, Published: 16 October 2023
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia.
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10.Imagem marcado/desmarcadoTERRA, L. A.; SOARES, C. de P.; TADRA-SFEIR, M. Z.; SOUZA, E. M.; SILVEIRA, V.; BALDANI, J. I.; VIDAL, M. S.; SCHWAB, S. Transcriptome and proteome approaches for the diazotroph Nitrospirillum amazonense grown in sugarcane apoplast fluid. In: SYMPOSIUM ON BIOLOGICAL NITROGEN FIXATION, 16., LATINAMERICAN WORKSHOP OF PGPR, 4., RELARE, 19., 2018, Foz do Iguaçu. Book of abstract....Foz do Iguaçu: Emprapa, 2018. p. 52 Session 4, Poster IV.5
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia.
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11.Imagem marcado/desmarcadoTERRA, L. A.; SOARES, C. de P.; MENESES, C. H. G. de; SFEIR, T.; SOUZA, E. M. de; SILVEIRA, V.; VIDAL, M. S.; BALDANI, J. I.; SCHWAB, S. Transcriptome and proteome profiles of the diazotroph Nitrospirillum amazonense strain CBAmC in response to the sugarcane apoplast fluid Plant and Soil, v. 451, p. 145-168, 2020.
Tipo: Artigo em Periódico Indexado
Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia.
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12.Imagem marcado/desmarcadoTERRA, L. A.; SCHWAB, S.; TEIXEIRA, K. R. dos S.; ARAUJO, J. L. S. de; CHAVES, M. S.; FREITAS, H. R. B. de; CRIVELARO, A. L. R.; NUNES, A. B. de C.; SANTOS, C. M. dos; ROSA, D. P. da S.; PADILHA, D. da S.; SILVA, E. da; MENDES, V. S.; FARINELLI, L.; CRUZ, L. M.; BALDANI, J. I. Draft genome sequence of Nitrospirillum amazonense strain CBAmC, a nitrogen fixer and plant growth promoter isolated from sugarcane, reveal bacterial potential benefits to cane culture In: INTERNATIONAL PGPR WORKSHOP, 10., Liége, 2015. Program and abstract book. Liége: Université de Liége, 2015.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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13.Imagem marcado/desmarcadoSOARES, C. de P.; TRADA-SFEIR, M. Z.; TERRA, L. A.; FERREIRA, J. de P.; SANTOS, C. M. dos; OLIVEIRA, I. G. B. de; ARAUJO, J. L. S. de; MENESES, C. H. S. G.; SOUZA, E. M. de; BALDANI, J. I.; VIDAL, M. S. Transcriptomic Response of the Diazotrophic Bacteria Gluconacetobacter diazotrophicus strain PAL5 to Iron limitation and characterization of the fur regulatory network International Journal Of Molecular Sciences, v. 23, n. 15, e8533, 2022.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
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