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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Cerrados. |
Data corrente: |
20/12/2023 |
Data da última atualização: |
20/12/2023 |
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
Autoria: |
PESSOA FILHO, M. A. C. de P.; SOARES, T. N.; TELLES, M. P. de C.; COELHO, A. S. G.; CHAVES, L. J. |
Afiliação: |
MARCO AURÉLIO CALDAS DE PINHO PESSO, CPAC; THANNYA NASCIMENTO SOARES, Siga Eventos; MARIANA PIRES DE CAMPOS TELLES, Siga Eventos; ALEXANDRE SIQUEIRA GUEDES COELHO, Universidade Federal Goias; LÁZARO JOSÉ CHAVES, Siga Eventos. |
Título: |
A draft genome assembly of the baru tree (Dipteryx alata vogel) as a resource for domestication, breding ans conservation. |
Ano de publicação: |
2023 |
Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 12., 2023, Caxambu, MG. Anais. Piracicaba: Sociedade Brasileira de Melhoramento de Plantas, 2023. |
Idioma: |
Português |
Notas: |
Resumo 667217. Na publicação: Marco Pessoa Filho. |
Conteúdo: |
Baru seed production is mostly based on extractivism, which, in addition to habitat loss, led to its inclusion in the IUCN Red List of Threatened Species. Genomic resources and propagation methods will support a program for baru domestication and breeding, so that commercial production systems are established and impacts of extractivism on natural populations are reduced. We present a draft genome assembly of the D. alata, based on third-generation PacBio CCS HiFi reads. High molecular weight DNA was extracted from young leaves of a single diploid individual. Sequencing was performed on a Sequel II system at Maryland Genomics, using one SMRT cell 8M on CCS HiFi mode, with a 30-hour runtime. Approximately 16 Gb were obtained in 1,4 million CCS reads, with an average size of 11kbp. The partially phased draft assembly was obtained with Hifiasm in HiFi-only mode. |
Palavras-Chave: |
Baru. |
Thesagro: |
Cerrado; Dipteryx Alata. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1160092/1/Resumo-667217-Congresso-Melhoramento-plantas-2023.pdf
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Marc: |
LEADER 01656nam a2200205 a 4500 001 2160092 005 2023-12-20 008 2023 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aPESSOA FILHO, M. A. C. de P. 245 $aA draft genome assembly of the baru tree (Dipteryx alata vogel) as a resource for domestication, breding ans conservation.$h[electronic resource] 260 $aIn: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 12., 2023, Caxambu, MG. Anais. Piracicaba: Sociedade Brasileira de Melhoramento de Plantas$c2023 500 $aResumo 667217. Na publicação: Marco Pessoa Filho. 520 $aBaru seed production is mostly based on extractivism, which, in addition to habitat loss, led to its inclusion in the IUCN Red List of Threatened Species. Genomic resources and propagation methods will support a program for baru domestication and breeding, so that commercial production systems are established and impacts of extractivism on natural populations are reduced. We present a draft genome assembly of the D. alata, based on third-generation PacBio CCS HiFi reads. High molecular weight DNA was extracted from young leaves of a single diploid individual. Sequencing was performed on a Sequel II system at Maryland Genomics, using one SMRT cell 8M on CCS HiFi mode, with a 30-hour runtime. Approximately 16 Gb were obtained in 1,4 million CCS reads, with an average size of 11kbp. The partially phased draft assembly was obtained with Hifiasm in HiFi-only mode. 650 $aCerrado 650 $aDipteryx Alata 653 $aBaru 700 1 $aSOARES, T. N. 700 1 $aTELLES, M. P. de C. 700 1 $aCOELHO, A. S. G. 700 1 $aCHAVES, L. J.
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Registro original: |
Embrapa Cerrados (CPAC) |
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Registros recuperados : 11 | |
1. | | SOARES, T. N.; CHAVES, L. J.; TELLES, M. P. de C.; DINIZ-FILHO, J. A. F.; RESENDE, L. V. Distribuição espacial da variabilidade genética intrapopulacional de Dipteryx alata. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 43, n. 9, p. 1151-1158, set. 2008. Título em inglês: Spatial distribution of intrapopulational genetic variability in Dipteryx alata.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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2. | | SOUZA, A. V. de; BERTONI. V. W.; FRANÇA, S. de C.; TELLES, M. P. de C.; PEREIRA, A. M. S. Diversidade genética em populações naturais de infalível. Horticultura Brasileira, Brasília, DF, v. 27, n. 2, p. S1118-1123, ago. 2009. 1 CD-ROM. Suplemento. Edição dos Trabalhos do 49 Congresso Brasileiro de Olericultura, Águas de Lindóia, ago. 2009.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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3. | | GOUVEIA, F. O.; COLLEVATTI, R. G.; TELLES, M. P. de C.; BORBA, T. C. de O.; SOARES, T. N. Estrutura genética espacial intrapopulacional em Annona crassiflora Mart. (Annonaceae). In: CONGRESSO DE PESQUISA, ENSINO E EXTENSÃO, 7., 2010, Goiânia. Conhecimento e desenvolvimento sustentável: anais... Goiânia: UFG, 2010. p. 5621-5625. Conpeex 2010.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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5. | | PESSOA FILHO, M. A. C. de P.; SOARES, T. N.; TELLES, M. P. de C.; COELHO, A. S. G.; CHAVES, L. J. A draft genome assembly of the baru tree (Dipteryx alata vogel) as a resource for domestication, breding ans conservation. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 12., 2023, Caxambu, MG. Anais. Piracicaba: Sociedade Brasileira de Melhoramento de Plantas, 2023. Resumo 667217. Na publicação: Marco Pessoa Filho.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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6. | | TELLES, M. P. de C.; SILVA, R. S. M.; CHAVES, L. J.; COELHO, A. S. G.; DINIZ FILHO, J. A. F. Divergência entre subpopulações de cagaiteira (Eugenia dysenterica) em resposta a padrões edáficos e distribuição espacial. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 36, n. 11, p. 1387-1394, nov. 2001 Título em inglês: Divergence among local populations of Eugenia dysenterica in response to edaphic patterns and spatial distribution.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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7. | | RESENDE, L. V.; MAGNABOSCO, C. de U.; VASCONCELLOS, B. de F. e; SOARES, T. N.; TELLES, M. P. de C.; MONTEIRO, M. S. R. Efeitos dos locos microssatélites BM2113 e CSN3 sobre características produtivas de bovinos. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 42., 2005, Goiânia. A produção animal e o foco no agronegócio: anais eletrônico. Goiânia: SBZ, 2005. 1 CD-ROMBiblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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9. | | MAGNABOSCO, C. de U.; RESENDE, L. V.; TELLES, M. P. de C.; TROVO, J. B. de F.; VASCONCELLOS, B. de F. e; JOSAHKIANS, L. A.; SAINZ, R. D. Relações polimorfismo de locos STR com características de crescimento e carcaça em bovinos da raça nelore. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 43., 2006, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBZ; UFPB, 2006. 1 CD-ROM.Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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11. | | VAZ, A. R. de C.; BORBA, T. C. de O.; BRONDANI, C.; RANGEL, P. H. N.; CAMARGO, G. S. de O.; TELLES, M. P. de C.; DINIZ FILHO, J. A. F.; BRONDANI, R. P. V. Genetic analysis of a local population of Oryza glumaepatula using SSR markers: implications for management and conservation programs. Genetica, v. 137, n. 2, p. 221-231, Nov. 2009.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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Registros recuperados : 11 | |
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