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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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Data corrente: |
27/09/2019 |
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Data da última atualização: |
07/11/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
AZEVEDO, D. A. A. de; MONTEIRO, J. P.; PINHEIRO, R. R.; MUDADU, M. de A.; ANDRIOLI, A.; ARAÚJO, J. F.; SOUSA, A. L. M. de; SIDER, L. H.; PEIXOTO, R. M.; TEIXEIRA, M. F. da S. |
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Afiliação: |
DALVA ALANA ARAGÃO DE AZEVEDO, Universidade Estadual do Ceará (UECE) - Fortaleza, CE, Brazil; JOMAR PATRICIO MONTEIRO, CNPC; RAYMUNDO RIZALDO PINHEIRO, CNPC; MAURICIO DE ALVARENGA MUDADU, CNPTIA; ALICE ANDRIOLI, CNPC; JUSCILÂNIA FURTADO ARAÚJO, Northeast Biotechnology Network, Universidade Estadual do Ceará (UECE) - Fortaleza, CE, Brazil; ANA LÍDIA MADEIRA DE SOUSA, Universidade Estadual do Ceará (UECE) - Fortaleza, CE, Brazil; LUCIA HELENA SIDER, CNPC; RENATO MESQUITA PEIXOTO, Universidade Federal do Acre (UFAC) - Rio Branco, AC, Brazil; MARIA FÁTIMA DA SILVA TEIXEIRA, Universidade Estadual do Ceará (UECE) - Fortaleza, CE, Brazil. |
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Título: |
Molecular characterization of circulating strains of small ruminant lentiviruses in Brazil based on complete gag and pol genes. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Small Ruminant Research, v. 177, p. 160-166, 2019. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.smallrumres.2019.06.011 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: Small ruminant lentiviruses (SRLV) are widely distributed in the world and cause productive and economic losses. These pathogens have high genetic variability, which hinders diagnosis by molecular methods. Molecular characterization studies are good strategies for elaborating programs aimed to control or eradicate diseases. Hence, this study aimed to sequence, characterize and compare strains of SRLV, which were isolated from naturally infected goats from the states of Ceará, Rio Grande do Norte and Minas Gerais, Brazil, based on total nucleotide sequences of gag and pol genes. SRLV isolates from the microbiological collection of Sheep and Goat of Embrapa were cultured in goat synovial membrane. Supernatants containing cells were stored and viral particles were purified with sucrose density gradient centrifugation for RNA extraction. Then, sequencing in HiSeq 2500 platform (Illumina) was performed to obtain the total genome of the SRLV strains. The software MEGA version 7.0 was used for sequence editing and phylogeny analysis. A total of 17 isolates were multiplied in cellular culture and six were viable, which were two from Minas Gerais (MG), one from Rio Grande do Norte (RN) and three from Ceará (CE). Two sequences were obtained from the sequencing by synthesis, one from MG (BRMG CNPC) and one from RN (BRRN CNPC). From the total SRLV genome (9,200 bases), sample BRMG CNPC generated a consensus of 6,378 bases, approximately 69,34% of the viral genome and sample BRRN CNPC generated a consensus of 5,351 bases, which comprised 58.16% of the total genome. Samples in this study demonstrated closer phylogenetic relation with genotype B (B1 group). The remaining strains sequenced in Brazil are also present in the same group with the exception of three samples from genotype A. Immunodominant regions of gag gene and motifs of pol gene were similar to the standard CAEV Cork strain. For the first time, the complete gag and pol genes were sequenced in Brazil from the strain BRMG CNPC isolated in Minas Gerais state. In addition, 2490 bases from the total of 3316 bases were sequenced from the pol gene of the BRRN CNPC sample from Rio Grande do Norte. MenosAbstract: Small ruminant lentiviruses (SRLV) are widely distributed in the world and cause productive and economic losses. These pathogens have high genetic variability, which hinders diagnosis by molecular methods. Molecular characterization studies are good strategies for elaborating programs aimed to control or eradicate diseases. Hence, this study aimed to sequence, characterize and compare strains of SRLV, which were isolated from naturally infected goats from the states of Ceará, Rio Grande do Norte and Minas Gerais, Brazil, based on total nucleotide sequences of gag and pol genes. SRLV isolates from the microbiological collection of Sheep and Goat of Embrapa were cultured in goat synovial membrane. Supernatants containing cells were stored and viral particles were purified with sucrose density gradient centrifugation for RNA extraction. Then, sequencing in HiSeq 2500 platform (Illumina) was performed to obtain the total genome of the SRLV strains. The software MEGA version 7.0 was used for sequence editing and phylogeny analysis. A total of 17 isolates were multiplied in cellular culture and six were viable, which were two from Minas Gerais (MG), one from Rio Grande do Norte (RN) and three from Ceará (CE). Two sequences were obtained from the sequencing by synthesis, one from MG (BRMG CNPC) and one from RN (BRRN CNPC). From the total SRLV genome (9,200 bases), sample BRMG CNPC generated a consensus of 6,378 bases, approximately 69,34% of the viral genome and sample BR... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Caracterização molecular; Molecular characterization; SRLV. |
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Thesaurus Nal: |
Genome; Goats; Lentivirus; Phylogeny; Sheep. |
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Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
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Marc: |
LEADER 03206naa a2200337 a 4500
001 2112529
005 2019-11-07
008 2019 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1016/j.smallrumres.2019.06.011$2DOI
100 1 $aAZEVEDO, D. A. A. de
245 $aMolecular characterization of circulating strains of small ruminant lentiviruses in Brazil based on complete gag and pol genes.$h[electronic resource]
260 $c2019
520 $aAbstract: Small ruminant lentiviruses (SRLV) are widely distributed in the world and cause productive and economic losses. These pathogens have high genetic variability, which hinders diagnosis by molecular methods. Molecular characterization studies are good strategies for elaborating programs aimed to control or eradicate diseases. Hence, this study aimed to sequence, characterize and compare strains of SRLV, which were isolated from naturally infected goats from the states of Ceará, Rio Grande do Norte and Minas Gerais, Brazil, based on total nucleotide sequences of gag and pol genes. SRLV isolates from the microbiological collection of Sheep and Goat of Embrapa were cultured in goat synovial membrane. Supernatants containing cells were stored and viral particles were purified with sucrose density gradient centrifugation for RNA extraction. Then, sequencing in HiSeq 2500 platform (Illumina) was performed to obtain the total genome of the SRLV strains. The software MEGA version 7.0 was used for sequence editing and phylogeny analysis. A total of 17 isolates were multiplied in cellular culture and six were viable, which were two from Minas Gerais (MG), one from Rio Grande do Norte (RN) and three from Ceará (CE). Two sequences were obtained from the sequencing by synthesis, one from MG (BRMG CNPC) and one from RN (BRRN CNPC). From the total SRLV genome (9,200 bases), sample BRMG CNPC generated a consensus of 6,378 bases, approximately 69,34% of the viral genome and sample BRRN CNPC generated a consensus of 5,351 bases, which comprised 58.16% of the total genome. Samples in this study demonstrated closer phylogenetic relation with genotype B (B1 group). The remaining strains sequenced in Brazil are also present in the same group with the exception of three samples from genotype A. Immunodominant regions of gag gene and motifs of pol gene were similar to the standard CAEV Cork strain. For the first time, the complete gag and pol genes were sequenced in Brazil from the strain BRMG CNPC isolated in Minas Gerais state. In addition, 2490 bases from the total of 3316 bases were sequenced from the pol gene of the BRRN CNPC sample from Rio Grande do Norte.
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700 1 $aMONTEIRO, J. P.
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700 1 $aTEIXEIRA, M. F. da S.
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Registro original: |
Embrapa Caprinos e Ovinos (CNPC) |
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| Registros recuperados : 159 | |
| 141. |  | PACIULLO, D. S. C.; CASTRO, C. R. T de; PIRES, M. DE F. A.; FERNANDES, E. N.; GOMIDE, C. A. de M.; MULLER, M. D.; AROEIRA, L. J. M. Desempenho de novilhas leiteiras em pastagem solteira ou em sistema silvipastoril constituído por Eucalyptus grandis e leguminosas arbóreas. In: CONGRESO NACIONAL DE SISTEMAS SILVOPASTORILES, 1., 2009, Posadas. Actas... Buenos Aires: INTA, 2009. p. 296-301.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 142. | | PACIULLO, D. S. C.; CASTRO, C. R. T. de; PIRES, M. de F. A.; FERNANDES, E. N.; GOMIDE, C. A. de M.; MULLER, M. D.; AROEIRA, L. J. M. Desempenho de novilhas leiteiras em pastagem solteira ou em sistema silvipastoril constituído por Eucalyptus grandis e leguminosas arbóreas. In: CONGRESO NACIONAL DE SISTEMAS SILVOPASTORILES. ASPECTOS RELACIONADOS A PASTIZALES Y ESPECIES FORRAJERAS, 1., 2009, Montecarlo. Anais... Montecarlo: INTA, 2009.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 143. | | PIRES, M. de F. A.; SALLA, L. E.; PACIULLO, D. S. C.; CASTRO, C. R. T. de; AROEIRA, L. J. M.; MOSTARO, L. E.; OLIVEIRA, M. C.; NASCIMENTO, F. J. Comportamento de novilhas mestiças Holandês x Zebu manejadas em pastagens de Brachiaria decumbens ou em sistema silvipastoril. In: REUNIÓN ASOCIACÓN LATINOAMERICANA DE PRODUCCIÓN ANIMAL, 20., REUNIÓN ASOCIACIÓN PERUANA DE PRODUCCIÓN ANIMAL, 30., CONGRESO INTERNACIONAL DE GANADERIA DOBLE PROPOSITO, 5., 2007, Cuzco. Anais... Cuzco: ALPA/APPA, 2007. 1 CD.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 144. | | PIRES, M. de F. A.; SALLA, L. E.; PACIULLO, D. S. C.; CASTRO, C. R. T. de; AROEIRA, L. J. M.; MOSTARO, L. E.; OLIVEIRA, M. C.; NASCIMENTO, F. J. Comportamento de novilhas mestiças Holandês x Zebu manejadas em pastagens de Brachiaria decumbens ou em sistema silvipastoril. In: REUNIÓN ASOCIACÓN LATINOAMERICANA DE PRODUCCIÓN ANIMAL, 20.; REUNIÓN ASOCIACIÓN PERUANA DE PRODUCCIÓN ANIMAL, 30.; CONGRESO INTERNACIONAL DE GANADERIA DOBLE PROPOSITO, 5., 2007, Cuzco. Resumenes... Cuzco: ALPA/APPA, 2007.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 145. | | ANDRADE, P. J. M.; ROCHA, W. S. D. da; SANTOS, A. M. B. dos; MARTINS, C. E.; SOUZA SOBRINHO, F. de; MULLER, M. D.; CASTRO, C. R. T. de; PACIULLO, D. S. C.; GOMIDE, C. A. de M. Implantação de sistemas de integração lavoura, pecuaria e floresta. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, Lupa Video Produções, Bunge Fertilizantes, 2009. Parceria: Lupa Vídeo Produções e Bungen Fertilizantes.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 148. | | CAMPANA, L. L.; GOMIDE, C. A. de M.; COSTA, I. de A.; GAMA, D. de S.; PACIULLO, D. S. C.; CASTRO, C. R. T. de; OLIVEIRA, A. M. S. de. Morfogênese de clones de capim-elefante de porte baixo. In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE, 5., 2010, Juiz de Fora, MG. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2010. 1 CD-ROM. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 141.). P. 23-26.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 149. | | SILVA, W. C. M. e; PACIULLO, D. S. C.; GOMIDE, C. A. de M.; FERNANDES, P. B.; LIMA, A. M.; CASTRO, C. R. T. de; SOUZA, V. F. de. Partição de matéria seca em Brachiaria decumbens em sistema silvipastoril. In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE, 4., 2009, Juiz de Fora, MG. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2009. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 136.). 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 150. | | PACIULLO, D. S. C.; CASTRO, C. R. T. de; COSTA, F. J. N.; TAVELA, R. C.; CARNEIRO, J. da C.; VERNEQUE, R. da S.; GOMIDE, C. A. de M. Massa de forragem, taxa de lotação e ganho de peso de novilhas mestiças em pastagem pura de Brachiaria decumbens e sistema silvipastoril. In: REUNIÓN ASOCIACÓN LATINOAMERICANA DE PRODUCCIÓN ANIMAL, 20.; REUNIÓN ASOCIACIÓN PERUANA DE PRODUCCIÓN ANIMAL, 30.; CONGRESO INTERNACIONAL DE GANADERIA DOBLE PROPOSITO, 5., 2007, Cuzco. Resumenes... Cuzco: ALPA/APPA, 2007. Publicado na revista Arch. Latinoam. Prod. Anim., v. 15, supl. 1, p. 439, 2007.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 152. | | PACIULLO, D. S. C.; PIRES, M. de F. A.; AROEIRA, L. J. M.; CASTRO, C. R. T. de; TAVELA, R. C.; CAMPOS, N. R.; SOUZA, B. P.; VERNEQUE, R. da S. Produção de leite de vacas mestiças Holandês x Zebu em pastagens sem árvores ou arborizadas com diferentes percentagens de leguminosas herbáceas. In: REUNIÓN ASOCIACÓN LATINOAMERICANA DE PRODUCCIÓN ANIMAL, 20., REUNIÓN ASOCIACIÓN PERUANA DE PRODUCCIÓN ANIMAL, 30., CONGRESO INTERNACIONAL DE GANADERIA DOBLE PROPOSITO, 5., 2007, Cuzco. Anais... Cuzco: ALPA/APPA, 2007. 1 CD.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
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| 153. | | PACIULLO, D. S. C.; PIRES, M. de F. A.; AROEIRA, L. J. M.; CASTRO, C. R. T. de; TAVELA, R. C.; CAMPOS, N. R.; SOUZA, B. P.; VERNEQUE, R. da S. Produção de leite de vacas mestiças Holandês x Zebu em pastagens sem árvores ou arborizadas com diferentes percentagens de leguminosas herbáceas. In: REUNIÓN ASOCIACÓN LATINOAMERICANA DE PRODUCCIÓN ANIMAL, 20.; REUNIÓN ASOCIACIÓN PERUANA DE PRODUCCIÓN ANIMAL, 30.; CONGRESO INTERNACIONAL DE GANADERIA DOBLE PROPOSITO, 5., 2007, Cuzco. Resumenes... Cuzco: ALPA/APPA, 2007.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 154. | | PACIULLO, D. S. C.; CASTRO, C. R. T. de; GOMIDE, C. A. de M.; FERNANDES, P. B.; ROCHA, W. S. D. da; MULLER, M. D.; ROSSIELO, R. O. P. Soil bulk density and biomass partitioning of Brachiaria decumbens in a silvopastoral system. Scientia Agricola, v. 67, n. 5, p. 598-603, 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 155. | | BRIGHENTI, A. M.; PACIULLO, D. S. C.; GOMIDE, C. A. de M.; CASTRO, C. R. T. de; SOUZA, E. M. B. de; SILVA, R. B. da; SOUZA SOBRINHO, F. de. Taxas de semeadura e métodos de plantio da "BRS Integra" (Urochloa ruziziensis) no consórcio com milho em cultivo de segunda safra. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2023. 25 p. (Embrapa Gado de Leite. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 50). ODS 2, ODS 12, ODS, 15.| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 156. | | CASTRO, C. R. T. de; VICENTINI, N. M.; LANGE, C. C.; DINIZ, F. H.; GAMA, M. A. S. da; MARTINS, C. E.; LOPES, F. C. F.; SOUZA, G. N. de; OTENIO, M. H.; SOBRAL, D.; COSTA, R. G. B.; REIS, E. S. dos; ARAÚJO, A. L. R.; MAGALHAES JUNIOR, W. C. P. de; PIRES, M. de F. A. Produção, qualidade microbiológica e aspectos nutricionais do queijo artesanal de Carvalhos-MG. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2023. 54 p. (Embrapa Gado de Leite. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 48). OSD 1, ODS 2, ODS 3, ODS 8, ODS 10.| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
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| 157. | | ALVIM, M. J.; COSER, A. C.; MARTINS, C. E.; VILELA, D.; PEREIRA, J. R.; AROEIRA, L. J. M.; CARVALHO, M. M. DE; BOTREL, M. DE A.; OLIVEIRA, J. S. e; ROCHA, W. S. D. da; SOUZA SOBRINHO, F. de; MULLER, M. D.; ANDRADE, P. J. M.; PACIULLO, D. S. C.; GOMIDE, C. A. de M.; CASTRO, C. R. T. de. Recursos forrageiros. In: CAMPOS, O. F. de; MIRANDA, J. E. C. de (ed.). Gado de leite: o produtor pergunta, a Embrapa responde. 3. ed. rev. ampl. Brasília, DF: Embrapa; Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2012. p. 84-159 (Coleção 500 perguntas 500 respostas).| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 158. | | AUAD, A. M.; BRIGHENTI, A. M.; CARNEIRO, A. V.; RIBEIRO, A. C. de C. L.; CARVALHO, A. da C.; FREITAS, A. F. de; CARVALHO, B. C. de; ALENCAR, C. A. B. de; GOMIDE, C. A. de M.; MARTINS, C. E.; CASTRO, C. R. T. de; PACIULLO, D. S. C.; NASCIMENTO JUNIOR, E. R. do; SOUZA SOBRINHO, F. de; DERESZ, F.; LOPES, F. C. F.; SOUZA, G. N. de; WERNERSBACH FILHO, H. L.; OLIVEIRA, J. S. e; CARNEIRO, J. da C.; VIANA, J. H. M.; MENDONCA, L. C.; STOCK, L. A.; CAMARGO, L. S. de A.; MULLER, M. D.; OTENIO, M. H.; PEREIRA, M. C.; MACHADO, M. A.; GAMA, M. A. S. da; JUNQUEIRA, M. M.; SILVA, M. V. G. B.; PIRES, M. de F. A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; MARTINS, M. F.; TORRES, R. de A.; TEIXEIRA, S. R.; OLIVEIRA, V. M. de; ROCHA, W. S. D. da. MANUAL de bovinocultura de leche. Brasília: LK Editora; Belo Horizonte: SENAR-AR/MG; Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2010. 607 p. il.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 159. | | AUAD, A. M.; BRIGHENTI, A. M.; CARNEIRO, A. V.; RIBEIRO, A. C. de C. L.; CARVALHO, A. da C.; FREITAS, A. F. de; CARVALHO, B. C. de; ALENCAR, C. A. B. de; GOMIDE, C. A. de M.; MARTINS, C. E.; CASTRO, C. R. T. de; PACIULLO, D. S. C.; NASCIMENTO JUNIOR, E. R. do; SOUZA SOBRINHO, F. de; DERESZ, F.; LOPES, F. C. F.; SOUZA, G. N. de; WERNERSBACH FILHO, H. L.; OLIVEIRA, J. S. e; CARNEIRO, J. da C.; VIANA, J. H. M.; FURLONG, J.; MENDONCA, L. C.; STOCK, L. A.; CAMARGO, L. S. de A.; MULLER, M. D.; OTENIO, M. H.; PEREIRA, M. C.; MACHADO, M. A.; GAMA, M. A. S. da; JUNQUEIRA, M. M.; SILVA, M. V. G. B.; PIRES, M. de F. A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; GUIMARAES, M. F. M.; TORRES, R. de A.; TEIXEIRA, S. R.; OLIVEIRA, V. M. de; ROCHA, W. S. D. da. MANUAL de bovinocultura de leite. Brasília: LK Editora; Belo Horizonte: SENAR-AR/MG; Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2010. 607 p. il.| Tipo: Autoria/Organização/Edição de Livros |
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